More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0718 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_2440  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  68.27 
 
 
498 aa  645    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0718  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  100 
 
 
477 aa  944    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2628  IMP dehydrogenase family protein  69.73 
 
 
479 aa  661    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000146734  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2437  IMP dehydrogenase family protein  67.64 
 
 
479 aa  651    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.692486  normal  0.0531703 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31560  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  75.99 
 
 
479 aa  721    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2202  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  67.99 
 
 
487 aa  654    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7161  IMP dehydrogenase  68.68 
 
 
479 aa  645    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.3739  normal  0.0266118 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0285  IMP dehydrogenase family protein  67.22 
 
 
479 aa  649    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.264091  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3360  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  69.52 
 
 
478 aa  635    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.731194  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0791  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  68.06 
 
 
479 aa  647    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.151269  hitchhiker  0.00623467 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0848  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  68.89 
 
 
479 aa  654    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.415468 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2763  IMP dehydrogenase family protein  66.18 
 
 
478 aa  632  1e-180  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.572416  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11871  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  66.39 
 
 
478 aa  631  1e-180  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.146983  normal  0.269192 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0273  IMP dehydrogenase family protein  69.31 
 
 
477 aa  629  1e-179  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1718  IMP dehydrogenase family protein  68.87 
 
 
484 aa  630  1e-179  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.289431 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3090  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  67.64 
 
 
478 aa  630  1e-179  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.314956 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1231  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  66.67 
 
 
485 aa  627  1e-178  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.861851  normal  0.215314 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2813  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  68.89 
 
 
478 aa  624  1e-178  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2840  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  68.89 
 
 
478 aa  624  1e-178  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2857  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  68.89 
 
 
478 aa  624  1e-178  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.699537  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0780  IMP dehydrogenase family protein  65.34 
 
 
478 aa  620  1e-176  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2316  IMP dehydrogenase family protein  68.48 
 
 
479 aa  617  1e-175  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16310  IMP dehydrogenase family protein  68.25 
 
 
484 aa  612  9.999999999999999e-175  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.130696  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2608  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  67.01 
 
 
478 aa  606  9.999999999999999e-173  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0642643  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1899  IMP dehydrogenase family protein  65.84 
 
 
482 aa  601  1.0000000000000001e-171  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.303165  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1951  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  66.05 
 
 
485 aa  585  1e-166  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00883766 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09190  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  62 
 
 
486 aa  570  1e-161  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2644  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  58.7 
 
 
492 aa  555  1e-157  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07740  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  60.2 
 
 
493 aa  529  1e-149  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3133  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  52.4 
 
 
478 aa  458  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3329  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  52.31 
 
 
478 aa  447  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3243  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  52.31 
 
 
478 aa  447  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3135  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  51.68 
 
 
478 aa  444  1e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0649238  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0448  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  37.37 
 
 
488 aa  267  2.9999999999999995e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0437  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  37.37 
 
 
488 aa  267  2.9999999999999995e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0749  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  37.02 
 
 
493 aa  266  5.999999999999999e-70  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0009  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  37.92 
 
 
488 aa  266  5.999999999999999e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0009  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  36.65 
 
 
488 aa  263  6e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0212236  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0069  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  37.24 
 
 
488 aa  261  1e-68  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.110755  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1137  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  37.53 
 
 
489 aa  262  1e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1108  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  39.1 
 
 
485 aa  261  2e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.927877  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20480  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  37.5 
 
 
486 aa  261  3e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000012591  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0009  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  38.09 
 
 
487 aa  260  4e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0014  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  38.09 
 
 
487 aa  260  4e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0120798  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0009  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  38.09 
 
 
487 aa  260  4e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.34316  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0008  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  38.09 
 
 
487 aa  260  4e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.303266  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0011  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  37.87 
 
 
487 aa  259  6e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0009  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  37.87 
 
 
487 aa  259  6e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0008  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  37.87 
 
 
487 aa  259  6e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.241162  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5306  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  38.09 
 
 
487 aa  259  6e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000300598  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0012  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  37.87 
 
 
487 aa  259  7e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0594668  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1320  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  39.83 
 
 
504 aa  259  7e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0931634  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1471  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  38.33 
 
 
485 aa  258  1e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0143553  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1482  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  37.53 
 
 
482 aa  258  2e-67  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1436  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  37.53 
 
 
482 aa  257  3e-67  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0012  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  37.66 
 
 
487 aa  257  3e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0008  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  37.23 
 
 
487 aa  256  4e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1639  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.73 
 
 
488 aa  256  8e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0762082  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0116  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.92 
 
 
508 aa  253  6e-66  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000189991  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1906  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.54 
 
 
484 aa  253  7e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0029  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.17 
 
 
485 aa  251  2e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.899515 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2159  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  36.71 
 
 
493 aa  249  5e-65  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0694637  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1569  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.97 
 
 
476 aa  249  6e-65  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0999  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.81 
 
 
491 aa  248  1e-64  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000499041  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0514  response regulator receiver protein  35.44 
 
 
484 aa  247  3e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.135977  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3087  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.08 
 
 
485 aa  247  4e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000190164  hitchhiker  0.00103544 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0829  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  39.42 
 
 
504 aa  247  4e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.363415  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1070  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.91 
 
 
485 aa  246  4.9999999999999997e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.462822  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1578  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.53 
 
 
483 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0722651  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1107  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  38.28 
 
 
503 aa  244  3e-63  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.714847  normal  0.939326 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1992  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  37 
 
 
493 aa  244  3e-63  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.369153  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1106  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.43 
 
 
483 aa  243  3.9999999999999997e-63  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2122  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.17 
 
 
491 aa  243  3.9999999999999997e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100541 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3391  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  38.56 
 
 
493 aa  243  5e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.207114  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2195  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  37.71 
 
 
491 aa  242  1e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0011  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.98 
 
 
494 aa  242  1e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0694392  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0288  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.03 
 
 
486 aa  242  1e-62  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4214  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  37.87 
 
 
488 aa  242  1e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0805  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.1 
 
 
488 aa  242  1e-62  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3126  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  38.76 
 
 
486 aa  242  1e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.151477 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1200  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.52 
 
 
492 aa  242  1e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1616  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  37.45 
 
 
486 aa  241  2.9999999999999997e-62  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1805  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.84 
 
 
485 aa  240  2.9999999999999997e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0147128  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1012  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  37.37 
 
 
498 aa  241  2.9999999999999997e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.155508 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1078  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  36.44 
 
 
485 aa  240  4e-62  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.472537  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0225  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  35.86 
 
 
493 aa  240  4e-62  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1201  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  36.09 
 
 
485 aa  239  5e-62  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.795344  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3287  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.17 
 
 
484 aa  240  5e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000039579  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0612  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  36.52 
 
 
483 aa  238  2e-61  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00142081  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0664  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  36.02 
 
 
485 aa  238  2e-61  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.116725  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0697  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  37.13 
 
 
490 aa  237  3e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0725248  normal  0.819187 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1200  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.1 
 
 
486 aa  236  8e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.608786  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0276  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  38.77 
 
 
482 aa  235  1.0000000000000001e-60  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2558  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  35.76 
 
 
484 aa  235  1.0000000000000001e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0500  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.59 
 
 
490 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2293  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.44 
 
 
491 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.711267  normal  0.709548 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0908  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  35.31 
 
 
485 aa  234  2.0000000000000002e-60  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0207  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.23 
 
 
507 aa  234  2.0000000000000002e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1949  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.83 
 
 
485 aa  235  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3124  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.38 
 
 
489 aa  234  3e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>