127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3057 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_3057  CBS domain-containing protein  100 
 
 
142 aa  291  2e-78  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.193556  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2408  CBS domain-containing protein  47.06 
 
 
136 aa  135  1e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2120  CBS domain-containing protein  47.06 
 
 
136 aa  135  1e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3340  CBS domain containing protein  41.67 
 
 
142 aa  111  3e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000762759  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0948  CBS domain containing membrane protein  42.06 
 
 
140 aa  106  1e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1822  CBS domain containing protein  31.43 
 
 
157 aa  61.2  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0544  CBS domain-containing protein  26.77 
 
 
147 aa  57  0.00000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.761557  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1597  CBS domain-containing protein  28.1 
 
 
157 aa  55.1  0.0000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1825  CBS domain-containing protein  27.35 
 
 
162 aa  52.4  0.000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00897459 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1889  signal transduction protein  27.27 
 
 
152 aa  52  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0991  CBS domain-containing protein  25.9 
 
 
196 aa  52  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1912  CBS domain-containing protein  26.67 
 
 
215 aa  51.6  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.043579  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0031  CBS domain containing membrane protein  27.59 
 
 
382 aa  52  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.668358 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1550  CBS domain-containing protein  27.41 
 
 
215 aa  51.2  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.241797  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4032  CBS domain-containing protein  26.96 
 
 
147 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.129704  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2240  signal transduction protein  24.79 
 
 
153 aa  50.8  0.000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1868  hemolysin-like protein  25.93 
 
 
215 aa  50.4  0.000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00862895  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2131  CBS domain-containing protein  26.28 
 
 
215 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.766649  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1915  CBS domain-containing protein  25.93 
 
 
215 aa  50.1  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2061  CBS domain-containing protein  25.93 
 
 
215 aa  50.1  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0026  CBS domain containing membrane protein  28.04 
 
 
382 aa  50.1  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2685  signal transduction protein  26.09 
 
 
147 aa  49.7  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.209094  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5763  CBS domain-containing protein  29.27 
 
 
391 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2162  CBS domain protein  26.67 
 
 
215 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.317884  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2094  CBS domain protein  25.93 
 
 
215 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1877  hemolysin-like protein  25.93 
 
 
215 aa  49.3  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.287324  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3827  CBS domain-containing protein  30.4 
 
 
391 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.940711  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4541  CBS domain-containing protein  30.4 
 
 
391 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.6284  normal  0.0139408 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2808  KpsF/GutQ family protein  29.59 
 
 
331 aa  48.9  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0970  CBS domain-containing protein  25.76 
 
 
155 aa  49.3  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1687  putative transcriptional regulator, XRE family  25.86 
 
 
151 aa  49.7  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0659  permease of the major facilitator superfamily  22.14 
 
 
683 aa  49.3  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4103  CBS domain protein  26.09 
 
 
147 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.696532  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0943  putative signal transduction protein with CBS domains  26.98 
 
 
154 aa  48.5  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3995  CBS domain-containing protein  28.95 
 
 
133 aa  48.5  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0305  CBS domain-containing protein  26.02 
 
 
160 aa  47.8  0.00005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0838  signal transduction protein  28.78 
 
 
279 aa  47.8  0.00005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.545659  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4086  CBS domain protein  25.22 
 
 
147 aa  47.4  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2308  KpsF/GutQ family protein  27.55 
 
 
333 aa  47.4  0.00006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2980  signal transduction protein  28.16 
 
 
423 aa  47.4  0.00007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3893  CBS domain-containing protein  24.35 
 
 
147 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.889403  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3725  CBS domain-containing protein  24.35 
 
 
147 aa  46.6  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.748636  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3741  CBS domain-containing protein  24.35 
 
 
147 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1304  CBS domain-containing protein  28.46 
 
 
391 aa  47  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.388311 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4196  CBS domain-containing protein  24.35 
 
 
147 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.503923  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0535  CBS domain-containing protein  27.35 
 
 
256 aa  46.2  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0393  CBS domain-containing membrane protein  32.41 
 
 
193 aa  46.2  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.464074  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3998  CBS domain protein  24.35 
 
 
147 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3406  magnesium transporter  29.51 
 
 
447 aa  46.2  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.200177  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1947  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  26.02 
 
 
500 aa  45.8  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0576  putative signal transduction protein with CBS domains  25.19 
 
 
152 aa  45.8  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.134096  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2805  CBS domain-containing membrane protein  26.5 
 
 
155 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08496  putative inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  26.36 
 
 
490 aa  46.2  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2052  CBS domain protein  24.44 
 
 
215 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0896141  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2338  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  29.36 
 
 
487 aa  45.4  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.879992  normal  0.100057 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3833  putative signal transduction protein with CBS domains  50 
 
 
201 aa  45.1  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0502745  normal  0.174348 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0789  putative transcriptional regulator, XRE family  23.81 
 
 
159 aa  45.1  0.0003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3255  CBS domain protein  24.44 
 
 
215 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.926669 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6174  CBS domain containing membrane protein  31.71 
 
 
246 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0942  CBS domain containing membrane protein  30.83 
 
 
277 aa  44.7  0.0004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0100206  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1902  CBS domain-containing protein  27.08 
 
 
231 aa  44.7  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5097  signal-transduction protein  27.93 
 
 
189 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.158303  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2966  signal-transduction protein  28.18 
 
 
132 aa  44.7  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5185  signal-transduction protein  27.93 
 
 
189 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.254661  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5476  signal-transduction protein  27.93 
 
 
189 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.184871  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3439  hypothetical protein  29.52 
 
 
385 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.612003  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2521  signal transduction protein  24.31 
 
 
161 aa  45.1  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0130  hypothetical protein  25.19 
 
 
378 aa  44.7  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4427  CBS domain-containing protein  28.23 
 
 
391 aa  44.7  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.963922  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0288  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  24.81 
 
 
486 aa  44.7  0.0005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1614  CBS domain containing membrane protein  31.25 
 
 
155 aa  44.7  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.267585  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1209  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  28.18 
 
 
499 aa  44.3  0.0005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.000000206103  hitchhiker  0.00000852941 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1933  CBS domain-containing protein  28.46 
 
 
228 aa  44.3  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.316651  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3965  CBS domain-containing protein  28.23 
 
 
391 aa  44.3  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.23088  normal  0.173621 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40540  CBS domain-containing protein  29.46 
 
 
385 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4119  CBS domain-containing protein  27.12 
 
 
399 aa  44.3  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0189  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  26.55 
 
 
489 aa  44.3  0.0006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000133225  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1812  CBS domain containing membrane protein  26.89 
 
 
132 aa  44.3  0.0006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2015  CBS domain containing membrane protein  21.9 
 
 
368 aa  44.3  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00292892  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0365  KpsF/GutQ family protein  27.27 
 
 
325 aa  43.9  0.0007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.623237  normal  0.274757 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3810  signal transduction protein  25.44 
 
 
147 aa  43.9  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1154  CBS domain protein  24.35 
 
 
147 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0264  CBS domain-containing protein  26.77 
 
 
153 aa  43.9  0.0008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2242  CBS domain-containing protein  31.86 
 
 
144 aa  43.5  0.0009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0307  KpsF/GutQ family protein  26.17 
 
 
327 aa  43.5  0.0009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0765  CBS  23.65 
 
 
224 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2232  CBS domain containing membrane protein  25.18 
 
 
164 aa  43.1  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.510755 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3005  CBS domain-containing protein  25 
 
 
210 aa  42.7  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0224331  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1473  CBS domain-containing protein  22.13 
 
 
390 aa  43.1  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.103531 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2812  CBS domain containing membrane protein  30.17 
 
 
201 aa  43.5  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000718769  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1308  putative signal transduction protein with CBS domains  24.29 
 
 
161 aa  43.5  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3706  cystathionine beta-synthase  24.79 
 
 
459 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1813  CBS domain-containing protein  21.43 
 
 
154 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2291  KpsF/GutQ family protein  25 
 
 
323 aa  42  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.827671  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3011  hypothetical protein  30.89 
 
 
429 aa  42  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0610  signal-transduction protein  27.05 
 
 
348 aa  41.6  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.909822  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1137  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  24.51 
 
 
489 aa  42  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0394  CBS domain-containing membrane protein  28.7 
 
 
201 aa  42  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.474769  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1228  signal-transduction protein  48.57 
 
 
339 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2421  CBS domain-containing protein  25.2 
 
 
206 aa  41.6  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>