104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2421 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_2421  CBS domain-containing protein  100 
 
 
206 aa  404  1.0000000000000001e-112  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2131  CBS domain-containing protein  98.54 
 
 
206 aa  397  9.999999999999999e-111  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3005  CBS domain-containing protein  34.8 
 
 
210 aa  122  5e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0224331  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1671  CBS domain-containing protein  30.41 
 
 
215 aa  74.3  0.000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1605  CBS domain-containing protein  30.41 
 
 
215 aa  72.8  0.000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0268  CBS domain-containing protein  30.39 
 
 
226 aa  70.1  0.00000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.812709  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0760  CBS domain containing protein  26.13 
 
 
217 aa  68.6  0.00000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2097  CBS domain containing protein  25.58 
 
 
209 aa  63.5  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0714  signal transduction protein  23.94 
 
 
211 aa  62.8  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.135984  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0935  CBS domain-containing protein  25.7 
 
 
225 aa  62.4  0.000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.872585  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2958  putative signal transduction protein with CBS domains  24.77 
 
 
217 aa  61.6  0.000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.330392  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1256  signal-transduction protein  26.07 
 
 
210 aa  60.1  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1056  CBS domain-containing protein  27.91 
 
 
207 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0535  CBS domain-containing protein  25.94 
 
 
256 aa  59.3  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0260  CBS domain-containing protein  25.93 
 
 
212 aa  57.8  0.0000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000543985  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0709  CBS domain containing protein  25 
 
 
214 aa  57.8  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2280  putative signal transduction protein with CBS domains  23.68 
 
 
217 aa  57  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0397  CBS domain-containing protein  25.35 
 
 
214 aa  56.6  0.0000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3300  CBS domain containing protein  25 
 
 
216 aa  56.2  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.490249  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2551  signal transduction protein  27.43 
 
 
220 aa  55.1  0.0000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0937  putative signal transduction protein with CBS domains  26.11 
 
 
214 aa  55.1  0.0000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000079186  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0947  CBS domain containing protein  25 
 
 
216 aa  55.1  0.0000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0017149 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0962  putative signal transduction protein with CBS domains  24.88 
 
 
208 aa  54.3  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.55358  normal  0.0758366 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1384  CBS domain protein  26.32 
 
 
207 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1446  CBS domain-containing protein  27.39 
 
 
207 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.187706  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1247  CBS domain-containing protein  26.75 
 
 
207 aa  53.5  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1487  CBS domain protein  27.39 
 
 
207 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3960  CBS domain protein  26.79 
 
 
207 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1915  CBS domain-containing protein  24.63 
 
 
223 aa  53.1  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.451224  unclonable  0.00000680839 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2208  CBS domain-containing protein  26.76 
 
 
221 aa  53.1  0.000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000650498  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2623  CBS domain containing protein  23.83 
 
 
215 aa  52.4  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1234  CBS domain containing membrane protein  30.99 
 
 
380 aa  52.4  0.000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1097  hypothetical protein  24.89 
 
 
222 aa  52  0.000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1224  hypothetical protein  27.54 
 
 
207 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2052  CBS domain protein  24.53 
 
 
215 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0896141  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1577  AcuB family protein  24.86 
 
 
219 aa  50.4  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1249  CBS domain-containing protein  26.75 
 
 
207 aa  50.1  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1222  hypothetical protein  26.75 
 
 
207 aa  50.1  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00319032  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1348  CBS domain-containing protein  26.75 
 
 
207 aa  50.1  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2685  signal transduction protein  27.91 
 
 
147 aa  50.4  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.209094  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3810  signal transduction protein  26.92 
 
 
147 aa  50.1  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2848  CBS domain containing membrane protein  25.25 
 
 
223 aa  50.1  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3255  CBS domain protein  24.53 
 
 
215 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.926669 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1421  CBS domain protein  26.75 
 
 
207 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0200653 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0027  CBS domain containing protein  25.12 
 
 
210 aa  50.4  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.63793  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1912  CBS domain-containing protein  24.41 
 
 
215 aa  49.7  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.043579  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0949  hypothetical protein  23.44 
 
 
453 aa  48.5  0.00006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000990304  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4086  CBS domain protein  26.15 
 
 
147 aa  48.5  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1868  hemolysin-like protein  23.11 
 
 
215 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00862895  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1136  signal transduction protein  24.87 
 
 
214 aa  47.8  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1013  CBS domain-containing protein  22.97 
 
 
216 aa  47.8  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0086429  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1678  hypothetical protein  27.34 
 
 
444 aa  47.4  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.306047  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1154  CBS domain protein  26.15 
 
 
147 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1533  CBS domain containing membrane protein  21.67 
 
 
223 aa  47.4  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.279871  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2131  CBS domain-containing protein  23.11 
 
 
215 aa  47  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.766649  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1915  CBS domain-containing protein  23.11 
 
 
215 aa  47  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0765  CBS  23.77 
 
 
224 aa  46.6  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2061  CBS domain-containing protein  23.11 
 
 
215 aa  47  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2753  hypothetical protein  23.98 
 
 
431 aa  46.6  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.429535  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1550  CBS domain-containing protein  25 
 
 
215 aa  47  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.241797  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4103  CBS domain protein  25.38 
 
 
147 aa  47  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.696532  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2094  CBS domain protein  23.11 
 
 
215 aa  47  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4032  CBS domain-containing protein  25.38 
 
 
147 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.129704  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0309  CBS domain-containing protein  25.57 
 
 
230 aa  46.6  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.349467  normal  0.455645 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2162  CBS domain protein  22.69 
 
 
215 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.317884  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0113  CBS domain containing protein  22.07 
 
 
216 aa  46.2  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1877  hemolysin-like protein  23.11 
 
 
215 aa  45.8  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.287324  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7487  hypothetical protein  25.68 
 
 
436 aa  45.8  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.160114 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3893  CBS domain-containing protein  25.38 
 
 
147 aa  45.8  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.889403  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3725  CBS domain-containing protein  25.38 
 
 
147 aa  45.8  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.748636  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3741  CBS domain-containing protein  25.38 
 
 
147 aa  45.8  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4196  CBS domain-containing protein  25.38 
 
 
147 aa  45.8  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.503923  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3998  CBS domain protein  25.38 
 
 
147 aa  45.8  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0544  CBS domain-containing protein  25.41 
 
 
147 aa  45.4  0.0006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.761557  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0486  signal transduction protein  30.3 
 
 
258 aa  45.1  0.0007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1761  hypothetical protein  27.34 
 
 
447 aa  45.1  0.0008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0357  Cl- channel, voltage-gated family protein  33.02 
 
 
588 aa  44.3  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0069  signal transduction protein  36.9 
 
 
158 aa  44.7  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0644  magnesium and cobalt efflux protein CorC  25 
 
 
442 aa  44.3  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0795  CBS domain containing protein  24.62 
 
 
281 aa  44.3  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0320  CBS domain-containing protein  27.5 
 
 
432 aa  43.5  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00497415  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1141  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  27.95 
 
 
486 aa  43.5  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.144187 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1058  KpsF/GutQ family protein  26.5 
 
 
338 aa  43.9  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal  0.335757 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2035  CBS domain-containing protein  22.56 
 
 
143 aa  43.9  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1625  signal transduction protein  25.86 
 
 
303 aa  43.5  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1304  signal-transduction protein  25.28 
 
 
200 aa  43.9  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0498  CBS domain-containing protein  26.52 
 
 
279 aa  43.9  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.235797  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3995  CBS domain-containing protein  27.56 
 
 
133 aa  43.9  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2925  hypothetical protein  26.67 
 
 
465 aa  43.9  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.221134  normal  0.412302 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0707  CBS domain containing membrane protein  23.81 
 
 
221 aa  43.9  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1032  peptidase M50  26.67 
 
 
395 aa  43.9  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0615226 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1660  CBS domain containing protein  23.44 
 
 
461 aa  43.9  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0738  diguanylate cyclase  27.41 
 
 
274 aa  42.7  0.003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.591119  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2711  hypothetical protein  22.68 
 
 
431 aa  43.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.155736 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0151  magnesium and cobalt efflux protein CorC  23.02 
 
 
433 aa  42.7  0.003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1524  signal transduction protein  23.17 
 
 
212 aa  43.1  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0592801 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2906  signal transduction protein  24.1 
 
 
291 aa  42.7  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0833  CBS domain-containing protein  20.87 
 
 
211 aa  42.7  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0964  putative signal transduction protein with CBS domains  26.5 
 
 
132 aa  42  0.006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0966  hypothetical protein  24.81 
 
 
331 aa  41.6  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>