36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1825 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_1825  CBS domain-containing protein  100 
 
 		 162 aa  329  8e-90  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00897459 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0544  CBS domain-containing protein  48.97 
 
 		 147 aa  135  2e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.761557  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1822  CBS domain containing protein  39.29 
 
 		 157 aa  99.8  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0943  putative signal transduction protein with CBS domains  37.16 
 
 		 154 aa  95.5  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4103  CBS domain protein  40.32 
 
 		 147 aa  95.1  4e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.696532  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4086  CBS domain protein  41.13 
 
 		 147 aa  94.7  5e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1154  CBS domain protein  41.13 
 
 		 147 aa  94.4  7e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2685  signal transduction protein  41.13 
 
 		 147 aa  93.2  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.209094  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4196  CBS domain-containing protein  39.52 
 
 		 147 aa  92.8  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.503923  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3725  CBS domain-containing protein  39.52 
 
 		 147 aa  92.8  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.748636  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3998  CBS domain protein  39.52 
 
 		 147 aa  92.8  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3893  CBS domain-containing protein  39.52 
 
 		 147 aa  92.8  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.889403  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3741  CBS domain-containing protein  39.52 
 
 		 147 aa  92.8  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4032  CBS domain-containing protein  39.52 
 
 		 147 aa  92.4  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.129704  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0789  putative transcriptional regulator, XRE family  36.08 
 
 		 159 aa  91.3  5e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3810  signal transduction protein  38.71 
 
 		 147 aa  89.7  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1400  CBS domain-containing protein  30.97 
 
 		 153 aa  88.2  4e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1687  putative transcriptional regulator, XRE family  38.19 
 
 		 151 aa  87  9e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1597  CBS domain-containing protein  31.41 
 
 		 157 aa  83.2  0.000000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0305  CBS domain-containing protein  29.88 
 
 		 160 aa  71.2  0.000000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3057  CBS domain-containing protein  27.35 
 
 		 142 aa  52.4  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.193556  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17480  predicted signal-transduction protein containing cAMP-binding and CBS domains  29.2 
 
 		 191 aa  46.2  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1622  Cl- channel, voltage-gated family protein  25.9 
 
 		 754 aa  45.4  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2120  CBS domain-containing protein  24.17 
 
 		 136 aa  45.8  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2408  CBS domain-containing protein  24.17 
 
 		 136 aa  45.8  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2232  CBS domain containing membrane protein  26.14 
 
 		 164 aa  43.5  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.510755 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20480  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  22.96 
 
 		 486 aa  42.7  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000012591  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1297  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  32.65 
 
 		 888 aa  43.1  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.795106  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0768  putative signal transduction protein with CBS and DRTGG domains  25 
 
 		 435 aa  42.4  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1091  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  25.89 
 
 		 495 aa  40.8  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2695  putative signal transduction protein with CBS and DRTGG domains  23.57 
 
 		 438 aa  40.4  0.009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0679  polynucleotide adenylyltransferase region  26.5 
 
 		 888 aa  40.8  0.009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.197003  normal  0.0338911 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1082  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  28.18 
 
 		 514 aa  40.8  0.009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3005  CBS domain-containing protein  22.31 
 
 		 210 aa  40.4  0.01  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0224331  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0935  CBS domain-containing protein  28.44 
 
 		 225 aa  40.4  0.01  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.872585  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0942  CBS domain containing membrane protein  25.38 
 
 		 277 aa  40.4  0.01  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0100206  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>