48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0789 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_0789  putative transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 159 aa  318  1.9999999999999998e-86  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0544  CBS domain-containing protein  34.97 
 
 		 147 aa  91.3  5e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.761557  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1825  CBS domain-containing protein  36.08 
 
 		 162 aa  91.3  5e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00897459 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0943  putative signal transduction protein with CBS domains  35.25 
 
 		 154 aa  90.5  8e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1822  CBS domain containing protein  35.51 
 
 		 157 aa  89.7  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4032  CBS domain-containing protein  35.77 
 
 		 147 aa  81.6  0.000000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.129704  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3998  CBS domain protein  35.77 
 
 		 147 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3725  CBS domain-containing protein  35.77 
 
 		 147 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.748636  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3741  CBS domain-containing protein  35.77 
 
 		 147 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4196  CBS domain-containing protein  35.77 
 
 		 147 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.503923  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3893  CBS domain-containing protein  35.77 
 
 		 147 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.889403  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4103  CBS domain protein  35.04 
 
 		 147 aa  80.5  0.000000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.696532  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4086  CBS domain protein  35.04 
 
 		 147 aa  80.5  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1400  CBS domain-containing protein  30.52 
 
 		 153 aa  79.3  0.00000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3810  signal transduction protein  35.04 
 
 		 147 aa  79  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1154  CBS domain protein  35.04 
 
 		 147 aa  78.2  0.00000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2685  signal transduction protein  35.77 
 
 		 147 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.209094  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0305  CBS domain-containing protein  29.68 
 
 		 160 aa  72.8  0.000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1597  CBS domain-containing protein  29.94 
 
 		 157 aa  62.4  0.000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1687  putative transcriptional regulator, XRE family  31.9 
 
 		 151 aa  61.2  0.000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0948  CBS domain containing membrane protein  31.4 
 
 		 140 aa  53.5  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17480  predicted signal-transduction protein containing cAMP-binding and CBS domains  26.32 
 
 		 191 aa  52  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2120  CBS domain-containing protein  26.72 
 
 		 136 aa  51.6  0.000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2408  CBS domain-containing protein  26.72 
 
 		 136 aa  51.6  0.000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3340  CBS domain containing protein  24.06 
 
 		 142 aa  49.7  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000762759  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3057  CBS domain-containing protein  23.81 
 
 		 142 aa  45.1  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.193556  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1796  CBS domain-containing protein  24.44 
 
 		 315 aa  44.7  0.0006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.507937  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0935  CBS domain-containing protein  35.62 
 
 		 225 aa  44.3  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.872585  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1827  hypothetical protein  25.68 
 
 		 448 aa  42.7  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2949  protein of unknown function DUF21  28.03 
 
 		 469 aa  42.7  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4495  CBS domain-containing protein  27.21 
 
 		 214 aa  42.7  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0565  signal transduction protein  29.01 
 
 		 286 aa  42.4  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.632057  hitchhiker  0.00109381 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4917  acetoin utilization protein AcuB  27.21 
 
 		 214 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4799  acetoin utilization protein AcuB  27.21 
 
 		 214 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4413  acetoin utilization protein  27.21 
 
 		 214 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4396  acetoin utilization protein  27.21 
 
 		 214 aa  42.7  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4562  acetoin utilization protein AcuB  27.21 
 
 		 214 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4782  acetoin utilization protein AcuB  27.21 
 
 		 214 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4803  acetoin utilization protein AcuB  27.21 
 
 		 214 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1938  CBS domain-containing protein  25.44 
 
 		 143 aa  42  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.704039  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1217  CBS domain-containing protein  24.35 
 
 		 143 aa  42  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1435  CBS domain containing protein  31.03 
 
 		 427 aa  41.6  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0640  CBS domain-containing protein  33.9 
 
 		 150 aa  41.2  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3750  peptidase M50  26.51 
 
 		 372 aa  40.8  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.69281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0890  CBS domain-containing protein  28.77 
 
 		 291 aa  40.8  0.008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.192583  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0963  putative signal transduction protein with CBS domains  25.23 
 
 		 162 aa  40.4  0.009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000158107  normal  0.526521 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0847  signal transduction protein  24.81 
 
 		 287 aa  40.8  0.009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.766257  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2760  protein of unknown function DUF21  26.45 
 
 		 437 aa  40.4  0.01  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.24757  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>