More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_2680 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014248  Aazo_1877  Cl- channel voltage-gated family protein  49.88 
 
 
859 aa  801    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4216  Chloride channel core  52.22 
 
 
863 aa  796    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.298005 
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5334  Cl- channel voltage-gated family protein  50.59 
 
 
863 aa  834    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.817477  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2162  Cl- channel, voltage gated  52.75 
 
 
862 aa  815    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.30551 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2680  Chloride channel core  100 
 
 
879 aa  1762    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2915  Chloride channel core  49.83 
 
 
897 aa  721    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3436  Chloride channel core  100 
 
 
879 aa  1762    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3591  Chloride channel core  64.77 
 
 
875 aa  1110    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0274826 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1588  CBS  42.4 
 
 
859 aa  517  1.0000000000000001e-145  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.497223  normal  0.185787 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1794  putative chloride channel  31.31 
 
 
452 aa  190  1e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18921  putative chloride channel  31.22 
 
 
452 aa  188  4e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19111  putative chloride channel  31.07 
 
 
452 aa  188  4e-46  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18921  putative chloride channel  30.53 
 
 
452 aa  184  4.0000000000000006e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.708029  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2297  putative chloride channel  32.04 
 
 
460 aa  179  2e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.73973  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3525  Chloride channel core  32.44 
 
 
533 aa  171  4e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3482  Cl- channel, voltage-gated family protein  28.54 
 
 
582 aa  172  4e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18351  putative chloride channel  32.29 
 
 
452 aa  171  5e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A25  chloride channel protein EriC  30.22 
 
 
510 aa  167  6.9999999999999995e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29991  putative chloride channel  32.77 
 
 
450 aa  167  8e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.593355 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4507  Cl- channel, voltage-gated family protein  26.85 
 
 
594 aa  164  5.0000000000000005e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0240  chloride channel protein  32.69 
 
 
473 aa  162  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53364  voltage-gated chloride channel  23.58 
 
 
764 aa  162  3e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0241  chloride channel protein  32.69 
 
 
473 aa  162  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0165964  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0223  chloride channel protein  32.69 
 
 
473 aa  162  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.230311  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4402  Cl- channel, voltage-gated family protein  27.35 
 
 
598 aa  161  5e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0824696  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1639  Cl- channel voltage-gated family protein  29.96 
 
 
597 aa  161  6e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1863  Cl- channel, voltage gated  27.08 
 
 
569 aa  161  6e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0224  chloride channel protein  32.45 
 
 
473 aa  160  7e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.154288  normal  0.638237 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0226  chloride channel protein  32.45 
 
 
473 aa  160  7e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1465  Cl- channel, voltage-gated family protein  26.95 
 
 
580 aa  160  7e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3102  chloride channel protein  31.28 
 
 
471 aa  159  3e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.965417  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3470  Cl- channel, voltage gated  26.57 
 
 
613 aa  157  8e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2944  Cl- channel, voltage-gated family protein  31.91 
 
 
526 aa  157  1e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0120087  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6434  Chloride channel core  28.88 
 
 
600 aa  155  2.9999999999999998e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.741309 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1620  chloride channel protein EriC  26.12 
 
 
606 aa  155  2.9999999999999998e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2794  chloride channel protein EriC  27.68 
 
 
608 aa  154  5.9999999999999996e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000831422  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2363  chloride channel family protein, putative  27.65 
 
 
614 aa  152  2e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.325858  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2173  voltage-gated chloride channel family protein  28.07 
 
 
519 aa  153  2e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1884  voltage gated chloride channel family protein  28.34 
 
 
519 aa  152  4e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0695  chloride channel protein  30.71 
 
 
466 aa  151  5e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.750689  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1447  Cl- channel voltage-gated family protein  24.27 
 
 
598 aa  150  1.0000000000000001e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000054528  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2188  Chloride channel core  28.4 
 
 
563 aa  150  1.0000000000000001e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000751746  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1352  Cl- channel, voltage gated  27.6 
 
 
577 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21821  putative chloride channel  30.41 
 
 
452 aa  149  3e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.607028 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1830  chloride channel protein EriC  31.75 
 
 
512 aa  148  3e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.116382  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0782  chloride channel protein  31.1 
 
 
479 aa  148  4.0000000000000006e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.12239 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2668  putative chloride channel  31.43 
 
 
481 aa  146  1e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3504  chloride channel family protein  25.1 
 
 
602 aa  147  1e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0310  CBS  28 
 
 
615 aa  146  2e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0681  Chloride channel core  27.79 
 
 
538 aa  146  2e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0552  Chloride channel core  26.43 
 
 
614 aa  144  5e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.18832  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1576  chloride channel protein  32.43 
 
 
463 aa  144  6e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.803836 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3458  chloride channel protein  30.47 
 
 
478 aa  143  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.41349  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2446  chloride channel core  28.2 
 
 
603 aa  143  9.999999999999999e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3329  chloride channel protein  30.47 
 
 
478 aa  143  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0993  chloride channel protein  30.47 
 
 
478 aa  143  9.999999999999999e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1588  Cl- channel, voltage gated  32.71 
 
 
539 aa  142  1.9999999999999998e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000108225  normal  0.782392 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0433  Cl- channel, voltage-gated family protein  26.87 
 
 
575 aa  143  1.9999999999999998e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.346865  normal  0.0128311 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1622  Cl- channel, voltage-gated family protein  26.11 
 
 
754 aa  142  3e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2543  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25.7 
 
 
591 aa  142  3e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.232119  normal  0.0827659 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4719  Cl- channel, voltage-gated family protein  31.17 
 
 
439 aa  142  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.690428  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2950  Cl- channel, voltage gated  27.99 
 
 
613 aa  140  1e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.952562  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2501  Cl- channel, voltage gated  26.74 
 
 
626 aa  139  2e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.169723  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1107  voltage-gated chloride channel family protein  32.63 
 
 
510 aa  139  3.0000000000000003e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1400  chloride channel, putative  27.54 
 
 
631 aa  139  3.0000000000000003e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0757  Chloride channel core  27.22 
 
 
528 aa  138  4e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.937422  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2293  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  23.98 
 
 
636 aa  138  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1448  Chloride channel core  25.3 
 
 
627 aa  137  7.000000000000001e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.132053  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0762  chloride channel core  31.04 
 
 
518 aa  137  8e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000775923  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0956  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25.39 
 
 
579 aa  137  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.872651  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2101  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25.39 
 
 
579 aa  137  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.516415  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2160  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25.39 
 
 
579 aa  137  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2437  chloride channel core  28.09 
 
 
629 aa  136  1.9999999999999998e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.276438  normal  0.470563 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2291  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  23.98 
 
 
628 aa  134  6e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.369864  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6390  Chloride channel core  26.79 
 
 
604 aa  134  6.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.315587  normal  0.638262 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2409  Chloride channel core  34.36 
 
 
435 aa  134  6.999999999999999e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1102  Cl- channel voltage-gated family protein  27.73 
 
 
584 aa  134  7.999999999999999e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5033  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  23.72 
 
 
598 aa  134  7.999999999999999e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.389584 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4536  Chloride channel core  26.83 
 
 
603 aa  134  7.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.143283 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2179  voltage-gated chloride channel  27.14 
 
 
528 aa  132  3e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0928  Cl- channel, voltage-gated family protein  25.75 
 
 
612 aa  132  3e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.453543  hitchhiker  0.000208416 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0041  Cl- channel, voltage-gated family protein  29.12 
 
 
587 aa  132  3e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0866  chloride channel protein  30.36 
 
 
470 aa  130  7.000000000000001e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0280286  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0493  Chloride channel core  24.42 
 
 
598 aa  130  8.000000000000001e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3181  chloride channel core  26.5 
 
 
669 aa  130  9.000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2221  putative chloride channel  28.36 
 
 
590 aa  130  1.0000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.247066  decreased coverage  0.00811968 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1662  voltage-gated chloride channel family protein  28.73 
 
 
523 aa  130  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0459  chloride channel protein  29.81 
 
 
468 aa  129  2.0000000000000002e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.511438  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1400  chloride channel protein  28.45 
 
 
523 aa  129  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.340394  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2352  Cl- channel, voltage-gated family protein  28.22 
 
 
612 aa  129  2.0000000000000002e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1107  Chloride channel core  28.19 
 
 
470 aa  129  3e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1823  putative chloride channel  28.09 
 
 
593 aa  129  3e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.039576  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3026  chloride channel protein  34.99 
 
 
436 aa  129  3e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.139269  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1658  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  24.48 
 
 
593 aa  128  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1975  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  23.79 
 
 
591 aa  128  4.0000000000000003e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.224056  normal  0.0566649 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1658  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  24.48 
 
 
593 aa  128  5e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2810  chloride channel protein  33.5 
 
 
472 aa  127  8.000000000000001e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0845  chloride channel protein EriC  34.16 
 
 
512 aa  127  8.000000000000001e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1130  Chloride channel core  23.55 
 
 
617 aa  126  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.711755  normal  0.273253 
 
 
-
 
NC_006680  CNK01900  conserved hypothetical protein  25.29 
 
 
873 aa  126  2e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00397821  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>