More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1231 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_0285  IMP dehydrogenase family protein  69.48 
 
 
479 aa  677    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.264091  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2440  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  69.28 
 
 
498 aa  670    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0791  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  70.93 
 
 
479 aa  677    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.151269  hitchhiker  0.00623467 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1718  IMP dehydrogenase family protein  75.05 
 
 
484 aa  683    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.289431 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16310  IMP dehydrogenase family protein  73.82 
 
 
484 aa  668    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.130696  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2202  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  67.08 
 
 
487 aa  637    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2628  IMP dehydrogenase family protein  69.07 
 
 
479 aa  645    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000146734  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2437  IMP dehydrogenase family protein  68.04 
 
 
479 aa  667    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.692486  normal  0.0531703 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1231  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  100 
 
 
485 aa  957    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.861851  normal  0.215314 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0848  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  72.37 
 
 
479 aa  686    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.415468 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0780  IMP dehydrogenase family protein  66.6 
 
 
478 aa  635    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1951  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  71.46 
 
 
485 aa  654    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00883766 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7161  IMP dehydrogenase  68.04 
 
 
479 aa  634  1e-180  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.3739  normal  0.0266118 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1899  IMP dehydrogenase family protein  70.02 
 
 
482 aa  629  1e-179  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.303165  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0273  IMP dehydrogenase family protein  69.28 
 
 
477 aa  629  1e-179  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31560  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  67.63 
 
 
479 aa  624  1e-178  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2608  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  67.63 
 
 
478 aa  614  9.999999999999999e-175  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0642643  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0718  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  66.67 
 
 
477 aa  610  1e-173  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3090  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  65.78 
 
 
478 aa  609  1e-173  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.314956 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2316  IMP dehydrogenase family protein  66.6 
 
 
479 aa  607  9.999999999999999e-173  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2644  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  64.26 
 
 
492 aa  604  1.0000000000000001e-171  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3360  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  67.42 
 
 
478 aa  598  1e-170  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.731194  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11871  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  63.73 
 
 
478 aa  592  1e-168  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.146983  normal  0.269192 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2840  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  65.92 
 
 
478 aa  589  1e-167  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2763  IMP dehydrogenase family protein  63.92 
 
 
478 aa  588  1e-167  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.572416  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2813  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  65.92 
 
 
478 aa  589  1e-167  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2857  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  65.92 
 
 
478 aa  589  1e-167  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.699537  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07740  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  63.03 
 
 
493 aa  571  1e-161  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09190  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  60.32 
 
 
486 aa  554  1e-156  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3133  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  51.96 
 
 
478 aa  462  1e-129  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3243  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  50.72 
 
 
478 aa  448  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3135  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  50.72 
 
 
478 aa  445  1e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0649238  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3329  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  50.31 
 
 
478 aa  445  1e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0116  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.79 
 
 
508 aa  285  2.0000000000000002e-75  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000189991  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0009  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  37.27 
 
 
488 aa  265  1e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0212236  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0288  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.23 
 
 
486 aa  265  2e-69  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20480  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.53 
 
 
486 aa  265  2e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000012591  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1569  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.52 
 
 
476 aa  264  2e-69  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1320  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  38.74 
 
 
504 aa  263  6.999999999999999e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0931634  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0009  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  36.82 
 
 
488 aa  263  6.999999999999999e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1436  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.94 
 
 
482 aa  261  2e-68  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1578  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.86 
 
 
483 aa  260  3e-68  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0722651  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1482  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.15 
 
 
482 aa  261  3e-68  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1106  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.18 
 
 
483 aa  259  8e-68  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0448  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.17 
 
 
488 aa  258  2e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1639  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.86 
 
 
488 aa  258  2e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0762082  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0437  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.17 
 
 
488 aa  258  2e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1049  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.86 
 
 
496 aa  256  5e-67  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0106058 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0029  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.38 
 
 
485 aa  254  2.0000000000000002e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.899515 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0805  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.18 
 
 
488 aa  253  5.000000000000001e-66  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0749  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.6 
 
 
493 aa  253  6e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3391  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  37.32 
 
 
493 aa  253  7e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.207114  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3087  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.1 
 
 
485 aa  252  1e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000190164  hitchhiker  0.00103544 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2159  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  36.25 
 
 
493 aa  251  2e-65  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0694637  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2217  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.46 
 
 
490 aa  249  7e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.166559  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5306  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  36.34 
 
 
487 aa  249  7e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000300598  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0008  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  35.71 
 
 
487 aa  249  8e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1137  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.29 
 
 
489 aa  249  8e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0012  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  36.13 
 
 
487 aa  249  9e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0594668  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0008  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  36.13 
 
 
487 aa  248  1e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.303266  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0999  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.77 
 
 
491 aa  249  1e-64  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000499041  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0009  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  36.13 
 
 
487 aa  248  2e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0009  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  36.13 
 
 
487 aa  248  2e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.34316  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0014  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  36.13 
 
 
487 aa  248  2e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0120798  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1628  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.69 
 
 
497 aa  247  3e-64  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0011  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  35.92 
 
 
487 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0009  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  35.92 
 
 
487 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0737  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.63 
 
 
483 aa  246  4.9999999999999997e-64  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.199419 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0008  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  35.92 
 
 
487 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.241162  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0069  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.09 
 
 
488 aa  245  9.999999999999999e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.110755  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0207  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.84 
 
 
507 aa  245  9.999999999999999e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0979  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  36.15 
 
 
482 aa  245  1.9999999999999999e-63  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1433  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.77 
 
 
496 aa  244  1.9999999999999999e-63  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.51558 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0012  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  35.71 
 
 
487 aa  244  3e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1471  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  37.5 
 
 
485 aa  244  3e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0143553  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0948  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.52 
 
 
486 aa  243  3.9999999999999997e-63  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0486  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.44 
 
 
482 aa  243  3.9999999999999997e-63  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0514  response regulator receiver protein  34.39 
 
 
484 aa  243  5e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.135977  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1070  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.58 
 
 
485 aa  243  6e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.462822  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08496  putative inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.76 
 
 
490 aa  243  6e-63  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3126  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  39.32 
 
 
486 aa  243  6e-63  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.151477 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1616  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  37.53 
 
 
486 aa  243  7e-63  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04740  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  38.59 
 
 
514 aa  242  1e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1906  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.31 
 
 
484 aa  241  2e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1646  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  38.78 
 
 
484 aa  241  2e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.536649  hitchhiker  0.0000000511927 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1904  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  32.92 
 
 
483 aa  241  2e-62  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00977743  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1159  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  35.38 
 
 
483 aa  241  2e-62  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.839971  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1012  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  37.71 
 
 
498 aa  241  2e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.155508 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0011  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.74 
 
 
494 aa  241  2e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0694392  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2596  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  37.97 
 
 
500 aa  241  2.9999999999999997e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3287  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.18 
 
 
484 aa  241  2.9999999999999997e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000039579  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0276  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  37.84 
 
 
482 aa  240  2.9999999999999997e-62  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0623  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.71 
 
 
492 aa  240  4e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.637063 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1992  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  35.12 
 
 
493 aa  239  5e-62  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.369153  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1193  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.04 
 
 
490 aa  239  6.999999999999999e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0638  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  37.83 
 
 
504 aa  239  8e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.726913  normal  0.734007 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2497  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  38.85 
 
 
485 aa  238  1e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0704163  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1488  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.39 
 
 
497 aa  238  2e-61  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1108  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.52 
 
 
485 aa  238  2e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.927877  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0697  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.76 
 
 
490 aa  238  2e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0725248  normal  0.819187 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>