More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0183 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_0183  KpsF/GutQ family protein  100 
 
 
337 aa  668    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.367959  normal  0.0516701 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0211  KpsF/GutQ  87.54 
 
 
342 aa  588  1e-167  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25501  putative polysialic acid capsule expression protein KpsF  80.06 
 
 
347 aa  492  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4201  KpsF/GutQ family protein  52.19 
 
 
333 aa  303  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.899261  normal  0.722227 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2291  KpsF/GutQ family protein  53.45 
 
 
323 aa  288  1e-76  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.827671  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0334  KpsF/GutQ family protein  41.54 
 
 
326 aa  240  2e-62  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0401  KpsF/GutQ family protein  41.56 
 
 
326 aa  238  8e-62  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1811  KpsF/GutQ family protein  38.96 
 
 
319 aa  237  2e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0404  KpsF/GutQ family protein  43.12 
 
 
323 aa  236  4e-61  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.126623 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0403  KpsF/GutQ family protein  42.15 
 
 
315 aa  234  1.0000000000000001e-60  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2221  KpsF/GutQ family protein  43.48 
 
 
326 aa  234  1.0000000000000001e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3339  KpsF/GutQ family protein  47.2 
 
 
326 aa  234  2.0000000000000002e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3174  arabinose-5-phosphate isomerase  40.68 
 
 
323 aa  229  6e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0438  KpsF/GutQ family protein  43.57 
 
 
326 aa  229  7e-59  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.181851 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5962  KpsF/GutQ family protein  44.48 
 
 
322 aa  228  8e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0467  KpsF/GutQ  42.55 
 
 
328 aa  228  1e-58  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1278  KpsF/GutQ  41.36 
 
 
321 aa  228  1e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000847451 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1123  KpsF/GutQ family protein  42.72 
 
 
342 aa  228  1e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0763  arabinose-5-phosphate isomerase  42.45 
 
 
324 aa  226  3e-58  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1202  arabinose-5-phosphate isomerase  42.32 
 
 
324 aa  226  4e-58  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0413  hypothetical protein  41.59 
 
 
333 aa  226  5.0000000000000005e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0763573 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2121  KpsF/GutQ family protein  42.86 
 
 
339 aa  226  6e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02764  hypothetical protein  39.51 
 
 
339 aa  225  7e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000908304  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02814  conserved hypothetical protein  39.51 
 
 
339 aa  225  7e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000939788  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0365  KpsF/GutQ family protein  42.06 
 
 
325 aa  224  2e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.623237  normal  0.274757 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2110  KpsF/GutQ family protein  42.32 
 
 
332 aa  223  3e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000613072  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3219  polysialic acid capsule expression protein KpsF  39.2 
 
 
339 aa  223  3e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1612  KpsF/GutQ family protein  41.02 
 
 
330 aa  223  4.9999999999999996e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2977  KpsF/GutQ family protein  42.41 
 
 
321 aa  223  4.9999999999999996e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00368361  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4108  KpsF/GutQ family protein  41.59 
 
 
330 aa  222  7e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.525065  normal  0.0965302 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57890  hypothetical protein  40.48 
 
 
326 aa  222  7e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2308  KpsF/GutQ family protein  45.07 
 
 
333 aa  222  8e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2808  KpsF/GutQ family protein  43.26 
 
 
331 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1943  arabinose-5-phosphate isomerase  41.98 
 
 
320 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0150417  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5030  hypothetical protein  40.24 
 
 
324 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.698137  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0006  KpsF/GutQ family protein  41.35 
 
 
357 aa  220  1.9999999999999999e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.157738  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0282  KpsF/GutQ family protein  37.72 
 
 
321 aa  219  5e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3603  KpsF/GutQ family protein  41.39 
 
 
324 aa  219  6e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.478278 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1907  KpsF/GutQ family protein  40.84 
 
 
330 aa  218  1e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3418  KpsF/GutQ  42.69 
 
 
332 aa  218  1e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000032508  normal  0.585789 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0359  KpsF/GutQ  41.59 
 
 
327 aa  218  1e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2608  KpsF/GutQ family protein  39.38 
 
 
322 aa  218  1e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0776  KpsF/GutQ family protein  41.85 
 
 
324 aa  218  1e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1617  arabinose-5-phosphate isomerase  37.96 
 
 
315 aa  217  2e-55  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.567393  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0436  KpsF/GutQ family protein  40.65 
 
 
326 aa  218  2e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0295  KpsF/GutQ family protein  41.28 
 
 
327 aa  218  2e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0268  KpsF/GutQ family protein  40.98 
 
 
327 aa  216  4e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1602  KpsF/GutQ family protein  39.08 
 
 
322 aa  216  4e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1437  arabinose-5-phosphate isomerase  37.96 
 
 
315 aa  216  5e-55  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.743757  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0166  KpsF/GutQ family protein  38.89 
 
 
319 aa  216  5e-55  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2710  KpsF/GutQ family protein  40.37 
 
 
329 aa  216  5.9999999999999996e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0307  KpsF/GutQ family protein  41.28 
 
 
327 aa  215  9e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0538  capsule expression protein KpsF/GutQ  42.55 
 
 
328 aa  215  9.999999999999999e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1778  arabinose-5-phosphate isomerase  37.65 
 
 
315 aa  215  9.999999999999999e-55  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.458122  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0294  arabinose-5-phosphate isomerase  38.6 
 
 
318 aa  214  9.999999999999999e-55  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4258  KpsF/GutQ family protein  39.29 
 
 
324 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12840  Arabinose 5-phosphate isomerase protein  41.3 
 
 
344 aa  214  1.9999999999999998e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0756  KpsF/GutQ family protein  39.33 
 
 
323 aa  214  1.9999999999999998e-54  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0996  KpsF/GutQ family protein  38.99 
 
 
324 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1893  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  42.76 
 
 
321 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.573226  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5294  KpsF/GutQ family protein  41.07 
 
 
332 aa  213  2.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18910  KpsF/GutQ family protein  38.41 
 
 
331 aa  213  2.9999999999999995e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.413862  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0964  KpsF/GutQ family protein  38.69 
 
 
324 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4448  sugar isomerase, KpsF/GutQ  39.58 
 
 
324 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1665  KpsF/GutQ family protein  37.15 
 
 
320 aa  213  4.9999999999999996e-54  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.309824  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03188  arabinose 5-phosphate isomerase  37.69 
 
 
326 aa  212  5.999999999999999e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.655458  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0298  KpsF/GutQ family sugar isomerase  38.84 
 
 
322 aa  212  5.999999999999999e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0154  KpsF/GutQ family protein  40.57 
 
 
333 aa  212  7.999999999999999e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0902  hypothetical protein  39.38 
 
 
320 aa  212  9e-54  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0871  hypothetical protein  39.38 
 
 
320 aa  212  9e-54  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0957  KpsF/GutQ family protein  38.69 
 
 
324 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2171  KpsF/GutQ family protein  42.56 
 
 
322 aa  211  1e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1747  KpsF/GutQ  41.3 
 
 
326 aa  211  2e-53  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.302564 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4898  KpsF/GutQ family protein  40.37 
 
 
335 aa  210  2e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.340772  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2225  KpsF/GutQ family protein  42.47 
 
 
341 aa  210  3e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.574714  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4237  KpsF/GutQ family protein  42.46 
 
 
333 aa  209  4e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02232  arabinose 5-phosphate isomerase  41.56 
 
 
333 aa  209  4e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0746  sugar isomerase, KpsF/GutQ  40.61 
 
 
330 aa  208  9e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.269497  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002407  arabinose 5-phosphate isomerase  37.13 
 
 
323 aa  208  9e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.585942  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0959  KpsF/GutQ family protein  41.88 
 
 
333 aa  208  1e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.444411 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0491  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  42.94 
 
 
327 aa  207  1e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.566737  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0969  KpsF/GutQ family protein  39.69 
 
 
321 aa  208  1e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0045257  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3611  KpsF/GutQ family protein  37.46 
 
 
325 aa  207  2e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2104  hypothetical protein  38.51 
 
 
326 aa  207  2e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1058  KpsF/GutQ family protein  40.99 
 
 
338 aa  207  2e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal  0.335757 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3809  arabinose-5-phosphate isomerase  43.86 
 
 
340 aa  207  2e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.127508 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4142  KpsF/GutQ  38.1 
 
 
324 aa  207  3e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0014  KpsF/GutQ  42.91 
 
 
366 aa  207  3e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1749  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  40.72 
 
 
319 aa  206  3e-52  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2788  sugar phosphate isomerase  41.56 
 
 
330 aa  206  4e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000495576  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0494  KpsF/GutQ family protein  38.89 
 
 
325 aa  206  4e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0102894  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0064  KpsF/GutQ family protein  37.65 
 
 
321 aa  206  4e-52  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0675  KpsF/GutQ family protein  40.06 
 
 
345 aa  206  4e-52  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0761  arabinose-5-phosphate isomerase  39.75 
 
 
345 aa  206  5e-52  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0862  KpsF/GutQ  38.51 
 
 
324 aa  206  6e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0601  KpsF/GutQ family protein  41.9 
 
 
327 aa  206  6e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0442241 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0335  KpsF/GutQ family protein  40.94 
 
 
334 aa  206  7e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00223142  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0731  Arabinose-5-phosphate isomerase  42.5 
 
 
325 aa  205  7e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0586  KpsF/GutQ family sugar isomerase  42.64 
 
 
327 aa  205  8e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4117  KpsF/GutQ  41.72 
 
 
327 aa  204  1e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>