More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1899 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_2440  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  67.56 
 
 
498 aa  635    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0848  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  69.69 
 
 
479 aa  652    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.415468 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1231  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  70.84 
 
 
485 aa  655    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.861851  normal  0.215314 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0285  IMP dehydrogenase family protein  67.56 
 
 
479 aa  642    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.264091  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16310  IMP dehydrogenase family protein  77.32 
 
 
484 aa  717    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.130696  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1951  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  72.22 
 
 
485 aa  664    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00883766 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1718  IMP dehydrogenase family protein  73.4 
 
 
484 aa  682    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.289431 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1899  IMP dehydrogenase family protein  100 
 
 
482 aa  949    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.303165  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0791  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  68.87 
 
 
479 aa  648    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.151269  hitchhiker  0.00623467 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2437  IMP dehydrogenase family protein  67.28 
 
 
479 aa  638    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.692486  normal  0.0531703 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2202  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  66.05 
 
 
487 aa  629  1e-179  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2628  IMP dehydrogenase family protein  66.94 
 
 
479 aa  621  1e-177  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000146734  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7161  IMP dehydrogenase  66.12 
 
 
479 aa  619  1e-176  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.3739  normal  0.0266118 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0273  IMP dehydrogenase family protein  65.77 
 
 
477 aa  613  9.999999999999999e-175  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0780  IMP dehydrogenase family protein  65.08 
 
 
478 aa  613  9.999999999999999e-175  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3090  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  65.22 
 
 
478 aa  610  1e-173  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.314956 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0718  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  66.46 
 
 
477 aa  605  9.999999999999999e-173  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2608  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  67.56 
 
 
478 aa  605  9.999999999999999e-173  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0642643  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11871  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  64.39 
 
 
478 aa  605  9.999999999999999e-173  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.146983  normal  0.269192 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3360  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  66.05 
 
 
478 aa  603  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.731194  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2813  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  66.05 
 
 
478 aa  599  1e-170  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31560  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  65.5 
 
 
479 aa  598  1e-170  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2644  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  63.84 
 
 
492 aa  598  1e-170  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2857  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  66.05 
 
 
478 aa  599  1e-170  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.699537  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2840  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  66.05 
 
 
478 aa  599  1e-170  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2316  IMP dehydrogenase family protein  65.29 
 
 
479 aa  590  1e-167  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2763  IMP dehydrogenase family protein  63.84 
 
 
478 aa  587  1e-166  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.572416  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07740  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  63.51 
 
 
493 aa  563  1.0000000000000001e-159  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09190  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  58.68 
 
 
486 aa  540  9.999999999999999e-153  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3133  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  50 
 
 
478 aa  431  1e-119  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3243  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  49.9 
 
 
478 aa  427  1e-118  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3329  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  49.48 
 
 
478 aa  423  1e-117  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3135  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  49.06 
 
 
478 aa  421  1e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0649238  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1482  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  37.61 
 
 
482 aa  260  4e-68  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1436  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  37.61 
 
 
482 aa  260  5.0000000000000005e-68  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0116  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.79 
 
 
508 aa  254  3e-66  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000189991  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1137  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.88 
 
 
489 aa  251  2e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0437  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.46 
 
 
488 aa  248  2e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1616  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  37.79 
 
 
486 aa  248  2e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0448  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.46 
 
 
488 aa  248  2e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1471  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.34 
 
 
485 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0143553  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0749  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.82 
 
 
493 aa  244  3e-63  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0009  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  35.23 
 
 
488 aa  243  5e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0009  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  35.92 
 
 
488 aa  242  9e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0212236  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0288  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.58 
 
 
486 aa  242  1e-62  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20480  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.82 
 
 
486 aa  241  1e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000012591  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0805  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.72 
 
 
488 aa  241  2e-62  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1639  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.03 
 
 
488 aa  241  2e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0762082  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1569  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.67 
 
 
476 aa  241  2e-62  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3126  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  38.45 
 
 
486 aa  240  2.9999999999999997e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.151477 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1578  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.87 
 
 
483 aa  239  9e-62  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0722651  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0029  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.61 
 
 
485 aa  238  2e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.899515 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0189  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  33.97 
 
 
489 aa  238  2e-61  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000133225  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0069  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.03 
 
 
488 aa  236  6e-61  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.110755  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0207  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.34 
 
 
507 aa  235  1.0000000000000001e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0008  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  35.79 
 
 
487 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1320  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.61 
 
 
504 aa  236  1.0000000000000001e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0931634  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3087  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  33.83 
 
 
485 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000190164  hitchhiker  0.00103544 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1070  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.33 
 
 
485 aa  234  2.0000000000000002e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.462822  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1805  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.58 
 
 
485 aa  234  3e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0147128  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3391  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.48 
 
 
493 aa  233  6e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.207114  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0697  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.69 
 
 
490 aa  233  6e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0725248  normal  0.819187 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1107  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  38.19 
 
 
503 aa  233  7.000000000000001e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.714847  normal  0.939326 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1049  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.02 
 
 
496 aa  233  7.000000000000001e-60  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0106058 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2122  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.38 
 
 
491 aa  231  2e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100541 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1200  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.73 
 
 
492 aa  231  3e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0514  response regulator receiver protein  33.12 
 
 
484 aa  231  3e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.135977  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0008  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  35.85 
 
 
487 aa  229  6e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.303266  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1012  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.44 
 
 
498 aa  229  6e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.155508 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0988  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  37.71 
 
 
485 aa  229  8e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00325513  hitchhiker  0.000530591 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1886  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  33.75 
 
 
485 aa  228  1e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4214  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  37.69 
 
 
488 aa  229  1e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1628  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  33.2 
 
 
497 aa  228  1e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0009  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  35.79 
 
 
487 aa  228  2e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0012  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  35.64 
 
 
487 aa  228  2e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0594668  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0009  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  35.79 
 
 
487 aa  228  2e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.34316  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5306  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  35.85 
 
 
487 aa  228  2e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000300598  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0486  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.38 
 
 
482 aa  228  2e-58  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0014  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  35.79 
 
 
487 aa  228  2e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0120798  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0009  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  35.58 
 
 
487 aa  227  3e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0011  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  35.58 
 
 
487 aa  227  4e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0008  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  35.58 
 
 
487 aa  227  4e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.241162  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1459  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.5 
 
 
556 aa  227  4e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.439962  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0548  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.44 
 
 
547 aa  227  4e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1906  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.16 
 
 
484 aa  227  4e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04740  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  37.66 
 
 
514 aa  226  5.0000000000000005e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0829  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  37.04 
 
 
504 aa  226  6e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.363415  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1108  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.61 
 
 
485 aa  226  6e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.927877  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3287  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  32.7 
 
 
484 aa  225  1e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000039579  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2146  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  35.65 
 
 
498 aa  224  2e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1433  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  33.2 
 
 
496 aa  224  2e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.51558 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0012  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  35.37 
 
 
487 aa  224  2e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0916  IMP dehydrogenase  32.77 
 
 
484 aa  224  2e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.366746  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1949  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.58 
 
 
485 aa  224  2e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2195  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.96 
 
 
491 aa  224  3e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1314  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  36.97 
 
 
486 aa  224  3e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3124  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.57 
 
 
489 aa  224  3e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0737  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  33.96 
 
 
483 aa  223  4e-57  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.199419 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1106  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  33.12 
 
 
483 aa  223  4.9999999999999996e-57  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0224  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  32.27 
 
 
485 aa  223  4.9999999999999996e-57  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.218435  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>