More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2966 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_2966  signal-transduction protein  100 
 
 		 132 aa  265  2e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0171  signal transduction protein  57.58 
 
 		 132 aa  162  1.0000000000000001e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.900499  normal  0.567274 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1203  CBS domain-containing protein  39.1 
 
 		 873 aa  77.4  0.00000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.452152  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2338  CBS domain containing membrane protein  34.97 
 
 		 247 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5821  signal-transduction protein  32.85 
 
 		 231 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.12685 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1497  CBS domain containing protein  36.36 
 
 		 845 aa  73.9  0.0000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1933  CBS domain-containing protein  32.87 
 
 		 228 aa  72.8  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.316651  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0393  CBS domain-containing membrane protein  35 
 
 		 193 aa  72.4  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.464074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1812  CBS domain containing membrane protein  37.39 
 
 		 132 aa  72.8  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5546  CBS domain containing membrane protein  29.37 
 
 		 230 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.103522  normal  0.484256 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3021  CBS domain containing membrane protein  32.24 
 
 		 149 aa  71.2  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1094  signal-transduction protein  32.87 
 
 		 230 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1912  signal-transduction protein  29.58 
 
 		 242 aa  69.3  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0206039  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1262  CBS domain containing membrane protein  31.58 
 
 		 149 aa  68.2  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00178252  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17480  predicted signal-transduction protein containing cAMP-binding and CBS domains  30.71 
 
 		 191 aa  68.6  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6220  signal-transduction protein  30.07 
 
 		 230 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4814  CBS domain containing membrane protein  32.35 
 
 		 226 aa  68.6  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6174  CBS domain containing membrane protein  30.77 
 
 		 246 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5760  hypothetical protein  28.17 
 
 		 242 aa  67.8  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.594459 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1344  putative signal-transduction protein with CBS domains  29.58 
 
 		 243 aa  67.8  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2087  Polynucleotide adenylyltransferase region  38.84 
 
 		 877 aa  67.4  0.00000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.625204 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0891  polynucleotide adenylyltransferase region  36.51 
 
 		 883 aa  67  0.00000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1310  CBS  39.68 
 
 		 213 aa  66.2  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.239794  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1873  hypothetical protein  28.17 
 
 		 229 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.994541 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3591  Chloride channel core  34.13 
 
 		 875 aa  65.5  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0274826 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5888  CBS domain-containing protein  29.86 
 
 		 242 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.361711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1302  CBS domain containing protein  30 
 
 		 769 aa  65.9  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1143  signal-transduction protein  33.33 
 
 		 138 aa  65.9  0.0000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.430444 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0149  CBS domain containing protein  32.79 
 
 		 377 aa  65.1  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0113637 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1614  CBS domain containing membrane protein  27.73 
 
 		 155 aa  65.1  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.267585  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2997  signal-transduction protein  27.94 
 
 		 223 aa  64.7  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1028  CBS domain containing membrane protein  34.72 
 
 		 226 aa  64.7  0.0000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0495705 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0243  signal transduction protein  32.21 
 
 		 155 aa  64.7  0.0000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1032  putative signal transduction protein with CBS domains  29.05 
 
 		 149 aa  64.3  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0368077  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2680  Chloride channel core  34.15 
 
 		 879 aa  63.9  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1883  CBS domain-containing protein  27.27 
 
 		 154 aa  63.9  0.0000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3436  Chloride channel core  34.15 
 
 		 879 aa  63.9  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4051  signal-transduction protein  25.35 
 
 		 242 aa  63.5  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4216  Chloride channel core  31.2 
 
 		 863 aa  63.9  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.298005 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1762  signal-transduction protein  33.33 
 
 		 139 aa  62.8  0.000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3570  CBS domain-containing protein  31.29 
 
 		 246 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.212334 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0304  signal transduction protein  26.15 
 
 		 261 aa  62.8  0.000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.123702  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4725  putative signal transduction protein with CBS domains  25.85 
 
 		 243 aa  62.8  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2162  Cl- channel, voltage gated  32.23 
 
 		 862 aa  62  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.30551 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1552  CBS domain-containing protein  31.97 
 
 		 378 aa  62  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.651546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0591  signal-transduction protein  33.06 
 
 		 155 aa  62  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0331315  normal  0.426072 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1023  hypothetical protein  27.97 
 
 		 243 aa  62  0.000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1695  CBS domain-containing protein  34.15 
 
 		 885 aa  61.6  0.000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1365  signal-transduction protein  26.76 
 
 		 243 aa  61.6  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.831809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1947  signal-transduction protein  28.47 
 
 		 226 aa  62  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.489577  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07150  CBS domain containing protein  36.97 
 
 		 865 aa  61.6  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0367477  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0677  signal transduction protein  30.95 
 
 		 399 aa  62  0.000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0684  polynucleotide adenylyltransferase region  31.09 
 
 		 877 aa  62  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0264  CBS domain-containing protein  30.72 
 
 		 153 aa  61.2  0.000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1882  CBS domain-containing protein  27.03 
 
 		 149 aa  61.6  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000211918  hitchhiker  0.00000438045 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0172  homoserine O-acetyltransferase  27.43 
 
 		 492 aa  61.2  0.000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2202  CBS domain-containing protein  26.21 
 
 		 152 aa  61.2  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000112787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0364  signal-transduction protein  31.67 
 
 		 139 aa  61.2  0.000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.612757 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1588  CBS  30.58 
 
 		 859 aa  60.8  0.000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.497223  normal  0.185787 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2791  hypothetical protein  30.23 
 
 		 141 aa  61.2  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.402578  normal  0.193338 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1703  CBS domain containing membrane protein  26.43 
 
 		 148 aa  61.2  0.000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.311156  normal  0.0624027 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2915  Chloride channel core  33.61 
 
 		 897 aa  60.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1420  polyA polymerase family protein  32.5 
 
 		 880 aa  60.5  0.000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0185526  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3428  Polynucleotide adenylyltransferase region  32.46 
 
 		 873 aa  60.5  0.000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000799776  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0680  hypothetical protein  26.67 
 
 		 249 aa  60.1  0.000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.480825 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1902  CBS domain-containing protein  31.47 
 
 		 231 aa  59.7  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1253  CBS domain-containing protein  27.59 
 
 		 150 aa  59.7  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.515572 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1004  CBS domain-containing protein  26.21 
 
 		 149 aa  59.3  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00024412  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1851  CBS domain-containing protein  37.27 
 
 		 120 aa  59.3  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2240  signal transduction protein  29.73 
 
 		 153 aa  59.3  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1217  CBS domain-containing protein  32.17 
 
 		 143 aa  58.5  0.00000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2046  CBS  28.47 
 
 		 150 aa  58.5  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.455097  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3268  CBS domain-containing protein  31.31 
 
 		 142 aa  58.5  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4019  hypothetical protein  28.19 
 
 		 339 aa  58.2  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.191976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1332  signal-transduction protein  30 
 
 		 139 aa  58.5  0.00000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.660277  normal  0.443449 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1801  CBS domain-containing protein  29.93 
 
 		 149 aa  58.2  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0256126  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0215  CBS domain-containing protein  31.67 
 
 		 863 aa  57.8  0.00000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0576  putative signal transduction protein with CBS domains  29.05 
 
 		 152 aa  57.8  0.00000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.134096  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0305  CBS domain containing membrane protein  26.21 
 
 		 147 aa  57.8  0.00000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0278  CBS domain containing membrane protein  25.52 
 
 		 150 aa  57.4  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10697 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4294  polynucleotide adenylyltransferase region  32.48 
 
 		 907 aa  57  0.00000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00498072  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2008  CBS  29.03 
 
 		 330 aa  57  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2537  putative signal transduction protein with CBS domains  33.01 
 
 		 143 aa  57  0.00000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.482232 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2262  CBS domain-containing protein  33.01 
 
 		 143 aa  57  0.00000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.175418 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2219  putative signal-transduction protein with CBS domains  33.01 
 
 		 143 aa  57  0.00000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0827472 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2097  CBS domain containing protein  33.33 
 
 		 209 aa  56.6  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0613  peptidase M50  28.93 
 
 		 377 aa  56.6  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0236174 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6307  putative signal transduction protein with CBS domains  26.76 
 
 		 229 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2320  CBS domain-containing protein  24.84 
 
 		 150 aa  56.6  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000465345  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2980  signal transduction protein  29.79 
 
 		 423 aa  56.2  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1885  signal-transduction protein  34.13 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2805  CBS domain-containing membrane protein  28.86 
 
 		 155 aa  56.6  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1879  CBS  27.89 
 
 		 157 aa  55.5  0.0000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1228  signal-transduction protein  28.86 
 
 		 339 aa  55.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1643  signal transduction protein  26.67 
 
 		 413 aa  55.8  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2707  signal-transduction protein  33.33 
 
 		 141 aa  55.8  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.44759 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2666  putative signal transduction protein with CBS domains  35.54 
 
 		 252 aa  55.5  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0113422  normal  0.552797 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1131  polynucleotide adenylyltransferase region  31.3 
 
 		 907 aa  55.8  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00727527  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1605  CBS domain-containing protein  31.4 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0675  signal transduction protein  27.52 
 
 		 153 aa  56.2  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.302021  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>