More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_05820 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



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Alignment on homolog gene
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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_05820  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  100 
 
 		 510 aa  981    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.835158  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06270  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  50 
 
 		 490 aa  412  1e-113  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0268  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  49.89 
 
 		 500 aa  406  1.0000000000000001e-112  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0312698  decreased coverage  0.00157172 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2424  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  46.94 
 
 		 496 aa  406  1.0000000000000001e-112  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.153591 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0845  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  47.39 
 
 		 489 aa  375  1e-103  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.222515  normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0161  EmrB/QacA family drug resistance transporter  48.87 
 
 		 494 aa  377  1e-103  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0326  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  46.36 
 
 		 490 aa  378  1e-103  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30030  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  46.95 
 
 		 487 aa  359  8e-98  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00171806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3361  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  47.47 
 
 		 492 aa  345  1e-93  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02600  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  47.37 
 
 		 505 aa  342  9e-93  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1298  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  46.29 
 
 		 500 aa  340  2.9999999999999998e-92  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.000893352  hitchhiker  0.00471574 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0734  lincomycin resistance protein  38.7 
 
 		 480 aa  340  4e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.498733  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1003  lincomycin resistance protein LmrB  38.7 
 
 		 480 aa  340  5e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.2001  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3099  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  46.47 
 
 		 491 aa  337  3.9999999999999995e-91  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14700  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  45.13 
 
 		 491 aa  325  1e-87  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0438074  normal  0.116411 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5520  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  44.05 
 
 		 502 aa  325  1e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0949  permease, general substrate transporter  40.38 
 
 		 482 aa  325  2e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000025972  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0959  permease, general substrate transporter  40.38 
 
 		 482 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0281229  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1116  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  40.17 
 
 		 482 aa  320  5e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000271146 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0971  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.53 
 
 		 482 aa  319  6e-86  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1038  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.53 
 
 		 482 aa  319  6e-86  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1459  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.08 
 
 		 483 aa  316  8e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.257317  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3194  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.11 
 
 		 484 aa  297  3e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.794509  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2739  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.77 
 
 		 482 aa  297  3e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000169232  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2937  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.95 
 
 		 492 aa  296  4e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.486174  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3240  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.87 
 
 		 492 aa  296  5e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0988  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  37.53 
 
 		 491 aa  296  9e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3232  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  36.53 
 
 		 513 aa  296  9e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1028  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  37.61 
 
 		 491 aa  294  2e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.10576e-22 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1115  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  38.36 
 
 		 491 aa  293  5e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4325  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  38.16 
 
 		 491 aa  292  8e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2014  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  36.33 
 
 		 513 aa  292  1e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2922  multidrug resistance protein B  36.27 
 
 		 492 aa  291  1e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0845  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.07 
 
 		 491 aa  291  1e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0888  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.03 
 
 		 486 aa  291  2e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2909  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.73 
 
 		 635 aa  291  2e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000610887  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22510  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.73 
 
 		 494 aa  291  2e-77  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.319093  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0944  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.03 
 
 		 486 aa  291  2e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2982  multidrug resistance protein B  36.36 
 
 		 492 aa  290  6e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1468  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.2 
 
 		 491 aa  290  6e-77  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.986472  normal  0.151461 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3251  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  38.27 
 
 		 492 aa  289  7e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3230  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  36.07 
 
 		 492 aa  289  8e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2994  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.27 
 
 		 492 aa  288  1e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.218586  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3223  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.27 
 
 		 492 aa  288  1e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0356226  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1944  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.49 
 
 		 658 aa  280  3e-74  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2340  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.39 
 
 		 472 aa  278  2e-73  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2428  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.05 
 
 		 561 aa  275  1.0000000000000001e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0683901  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2236  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.03 
 
 		 481 aa  268  1e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.126562  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2198  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.03 
 
 		 481 aa  268  1e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0460557  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1766  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.61 
 
 		 479 aa  261  2e-68  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.239731  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1833  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.94 
 
 		 564 aa  259  1e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0281974  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2448  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.65 
 
 		 570 aa  258  2e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0877  major facilitator superfamily permease  33.89 
 
 		 496 aa  258  2e-67  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.192576  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2422  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.14 
 
 		 643 aa  257  3e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.845412  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2376  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.14 
 
 		 643 aa  257  3e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2440  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.92 
 
 		 479 aa  256  6e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2488  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.92 
 
 		 479 aa  256  6e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2489  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.16 
 
 		 657 aa  253  8.000000000000001e-66  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0725  major facilitator superfamily permease  32.56 
 
 		 490 aa  248  2e-64  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.29773 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1519  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.56 
 
 		 502 aa  244  1.9999999999999999e-63  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3254  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.26 
 
 		 579 aa  244  3e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0659  permease of the major facilitator superfamily  32.83 
 
 		 683 aa  243  7e-63  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0561  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  32.06 
 
 		 599 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000151463  hitchhiker  0.00000000000000678179 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4699  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.94 
 
 		 599 aa  240  5e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0449963  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4399  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.33 
 
 		 597 aa  232  1e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00696651  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4683  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  33.09 
 
 		 599 aa  231  2e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.74665e-44 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4310  multidrug resistance protein B  32.85 
 
 		 599 aa  231  3e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4464  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.85 
 
 		 599 aa  230  4e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.737474  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4299  multidrug resistance protein B  33.09 
 
 		 599 aa  230  4e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.649426  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4812  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.85 
 
 		 599 aa  230  4e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.127812  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4676  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  32.85 
 
 		 599 aa  230  5e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00195609  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4692  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  32.85 
 
 		 599 aa  229  7e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000143582  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1863  major facilitator superfamily permease  31.71 
 
 		 465 aa  226  7e-58  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0147099  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0354  drug resistance MFS transporter, drug:H+ antiporter-2 (14 Spanner) (DHA2) family protein  32.51 
 
 		 542 aa  224  2e-57  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1880  major facilitator superfamily permease  31.31 
 
 		 503 aa  217  4e-55  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1318  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.5 
 
 		 465 aa  216  9.999999999999999e-55  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1299  major facilitator transporter  31.86 
 
 		 479 aa  211  3e-53  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0998  putative permease  32.11 
 
 		 548 aa  210  6e-53  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1686  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.96 
 
 		 620 aa  209  1e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.892029  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1707  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.8 
 
 		 499 aa  207  2e-52  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00395265  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2667  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.42 
 
 		 485 aa  201  1.9999999999999998e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0905281  normal  0.424193 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08630  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.33 
 
 		 509 aa  199  1.0000000000000001e-49  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.315329 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27290  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.93 
 
 		 628 aa  197  3e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0425  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.25 
 
 		 485 aa  196  8.000000000000001e-49  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1853  major facilitator superfamily permease  29 
 
 		 471 aa  194  2e-48  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007644  Moth_2324  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.03 
 
 		 534 aa  192  2e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.937948  normal  1 
 
 
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NC_008530  LGAS_1423  major facilitator superfamily permease  29.44 
 
 		 464 aa  191  2e-47  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.904673  hitchhiker  0.0000661431 
 
 
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NC_009972  Haur_2761  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.26 
 
 		 545 aa  190  5.999999999999999e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000648651  n/a   
 
 
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NC_013216  Dtox_2326  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.96 
 
 		 579 aa  186  9e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000685947  hitchhiker  0.0026086 
 
 
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NC_013170  Ccur_11090  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.11 
 
 		 640 aa  185  2.0000000000000003e-45  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000431734  normal  1 
 
 
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NC_008528  OEOE_1378  major facilitator superfamily permease  26.64 
 
 		 512 aa  185  2.0000000000000003e-45  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0602023  n/a   
 
 
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NC_013204  Elen_0190  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.57 
 
 		 625 aa  184  4.0000000000000006e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013204  Elen_2756  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.13 
 
 		 471 aa  183  7e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009513  Lreu_0360  major facilitator transporter  28.69 
 
 		 461 aa  182  1e-44  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010816  BLD_0049  sugar efflux permease  29.77 
 
 		 485 aa  179  1e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.242248  n/a   
 
 
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NC_008527  LACR_1383  major facilitator superfamily permease  28.87 
 
 		 519 aa  179  1e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.601618  n/a   
 
 
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NC_009253  Dred_0455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.04 
 
 		 514 aa  177  4e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009513  Lreu_0947  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.81 
 
 		 462 aa  177  6e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000410718  n/a   
 
 
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NC_008528  OEOE_0290  major facilitator superfamily permease  28.73 
 
 		 463 aa  175  1.9999999999999998e-42  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.146864  n/a   
 
 
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NC_008699  Noca_0136  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.18 
 
 		 504 aa  172  1e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.903569  n/a   
 
 
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