52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0544 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_0544  CBS domain-containing protein  100 
 
 
147 aa  302  1.0000000000000001e-81  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.761557  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1825  CBS domain-containing protein  48.97 
 
 
162 aa  135  1e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00897459 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1822  CBS domain containing protein  41.86 
 
 
157 aa  102  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4086  CBS domain protein  41.79 
 
 
147 aa  97.8  4e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0943  putative signal transduction protein with CBS domains  42.74 
 
 
154 aa  97.8  5e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4103  CBS domain protein  43.09 
 
 
147 aa  97.4  6e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.696532  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3998  CBS domain protein  43.09 
 
 
147 aa  96.7  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4196  CBS domain-containing protein  43.09 
 
 
147 aa  96.7  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.503923  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3741  CBS domain-containing protein  43.09 
 
 
147 aa  96.7  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3725  CBS domain-containing protein  43.09 
 
 
147 aa  96.7  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.748636  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3893  CBS domain-containing protein  43.09 
 
 
147 aa  96.7  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.889403  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2685  signal transduction protein  39.44 
 
 
147 aa  95.9  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.209094  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4032  CBS domain-containing protein  42.28 
 
 
147 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.129704  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1154  CBS domain protein  40.3 
 
 
147 aa  95.1  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3810  signal transduction protein  40.3 
 
 
147 aa  92.8  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0789  putative transcriptional regulator, XRE family  34.97 
 
 
159 aa  91.3  4e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1400  CBS domain-containing protein  32.65 
 
 
153 aa  90.9  5e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0305  CBS domain-containing protein  35.14 
 
 
160 aa  84  7e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1597  CBS domain-containing protein  28.97 
 
 
157 aa  78.2  0.00000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1687  putative transcriptional regulator, XRE family  35.51 
 
 
151 aa  76.6  0.00000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0948  CBS domain containing membrane protein  29.1 
 
 
140 aa  57  0.00000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3057  CBS domain-containing protein  26.77 
 
 
142 aa  57  0.00000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.193556  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3340  CBS domain containing protein  28.69 
 
 
142 aa  55.8  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000762759  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17480  predicted signal-transduction protein containing cAMP-binding and CBS domains  32.76 
 
 
191 aa  47.8  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2131  CBS domain-containing protein  25.41 
 
 
206 aa  45.8  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2408  CBS domain-containing protein  26.02 
 
 
136 aa  45.4  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2421  CBS domain-containing protein  25.41 
 
 
206 aa  45.4  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2120  CBS domain-containing protein  26.02 
 
 
136 aa  45.4  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3005  CBS domain-containing protein  24.79 
 
 
210 aa  45.1  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0224331  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0565  signal transduction protein  31.96 
 
 
286 aa  44.7  0.0004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.632057  hitchhiker  0.00109381 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1899  IMP dehydrogenase/GMP reductase  28.17 
 
 
517 aa  43.9  0.0007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2440  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  26.5 
 
 
498 aa  42.7  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1435  CBS domain containing protein  26.27 
 
 
427 aa  42  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1742  signal transduction protein  26.4 
 
 
286 aa  42.4  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.12379 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1659  signal transduction protein  38.03 
 
 
660 aa  42.7  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1308  putative signal transduction protein with CBS domains  34.72 
 
 
161 aa  42  0.003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1555  signal transduction protein  23.02 
 
 
286 aa  42  0.003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1632  CBS domain-containing protein  26.4 
 
 
211 aa  42  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1735  signal transduction protein  25.22 
 
 
286 aa  41.6  0.004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.281156  decreased coverage  0.000421461 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0311  hypothetical protein  30.95 
 
 
500 aa  41.2  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3779  CBS domain-containing protein  24.49 
 
 
162 aa  41.6  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.458118  normal  0.116222 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2695  putative signal transduction protein with CBS and DRTGG domains  22.07 
 
 
438 aa  41.2  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0768  putative signal transduction protein with CBS and DRTGG domains  22.92 
 
 
435 aa  41.6  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1622  Cl- channel, voltage-gated family protein  26.61 
 
 
754 aa  41.2  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0771  signal-transduction protein  23.77 
 
 
164 aa  40.8  0.006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.411579  normal  0.0544722 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0765  CBS  39.34 
 
 
224 aa  40.8  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1207  homoserine O-acetyltransferase  35.23 
 
 
490 aa  40.8  0.007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0144114  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0285  IMP dehydrogenase family protein  27.12 
 
 
479 aa  40.4  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.264091  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0935  CBS domain-containing protein  27.64 
 
 
225 aa  40.4  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.872585  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2352  Cl- channel, voltage-gated family protein  36.11 
 
 
612 aa  40.4  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0615  protein of unknown function DUF190  26.53 
 
 
426 aa  40.4  0.009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0545  homoserine O-acetyltransferase  33.78 
 
 
487 aa  40.4  0.009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.419548  normal  0.193935 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>