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for query gene Shel_27290 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_27290  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  100 
 
 		 628 aa  1243    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0190  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  45.2 
 
 		 625 aa  468  9.999999999999999e-131  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1101  major facilitator superfamily MFS_1  41.5 
 
 		 469 aa  308  2.0000000000000002e-82  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000859946  hitchhiker  0.0000000000000597141 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2489  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.14 
 
 		 657 aa  287  5e-76  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1686  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.52 
 
 		 620 aa  284  3.0000000000000004e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.892029  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11090  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.05 
 
 		 640 aa  266  5.999999999999999e-70  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000431734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0659  permease of the major facilitator superfamily  27.86 
 
 		 683 aa  262  1e-68  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1459  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.42 
 
 		 483 aa  224  4e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.257317  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05820  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.93 
 
 		 510 aa  221  1.9999999999999999e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.835158  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1028  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  30.33 
 
 		 491 aa  218  2e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.10576e-22 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0845  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.51 
 
 		 491 aa  217  5e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0988  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  28.63 
 
 		 491 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2739  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.79 
 
 		 482 aa  213  7.999999999999999e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000169232  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0888  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.91 
 
 		 486 aa  212  1e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0944  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.91 
 
 		 486 aa  212  1e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0734  lincomycin resistance protein  31.53 
 
 		 480 aa  211  2e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.498733  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1003  lincomycin resistance protein LmrB  31.53 
 
 		 480 aa  212  2e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.2001  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1115  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  29.05 
 
 		 491 aa  211  3e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0268  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.48 
 
 		 500 aa  211  4e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0312698  decreased coverage  0.00157172 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0959  permease, general substrate transporter  32.69 
 
 		 482 aa  211  5e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0281229  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0971  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.69 
 
 		 482 aa  210  6e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1038  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.69 
 
 		 482 aa  210  6e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1116  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  32.45 
 
 		 482 aa  209  1e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000271146 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4325  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  28.84 
 
 		 491 aa  208  2e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06270  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.48 
 
 		 490 aa  209  2e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2014  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  32.23 
 
 		 513 aa  207  4e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3194  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.37 
 
 		 484 aa  207  5e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.794509  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0949  permease, general substrate transporter  32.45 
 
 		 482 aa  207  6e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000025972  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2922  multidrug resistance protein B  30.98 
 
 		 492 aa  206  1e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3251  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  32.79 
 
 		 492 aa  205  2e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3230  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  31.46 
 
 		 492 aa  204  3e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3232  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  32.55 
 
 		 513 aa  205  3e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2424  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.49 
 
 		 496 aa  204  3e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.153591 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2982  multidrug resistance protein B  32.56 
 
 		 492 aa  204  6e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3240  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.98 
 
 		 492 aa  203  9e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2994  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.67 
 
 		 492 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.218586  n/a   
 
 
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NC_007530  GBAA_3223  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.67 
 
 		 492 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0356226  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2937  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.35 
 
 		 492 aa  202  1.9999999999999998e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.486174  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1318  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.93 
 
 		 465 aa  201  1.9999999999999998e-50  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1468  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.03 
 
 		 491 aa  200  7e-50  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.986472  normal  0.151461 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0326  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.54 
 
 		 490 aa  199  1.0000000000000001e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1766  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.29 
 
 		 479 aa  198  2.0000000000000003e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.239731  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2909  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.17 
 
 		 635 aa  197  6e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000610887  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2340  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.74 
 
 		 472 aa  197  7e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2198  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.3 
 
 		 481 aa  196  9e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0460557  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2236  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.3 
 
 		 481 aa  196  9e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.126562  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2428  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.7 
 
 		 561 aa  196  1e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0683901  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1863  major facilitator superfamily permease  31.08 
 
 		 465 aa  195  2e-48  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0147099  n/a   
 
 
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NC_009632  SaurJH1_2488  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.1 
 
 		 479 aa  194  3e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2440  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.1 
 
 		 479 aa  194  3e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0877  major facilitator superfamily permease  31.01 
 
 		 496 aa  194  4e-48  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.192576  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0161  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.48 
 
 		 494 aa  192  1e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3099  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.28 
 
 		 491 aa  192  2e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2448  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.35 
 
 		 570 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_013172  Bfae_22510  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.54 
 
 		 494 aa  182  1e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.319093  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1944  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.07 
 
 		 658 aa  182  2e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02600  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.94 
 
 		 505 aa  181  2.9999999999999997e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4699  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.02 
 
 		 599 aa  179  1e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0449963  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0561  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  28.57 
 
 		 599 aa  179  1e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000151463  hitchhiker  0.00000000000000678179 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1519  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.81 
 
 		 502 aa  179  1e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3254  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.91 
 
 		 579 aa  179  2e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2667  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.68 
 
 		 485 aa  176  9.999999999999999e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0905281  normal  0.424193 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4464  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.9 
 
 		 599 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.737474  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4683  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  28.9 
 
 		 599 aa  175  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.74665e-44 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4812  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.9 
 
 		 599 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.127812  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30030  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.83 
 
 		 487 aa  174  3.9999999999999995e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00171806  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4310  multidrug resistance protein B  28.9 
 
 		 599 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1833  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.83 
 
 		 564 aa  174  3.9999999999999995e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0281974  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4299  multidrug resistance protein B  28.9 
 
 		 599 aa  174  5e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.649426  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4692  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  28.9 
 
 		 599 aa  174  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000143582  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4676  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  28.9 
 
 		 599 aa  173  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00195609  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4399  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.14 
 
 		 597 aa  173  1e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00696651  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0845  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.52 
 
 		 489 aa  172  2e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.222515  normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08630  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.13 
 
 		 509 aa  171  3e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.315329 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14700  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.51 
 
 		 491 aa  171  5e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0438074  normal  0.116411 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1383  major facilitator superfamily permease  26.99 
 
 		 519 aa  171  5e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.601618  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3361  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.11 
 
 		 492 aa  169  1e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0725  major facilitator superfamily permease  26.96 
 
 		 490 aa  168  2.9999999999999998e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.29773 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2756  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.35 
 
 		 471 aa  167  5.9999999999999996e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1298  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.98 
 
 		 500 aa  165  2.0000000000000002e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.000893352  hitchhiker  0.00471574 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2376  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.32 
 
 		 643 aa  163  1e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009632  SaurJH1_2422  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.32 
 
 		 643 aa  163  1e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.845412  n/a   
 
 
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NC_013721  HMPREF0424_0354  drug resistance MFS transporter, drug:H+ antiporter-2 (14 Spanner) (DHA2) family protein  26.78 
 
 		 542 aa  162  1e-38  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_010816  BLD_0998  putative permease  26.22 
 
 		 548 aa  159  1e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008528  OEOE_1853  major facilitator superfamily permease  25.31 
 
 		 471 aa  158  3e-37  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0425  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.36 
 
 		 485 aa  158  3e-37  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_004116  SAG1707  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.85 
 
 		 499 aa  156  1e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00395265  n/a   
 
 
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NC_009253  Dred_0455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.46 
 
 		 514 aa  156  1e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013947  Snas_5520  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.3 
 
 		 502 aa  155  2.9999999999999998e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013510  Tcur_1972  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.39 
 
 		 510 aa  153  8.999999999999999e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.073103  n/a   
 
 
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NC_013739  Cwoe_3300  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.87 
 
 		 501 aa  151  3e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.17007  normal  1 
 
 
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NC_008530  LGAS_1423  major facilitator superfamily permease  27.11 
 
 		 464 aa  151  3e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.904673  hitchhiker  0.0000661431 
 
 
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NC_008528  OEOE_0290  major facilitator superfamily permease  26.74 
 
 		 463 aa  150  5e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.146864  n/a   
 
 
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NC_010816  BLD_0049  sugar efflux permease  31.48 
 
 		 485 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.242248  n/a   
 
 
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NC_008528  OEOE_1378  major facilitator superfamily permease  26.11 
 
 		 512 aa  149  2.0000000000000003e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0602023  n/a   
 
 
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NC_013216  Dtox_2326  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.38 
 
 		 579 aa  145  2e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000685947  hitchhiker  0.0026086 
 
 
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NC_009513  Lreu_0360  major facilitator transporter  26.77 
 
 		 461 aa  144  4e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008531  LEUM_1880  major facilitator superfamily permease  24.6 
 
 		 503 aa  143  7e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008527  LACR_1471  major facilitator superfamily permease  28.11 
 
 		 454 aa  142  9.999999999999999e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00462633  n/a   
 
 
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NC_008531  LEUM_0963  major facilitator superfamily permease  23.59 
 
 		 449 aa  142  1.9999999999999998e-32  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.337437  n/a   
 
 
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