More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0273 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_2440  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  70.56 
 
 
498 aa  665    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0285  IMP dehydrogenase family protein  71.82 
 
 
479 aa  688    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.264091  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2202  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  68.41 
 
 
487 aa  658    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7161  IMP dehydrogenase  68.68 
 
 
479 aa  644    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.3739  normal  0.0266118 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0273  IMP dehydrogenase family protein  100 
 
 
477 aa  944    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2628  IMP dehydrogenase family protein  69.1 
 
 
479 aa  645    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000146734  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0848  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  70.35 
 
 
479 aa  657    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.415468 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2437  IMP dehydrogenase family protein  69.52 
 
 
479 aa  664    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.692486  normal  0.0531703 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0791  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  69.94 
 
 
479 aa  654    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.151269  hitchhiker  0.00623467 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1231  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  69.28 
 
 
485 aa  645    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.861851  normal  0.215314 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1718  IMP dehydrogenase family protein  68.8 
 
 
484 aa  631  1e-180  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.289431 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0718  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  69.31 
 
 
477 aa  628  1e-179  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16310  IMP dehydrogenase family protein  68.18 
 
 
484 aa  624  1e-177  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.130696  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0780  IMP dehydrogenase family protein  65.76 
 
 
478 aa  612  9.999999999999999e-175  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1899  IMP dehydrogenase family protein  65.15 
 
 
482 aa  608  1e-173  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.303165  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2608  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  66.11 
 
 
478 aa  604  1.0000000000000001e-171  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0642643  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31560  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  65 
 
 
479 aa  594  1e-169  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1951  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  64.54 
 
 
485 aa  597  1e-169  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00883766 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3090  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  64.44 
 
 
478 aa  597  1e-169  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.314956 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11871  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  62.34 
 
 
478 aa  593  1e-168  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.146983  normal  0.269192 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2316  IMP dehydrogenase family protein  64.51 
 
 
479 aa  593  1e-168  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3360  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  62.34 
 
 
478 aa  582  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.731194  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2644  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  61.94 
 
 
492 aa  580  1e-164  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2840  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  62.97 
 
 
478 aa  575  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2813  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  62.97 
 
 
478 aa  575  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2857  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  62.97 
 
 
478 aa  575  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.699537  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2763  IMP dehydrogenase family protein  59.5 
 
 
478 aa  570  1e-161  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.572416  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07740  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  59.6 
 
 
493 aa  533  1e-150  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09190  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  58.04 
 
 
486 aa  527  1e-148  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3329  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  52.31 
 
 
478 aa  464  1e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3243  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  52.31 
 
 
478 aa  464  1e-129  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3133  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  51.47 
 
 
478 aa  461  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3135  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  51.26 
 
 
478 aa  458  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0649238  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1137  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  38.89 
 
 
489 aa  281  1e-74  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0749  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  37.79 
 
 
493 aa  280  4e-74  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1482  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  38.94 
 
 
482 aa  276  8e-73  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1436  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  38.94 
 
 
482 aa  275  9e-73  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0288  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.38 
 
 
486 aa  275  1.0000000000000001e-72  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0116  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.46 
 
 
508 aa  272  8.000000000000001e-72  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000189991  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1639  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  37.61 
 
 
488 aa  271  1e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0762082  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0514  response regulator receiver protein  36.83 
 
 
484 aa  270  4e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.135977  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0069  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  37.87 
 
 
488 aa  268  1e-70  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.110755  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0437  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  37.23 
 
 
488 aa  268  1e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0448  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  37.23 
 
 
488 aa  268  1e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1320  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  40.58 
 
 
504 aa  266  8.999999999999999e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0931634  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0009  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  37.66 
 
 
488 aa  265  1e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0009  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  37.23 
 
 
488 aa  265  1e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0212236  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0029  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.4 
 
 
485 aa  265  2e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.899515 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1108  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  37.69 
 
 
485 aa  263  6.999999999999999e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.927877  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3087  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  37.47 
 
 
485 aa  262  1e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000190164  hitchhiker  0.00103544 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2159  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  37.29 
 
 
493 aa  261  2e-68  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0694637  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1569  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.67 
 
 
476 aa  261  2e-68  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20480  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.32 
 
 
486 aa  261  3e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000012591  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1070  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  38.12 
 
 
485 aa  259  6e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.462822  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1471  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  37.72 
 
 
485 aa  259  7e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0143553  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0500  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  37.84 
 
 
490 aa  259  1e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0008  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  36.81 
 
 
487 aa  257  3e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1107  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  38.41 
 
 
503 aa  256  5e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.714847  normal  0.939326 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0008  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  37.45 
 
 
487 aa  256  7e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.303266  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1106  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.86 
 
 
483 aa  255  9e-67  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0805  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.32 
 
 
488 aa  256  9e-67  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0009  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  37.45 
 
 
487 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0009  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  37.45 
 
 
487 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.34316  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0014  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  37.45 
 
 
487 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0120798  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0011  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  37.23 
 
 
487 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0009  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  37.23 
 
 
487 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0008  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  37.23 
 
 
487 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.241162  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1578  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.74 
 
 
483 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0722651  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0012  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  37.02 
 
 
487 aa  254  3e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0594668  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5306  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  37.23 
 
 
487 aa  254  3e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000300598  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3126  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  39.53 
 
 
486 aa  254  3e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.151477 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1906  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.83 
 
 
484 aa  253  4.0000000000000004e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1012  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  37.42 
 
 
498 aa  253  4.0000000000000004e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.155508 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0011  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.94 
 
 
494 aa  252  1e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0694392  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0012  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  37.02 
 
 
487 aa  251  1e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1992  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  36.27 
 
 
493 aa  251  2e-65  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.369153  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0999  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.51 
 
 
491 aa  251  2e-65  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000499041  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0612  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  35.67 
 
 
483 aa  250  4e-65  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00142081  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0988  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  39.28 
 
 
485 aa  250  5e-65  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00325513  hitchhiker  0.000530591 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04740  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  39.75 
 
 
514 aa  249  7e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3391  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  37.13 
 
 
493 aa  249  1e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.207114  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0486  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.09 
 
 
482 aa  248  1e-64  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0207  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  38.09 
 
 
507 aa  248  2e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08496  putative inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  37.13 
 
 
490 aa  248  2e-64  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0225  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  36.02 
 
 
493 aa  248  2e-64  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1201  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  37.69 
 
 
485 aa  247  3e-64  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.795344  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1159  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  35.46 
 
 
483 aa  247  3e-64  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.839971  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1078  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  37.69 
 
 
485 aa  247  3e-64  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.472537  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0664  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  37.47 
 
 
485 aa  247  4e-64  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.116725  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0613  IMP dehydrogenase  38.7 
 
 
486 aa  246  4.9999999999999997e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000830235  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2596  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  38.48 
 
 
500 aa  246  8e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0697  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  37.87 
 
 
490 aa  245  9.999999999999999e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0725248  normal  0.819187 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2261  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  35.82 
 
 
484 aa  245  9.999999999999999e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0829  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  37.63 
 
 
504 aa  244  3e-63  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.363415  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2558  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  35.82 
 
 
484 aa  244  3e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0623  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  37.11 
 
 
492 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.637063 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1213  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  37.66 
 
 
513 aa  243  3.9999999999999997e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.398253  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4214  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  38 
 
 
488 aa  243  7.999999999999999e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3124  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.54 
 
 
489 aa  241  2e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0916  IMP dehydrogenase  34.9 
 
 
484 aa  241  2e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.366746  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>