More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2661 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_2661  CBS domain-containing protein  100 
 
 		 156 aa  314  3e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.611003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2123  CBS domain-containing protein  31.79 
 
 		 159 aa  92  3e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00617964  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6174  CBS domain containing membrane protein  32.28 
 
 		 246 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2338  CBS domain containing membrane protein  30.32 
 
 		 247 aa  72.4  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0305  CBS domain containing membrane protein  31.79 
 
 		 147 aa  70.5  0.000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1201  CBS domain-containing protein  28.95 
 
 		 152 aa  70.5  0.000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000963836  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6307  putative signal transduction protein with CBS domains  28.57 
 
 		 229 aa  67.8  0.00000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5888  CBS domain-containing protein  33.77 
 
 		 242 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.361711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4751  CBS domain containing membrane protein  33.99 
 
 		 154 aa  67  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142923  hitchhiker  0.00000010565 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1094  signal-transduction protein  30.52 
 
 		 230 aa  67  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5821  signal-transduction protein  29.8 
 
 		 231 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.12685 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1497  CBS domain containing protein  32.12 
 
 		 845 aa  61.6  0.000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1873  hypothetical protein  28.67 
 
 		 229 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.994541 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2431  signal transduction protein  28.79 
 
 		 138 aa  60.8  0.000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1851  CBS domain containing membrane protein  26.32 
 
 		 151 aa  60.5  0.000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.309684  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2232  CBS domain containing membrane protein  26.99 
 
 		 164 aa  60.1  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.510755 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1889  signal transduction protein  28.77 
 
 		 152 aa  60.1  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1253  CBS domain-containing protein  30.14 
 
 		 150 aa  60.1  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.515572 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1801  CBS domain-containing protein  28.97 
 
 		 149 aa  58.9  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0256126  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2962  putative signal transduction protein with CBS domains  28.67 
 
 		 145 aa  58.9  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5546  CBS domain containing membrane protein  28.48 
 
 		 230 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.103522  normal  0.484256 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0576  putative signal transduction protein with CBS domains  30.82 
 
 		 152 aa  59.3  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.134096  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0964  hypothetical protein  25 
 
 		 217 aa  58.5  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1708  phosphoesterase, RecJ-like  31.58 
 
 		 904 aa  58.9  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.833662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6220  signal-transduction protein  26.9 
 
 		 230 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0976  CBS  33.33 
 
 		 909 aa  58.2  0.00000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000281258  normal  0.107884 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2805  CBS domain-containing membrane protein  28.57 
 
 		 155 aa  57.8  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2202  CBS domain-containing protein  24.16 
 
 		 152 aa  57.8  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000112787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1896  signal transduction protein  27.46 
 
 		 138 aa  57.8  0.00000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000161177 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0728  XRE family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 199 aa  57.4  0.00000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.109971  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2228  CBS domain-containing protein  27.46 
 
 		 138 aa  57.4  0.00000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1863  putative signal transduction protein with CBS domains  27.97 
 
 		 141 aa  57.4  0.00000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0278  CBS domain containing membrane protein  26.62 
 
 		 150 aa  57  0.00000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10697 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2721  putative signal transduction protein with CBS domains  27.74 
 
 		 153 aa  56.6  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0004  signal-transduction protein  29.51 
 
 		 142 aa  57  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1899  signal transduction protein  27.46 
 
 		 138 aa  57  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.288112  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1838  signal transduction protein  27.46 
 
 		 138 aa  57  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00822959 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2139  signal transduction protein  27.46 
 
 		 138 aa  57  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0162016 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1883  CBS domain-containing protein  28.76 
 
 		 154 aa  57  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1618  CBS domain-containing protein  29.25 
 
 		 138 aa  56.6  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.182055 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1766  signal transduction protein  29.63 
 
 		 138 aa  57  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0675  signal transduction protein  32.52 
 
 		 147 aa  56.2  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1495  putative signal-transduction protein with CBS domains  27.1 
 
 		 153 aa  56.2  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000649642  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4294  polynucleotide adenylyltransferase region  30.34 
 
 		 907 aa  55.8  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00498072  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2997  signal-transduction protein  29.66 
 
 		 223 aa  55.8  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3570  CBS domain-containing protein  30.13 
 
 		 246 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.212334 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0970  CBS domain-containing protein  24.09 
 
 		 155 aa  55.1  0.0000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2231  signal-transduction protein  27.74 
 
 		 188 aa  55.1  0.0000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.943647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0490  signal transduction protein  31.85 
 
 		 158 aa  54.7  0.0000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.630311  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1387  CBS domain containing protein  22.76 
 
 		 148 aa  54.7  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4929  CBS domain containing protein  26.14 
 
 		 153 aa  54.3  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.076883 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1421  polynucleotide adenylyltransferase region  30.14 
 
 		 909 aa  54.3  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1909  signal transduction protein  26.52 
 
 		 138 aa  54.3  0.0000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.597362  normal  0.0569884 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5760  hypothetical protein  31.62 
 
 		 242 aa  54.3  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.594459 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1308  putative signal transduction protein with CBS domains  24.53 
 
 		 161 aa  54.3  0.0000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1050  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  27.78 
 
 		 600 aa  54.3  0.0000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2434  CBS domain containing membrane protein  25.81 
 
 		 168 aa  53.9  0.0000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0700724 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2966  signal-transduction protein  31.45 
 
 		 132 aa  53.9  0.0000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0488  hypothetical protein  35.48 
 
 		 302 aa  53.5  0.0000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0243  signal transduction protein  29.75 
 
 		 155 aa  53.9  0.0000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2387  putative signal transduction protein with CBS domains  26.76 
 
 		 138 aa  53.5  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.851922  normal  0.155065 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3596  CBS domain-containing protein  27.92 
 
 		 241 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.247468  normal  0.0301148 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1939  signal transduction protein  26.76 
 
 		 138 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1932  signal transduction protein  26.76 
 
 		 138 aa  53.5  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.412842  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2685  signal transduction protein  28.91 
 
 		 138 aa  53.1  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2771  hypothetical protein  40 
 
 		 125 aa  53.5  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.372067 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1028  CBS domain containing membrane protein  26.55 
 
 		 226 aa  53.5  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0495705 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1203  CBS domain-containing protein  29.33 
 
 		 873 aa  53.5  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.452152  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1906  signal transduction protein  26.76 
 
 		 138 aa  53.5  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0469  CBS domain containing protein  24.18 
 
 		 138 aa  52.4  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3316  CBS domain-containing protein  24.84 
 
 		 144 aa  52.4  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00011902  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1916  CBS domain containing membrane protein  49.06 
 
 		 219 aa  52.4  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.683041  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0303  signal transduction protein  28.77 
 
 		 320 aa  52.8  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.123815  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0640  CBS domain-containing protein  30.77 
 
 		 150 aa  53.1  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1703  CBS domain containing membrane protein  26.32 
 
 		 148 aa  52.8  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.311156  normal  0.0624027 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1197  signal-transduction protein  33.78 
 
 		 280 aa  52.8  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.749795  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1004  CBS domain-containing protein  25.53 
 
 		 149 aa  52.4  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00024412  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2388  Polynucleotide adenylyltransferase region  30.14 
 
 		 903 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.991166 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1712  CBS domain-containing protein  28 
 
 		 131 aa  52  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3742  Polynucleotide adenylyltransferase region  31.43 
 
 		 903 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1462  putative signal transduction protein with CBS domains  23.08 
 
 		 145 aa  51.6  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0493403  normal  0.625814 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1882  CBS domain-containing protein  28.87 
 
 		 149 aa  51.6  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000211918  hitchhiker  0.00000438045 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1341  CBS domain-containing protein  27.03 
 
 		 154 aa  51.6  0.000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1933  CBS domain-containing protein  23.6 
 
 		 228 aa  51.6  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.316651  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0803  signal transduction protein  25.93 
 
 		 160 aa  51.6  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.708068  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0264  CBS domain-containing protein  24.49 
 
 		 153 aa  51.6  0.000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3792  Polynucleotide adenylyltransferase region  31.43 
 
 		 903 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3355  CBS domain-containing protein  30.5 
 
 		 134 aa  51.6  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0383  putative signal transduction protein with CBS domains  33.33 
 
 		 149 aa  50.8  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0412615  normal  0.799719 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1446  signal transduction protein  27.46 
 
 		 138 aa  50.8  0.000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.697131  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2260  CBS domain-containing protein  27.97 
 
 		 150 aa  50.8  0.000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000586041  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0680  hypothetical protein  31.16 
 
 		 249 aa  51.2  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.480825 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2046  CBS  25.49 
 
 		 150 aa  50.8  0.000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.455097  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2064  hypothetical protein  26.49 
 
 		 139 aa  50.4  0.000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.769911  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1506  CBS domain-containing protein  26.12 
 
 		 138 aa  50.4  0.000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1032  putative signal transduction protein with CBS domains  23.68 
 
 		 149 aa  50.4  0.000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0368077  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1262  CBS domain containing membrane protein  25.87 
 
 		 149 aa  50.4  0.000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00178252  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2021  CBS domain containing membrane protein  22.35 
 
 		 164 aa  49.7  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0656  CBS domain containing protein  35.09 
 
 		 142 aa  50.1  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1902  CBS domain-containing protein  26.17 
 
 		 231 aa  50.1  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>