More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_08630 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013170  Ccur_08630  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  100 
 
 
509 aa  1019    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.315329 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2667  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  43.14 
 
 
485 aa  350  3e-95  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0905281  normal  0.424193 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0877  major facilitator superfamily permease  35.76 
 
 
496 aa  283  4.0000000000000003e-75  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.192576  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1519  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.44 
 
 
502 aa  271  2e-71  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2489  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.05 
 
 
657 aa  270  2.9999999999999997e-71  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0725  major facilitator superfamily permease  31.48 
 
 
490 aa  266  8e-70  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.29773 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22510  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.27 
 
 
494 aa  259  8e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.319093  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2340  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.85 
 
 
472 aa  256  7e-67  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3232  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  31.58 
 
 
513 aa  253  5.000000000000001e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3240  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.58 
 
 
492 aa  252  9.000000000000001e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2994  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.58 
 
 
492 aa  251  2e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.218586  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3223  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.58 
 
 
492 aa  251  2e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0356226  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2014  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  33.17 
 
 
513 aa  251  2e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2937  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.58 
 
 
492 aa  251  2e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.486174  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2922  multidrug resistance protein B  31.37 
 
 
492 aa  250  3e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3230  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  33.41 
 
 
492 aa  250  4e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2982  multidrug resistance protein B  31.37 
 
 
492 aa  249  7e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2428  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.38 
 
 
561 aa  248  1e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0683901  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3251  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  31.37 
 
 
492 aa  248  2e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2909  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.66 
 
 
635 aa  244  3e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000610887  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2440  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.83 
 
 
479 aa  241  2e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2488  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.83 
 
 
479 aa  241  2e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2448  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.33 
 
 
570 aa  241  2e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1833  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.94 
 
 
564 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0281974  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1707  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.06 
 
 
499 aa  233  5e-60  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00395265  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0998  putative permease  34.47 
 
 
548 aa  233  6e-60  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1944  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.89 
 
 
658 aa  233  7.000000000000001e-60  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2236  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.24 
 
 
481 aa  231  2e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.126562  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2198  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.24 
 
 
481 aa  231  2e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0460557  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1880  major facilitator superfamily permease  33.41 
 
 
503 aa  231  3e-59  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1766  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.3 
 
 
479 aa  230  4e-59  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.239731  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0354  drug resistance MFS transporter, drug:H+ antiporter-2 (14 Spanner) (DHA2) family protein  33.62 
 
 
542 aa  229  6e-59  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11090  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.74 
 
 
640 aa  229  9e-59  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000431734  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1378  major facilitator superfamily permease  32.11 
 
 
512 aa  221  3e-56  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0602023  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1863  major facilitator superfamily permease  31.93 
 
 
465 aa  219  1e-55  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0147099  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0734  lincomycin resistance protein  32.51 
 
 
480 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.498733  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1003  lincomycin resistance protein LmrB  32.51 
 
 
480 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.2001  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3254  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.75 
 
 
579 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0561  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  30.75 
 
 
599 aa  213  9e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000151463  hitchhiker  0.00000000000000678179 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1459  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.02 
 
 
483 aa  211  3e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.257317  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2376  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.83 
 
 
643 aa  210  5e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2422  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.83 
 
 
643 aa  210  5e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.845412  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2424  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.47 
 
 
496 aa  209  7e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.153591 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0659  permease of the major facilitator superfamily  31.77 
 
 
683 aa  209  1e-52  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1383  major facilitator superfamily permease  32.05 
 
 
519 aa  208  1e-52  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.601618  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4399  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.5 
 
 
597 aa  209  1e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00696651  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4676  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  30.65 
 
 
599 aa  206  8e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00195609  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3194  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.7 
 
 
484 aa  206  9e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.794509  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4699  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.72 
 
 
599 aa  206  1e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0449963  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0949  permease, general substrate transporter  31.07 
 
 
482 aa  206  1e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000025972  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4464  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.1 
 
 
599 aa  205  2e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.737474  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4310  multidrug resistance protein B  32.1 
 
 
599 aa  205  2e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4692  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  32.1 
 
 
599 aa  204  2e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000143582  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4812  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.1 
 
 
599 aa  205  2e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.127812  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4299  multidrug resistance protein B  31.85 
 
 
599 aa  204  3e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.649426  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4683  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  31.85 
 
 
599 aa  204  3e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.74665e-44 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2739  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.28 
 
 
482 aa  202  1.9999999999999998e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000169232  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1686  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.39 
 
 
620 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.892029  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1028  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  30.96 
 
 
491 aa  201  3e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.10576e-22 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0959  permease, general substrate transporter  30.85 
 
 
482 aa  201  3.9999999999999996e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0281229  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05820  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.67 
 
 
510 aa  200  5e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.835158  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0971  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.85 
 
 
482 aa  200  5e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1038  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.85 
 
 
482 aa  200  5e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0845  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.62 
 
 
491 aa  200  6e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0988  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  30.48 
 
 
491 aa  200  6e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1116  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  30.63 
 
 
482 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000271146 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0888  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.47 
 
 
486 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0944  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.47 
 
 
486 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4325  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  30.47 
 
 
491 aa  195  1e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1468  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.02 
 
 
491 aa  194  2e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.986472  normal  0.151461 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1115  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  30.47 
 
 
491 aa  195  2e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2756  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.23 
 
 
471 aa  193  5e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06270  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.86 
 
 
490 aa  193  6e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0268  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.42 
 
 
500 aa  193  8e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0312698  decreased coverage  0.00157172 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0161  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.56 
 
 
494 aa  192  9e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0845  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.07 
 
 
489 aa  190  5.999999999999999e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.222515  normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23660  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.88 
 
 
461 aa  189  1e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.629317  normal  0.503051 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1318  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.88 
 
 
465 aa  189  1e-46  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0326  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.42 
 
 
490 aa  189  1e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30030  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.18 
 
 
487 aa  188  2e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00171806  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3099  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.34 
 
 
491 aa  187  4e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02600  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.25 
 
 
505 aa  186  8e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3361  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.1 
 
 
492 aa  177  6e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1299  major facilitator transporter  27.19 
 
 
479 aa  176  9.999999999999999e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1423  major facilitator superfamily permease  31.57 
 
 
464 aa  172  1e-41  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.904673  hitchhiker  0.0000661431 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0192  major facilitator superfamily permease  28.39 
 
 
456 aa  170  7e-41  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0546  major facilitator superfamily permease  28.12 
 
 
448 aa  166  9e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000674821  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2324  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.75 
 
 
534 aa  166  1.0000000000000001e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.937948  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2326  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.55 
 
 
579 aa  166  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000685947  hitchhiker  0.0026086 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0290  major facilitator superfamily permease  27.29 
 
 
463 aa  164  2.0000000000000002e-39  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.146864  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1972  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.86 
 
 
510 aa  164  4.0000000000000004e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.073103  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5520  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.68 
 
 
502 aa  162  1e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0360  major facilitator transporter  29.74 
 
 
461 aa  160  4e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14700  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.76 
 
 
491 aa  159  1e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0438074  normal  0.116411 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1853  major facilitator superfamily permease  27.95 
 
 
471 aa  158  2e-37  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0947  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.75 
 
 
462 aa  157  3e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000410718  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1298  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.75 
 
 
500 aa  157  4e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.000893352  hitchhiker  0.00471574 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0280  major facilitator transporter  27.68 
 
 
466 aa  150  5e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000040332  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0190  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.31 
 
 
625 aa  147  4.0000000000000006e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0100  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.51 
 
 
524 aa  146  9e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>