More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0211 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0211  KpsF/GutQ  100 
 
 
342 aa  682    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0183  KpsF/GutQ family protein  87.54 
 
 
337 aa  568  1e-161  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.367959  normal  0.0516701 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25501  putative polysialic acid capsule expression protein KpsF  79.5 
 
 
347 aa  499  1e-140  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4201  KpsF/GutQ family protein  50.31 
 
 
333 aa  292  5e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.899261  normal  0.722227 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2291  KpsF/GutQ family protein  50.31 
 
 
323 aa  287  2e-76  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.827671  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2221  KpsF/GutQ family protein  43.79 
 
 
326 aa  243  3e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0401  KpsF/GutQ family protein  41.25 
 
 
326 aa  236  6e-61  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0403  KpsF/GutQ family protein  40.79 
 
 
315 aa  235  1.0000000000000001e-60  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0404  KpsF/GutQ family protein  43.44 
 
 
323 aa  234  1.0000000000000001e-60  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.126623 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1811  KpsF/GutQ family protein  38.46 
 
 
319 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3339  KpsF/GutQ family protein  46.91 
 
 
326 aa  233  3e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0365  KpsF/GutQ family protein  41.74 
 
 
325 aa  233  5e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.623237  normal  0.274757 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0334  KpsF/GutQ family protein  41.25 
 
 
326 aa  232  9e-60  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2308  KpsF/GutQ family protein  42.14 
 
 
333 aa  231  1e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1278  KpsF/GutQ  40.56 
 
 
321 aa  230  3e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000847451 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1123  KpsF/GutQ family protein  42.41 
 
 
342 aa  229  6e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0438  KpsF/GutQ family protein  41.82 
 
 
326 aa  229  8e-59  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.181851 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0467  KpsF/GutQ  40.99 
 
 
328 aa  228  1e-58  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02814  conserved hypothetical protein  38.77 
 
 
339 aa  228  2e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000939788  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3219  polysialic acid capsule expression protein KpsF  38.77 
 
 
339 aa  227  2e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02764  hypothetical protein  38.77 
 
 
339 aa  228  2e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000908304  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0282  KpsF/GutQ family protein  37.88 
 
 
321 aa  227  2e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0763  arabinose-5-phosphate isomerase  40.69 
 
 
324 aa  226  7e-58  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1202  arabinose-5-phosphate isomerase  40.57 
 
 
324 aa  225  7e-58  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0436  KpsF/GutQ family protein  41.56 
 
 
326 aa  224  1e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3174  arabinose-5-phosphate isomerase  37.95 
 
 
323 aa  223  3e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2808  KpsF/GutQ family protein  42.11 
 
 
331 aa  223  3e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1943  arabinose-5-phosphate isomerase  41.36 
 
 
320 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0150417  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1612  KpsF/GutQ family protein  41.38 
 
 
330 aa  222  8e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1747  KpsF/GutQ  42.86 
 
 
326 aa  221  9.999999999999999e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.302564 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0776  KpsF/GutQ family protein  40.12 
 
 
324 aa  221  9.999999999999999e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5962  KpsF/GutQ family protein  43.44 
 
 
322 aa  221  9.999999999999999e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1907  KpsF/GutQ family protein  41.51 
 
 
330 aa  220  3e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0413  hypothetical protein  41.27 
 
 
333 aa  220  3e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0763573 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2121  KpsF/GutQ family protein  40.85 
 
 
339 aa  219  3.9999999999999997e-56  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57890  hypothetical protein  39.58 
 
 
326 aa  219  5e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5030  hypothetical protein  39.34 
 
 
324 aa  218  2e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.698137  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1617  arabinose-5-phosphate isomerase  38.08 
 
 
315 aa  217  2e-55  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.567393  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1778  arabinose-5-phosphate isomerase  37.77 
 
 
315 aa  217  2e-55  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.458122  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03188  arabinose 5-phosphate isomerase  37.8 
 
 
326 aa  217  2e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.655458  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0538  capsule expression protein KpsF/GutQ  42.86 
 
 
328 aa  217  2e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2977  KpsF/GutQ family protein  38.37 
 
 
321 aa  217  2e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00368361  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4448  sugar isomerase, KpsF/GutQ  39.29 
 
 
324 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0166  KpsF/GutQ family protein  40.07 
 
 
319 aa  217  2.9999999999999998e-55  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4108  KpsF/GutQ family protein  40.31 
 
 
330 aa  216  2.9999999999999998e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.525065  normal  0.0965302 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0295  KpsF/GutQ family protein  41.9 
 
 
327 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0959  KpsF/GutQ family protein  41.88 
 
 
333 aa  216  2.9999999999999998e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.444411 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1893  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  38.97 
 
 
321 aa  216  4e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.573226  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2110  KpsF/GutQ family protein  40.13 
 
 
332 aa  216  4e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000613072  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0298  KpsF/GutQ family sugar isomerase  39.09 
 
 
322 aa  216  4e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1437  arabinose-5-phosphate isomerase  37.77 
 
 
315 aa  216  5e-55  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.743757  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0746  sugar isomerase, KpsF/GutQ  41.25 
 
 
330 aa  216  5e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.269497  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1749  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  41.69 
 
 
319 aa  216  5.9999999999999996e-55  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4898  KpsF/GutQ family protein  40.62 
 
 
335 aa  216  7e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.340772  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18910  KpsF/GutQ family protein  39.76 
 
 
331 aa  216  7e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.413862  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2710  KpsF/GutQ family protein  38.82 
 
 
329 aa  216  7e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0268  KpsF/GutQ family protein  42.57 
 
 
327 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5294  KpsF/GutQ family protein  41.59 
 
 
332 aa  214  1.9999999999999998e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3809  arabinose-5-phosphate isomerase  43.86 
 
 
340 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.127508 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0154  KpsF/GutQ family protein  40 
 
 
333 aa  214  1.9999999999999998e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0335  KpsF/GutQ family protein  39.64 
 
 
334 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00223142  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0359  KpsF/GutQ  41.07 
 
 
327 aa  213  3.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0902  hypothetical protein  38.94 
 
 
320 aa  212  5.999999999999999e-54  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0871  hypothetical protein  38.94 
 
 
320 aa  212  5.999999999999999e-54  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3633  D-arabinose 5-phosphate isomerase  38.96 
 
 
328 aa  212  5.999999999999999e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.143875 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1058  KpsF/GutQ family protein  41.3 
 
 
338 aa  213  5.999999999999999e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal  0.335757 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0756  KpsF/GutQ family protein  37.88 
 
 
323 aa  212  5.999999999999999e-54  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3372  KpsF/GutQ family protein  37.58 
 
 
325 aa  212  7e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.600625  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3611  KpsF/GutQ family protein  36.53 
 
 
325 aa  212  7e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2608  KpsF/GutQ family protein  41.18 
 
 
322 aa  212  7.999999999999999e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12840  Arabinose 5-phosphate isomerase protein  38.42 
 
 
344 aa  211  1e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0307  KpsF/GutQ family protein  40.94 
 
 
327 aa  211  1e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3603  KpsF/GutQ family protein  39.94 
 
 
324 aa  211  1e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.478278 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0006  KpsF/GutQ family protein  41.9 
 
 
357 aa  211  1e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.157738  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4258  KpsF/GutQ family protein  38.1 
 
 
324 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4142  KpsF/GutQ  38.28 
 
 
324 aa  211  2e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02232  arabinose 5-phosphate isomerase  40.3 
 
 
333 aa  211  2e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3507  D-arabinose 5-phosphate isomerase  40.61 
 
 
328 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0964  KpsF/GutQ family protein  38.11 
 
 
324 aa  210  2e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0675  KpsF/GutQ family protein  37.97 
 
 
345 aa  211  2e-53  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3674  D-arabinose 5-phosphate isomerase  40.61 
 
 
328 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.835894  normal  0.0549633 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0996  KpsF/GutQ family protein  38.41 
 
 
324 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3612  D-arabinose 5-phosphate isomerase  40.61 
 
 
328 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.164557 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3576  D-arabinose 5-phosphate isomerase  40.61 
 
 
328 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03062  D-arabinose 5-phosphate isomerase  41.81 
 
 
328 aa  210  3e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00212199  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0510  KpsF/GutQ family protein  41.81 
 
 
328 aa  210  3e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3910  KpsF/GutQ family protein  40.52 
 
 
310 aa  210  3e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.539789 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4519  D-arabinose 5-phosphate isomerase  41.81 
 
 
328 aa  210  3e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.498324  normal  0.41247 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3685  D-arabinose 5-phosphate isomerase  41.81 
 
 
328 aa  210  3e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0503  D-arabinose 5-phosphate isomerase  41.81 
 
 
328 aa  210  3e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.183909 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1602  KpsF/GutQ family protein  37.35 
 
 
322 aa  210  3e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03013  hypothetical protein  41.81 
 
 
328 aa  210  3e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00296594  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3493  D-arabinose 5-phosphate isomerase  41.81 
 
 
328 aa  210  3e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3573  D-arabinose 5-phosphate isomerase  41.81 
 
 
328 aa  210  3e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002407  arabinose 5-phosphate isomerase  36.34 
 
 
323 aa  210  3e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.585942  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3390  D-arabinose 5-phosphate isomerase  41.81 
 
 
328 aa  210  3e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.997652  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3505  D-arabinose 5-phosphate isomerase  40.61 
 
 
328 aa  210  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0761  arabinose-5-phosphate isomerase  37.68 
 
 
345 aa  210  3e-53  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0957  KpsF/GutQ family protein  38.11 
 
 
324 aa  209  4e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3418  KpsF/GutQ  41.88 
 
 
332 aa  209  4e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000032508  normal  0.585789 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>