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for query gene LACR_1383 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



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Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_1383  major facilitator superfamily permease  100 
 
 
519 aa  1034    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.601618  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1707  EmrB/QacA family drug resistance transporter  56.28 
 
 
499 aa  553  1e-156  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00395265  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1378  major facilitator superfamily permease  50.88 
 
 
512 aa  504  1e-141  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0602023  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1880  major facilitator superfamily permease  48.8 
 
 
503 aa  454  1.0000000000000001e-126  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0877  major facilitator superfamily permease  45.44 
 
 
496 aa  427  1e-118  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.192576  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1519  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.38 
 
 
502 aa  420  1e-116  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0725  major facilitator superfamily permease  43.03 
 
 
490 aa  400  9.999999999999999e-111  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.29773 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2428  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.46 
 
 
561 aa  303  5.000000000000001e-81  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0683901  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1833  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.33 
 
 
564 aa  296  8e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0281974  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2448  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.39 
 
 
570 aa  295  1e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1944  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.43 
 
 
658 aa  293  7e-78  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3230  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  35.9 
 
 
492 aa  292  9e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3240  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.63 
 
 
492 aa  291  3e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3232  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  36.03 
 
 
513 aa  290  3e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2922  multidrug resistance protein B  35.83 
 
 
492 aa  290  5.0000000000000004e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2994  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.63 
 
 
492 aa  289  7e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.218586  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3223  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.63 
 
 
492 aa  289  7e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0356226  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4299  multidrug resistance protein B  39.4 
 
 
599 aa  288  1e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.649426  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2440  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.94 
 
 
479 aa  288  1e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2488  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.94 
 
 
479 aa  288  1e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4464  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.94 
 
 
599 aa  288  2e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.737474  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2982  multidrug resistance protein B  35.83 
 
 
492 aa  288  2e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4812  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.94 
 
 
599 aa  288  2e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.127812  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4683  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  38.94 
 
 
599 aa  288  2e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.74665e-44 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22510  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.42 
 
 
494 aa  288  2e-76  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.319093  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2014  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  35.22 
 
 
513 aa  288  2e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2909  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.83 
 
 
635 aa  288  2e-76  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000610887  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3254  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39 
 
 
579 aa  288  2e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4310  multidrug resistance protein B  38.94 
 
 
599 aa  287  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3251  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  35.63 
 
 
492 aa  287  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4399  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.32 
 
 
597 aa  287  2.9999999999999996e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00696651  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4676  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  39.17 
 
 
599 aa  286  4e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00195609  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4692  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  39.17 
 
 
599 aa  286  5.999999999999999e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000143582  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0561  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  38.64 
 
 
599 aa  286  8e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000151463  hitchhiker  0.00000000000000678179 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4699  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.57 
 
 
599 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0449963  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2937  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.02 
 
 
492 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.486174  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1863  major facilitator superfamily permease  37.24 
 
 
465 aa  278  2e-73  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0147099  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2739  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.87 
 
 
482 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000169232  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3194  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.07 
 
 
484 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.794509  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1766  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.42 
 
 
479 aa  270  4e-71  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.239731  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2340  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.94 
 
 
472 aa  267  2.9999999999999995e-70  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2198  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.54 
 
 
481 aa  261  1e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0460557  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2236  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.54 
 
 
481 aa  261  1e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.126562  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2422  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.35 
 
 
643 aa  258  2e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.845412  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2376  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.35 
 
 
643 aa  258  2e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2489  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.55 
 
 
657 aa  246  4.9999999999999997e-64  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0988  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  34.93 
 
 
491 aa  239  9e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0949  permease, general substrate transporter  37.74 
 
 
482 aa  237  4e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000025972  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1003  lincomycin resistance protein LmrB  35.33 
 
 
480 aa  236  6e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.2001  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0734  lincomycin resistance protein  35.33 
 
 
480 aa  236  6e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.498733  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0845  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.95 
 
 
491 aa  236  6e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0959  permease, general substrate transporter  37.53 
 
 
482 aa  236  7e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0281229  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0971  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.64 
 
 
482 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1038  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.64 
 
 
482 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1116  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  36.84 
 
 
482 aa  236  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000271146 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0888  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.75 
 
 
486 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0944  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.75 
 
 
486 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1028  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  34.32 
 
 
491 aa  233  6e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.10576e-22 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1115  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  34.39 
 
 
491 aa  233  9e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4325  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  33.68 
 
 
491 aa  233  9e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0659  permease of the major facilitator superfamily  30.42 
 
 
683 aa  229  8e-59  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1468  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.69 
 
 
491 aa  225  1e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.986472  normal  0.151461 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1459  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.05 
 
 
483 aa  223  6e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.257317  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2667  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.64 
 
 
485 aa  215  1.9999999999999998e-54  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0905281  normal  0.424193 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2424  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.3 
 
 
496 aa  214  2.9999999999999995e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.153591 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06270  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.63 
 
 
490 aa  214  3.9999999999999995e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1318  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.58 
 
 
465 aa  210  5e-53  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0998  putative permease  32.71 
 
 
548 aa  209  9e-53  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08630  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.05 
 
 
509 aa  209  1e-52  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.315329 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1853  major facilitator superfamily permease  32.08 
 
 
471 aa  207  4e-52  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0354  drug resistance MFS transporter, drug:H+ antiporter-2 (14 Spanner) (DHA2) family protein  31 
 
 
542 aa  206  7e-52  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0268  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.43 
 
 
500 aa  204  4e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0312698  decreased coverage  0.00157172 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2756  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.77 
 
 
471 aa  203  6e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1686  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.88 
 
 
620 aa  197  3e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.892029  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0326  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.17 
 
 
490 aa  197  4.0000000000000005e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0161  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.43 
 
 
494 aa  196  1e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2324  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.86 
 
 
534 aa  194  3e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.937948  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1423  major facilitator superfamily permease  32.84 
 
 
464 aa  194  5e-48  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.904673  hitchhiker  0.0000661431 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0360  major facilitator transporter  31.49 
 
 
461 aa  192  2e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1298  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.94 
 
 
500 aa  191  2e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.000893352  hitchhiker  0.00471574 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1299  major facilitator transporter  30.46 
 
 
479 aa  191  4e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3099  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.29 
 
 
491 aa  184  5.0000000000000004e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05820  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.87 
 
 
510 aa  179  1e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.835158  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30030  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.91 
 
 
487 aa  177  5e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00171806  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0100  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.13 
 
 
524 aa  177  6e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2326  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.12 
 
 
579 aa  177  6e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000685947  hitchhiker  0.0026086 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.92 
 
 
514 aa  175  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11090  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.92 
 
 
640 aa  175  1.9999999999999998e-42  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000431734  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0033  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.83 
 
 
541 aa  175  1.9999999999999998e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_013530  Xcel_3361  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.28 
 
 
492 aa  173  5.999999999999999e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009513  Lreu_0947  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.3 
 
 
462 aa  173  7.999999999999999e-42  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000410718  n/a   
 
 
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NC_013172  Bfae_02600  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.27 
 
 
505 aa  172  1e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009972  Haur_2761  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.1 
 
 
545 aa  170  6e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000648651  n/a   
 
 
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NC_013169  Ksed_14700  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.97 
 
 
491 aa  166  6.9999999999999995e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0438074  normal  0.116411 
 
 
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NC_012669  Bcav_0845  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.67 
 
 
489 aa  164  3e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.222515  normal  0.167552 
 
 
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NC_013203  Apar_0425  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.08 
 
 
485 aa  160  4e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_013510  Tcur_1972  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.73 
 
 
510 aa  158  2e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.073103  n/a   
 
 
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NC_013165  Shel_23660  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.54 
 
 
461 aa  157  6e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.629317  normal  0.503051 
 
 
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NC_008531  LEUM_0963  major facilitator superfamily permease  31.36 
 
 
449 aa  154  4e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.337437  n/a   
 
 
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NC_008740  Maqu_0617  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.49 
 
 
543 aa  154  4e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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