More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_4399 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003909  BCE_4699  EmrB/QacA family drug resistance transporter  94.16 
 
 		 599 aa  1097    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0449963  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4464  EmrB/QacA family drug resistance transporter  93.16 
 
 		 599 aa  1085    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.737474  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4299  multidrug resistance protein B  93.99 
 
 		 599 aa  1092    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.649426  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4310  multidrug resistance protein B  93.49 
 
 		 599 aa  1090    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0561  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  93.82 
 
 		 599 aa  1117    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000151463  hitchhiker  0.00000000000000678179 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4399  EmrB/QacA family drug resistance transporter  100 
 
 		 597 aa  1195    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00696651  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4692  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  93.99 
 
 		 599 aa  1094    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000143582  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3254  EmrB/QacA family drug resistance transporter  87.1 
 
 		 579 aa  1019    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4812  EmrB/QacA family drug resistance transporter  93.16 
 
 		 599 aa  1085    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.127812  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4676  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  93.66 
 
 		 599 aa  1090    Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00195609  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4683  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  93.49 
 
 		 599 aa  1088    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.74665e-44 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1944  EmrB/QacA family drug resistance transporter  50.26 
 
 		 658 aa  591  1e-167  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2376  EmrB/QacA family drug resistance transporter  51.82 
 
 		 643 aa  545  1e-153  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2422  EmrB/QacA family drug resistance transporter  51.82 
 
 		 643 aa  545  1e-153  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.845412  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1833  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  46.19 
 
 		 564 aa  523  1e-147  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0281974  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2448  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  44.27 
 
 		 570 aa  515  1e-144  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2428  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  48.35 
 
 		 561 aa  481  1e-134  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0683901  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2909  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  47.97 
 
 		 635 aa  469  1.0000000000000001e-131  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000610887  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3194  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.29 
 
 		 484 aa  414  1e-114  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.794509  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3232  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  46.38 
 
 		 513 aa  404  1e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2739  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.71 
 
 		 482 aa  403  1e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000169232  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2994  EmrB/QacA family drug resistance transporter  47.2 
 
 		 492 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.218586  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2982  multidrug resistance protein B  47.66 
 
 		 492 aa  402  9.999999999999999e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3230  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  47.43 
 
 		 492 aa  402  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3223  EmrB/QacA family drug resistance transporter  47.2 
 
 		 492 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0356226  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2014  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  46.35 
 
 		 513 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2937  EmrB/QacA family drug resistance transporter  48.05 
 
 		 492 aa  396  1e-109  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.486174  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3240  EmrB/QacA family drug resistance transporter  46.96 
 
 		 492 aa  399  1e-109  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2922  multidrug resistance protein B  47.2 
 
 		 492 aa  397  1e-109  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3251  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  46.73 
 
 		 492 aa  397  1e-109  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0725  major facilitator superfamily permease  40.04 
 
 		 490 aa  387  1e-106  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.29773 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0877  major facilitator superfamily permease  41.13 
 
 		 496 aa  372  1e-101  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.192576  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1519  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.19 
 
 		 502 aa  367  1e-100  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22510  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.32 
 
 		 494 aa  357  5e-97  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.319093  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1863  major facilitator superfamily permease  41.42 
 
 		 465 aa  354  2e-96  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0147099  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0734  lincomycin resistance protein  40.27 
 
 		 480 aa  334  2e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.498733  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2324  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.15 
 
 		 534 aa  335  2e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.937948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1003  lincomycin resistance protein LmrB  40.27 
 
 		 480 aa  334  2e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.2001  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2326  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.81 
 
 		 579 aa  333  5e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000685947  hitchhiker  0.0026086 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36 
 
 		 514 aa  329  9e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1766  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.96 
 
 		 479 aa  328  1.0000000000000001e-88  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.239731  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2489  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  44.12 
 
 		 657 aa  328  2.0000000000000001e-88  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1468  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.28 
 
 		 491 aa  323  4e-87  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.986472  normal  0.151461 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2236  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.84 
 
 		 481 aa  323  6e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.126562  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2198  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.84 
 
 		 481 aa  323  6e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0460557  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0888  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.68 
 
 		 486 aa  319  7.999999999999999e-86  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0944  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.68 
 
 		 486 aa  319  7.999999999999999e-86  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4325  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  38.67 
 
 		 491 aa  318  2e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0845  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.11 
 
 		 491 aa  318  2e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0949  permease, general substrate transporter  41.27 
 
 		 482 aa  317  3e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000025972  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1028  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  39.23 
 
 		 491 aa  317  4e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.10576e-22 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0959  permease, general substrate transporter  40.73 
 
 		 482 aa  316  6e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0281229  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0971  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.73 
 
 		 482 aa  316  7e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1038  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.73 
 
 		 482 aa  316  7e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0988  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  38.86 
 
 		 491 aa  316  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1116  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  40.73 
 
 		 482 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000271146 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2340  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.95 
 
 		 472 aa  314  2.9999999999999996e-84  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1115  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  35.83 
 
 		 491 aa  312  1e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1459  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.06 
 
 		 483 aa  312  1e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.257317  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0659  permease of the major facilitator superfamily  37.13 
 
 		 683 aa  310  5e-83  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1383  major facilitator superfamily permease  39.37 
 
 		 519 aa  310  5e-83  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.601618  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06270  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.38 
 
 		 490 aa  304  2.0000000000000002e-81  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0326  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.67 
 
 		 490 aa  298  2e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2424  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.91 
 
 		 496 aa  298  2e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.153591 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0268  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.99 
 
 		 500 aa  295  2e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0312698  decreased coverage  0.00157172 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2488  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.25 
 
 		 479 aa  291  2e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2440  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.25 
 
 		 479 aa  291  2e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1707  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.5 
 
 		 499 aa  291  3e-77  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00395265  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1880  major facilitator superfamily permease  39.02 
 
 		 503 aa  288  2e-76  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0161  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.07 
 
 		 494 aa  288  2e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0100  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.13 
 
 		 524 aa  284  3.0000000000000004e-75  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1378  major facilitator superfamily permease  34.62 
 
 		 512 aa  270  5e-71  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0602023  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2761  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.86 
 
 		 545 aa  270  5.9999999999999995e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000648651  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0845  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.94 
 
 		 489 aa  269  8.999999999999999e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.222515  normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3099  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.06 
 
 		 491 aa  268  2e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02600  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.33 
 
 		 505 aa  265  1e-69  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1686  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.92 
 
 		 620 aa  264  4e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.892029  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30030  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.9 
 
 		 487 aa  262  1e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00171806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05820  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.41 
 
 		 510 aa  253  7e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.835158  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0998  putative permease  31.06 
 
 		 548 aa  253  8.000000000000001e-66  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0354  drug resistance MFS transporter, drug:H+ antiporter-2 (14 Spanner) (DHA2) family protein  35.15 
 
 		 542 aa  250  6e-65  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5520  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.5 
 
 		 502 aa  247  4.9999999999999997e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1318  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.91 
 
 		 465 aa  246  6.999999999999999e-64  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11090  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.54 
 
 		 640 aa  241  2e-62  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000431734  normal  1 
 
 
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NC_013169  Ksed_14700  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.33 
 
 		 491 aa  240  5e-62  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0438074  normal  0.116411 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0033  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.86 
 
 		 541 aa  239  1e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1972  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.29 
 
 		 510 aa  238  3e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.073103  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3361  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.28 
 
 		 492 aa  237  6e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1573  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.79 
 
 		 529 aa  235  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009441  Fjoh_4904  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.54 
 
 		 529 aa  232  2e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5403  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.09 
 
 		 537 aa  231  2e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011145  AnaeK_2290  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.49 
 
 		 529 aa  231  2e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.192526  n/a   
 
 
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NC_014151  Cfla_1298  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.02 
 
 		 500 aa  230  6e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.000893352  hitchhiker  0.00471574 
 
 
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NC_013170  Ccur_08630  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30 
 
 		 509 aa  230  6e-59  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.315329 
 
 
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NC_011891  A2cp1_2378  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.29 
 
 		 529 aa  229  1e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013037  Dfer_2019  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.21 
 
 		 524 aa  227  5.0000000000000005e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013739  Cwoe_3300  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.27 
 
 		 501 aa  225  1e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.17007  normal  1 
 
 
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NC_010681  Bphyt_3951  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.42 
 
 		 520 aa  224  3e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.909778  normal  1 
 
 
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NC_013132  Cpin_5006  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.96 
 
 		 513 aa  224  4e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.328138  hitchhiker  0.00378398 
 
 
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NC_013204  Elen_2756  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.8 
 
 		 471 aa  224  4.9999999999999996e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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