More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_2291 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_2291  KpsF/GutQ family protein  100 
 
 
323 aa  641    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.827671  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4201  KpsF/GutQ family protein  57.01 
 
 
333 aa  362  4e-99  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.899261  normal  0.722227 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0211  KpsF/GutQ  50 
 
 
342 aa  298  6e-80  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0183  KpsF/GutQ family protein  53.45 
 
 
337 aa  287  1e-76  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.367959  normal  0.0516701 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0365  KpsF/GutQ family protein  48.89 
 
 
325 aa  286  2e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.623237  normal  0.274757 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0154  KpsF/GutQ family protein  49.84 
 
 
333 aa  280  2e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2121  KpsF/GutQ family protein  48.28 
 
 
339 aa  276  3e-73  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2221  KpsF/GutQ family protein  47.63 
 
 
326 aa  276  3e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3339  KpsF/GutQ family protein  51.1 
 
 
326 aa  275  1.0000000000000001e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0756  KpsF/GutQ family protein  47.63 
 
 
323 aa  274  2.0000000000000002e-72  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0675  KpsF/GutQ family protein  48.26 
 
 
345 aa  273  2.0000000000000002e-72  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0334  KpsF/GutQ family protein  47.32 
 
 
326 aa  273  3e-72  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02232  arabinose 5-phosphate isomerase  47.95 
 
 
333 aa  273  3e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0761  arabinose-5-phosphate isomerase  47.95 
 
 
345 aa  273  4.0000000000000004e-72  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0746  sugar isomerase, KpsF/GutQ  47.15 
 
 
330 aa  271  1e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.269497  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0875  KpsF/GutQ family protein  45.74 
 
 
324 aa  270  2e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4898  KpsF/GutQ family protein  47.96 
 
 
335 aa  270  2.9999999999999997e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.340772  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25501  putative polysialic acid capsule expression protein KpsF  54.34 
 
 
347 aa  267  1e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0436  KpsF/GutQ family protein  45.45 
 
 
326 aa  268  1e-70  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12840  Arabinose 5-phosphate isomerase protein  45.74 
 
 
344 aa  267  2e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4448  sugar isomerase, KpsF/GutQ  45.74 
 
 
324 aa  267  2e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0538  capsule expression protein KpsF/GutQ  47.65 
 
 
328 aa  267  2e-70  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1811  KpsF/GutQ family protein  44.27 
 
 
319 aa  266  2e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0404  KpsF/GutQ family protein  46.06 
 
 
323 aa  267  2e-70  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.126623 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4142  KpsF/GutQ  45.74 
 
 
324 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3030  sugar isomerase, KpsF/GutQ family  49.83 
 
 
328 aa  266  2.9999999999999995e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2638  KpsF/GutQ family protein  49.83 
 
 
328 aa  266  2.9999999999999995e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.545154  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0401  KpsF/GutQ family protein  44.79 
 
 
326 aa  266  4e-70  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1202  arabinose-5-phosphate isomerase  44.51 
 
 
324 aa  265  8e-70  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0403  KpsF/GutQ family protein  44.79 
 
 
315 aa  265  8e-70  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6051  KpsF/GutQ family protein  46.71 
 
 
333 aa  264  1e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3083  arabinose-5-phosphate isomerase  42.72 
 
 
325 aa  264  1e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.353966 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0763  arabinose-5-phosphate isomerase  44.51 
 
 
324 aa  264  1e-69  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0957  KpsF/GutQ family protein  45.62 
 
 
324 aa  263  2e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0959  KpsF/GutQ family protein  47.3 
 
 
333 aa  263  3e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.444411 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0413  hypothetical protein  44.83 
 
 
333 aa  263  4e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0763573 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2225  KpsF/GutQ family protein  49.22 
 
 
341 aa  263  4e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.574714  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0731  Arabinose-5-phosphate isomerase  47.94 
 
 
325 aa  263  4e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5030  hypothetical protein  45.11 
 
 
324 aa  262  6e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.698137  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0964  KpsF/GutQ family protein  45.31 
 
 
324 aa  261  1e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0467  KpsF/GutQ  46.06 
 
 
328 aa  261  1e-68  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4235  KpsF/GutQ family protein  41.01 
 
 
325 aa  260  2e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000366362 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0996  KpsF/GutQ family protein  45.31 
 
 
324 aa  261  2e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3306  KpsF/GutQ family protein  41.64 
 
 
325 aa  260  2e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.57065 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1747  KpsF/GutQ  44.16 
 
 
326 aa  259  3e-68  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.302564 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3956  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  40.82 
 
 
325 aa  259  4e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0862  KpsF/GutQ  44.06 
 
 
324 aa  259  4e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4237  KpsF/GutQ family protein  46.08 
 
 
333 aa  259  4e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57890  hypothetical protein  44.79 
 
 
326 aa  259  4e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0731  arabinose-5-phosphate isomerase  41.01 
 
 
325 aa  259  4e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.338058 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3344  KpsF/GutQ family protein  40.51 
 
 
325 aa  259  5.0000000000000005e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.275941 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0295  KpsF/GutQ family protein  45.14 
 
 
327 aa  258  7e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2308  KpsF/GutQ family protein  45.28 
 
 
333 aa  258  8e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2710  KpsF/GutQ family protein  44.23 
 
 
329 aa  258  8e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3174  arabinose-5-phosphate isomerase  41.01 
 
 
323 aa  258  9e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4258  KpsF/GutQ family protein  45.31 
 
 
324 aa  258  1e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0677  KpsF/GutQ family protein  40.19 
 
 
325 aa  258  1e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.953587  normal  0.0677039 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3507  D-arabinose 5-phosphate isomerase  43.85 
 
 
328 aa  257  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3576  D-arabinose 5-phosphate isomerase  43.85 
 
 
328 aa  257  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3612  D-arabinose 5-phosphate isomerase  43.85 
 
 
328 aa  257  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.164557 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0678  KpsF/GutQ family protein  40.19 
 
 
325 aa  257  2e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.732488  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3674  D-arabinose 5-phosphate isomerase  43.85 
 
 
328 aa  257  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.835894  normal  0.0549633 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0494  KpsF/GutQ family protein  41.46 
 
 
325 aa  256  3e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0102894  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3505  D-arabinose 5-phosphate isomerase  43.85 
 
 
328 aa  256  3e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4108  KpsF/GutQ family protein  46.39 
 
 
330 aa  256  5e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.525065  normal  0.0965302 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0563  KpsF/GutQ family protein  44.34 
 
 
323 aa  255  8e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.57393  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3652  D-arabinose 5-phosphate isomerase  44.16 
 
 
328 aa  254  1.0000000000000001e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0268  KpsF/GutQ family protein  44.51 
 
 
327 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2808  KpsF/GutQ family protein  44.3 
 
 
331 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3611  KpsF/GutQ family protein  40.19 
 
 
325 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0712  KpsF/GutQ family protein  40.51 
 
 
325 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0114298 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3663  KpsF/GutQ family protein  40.51 
 
 
325 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000627199  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2788  sugar phosphate isomerase  46.35 
 
 
330 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000495576  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0720  KpsF/GutQ family protein  41.14 
 
 
325 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.500239  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1058  KpsF/GutQ family protein  45.48 
 
 
338 aa  253  2.0000000000000002e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal  0.335757 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0721  KpsF/GutQ family protein  40.51 
 
 
325 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.2896 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0691  KpsF/GutQ family protein  40.51 
 
 
325 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.983087  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0166  KpsF/GutQ family protein  43.96 
 
 
319 aa  253  2.0000000000000002e-66  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0438  KpsF/GutQ family protein  44.79 
 
 
326 aa  253  3e-66  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.181851 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0902  hypothetical protein  41.27 
 
 
320 aa  253  3e-66  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0871  hypothetical protein  41.27 
 
 
320 aa  253  3e-66  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2104  hypothetical protein  44.03 
 
 
326 aa  253  3e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4785  KpsF/GutQ family protein  48.59 
 
 
339 aa  252  6e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1907  KpsF/GutQ family protein  43.71 
 
 
330 aa  252  7e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0969  KpsF/GutQ family protein  44.83 
 
 
321 aa  252  7e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0045257  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002407  arabinose 5-phosphate isomerase  42.32 
 
 
323 aa  251  1e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.585942  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0137  KpsF/GutQ family protein  47.3 
 
 
335 aa  250  2e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3372  KpsF/GutQ family protein  40.38 
 
 
325 aa  250  3e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.600625  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4538  KpsF/GutQ family protein  42.01 
 
 
321 aa  249  4e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0776  KpsF/GutQ family protein  43.26 
 
 
324 aa  249  4e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0307  KpsF/GutQ family protein  46.39 
 
 
327 aa  249  4e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0359  KpsF/GutQ  45.45 
 
 
327 aa  249  5e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3633  D-arabinose 5-phosphate isomerase  43.22 
 
 
328 aa  249  6e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.143875 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4362  D-arabinose 5-phosphate isomerase  42.27 
 
 
328 aa  249  6e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.315495  normal  0.179965 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03188  arabinose 5-phosphate isomerase  41.38 
 
 
326 aa  249  6e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.655458  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0510  D-arabinose 5-phosphate isomerase  42.59 
 
 
357 aa  248  7e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03660  hypothetical protein  41.38 
 
 
323 aa  248  7e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3810  D-arabinose 5-phosphate isomerase  42.9 
 
 
328 aa  248  7e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.109519  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0446  D-arabinose 5-phosphate isomerase  42.59 
 
 
328 aa  248  9e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5294  KpsF/GutQ family protein  45.11 
 
 
332 aa  248  9e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>