More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0033 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_0033  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  100 
 
 		 541 aa  1069    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013510  Tcur_1972  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  58.25 
 
 		 510 aa  545  1e-154  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.073103  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1086  EmrB/QacA family drug resistance transporter  58.69 
 
 		 531 aa  543  1e-153  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.970713  normal  0.875398 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0974  EmrB/QacA family drug resistance transporter  58.1 
 
 		 534 aa  535  1e-151  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00760021 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0136  EmrB/QacA family drug resistance transporter  59.73 
 
 		 504 aa  534  1e-150  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.903569  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3619  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  57.59 
 
 		 536 aa  509  1e-143  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.591256  n/a   
 
 
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NC_013441  Gbro_0842  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  59.49 
 
 		 493 aa  493  9.999999999999999e-139  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1713  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  51.69 
 
 		 519 aa  440  9.999999999999999e-123  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0126419 
 
 
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NC_009565  TBFG_10798  multi-drug resistance integral membrane efflux protein emrB  47.07 
 
 		 540 aa  421  1e-116  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3660  EmrB/QacA family drug resistance transporter  45.88 
 
 		 558 aa  417  9.999999999999999e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2014  EmrB/QacA family drug resistance transporter  45.97 
 
 		 523 aa  417  9.999999999999999e-116  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0874  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.31 
 
 		 479 aa  366  1e-100  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0132531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1244  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.03 
 
 		 559 aa  355  1e-96  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.198291 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3300  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  42.45 
 
 		 501 aa  349  8e-95  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.17007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8102  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.48 
 
 		 509 aa  335  2e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3481  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.06 
 
 		 485 aa  329  8e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.208479  normal  0.0762295 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3341  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.98 
 
 		 517 aa  320  5e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.987085 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2086  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.96 
 
 		 491 aa  299  7e-80  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.377299  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3261  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  39.71 
 
 		 488 aa  298  2e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.27524  normal  0.337797 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4154  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.03 
 
 		 483 aa  296  6e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28210  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.55 
 
 		 467 aa  288  2e-76  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013093  Amir_2718  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.76 
 
 		 467 aa  283  4.0000000000000003e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.815638  n/a   
 
 
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NC_014165  Tbis_0947  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  42.76 
 
 		 536 aa  283  6.000000000000001e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.270463  normal  0.635286 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20770  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.59 
 
 		 473 aa  282  1e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00107879  normal  0.0501756 
 
 
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NC_009921  Franean1_6409  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.99 
 
 		 578 aa  277  4e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.438631 
 
 
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NC_011830  Dhaf_2825  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.52 
 
 		 473 aa  274  3e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.448147  n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_3635  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.82 
 
 		 463 aa  273  5.000000000000001e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013216  Dtox_2326  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.19 
 
 		 579 aa  271  2e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000685947  hitchhiker  0.0026086 
 
 
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NC_007951  Bxe_A1710  major facilitator superfamily drug efflux transporter  38.07 
 
 		 480 aa  263  6e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.460186  normal  1 
 
 
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NC_013595  Sros_2059  major facilitator superfamily drug efflux transporter  41.61 
 
 		 445 aa  261  2e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.52422  normal  0.961037 
 
 
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NC_009972  Haur_2761  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.2 
 
 		 545 aa  260  5.0000000000000005e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000648651  n/a   
 
 
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NC_007511  Bcep18194_B1271  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.28 
 
 		 484 aa  256  7e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00841234  normal  1 
 
 
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NC_007953  Bxe_C0760  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  35.45 
 
 		 461 aa  251  2e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.231673 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2324  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.37 
 
 		 534 aa  247  4e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.937948  normal  1 
 
 
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NC_010515  Bcenmc03_5732  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.07 
 
 		 475 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008061  Bcen_3795  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.07 
 
 		 475 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008543  Bcen2424_4573  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.07 
 
 		 475 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.94055  normal  1 
 
 
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NC_010552  BamMC406_4465  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.95 
 
 		 485 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.090141  normal  1 
 
 
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NC_008391  Bamb_4002  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.4 
 
 		 485 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011761  AFE_2349  multidrug resistance protein  30.79 
 
 		 561 aa  240  4e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.306519  n/a   
 
 
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NC_009921  Franean1_6823  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.03 
 
 		 558 aa  240  4e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009253  Dred_0455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.11 
 
 		 514 aa  239  1e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011206  Lferr_1984  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.51 
 
 		 511 aa  237  4e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.241117  normal  1 
 
 
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NC_008528  OEOE_0097  major facilitator superfamily permease  30.57 
 
 		 493 aa  234  2.0000000000000002e-60  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000342925  n/a   
 
 
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NC_008528  OEOE_1686  major facilitator superfamily permease  33.08 
 
 		 455 aa  234  4.0000000000000004e-60  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009380  Strop_4406  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.66 
 
 		 514 aa  233  5e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.853367 
 
 
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NC_009953  Sare_2724  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.46 
 
 		 515 aa  233  8.000000000000001e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.701538  normal  0.0103293 
 
 
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NC_013411  GYMC61_2448  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.52 
 
 		 570 aa  232  1e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_013385  Adeg_0100  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.49 
 
 		 524 aa  232  1e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011206  Lferr_1474  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.8 
 
 		 510 aa  230  5e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.942704  normal  1 
 
 
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NC_011761  AFE_1797  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  31.8 
 
 		 503 aa  230  6e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009674  Bcer98_3254  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.08 
 
 		 579 aa  229  7e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010086  Bmul_4070  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.87 
 
 		 484 aa  229  8e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011772  BCG9842_B0561  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  32.41 
 
 		 599 aa  229  1e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000151463  hitchhiker  0.00000000000000678179 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1415  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.41 
 
 		 475 aa  229  1e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00176967  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2635  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.75 
 
 		 520 aa  229  1e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.723891  n/a   
 
 
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NC_003909  BCE_4699  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.92 
 
 		 599 aa  227  4e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0449963  n/a   
 
 
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NC_009428  Rsph17025_2256  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.95 
 
 		 507 aa  227  5.0000000000000005e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0484017  normal  0.408162 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4310  multidrug resistance protein B  32.46 
 
 		 599 aa  226  6e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4464  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.46 
 
 		 599 aa  226  7e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.737474  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4812  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.46 
 
 		 599 aa  226  7e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.127812  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4683  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  32.46 
 
 		 599 aa  226  8e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.74665e-44 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1604  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.85 
 
 		 515 aa  226  1e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2238  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  33.63 
 
 		 507 aa  225  1e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.382837  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2706  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.86 
 
 		 537 aa  226  1e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4676  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  31.99 
 
 		 599 aa  224  2e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00195609  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.42 
 
 		 515 aa  225  2e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.383083  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4299  multidrug resistance protein B  31.99 
 
 		 599 aa  225  2e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.649426  n/a   
 
 
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NC_009049  Rsph17029_0913  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.63 
 
 		 507 aa  225  2e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.31457 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4692  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  31.99 
 
 		 599 aa  224  2e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000143582  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7638  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.38 
 
 		 501 aa  225  2e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4399  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.99 
 
 		 597 aa  224  4e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00696651  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1919  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.2 
 
 		 513 aa  222  9.999999999999999e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0639753  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1842  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.12 
 
 		 516 aa  222  9.999999999999999e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2184  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  30.12 
 
 		 514 aa  222  9.999999999999999e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.208618  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0659  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.63 
 
 		 517 aa  222  1.9999999999999999e-56  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.372094  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1202  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.64 
 
 		 536 aa  222  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00417242  normal  0.367186 
 
 
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NC_010505  Mrad2831_3614  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.21 
 
 		 554 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.315479  normal  0.0101645 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3092  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.24 
 
 		 506 aa  219  8.999999999999998e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.34 
 
 		 521 aa  219  1e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012793  GWCH70_1833  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.75 
 
 		 564 aa  216  8e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0281974  n/a   
 
 
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NC_009487  SaurJH9_2440  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.69 
 
 		 479 aa  216  9.999999999999999e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009632  SaurJH1_2488  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.69 
 
 		 479 aa  216  9.999999999999999e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011004  Rpal_0515  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.96 
 
 		 520 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008527  LACR_0629  major facilitator superfamily permease  31.15 
 
 		 436 aa  215  1.9999999999999998e-54  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.271531  n/a   
 
 
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NC_010338  Caul_2689  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.39 
 
 		 511 aa  214  2.9999999999999995e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0761069  normal  1 
 
 
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NC_003295  RSc1292  multidrug resistance B (translocase) transmembrane protein  31.3 
 
 		 518 aa  213  4.9999999999999996e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.453307  normal  1 
 
 
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NC_009654  Mmwyl1_0098  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.77 
 
 		 508 aa  213  7e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.700736  normal  1 
 
 
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NC_009436  Ent638_4110  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.76 
 
 		 475 aa  213  9e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00236277  normal  0.0163752 
 
 
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NC_013061  Phep_4262  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.93 
 
 		 515 aa  212  1e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008781  Pnap_1446  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.06 
 
 		 524 aa  211  3e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0633713  normal  1 
 
 
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NC_007517  Gmet_1374  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.16 
 
 		 517 aa  211  4e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.511847  hitchhiker  0.000280107 
 
 
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NC_011145  AnaeK_2290  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.52 
 
 		 529 aa  210  5e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.192526  n/a   
 
 
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NC_008322  Shewmr7_1875  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.27 
 
 		 527 aa  210  5e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.994657 
 
 
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NC_008577  Shewana3_2224  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.13 
 
 		 526 aa  210  5e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.264069  normal  0.72348 
 
 
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NC_008528  OEOE_0877  major facilitator superfamily permease  29.14 
 
 		 496 aa  210  6e-53  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.192576  n/a   
 
 
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NC_007964  Nham_0615  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.98 
 
 		 518 aa  210  7e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0683738  n/a   
 
 
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NC_008321  Shewmr4_2099  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.27 
 
 		 527 aa  209  7e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.710397 
 
 
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NC_008009  Acid345_1476  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.17 
 
 		 530 aa  209  8e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008048  Sala_2083  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.26 
 
 		 529 aa  209  9e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.438087  normal  0.890804 
 
 
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