More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2763 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_2316  IMP dehydrogenase family protein  71.82 
 
 
479 aa  664    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2763  IMP dehydrogenase family protein  100 
 
 
478 aa  944    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.572416  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11871  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  69.52 
 
 
478 aa  665    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.146983  normal  0.269192 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2840  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  72.23 
 
 
478 aa  666    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3360  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  72.03 
 
 
478 aa  664    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.731194  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2813  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  72.23 
 
 
478 aa  666    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31560  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  68.27 
 
 
479 aa  640    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2857  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  72.23 
 
 
478 aa  666    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.699537  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3090  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  70.35 
 
 
478 aa  659    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.314956 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0848  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  64.93 
 
 
479 aa  623  1e-177  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.415468 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2440  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  64.51 
 
 
498 aa  618  1e-176  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0718  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  66.18 
 
 
477 aa  618  1e-176  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0285  IMP dehydrogenase family protein  63.47 
 
 
479 aa  620  1e-176  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.264091  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0791  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  64.72 
 
 
479 aa  617  1e-175  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.151269  hitchhiker  0.00623467 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2608  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  67.85 
 
 
478 aa  611  9.999999999999999e-175  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0642643  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2628  IMP dehydrogenase family protein  64.72 
 
 
479 aa  610  1e-173  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000146734  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2437  IMP dehydrogenase family protein  63.47 
 
 
479 aa  608  1e-173  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.692486  normal  0.0531703 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2202  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  64.09 
 
 
487 aa  608  1e-173  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0780  IMP dehydrogenase family protein  63.24 
 
 
478 aa  597  1e-169  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1718  IMP dehydrogenase family protein  64.12 
 
 
484 aa  592  1e-168  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.289431 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1231  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  63.92 
 
 
485 aa  588  1e-167  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.861851  normal  0.215314 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7161  IMP dehydrogenase  62.21 
 
 
479 aa  584  1.0000000000000001e-165  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.3739  normal  0.0266118 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16310  IMP dehydrogenase family protein  62.96 
 
 
484 aa  571  1.0000000000000001e-162  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.130696  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1899  IMP dehydrogenase family protein  63.22 
 
 
482 aa  569  1e-161  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.303165  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1951  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  61.91 
 
 
485 aa  556  1e-157  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00883766 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0273  IMP dehydrogenase family protein  59.5 
 
 
477 aa  554  1e-156  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2644  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  58.99 
 
 
492 aa  535  1e-151  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09190  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  56.64 
 
 
486 aa  508  9.999999999999999e-143  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07740  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  55.96 
 
 
493 aa  483  1e-135  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3133  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  49.58 
 
 
478 aa  421  1e-116  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3135  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  48.75 
 
 
478 aa  416  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0649238  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3243  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  48.12 
 
 
478 aa  410  1e-113  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3329  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  48.12 
 
 
478 aa  410  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0009  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  37.37 
 
 
488 aa  263  4.999999999999999e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0437  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  37.26 
 
 
488 aa  262  1e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0448  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  37.26 
 
 
488 aa  262  1e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0009  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  36.52 
 
 
488 aa  259  7e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0212236  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0029  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.68 
 
 
485 aa  256  4e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.899515 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1569  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.76 
 
 
476 aa  257  4e-67  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0008  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  36.6 
 
 
487 aa  256  5e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1482  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.96 
 
 
482 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1436  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.08 
 
 
482 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0116  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.42 
 
 
508 aa  252  1e-65  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000189991  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20480  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.38 
 
 
486 aa  251  2e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000012591  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1578  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.23 
 
 
483 aa  250  5e-65  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0722651  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5306  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  37.23 
 
 
487 aa  249  6e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000300598  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1639  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.39 
 
 
488 aa  249  8e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0762082  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0011  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  37.02 
 
 
487 aa  249  8e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0009  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  37.02 
 
 
487 aa  249  8e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0008  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  37.02 
 
 
487 aa  249  8e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.241162  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0009  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  37.02 
 
 
487 aa  248  1e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0009  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  37.02 
 
 
487 aa  248  1e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.34316  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0014  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  37.02 
 
 
487 aa  248  1e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0120798  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0012  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  37.02 
 
 
487 aa  249  1e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0594668  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1906  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.11 
 
 
484 aa  248  2e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0008  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  37.02 
 
 
487 aa  248  2e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.303266  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0012  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  36.81 
 
 
487 aa  247  3e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0288  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.9 
 
 
486 aa  245  9.999999999999999e-64  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1320  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  37.89 
 
 
504 aa  245  1.9999999999999999e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0931634  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0514  response regulator receiver protein  34.4 
 
 
484 aa  244  3e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.135977  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0749  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.26 
 
 
493 aa  243  3.9999999999999997e-63  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0916  IMP dehydrogenase  35.26 
 
 
484 aa  241  2e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.366746  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0069  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.23 
 
 
488 aa  240  5e-62  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.110755  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3087  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.62 
 
 
485 aa  239  9e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000190164  hitchhiker  0.00103544 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1012  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.78 
 
 
498 aa  239  9e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.155508 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1070  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.62 
 
 
485 aa  236  5.0000000000000005e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.462822  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0011  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.4 
 
 
494 aa  236  1.0000000000000001e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0694392  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1108  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.97 
 
 
485 aa  234  2.0000000000000002e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.927877  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0805  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  33.26 
 
 
488 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1137  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.83 
 
 
489 aa  233  5e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2159  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  34.81 
 
 
493 aa  232  1e-59  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0694637  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3391  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.73 
 
 
493 aa  230  4e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.207114  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1805  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.12 
 
 
485 aa  230  5e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0147128  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1471  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.47 
 
 
485 aa  229  6e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0143553  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2596  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  38.12 
 
 
500 aa  229  1e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1200  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.89 
 
 
492 aa  228  2e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2195  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.16 
 
 
491 aa  226  5.0000000000000005e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1628  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  32.6 
 
 
497 aa  226  9e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2122  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.29 
 
 
491 aa  226  1e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100541 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1616  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  33.83 
 
 
486 aa  224  2e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0737  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.33 
 
 
483 aa  224  2e-57  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.199419 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1992  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  34.25 
 
 
493 aa  224  2e-57  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.369153  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4253  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.21 
 
 
500 aa  224  3e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1556  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.18 
 
 
486 aa  223  4e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0214645  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0189  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  31.93 
 
 
489 aa  223  7e-57  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000133225  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08496  putative inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.23 
 
 
490 aa  223  7e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1091  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.43 
 
 
495 aa  221  3e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4214  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.34 
 
 
488 aa  221  3e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0207  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.33 
 
 
507 aa  220  3e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2293  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.74 
 
 
491 aa  220  5e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.711267  normal  0.709548 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1159  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  35.03 
 
 
483 aa  218  1e-55  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.839971  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1459  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.1 
 
 
556 aa  219  1e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.439962  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0500  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.02 
 
 
490 aa  219  1e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0988  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.13 
 
 
485 aa  218  2e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00325513  hitchhiker  0.000530591 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0623  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.43 
 
 
492 aa  218  2e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.637063 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3124  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  32.55 
 
 
489 aa  217  2.9999999999999998e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4447  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.9 
 
 
501 aa  217  4e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1160  IMP dehydrogenase  35.08 
 
 
493 aa  216  9e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.827083  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1049  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  32.72 
 
 
496 aa  215  9.999999999999999e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0106058 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3126  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.9 
 
 
486 aa  216  9.999999999999999e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.151477 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>