More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2440 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_2437  IMP dehydrogenase family protein  78.5 
 
 
479 aa  755    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.692486  normal  0.0531703 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0848  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  75.37 
 
 
479 aa  731    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.415468 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2628  IMP dehydrogenase family protein  76.62 
 
 
479 aa  729    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000146734  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2440  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  100 
 
 
498 aa  998    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1718  IMP dehydrogenase family protein  69.55 
 
 
484 aa  642    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.289431 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31560  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  68.68 
 
 
479 aa  641    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0791  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  75.57 
 
 
479 aa  726    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.151269  hitchhiker  0.00623467 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0273  IMP dehydrogenase family protein  70.56 
 
 
477 aa  649    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16310  IMP dehydrogenase family protein  70.16 
 
 
484 aa  651    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.130696  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1231  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  69.28 
 
 
485 aa  670    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.861851  normal  0.215314 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7161  IMP dehydrogenase  75.57 
 
 
479 aa  733    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.3739  normal  0.0266118 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2202  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  73.07 
 
 
487 aa  713    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0780  IMP dehydrogenase family protein  72.63 
 
 
478 aa  690    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0285  IMP dehydrogenase family protein  81.63 
 
 
479 aa  807    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.264091  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2608  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  69.1 
 
 
478 aa  640    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0642643  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3090  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  66.6 
 
 
478 aa  636    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.314956 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1951  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  67.9 
 
 
485 aa  629  1e-179  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00883766 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0718  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  68.27 
 
 
477 aa  628  1e-179  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11871  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  64.72 
 
 
478 aa  630  1e-179  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.146983  normal  0.269192 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2316  IMP dehydrogenase family protein  67.01 
 
 
479 aa  626  1e-178  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2763  IMP dehydrogenase family protein  64.51 
 
 
478 aa  618  1e-176  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.572416  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1899  IMP dehydrogenase family protein  66.94 
 
 
482 aa  615  1e-175  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.303165  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3360  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  65.34 
 
 
478 aa  616  1e-175  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.731194  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2813  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  65.14 
 
 
478 aa  606  9.999999999999999e-173  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2840  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  65.14 
 
 
478 aa  606  9.999999999999999e-173  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2857  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  65.14 
 
 
478 aa  606  9.999999999999999e-173  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.699537  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2644  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  63.03 
 
 
492 aa  596  1e-169  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09190  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  60.71 
 
 
486 aa  572  1.0000000000000001e-162  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07740  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  62.83 
 
 
493 aa  564  1.0000000000000001e-159  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3243  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  55.95 
 
 
478 aa  503  1e-141  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3329  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  55.53 
 
 
478 aa  500  1e-140  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3135  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  54.91 
 
 
478 aa  499  1e-140  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0649238  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3133  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  54.7 
 
 
478 aa  493  9.999999999999999e-139  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0009  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  39.49 
 
 
488 aa  291  2e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0009  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  38.85 
 
 
488 aa  291  3e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0212236  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0116  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.68 
 
 
508 aa  288  2e-76  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000189991  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1320  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  41.4 
 
 
504 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0931634  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2159  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  37.65 
 
 
493 aa  283  4.0000000000000003e-75  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0694637  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20480  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  39.49 
 
 
486 aa  283  4.0000000000000003e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000012591  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0448  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  38.98 
 
 
488 aa  283  4.0000000000000003e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0437  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  38.98 
 
 
488 aa  283  4.0000000000000003e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1482  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  38.61 
 
 
482 aa  283  6.000000000000001e-75  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0069  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  38.62 
 
 
488 aa  283  7.000000000000001e-75  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.110755  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1436  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  38.61 
 
 
482 aa  282  8.000000000000001e-75  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1471  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  40.04 
 
 
485 aa  279  8e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0143553  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1992  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  37.65 
 
 
493 aa  278  1e-73  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.369153  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0008  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  37.95 
 
 
487 aa  278  2e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0008  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  38.17 
 
 
487 aa  277  3e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.303266  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0749  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  37.11 
 
 
493 aa  276  5e-73  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0012  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  38.17 
 
 
487 aa  276  8e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0594668  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0029  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.13 
 
 
485 aa  276  8e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.899515 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0805  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.62 
 
 
488 aa  276  9e-73  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0009  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  38.38 
 
 
487 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0009  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  38.38 
 
 
487 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.34316  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1578  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.28 
 
 
483 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0722651  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5306  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  37.95 
 
 
487 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000300598  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3391  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  39.41 
 
 
493 aa  275  1.0000000000000001e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.207114  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1639  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  37.37 
 
 
488 aa  275  1.0000000000000001e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0762082  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0207  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  38.52 
 
 
507 aa  275  1.0000000000000001e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0014  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  38.38 
 
 
487 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0120798  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0011  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  38.17 
 
 
487 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0009  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  38.17 
 
 
487 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0008  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  38.17 
 
 
487 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.241162  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1569  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.39 
 
 
476 aa  273  5.000000000000001e-72  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0288  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.36 
 
 
486 aa  272  9e-72  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0012  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  37.95 
 
 
487 aa  272  1e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0999  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  37.29 
 
 
491 aa  271  2e-71  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000499041  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1137  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  38.46 
 
 
489 aa  271  2e-71  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2217  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  37.81 
 
 
490 aa  269  7e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.166559  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0514  response regulator receiver protein  36.19 
 
 
484 aa  268  2e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.135977  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08496  putative inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  39.11 
 
 
490 aa  268  2e-70  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1108  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  38.46 
 
 
485 aa  268  2e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.927877  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1107  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  39.96 
 
 
503 aa  268  2e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.714847  normal  0.939326 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0548  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  41.01 
 
 
547 aa  267  2.9999999999999995e-70  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3087  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.71 
 
 
485 aa  266  4e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000190164  hitchhiker  0.00103544 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3287  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.25 
 
 
484 aa  266  5e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000039579  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0697  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  38.36 
 
 
490 aa  266  5.999999999999999e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0725248  normal  0.819187 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0829  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  39.6 
 
 
504 aa  266  5.999999999999999e-70  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.363415  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0737  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  37.23 
 
 
483 aa  265  1e-69  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.199419 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0500  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  38.25 
 
 
490 aa  265  1e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0225  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  36.4 
 
 
493 aa  265  1e-69  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1805  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  38.12 
 
 
485 aa  263  6e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0147128  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3126  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  39.19 
 
 
486 aa  262  8.999999999999999e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.151477 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1106  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.04 
 
 
483 aa  262  1e-68  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1949  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  38.2 
 
 
485 aa  261  2e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1200  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  38.09 
 
 
492 aa  260  3e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1159  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  37.69 
 
 
483 aa  259  5.0000000000000005e-68  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.839971  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0189  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  37.44 
 
 
489 aa  259  6e-68  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000133225  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2497  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  39.96 
 
 
485 aa  259  7e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0704163  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0979  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  38.2 
 
 
482 aa  259  7e-68  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0477  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  38.97 
 
 
494 aa  259  7e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.578734  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4214  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  38.03 
 
 
488 aa  259  9e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1904  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.37 
 
 
483 aa  259  1e-67  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00977743  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0988  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  37.74 
 
 
485 aa  258  2e-67  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00325513  hitchhiker  0.000530591 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0224  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.41 
 
 
485 aa  256  5e-67  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.218435  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0011  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  37.53 
 
 
494 aa  255  1.0000000000000001e-66  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0694392  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1616  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  38.21 
 
 
486 aa  255  2.0000000000000002e-66  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04740  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  38.81 
 
 
514 aa  254  3e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0612  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  37.69 
 
 
483 aa  254  3e-66  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00142081  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1200  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  38.09 
 
 
486 aa  253  4.0000000000000004e-66  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.608786  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>