242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3005 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_3005  CBS domain-containing protein  100 
 
 
210 aa  429  1e-119  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0224331  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2131  CBS domain-containing protein  34.8 
 
 
206 aa  122  4e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2421  CBS domain-containing protein  34.8 
 
 
206 aa  122  5e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0937  CBS domain-containing protein  26.24 
 
 
232 aa  75.1  0.0000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.447969  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1577  AcuB family protein  26.92 
 
 
219 aa  68.9  0.00000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0947  CBS domain containing protein  27.98 
 
 
216 aa  67.8  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0017149 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3300  CBS domain containing protein  29.75 
 
 
216 aa  67.8  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.490249  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0709  CBS domain containing protein  27.66 
 
 
214 aa  67  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2623  CBS domain containing protein  26.5 
 
 
215 aa  64.7  0.0000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1550  CBS domain-containing protein  24.17 
 
 
215 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.241797  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1671  CBS domain-containing protein  27.6 
 
 
215 aa  63.9  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1605  CBS domain-containing protein  27.08 
 
 
215 aa  62.8  0.000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0765  CBS  25.42 
 
 
224 aa  62  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1136  signal transduction protein  26.02 
 
 
214 aa  61.6  0.000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1256  signal-transduction protein  27.69 
 
 
210 aa  61.2  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2131  CBS domain-containing protein  24.64 
 
 
215 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.766649  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0027  CBS domain containing protein  27.94 
 
 
210 aa  60.5  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.63793  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2052  CBS domain protein  24.64 
 
 
215 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0896141  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1097  hypothetical protein  24.23 
 
 
222 aa  59.7  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2162  CBS domain protein  24.17 
 
 
215 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.317884  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3255  CBS domain protein  24.64 
 
 
215 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.926669 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1877  hemolysin-like protein  25.7 
 
 
215 aa  59.3  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.287324  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2731  CBS domain containing membrane protein  26.6 
 
 
214 aa  58.9  0.00000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0937  putative signal transduction protein with CBS domains  27.13 
 
 
214 aa  58.9  0.00000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000079186  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4941  CBS domain containing protein  23.12 
 
 
208 aa  58.2  0.00000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0382465  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1915  CBS domain-containing protein  25.14 
 
 
215 aa  57.8  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1868  hemolysin-like protein  24.17 
 
 
215 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00862895  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2061  CBS domain-containing protein  25.14 
 
 
215 aa  57.8  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2094  CBS domain protein  25.14 
 
 
215 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1304  signal-transduction protein  24.31 
 
 
200 aa  56.6  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0309  CBS domain-containing protein  25.45 
 
 
230 aa  57.4  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.349467  normal  0.455645 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1916  CBS domain containing membrane protein  24.7 
 
 
219 aa  56.2  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.683041  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1524  signal transduction protein  26.28 
 
 
212 aa  56.6  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0592801 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2958  putative signal transduction protein with CBS domains  23.5 
 
 
217 aa  54.3  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.330392  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3404  signal transduction protein  27.81 
 
 
212 aa  54.7  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.843193  normal  0.543078 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1915  CBS domain-containing protein  23.38 
 
 
223 aa  53.5  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.451224  unclonable  0.00000680839 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2217  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  32.54 
 
 
490 aa  53.5  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.166559  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3292  signal transduction protein  25 
 
 
142 aa  53.1  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.792405 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0243  signal transduction protein  25 
 
 
155 aa  52.8  0.000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2551  signal transduction protein  24.3 
 
 
220 aa  53.1  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0552  putative signal transduction protein with CBS domains  26.72 
 
 
250 aa  52.8  0.000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.168262  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0328  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  31.62 
 
 
482 aa  52.4  0.000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6330  CBS domain containing protein  27.27 
 
 
139 aa  52.4  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.1107  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1198  CBS  29.09 
 
 
139 aa  52  0.000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1425  CBS domain-containing protein  30.69 
 
 
859 aa  52  0.000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2526  signal-transduction protein  30.53 
 
 
143 aa  52  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.526316  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0735  putative signal transduction protein with CBS domains  28.44 
 
 
290 aa  51.6  0.000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.14806  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3337  CBS domain-containing protein  23.81 
 
 
214 aa  52  0.000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.126622  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0153  signal-transduction protein  26.36 
 
 
142 aa  51.6  0.000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2097  CBS domain containing protein  24.17 
 
 
209 aa  51.6  0.000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2651  putative signal transduction protein with CBS domains  27.74 
 
 
161 aa  51.2  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.440356 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0898  CBS domain-containing protein  28.57 
 
 
266 aa  50.4  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0675  signal transduction protein  28.46 
 
 
153 aa  50.4  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.302021  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1700  acetoin utilization protein AcuB, putative  26.92 
 
 
133 aa  50.1  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0154068 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01513  hypothetical protein  28.57 
 
 
139 aa  50.1  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1716  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  28.37 
 
 
489 aa  50.4  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.626692  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0707  CBS domain containing membrane protein  23.4 
 
 
221 aa  50.8  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0771  signal-transduction protein  28.16 
 
 
164 aa  50.1  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.411579  normal  0.0544722 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0623  CBS  23.08 
 
 
143 aa  50.1  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0760  CBS domain containing protein  26.37 
 
 
217 aa  49.7  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1395  signal transduction protein  29.23 
 
 
153 aa  49.7  0.00003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6936  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  33.33 
 
 
490 aa  48.9  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.294111 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2060  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  24.17 
 
 
490 aa  48.9  0.00005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3698  CBS domain-containing protein  29.51 
 
 
202 aa  48.9  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.701418 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1253  CBS domain-containing protein  31.91 
 
 
150 aa  48.9  0.00006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.515572 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1622  Cl- channel, voltage-gated family protein  26.32 
 
 
754 aa  48.9  0.00006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2620  CBS domain protein  28.57 
 
 
146 aa  48.5  0.00007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00014001  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0490  signal transduction protein  26.12 
 
 
158 aa  48.5  0.00008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.630311  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02402  CBS domain protein  27.35 
 
 
148 aa  48.5  0.00008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.121948  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3446  signal transduction protein  24.14 
 
 
226 aa  48.5  0.00008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0113  CBS domain containing protein  21.78 
 
 
216 aa  48.5  0.00008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0768  CBS domain containing membrane protein  28.93 
 
 
138 aa  48.1  0.00009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.838909  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1281  signal transduction protein  26.62 
 
 
153 aa  48.1  0.00009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.366949  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4495  CBS domain-containing protein  23.28 
 
 
214 aa  47.8  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1843  CBS domain-containing protein  27.27 
 
 
181 aa  47.8  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4803  acetoin utilization protein AcuB  23.28 
 
 
214 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4562  acetoin utilization protein AcuB  23.28 
 
 
214 aa  48.1  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4396  acetoin utilization protein  23.28 
 
 
214 aa  48.1  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4413  acetoin utilization protein  23.28 
 
 
214 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4917  acetoin utilization protein AcuB  23.28 
 
 
214 aa  48.1  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0917  CBS domain-containing protein  28.81 
 
 
162 aa  47.4  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0848141 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0383  putative signal transduction protein with CBS domains  28.57 
 
 
149 aa  47.8  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0412615  normal  0.799719 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4799  acetoin utilization protein AcuB  23.28 
 
 
214 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4777  acetoin utilization protein AcuB  23.28 
 
 
214 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4782  acetoin utilization protein AcuB  23.28 
 
 
214 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0233  putative signal transduction protein with CBS domains  25.37 
 
 
140 aa  47.8  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.193926  normal  0.17761 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2925  CBS domain-containing protein  26.95 
 
 
139 aa  47.8  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00660702  normal  0.275882 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1126  putative signal transduction protein with CBS domains  25.4 
 
 
143 aa  47.8  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0462  acetoin utilization protein AcuB  23.28 
 
 
214 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000917116 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2848  CBS domain containing membrane protein  22.34 
 
 
223 aa  47.8  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0486  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  29.92 
 
 
482 aa  47.4  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3778  CBS domain-containing protein  26.09 
 
 
225 aa  47  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.857066  normal  0.425445 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1395  HPP family protein  28.24 
 
 
416 aa  47.4  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.877198  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2351  CBS domain-containing protein  27.97 
 
 
283 aa  47  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000984272  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08496  putative inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  28.33 
 
 
490 aa  47  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0535  CBS domain-containing protein  24.58 
 
 
256 aa  47  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0272  CBS domain-containing protein  25.89 
 
 
145 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1568  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  26.05 
 
 
488 aa  47  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0947  CBS domain-containing protein  27.27 
 
 
689 aa  46.6  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3135  CBS domain-containing protein  25.9 
 
 
141 aa  46.6  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0694667  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>