More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2316 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_11871  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  73.33 
 
 
478 aa  704    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.146983  normal  0.269192 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2440  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  67.01 
 
 
498 aa  637    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2437  IMP dehydrogenase family protein  67.01 
 
 
479 aa  646    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.692486  normal  0.0531703 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2316  IMP dehydrogenase family protein  100 
 
 
479 aa  947    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31560  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  69.52 
 
 
479 aa  642    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0848  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  68.48 
 
 
479 aa  642    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.415468 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2763  IMP dehydrogenase family protein  71.82 
 
 
478 aa  679    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.572416  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2813  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  75.57 
 
 
478 aa  708    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0285  IMP dehydrogenase family protein  66.39 
 
 
479 aa  639    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.264091  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3360  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  79.33 
 
 
478 aa  735    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.731194  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2840  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  75.57 
 
 
478 aa  708    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0791  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  68.48 
 
 
479 aa  643    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.151269  hitchhiker  0.00623467 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2202  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  67.01 
 
 
487 aa  638    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2857  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  75.57 
 
 
478 aa  708    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.699537  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3090  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  77.24 
 
 
478 aa  726    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.314956 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7161  IMP dehydrogenase  66.18 
 
 
479 aa  630  1e-179  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.3739  normal  0.0266118 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0780  IMP dehydrogenase family protein  65.76 
 
 
478 aa  619  1e-176  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2628  IMP dehydrogenase family protein  65.34 
 
 
479 aa  619  1e-176  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000146734  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2608  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  67.85 
 
 
478 aa  619  1e-176  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0642643  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1231  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  66.6 
 
 
485 aa  617  1e-175  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.861851  normal  0.215314 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0718  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  68.48 
 
 
477 aa  613  9.999999999999999e-175  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1718  IMP dehydrogenase family protein  66.05 
 
 
484 aa  600  1e-170  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.289431 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16310  IMP dehydrogenase family protein  65.43 
 
 
484 aa  593  1e-168  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.130696  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0273  IMP dehydrogenase family protein  64.51 
 
 
477 aa  587  1e-166  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1899  IMP dehydrogenase family protein  64.46 
 
 
482 aa  583  1.0000000000000001e-165  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.303165  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1951  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  63.34 
 
 
485 aa  569  1e-161  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00883766 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2644  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  59.39 
 
 
492 aa  550  1e-155  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09190  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  59.02 
 
 
486 aa  535  1e-151  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07740  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  60.4 
 
 
493 aa  535  1e-151  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3133  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  51.77 
 
 
478 aa  444  1e-123  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3135  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  51.36 
 
 
478 aa  440  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0649238  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3243  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  50.52 
 
 
478 aa  436  1e-121  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3329  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  50.73 
 
 
478 aa  436  1e-121  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0448  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  38.27 
 
 
488 aa  266  8e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0437  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  38.27 
 
 
488 aa  266  8e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0009  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  36.92 
 
 
488 aa  265  1e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0212236  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0009  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  37.34 
 
 
488 aa  264  2e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20480  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.78 
 
 
486 aa  259  5.0000000000000005e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000012591  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4253  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  38.83 
 
 
500 aa  258  1e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1320  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  38.22 
 
 
504 aa  258  2e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0931634  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0009  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  37.79 
 
 
487 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0009  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  37.79 
 
 
487 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.34316  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5306  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  37.79 
 
 
487 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000300598  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0014  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  37.79 
 
 
487 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0120798  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0011  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  37.58 
 
 
487 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0009  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  37.58 
 
 
487 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0288  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.18 
 
 
486 aa  254  2.0000000000000002e-66  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0008  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  37.58 
 
 
487 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.241162  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0012  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  37.58 
 
 
487 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0594668  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4447  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  38.54 
 
 
501 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1012  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  38.8 
 
 
498 aa  254  2.0000000000000002e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.155508 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1569  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.23 
 
 
476 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0008  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  37.84 
 
 
487 aa  254  3e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.303266  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1578  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.67 
 
 
483 aa  254  3e-66  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0722651  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1482  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.71 
 
 
482 aa  253  4.0000000000000004e-66  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2159  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  36.76 
 
 
493 aa  253  5.000000000000001e-66  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0694637  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1436  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.71 
 
 
482 aa  253  5.000000000000001e-66  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0638  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  37.29 
 
 
504 aa  253  6e-66  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.726913  normal  0.734007 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0008  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  37 
 
 
487 aa  252  1e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0012  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  37.63 
 
 
487 aa  252  1e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0623  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.85 
 
 
492 aa  251  2e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.637063 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0069  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.36 
 
 
488 aa  250  3e-65  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.110755  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2596  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  39.34 
 
 
500 aa  251  3e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0805  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.32 
 
 
488 aa  249  6e-65  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1137  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.17 
 
 
489 aa  249  7e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0011  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  37.45 
 
 
494 aa  249  9e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0694392  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0979  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  35.53 
 
 
482 aa  249  1e-64  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0514  response regulator receiver protein  35.67 
 
 
484 aa  249  1e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.135977  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0829  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  39.2 
 
 
504 aa  248  2e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.363415  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1992  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  36.76 
 
 
493 aa  248  2e-64  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.369153  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1639  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.11 
 
 
488 aa  247  4e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0762082  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1108  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  37.02 
 
 
485 aa  246  8e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.927877  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1471  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  37.18 
 
 
485 aa  246  9e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0143553  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1160  IMP dehydrogenase  36.69 
 
 
493 aa  245  9.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.827083  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04740  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  39.38 
 
 
514 aa  244  3e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1091  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.17 
 
 
495 aa  244  3e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0116  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  33.9 
 
 
508 aa  243  6e-63  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000189991  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28670  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.51 
 
 
507 aa  243  7.999999999999999e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2195  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.42 
 
 
491 aa  242  1e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0366  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  38.92 
 
 
516 aa  242  1e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.213754 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3126  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  38.51 
 
 
486 aa  241  2e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.151477 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0742  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  37.08 
 
 
510 aa  241  2e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00516677  normal  0.265718 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0276  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  36.6 
 
 
482 aa  241  2e-62  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0749  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  33.26 
 
 
493 aa  241  2e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0916  IMP dehydrogenase  35.03 
 
 
484 aa  241  2.9999999999999997e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.366746  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1906  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.82 
 
 
484 aa  241  2.9999999999999997e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0548  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  37.97 
 
 
547 aa  240  4e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1805  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.89 
 
 
485 aa  240  4e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0147128  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1213  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  38.33 
 
 
513 aa  240  5e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.398253  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3391  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.65 
 
 
493 aa  240  5e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.207114  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1106  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.45 
 
 
483 aa  240  5e-62  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3087  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.11 
 
 
485 aa  239  5.999999999999999e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000190164  hitchhiker  0.00103544 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0999  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.89 
 
 
491 aa  239  8e-62  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000499041  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0207  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.39 
 
 
507 aa  239  9e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1159  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  34.04 
 
 
483 aa  239  1e-61  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.839971  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0029  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.12 
 
 
485 aa  239  1e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.899515 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0486  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  33.97 
 
 
482 aa  238  2e-61  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4227  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  38 
 
 
520 aa  238  2e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.147199 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1107  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  37.16 
 
 
503 aa  238  2e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.714847  normal  0.939326 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0500  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.23 
 
 
490 aa  237  3e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>