More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1951 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_1231  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  71.46 
 
 
485 aa  676    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.861851  normal  0.215314 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2440  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  67.9 
 
 
498 aa  644    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1718  IMP dehydrogenase family protein  73.31 
 
 
484 aa  684    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.289431 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1899  IMP dehydrogenase family protein  71.6 
 
 
482 aa  657    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.303165  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2437  IMP dehydrogenase family protein  66.39 
 
 
479 aa  644    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.692486  normal  0.0531703 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0285  IMP dehydrogenase family protein  66.87 
 
 
479 aa  649    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.264091  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1951  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  100 
 
 
485 aa  957    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00883766 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16310  IMP dehydrogenase family protein  75.98 
 
 
484 aa  716    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.130696  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2628  IMP dehydrogenase family protein  66.6 
 
 
479 aa  632  1e-180  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000146734  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0848  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  66.67 
 
 
479 aa  632  1e-180  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.415468 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0791  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  66.46 
 
 
479 aa  630  1e-179  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.151269  hitchhiker  0.00623467 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2202  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  66.87 
 
 
487 aa  626  1e-178  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7161  IMP dehydrogenase  65.23 
 
 
479 aa  611  1e-173  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.3739  normal  0.0266118 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0780  IMP dehydrogenase family protein  63.58 
 
 
478 aa  609  1e-173  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31560  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  65.84 
 
 
479 aa  605  9.999999999999999e-173  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3090  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  64.12 
 
 
478 aa  606  9.999999999999999e-173  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.314956 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11871  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  63.71 
 
 
478 aa  603  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.146983  normal  0.269192 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0273  IMP dehydrogenase family protein  64.54 
 
 
477 aa  598  1e-169  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3360  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  64.95 
 
 
478 aa  593  1e-168  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.731194  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2608  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  66.19 
 
 
478 aa  593  1e-168  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0642643  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07740  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  65.25 
 
 
493 aa  587  1e-166  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2813  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  64.12 
 
 
478 aa  587  1e-166  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0718  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  66.05 
 
 
477 aa  587  1e-166  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2644  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  63.36 
 
 
492 aa  585  1e-166  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2840  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  64.12 
 
 
478 aa  587  1e-166  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2857  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  64.12 
 
 
478 aa  587  1e-166  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.699537  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2316  IMP dehydrogenase family protein  63.34 
 
 
479 aa  578  1e-164  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2763  IMP dehydrogenase family protein  62.22 
 
 
478 aa  573  1.0000000000000001e-162  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.572416  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09190  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  58.81 
 
 
486 aa  532  1e-150  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3243  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  52.38 
 
 
478 aa  452  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3329  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  51.97 
 
 
478 aa  449  1e-125  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3135  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  51.35 
 
 
478 aa  447  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0649238  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3133  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  51.35 
 
 
478 aa  448  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0116  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  38.11 
 
 
508 aa  278  1e-73  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000189991  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1482  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  38.2 
 
 
482 aa  272  1e-71  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1436  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  38.2 
 
 
482 aa  271  2e-71  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0009  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  36.19 
 
 
488 aa  268  2e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0212236  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0009  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  36.82 
 
 
488 aa  266  7e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0029  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.17 
 
 
485 aa  262  8.999999999999999e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.899515 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1569  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.92 
 
 
476 aa  261  2e-68  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0437  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.9 
 
 
488 aa  261  2e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0448  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.9 
 
 
488 aa  261  2e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1320  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  40.42 
 
 
504 aa  260  3e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0931634  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0805  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.92 
 
 
488 aa  260  4e-68  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1639  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.52 
 
 
488 aa  259  5.0000000000000005e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0762082  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0623  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  39.34 
 
 
492 aa  258  1e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.637063 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1012  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  38.23 
 
 
498 aa  259  1e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.155508 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0008  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  36.9 
 
 
487 aa  258  1e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.303266  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20480  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.76 
 
 
486 aa  258  1e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000012591  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1805  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  39.2 
 
 
485 aa  257  3e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0147128  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0009  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  36.69 
 
 
487 aa  256  6e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0009  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  36.69 
 
 
487 aa  256  6e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.34316  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0014  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  36.69 
 
 
487 aa  256  6e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0120798  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0008  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  36.42 
 
 
487 aa  256  6e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5306  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  36.69 
 
 
487 aa  256  7e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000300598  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0012  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  36.48 
 
 
487 aa  256  9e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0594668  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0011  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  36.84 
 
 
487 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0009  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  36.84 
 
 
487 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0008  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  36.84 
 
 
487 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.241162  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1471  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  38.11 
 
 
485 aa  255  2.0000000000000002e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0143553  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1106  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.57 
 
 
483 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0638  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  38.27 
 
 
504 aa  254  3e-66  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.726913  normal  0.734007 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0749  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.86 
 
 
493 aa  253  4.0000000000000004e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0069  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.7 
 
 
488 aa  253  5.000000000000001e-66  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.110755  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4447  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  40.53 
 
 
501 aa  253  6e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0012  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  36.63 
 
 
487 aa  253  7e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0288  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.82 
 
 
486 aa  253  7e-66  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1578  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.29 
 
 
483 aa  252  1e-65  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0722651  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1616  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  37.42 
 
 
486 aa  251  2e-65  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1108  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.86 
 
 
485 aa  250  3e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.927877  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2195  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  38.11 
 
 
491 aa  249  6e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3391  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  38.41 
 
 
493 aa  249  8e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.207114  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3126  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  40.04 
 
 
486 aa  249  8e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.151477 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0514  response regulator receiver protein  35.05 
 
 
484 aa  248  1e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.135977  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1137  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.27 
 
 
489 aa  248  2e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4253  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  38.55 
 
 
500 aa  248  2e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2596  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  39.75 
 
 
500 aa  247  3e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0988  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  39.33 
 
 
485 aa  247  4e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00325513  hitchhiker  0.000530591 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04740  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  40.17 
 
 
514 aa  246  6.999999999999999e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3645  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  37.3 
 
 
500 aa  246  6.999999999999999e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.808002  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0737  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.21 
 
 
483 aa  245  9.999999999999999e-64  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.199419 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3055  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  37.22 
 
 
505 aa  245  9.999999999999999e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.171926 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3287  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  33.69 
 
 
484 aa  245  1.9999999999999999e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000039579  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3087  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.52 
 
 
485 aa  243  6e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000190164  hitchhiker  0.00103544 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2159  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  35.56 
 
 
493 aa  243  6e-63  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0694637  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1524  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  38.82 
 
 
486 aa  243  6e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.048391  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2549  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  38.82 
 
 
486 aa  243  6e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.425317  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1314  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  39.03 
 
 
486 aa  243  6e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2405  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  38.82 
 
 
486 aa  243  6e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.323419  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1295  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  38.82 
 
 
486 aa  243  6e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1628  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  33.87 
 
 
497 aa  243  6e-63  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3287  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  38.82 
 
 
486 aa  243  6e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00821787  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2457  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  38.82 
 
 
486 aa  243  6e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195801  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2024  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  38.82 
 
 
486 aa  243  6e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.637626  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2293  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  37.26 
 
 
491 aa  243  7.999999999999999e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.711267  normal  0.709548 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0011  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  37.16 
 
 
494 aa  242  7.999999999999999e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0694392  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1706  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  38.87 
 
 
486 aa  242  9e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0207  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  37.74 
 
 
507 aa  241  1e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0999  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  37.06 
 
 
491 aa  242  1e-62  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000499041  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0189  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.8 
 
 
489 aa  242  1e-62  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000133225  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>