More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_2753 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_3152  protein of unknown function DUF21  79.02 
 
 		 431 aa  683    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2711  hypothetical protein  90.95 
 
 		 431 aa  776    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.155736 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2753  hypothetical protein  77.67 
 
 		 433 aa  643    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.151662  normal  0.98691 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2753  hypothetical protein  100 
 
 		 431 aa  848    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.429535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7487  hypothetical protein  71.19 
 
 		 436 aa  614  1e-175  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.160114 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1919  hemolysin  50.71 
 
 		 430 aa  424  1e-117  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3672  hypothetical protein  52.59 
 
 		 425 aa  422  1e-117  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00780947 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0828  protein of unknown function DUF21  51.18 
 
 		 424 aa  423  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0942  protein of unknown function DUF21  51.18 
 
 		 424 aa  419  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.429612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2122  hypothetical protein  49.77 
 
 		 436 aa  418  1e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.705935  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3348  hypothetical protein  52.48 
 
 		 429 aa  418  9.999999999999999e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0165594  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0723  hypothetical protein  52.96 
 
 		 425 aa  401  9.999999999999999e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4282  hypothetical protein  52.12 
 
 		 434 aa  396  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.789831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4139  hypothetical protein  49.02 
 
 		 452 aa  393  1e-108  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0969684 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2321  hypothetical protein  46.5 
 
 		 446 aa  380  1e-104  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.638143  normal  0.0384275 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5725  hypothetical protein  51.33 
 
 		 434 aa  372  1e-102  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.239106  hitchhiker  0.00714589 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2673  hypothetical protein  50.83 
 
 		 424 aa  366  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.460279  normal  0.557621 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1013  hemolysin  50.83 
 
 		 424 aa  366  1e-100  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.471918  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3174  hypothetical protein  45 
 
 		 458 aa  368  1e-100  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3102  hypothetical protein  47.04 
 
 		 466 aa  366  1e-100  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0806544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0756  hypothetical protein  44.7 
 
 		 436 aa  347  2e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0635919  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2766  hypothetical protein  42.96 
 
 		 442 aa  340  4e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5623  protein of unknown function DUF21  52.83 
 
 		 403 aa  334  2e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4403  hypothetical protein  44.13 
 
 		 436 aa  333  2e-90  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0196704  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3597  protein of unknown function DUF21  40.44 
 
 		 447 aa  325  1e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000988374 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2233  protein of unknown function DUF21  41.27 
 
 		 437 aa  324  2e-87  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0926  protein of unknown function DUF21  41.16 
 
 		 441 aa  316  6e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1413  hypothetical protein  39.58 
 
 		 430 aa  309  6.999999999999999e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0999393  normal  0.104956 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4050  hypothetical protein  39.67 
 
 		 440 aa  309  6.999999999999999e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0807851  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1287  protein of unknown function DUF21  39.44 
 
 		 428 aa  306  4.0000000000000004e-82  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2480  hemolysin  40.28 
 
 		 436 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1314  hypothetical protein  41.55 
 
 		 439 aa  302  7.000000000000001e-81  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0274508  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1085  hypothetical protein  40.9 
 
 		 464 aa  302  9e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.792914 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2815  CBS domain-containing protein  36.19 
 
 		 439 aa  301  1e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3036  CBS  38.19 
 
 		 442 aa  299  8e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0264  hypothetical protein  40.93 
 
 		 432 aa  298  1e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.265353 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2774  protein of unknown function DUF21  39.68 
 
 		 440 aa  297  2e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.730131  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3770  hypothetical protein  40.14 
 
 		 441 aa  296  3e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4935  hypothetical protein  39.44 
 
 		 443 aa  297  3e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2432  protein of unknown function DUF21  38.81 
 
 		 443 aa  296  7e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3678  protein of unknown function DUF21  38.81 
 
 		 443 aa  296  7e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.35091 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2313  hypothetical protein  39.38 
 
 		 438 aa  295  1e-78  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0831  protein of unknown function DUF21  39.63 
 
 		 452 aa  293  4e-78  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0300168 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3447  hypothetical protein  39.22 
 
 		 440 aa  292  8e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3640  hypothetical protein  40.05 
 
 		 441 aa  291  1e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0021  protein of unknown function DUF21  40.86 
 
 		 435 aa  291  1e-77  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.099852 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2846  protein of unknown function DUF21  37.35 
 
 		 443 aa  290  5.0000000000000004e-77  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1250  CBS domain-containing protein  38.59 
 
 		 432 aa  288  1e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.144301  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2439  protein of unknown function DUF21  36.64 
 
 		 443 aa  287  2e-76  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2385  hypothetical protein  39.07 
 
 		 433 aa  286  7e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0902  protein of unknown function DUF21  35.58 
 
 		 436 aa  285  1.0000000000000001e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0608  hemolysin  38.76 
 
 		 439 aa  284  2.0000000000000002e-75  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0562  hypothetical protein  38.76 
 
 		 439 aa  284  2.0000000000000002e-75  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.371677  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2077  CBS domain-containing protein  38.76 
 
 		 441 aa  283  4.0000000000000003e-75  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1577  protein of unknown function DUF21  40.05 
 
 		 447 aa  282  9e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.569313  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00183  hemolysin  39.07 
 
 		 435 aa  282  1e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.702411  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0470  hypothetical protein  37.85 
 
 		 432 aa  281  2e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000200568  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4228  hypothetical protein  39.91 
 
 		 445 aa  279  6e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.351193  normal  0.199337 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35020  hemolysin-like protein  37.89 
 
 		 432 aa  278  1e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.518958  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0266  protein of unknown function DUF21  39.29 
 
 		 444 aa  278  1e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1932  CBS  36.51 
 
 		 456 aa  278  1e-73  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0017665  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1441  protein of unknown function DUF21  36.45 
 
 		 439 aa  276  6e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.114074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0098  hypothetical protein  36.13 
 
 		 460 aa  273  5.000000000000001e-72  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2145  hypothetical protein  37.95 
 
 		 430 aa  271  1e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4026  CBS:protein of unknown function DUF21:transporter-associated region  39.14 
 
 		 437 aa  270  4e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2235  protein of unknown function DUF21  34.35 
 
 		 439 aa  270  4e-71  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2925  hypothetical protein  38.37 
 
 		 465 aa  270  4e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.221134  normal  0.412302 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0343  hypothetical protein  35.25 
 
 		 437 aa  268  1e-70  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.384323  normal  0.630353 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0819  protein of unknown function DUF21  36.74 
 
 		 441 aa  265  1e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3197  hypothetical protein  38.85 
 
 		 479 aa  265  1e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.241932  normal  0.866715 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0238  protein of unknown function DUF21  34.46 
 
 		 417 aa  263  4.999999999999999e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2853  CBS domain-containing protein  37.3 
 
 		 439 aa  261  2e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2008  protein of unknown function DUF21  34.26 
 
 		 447 aa  261  2e-68  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000403932  normal  0.229254 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4765  hypothetical protein  38.26 
 
 		 437 aa  259  6e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.942078 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0769  hypothetical protein  36.88 
 
 		 447 aa  258  2e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.574193 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004057  hemolysin  34.73 
 
 		 434 aa  258  2e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0092  hypothetical protein  39.16 
 
 		 435 aa  256  4e-67  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2157  hypothetical protein  37.11 
 
 		 437 aa  253  6e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.285648  normal  0.808245 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1852  protein of unknown function DUF21  36.89 
 
 		 433 aa  250  4e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0710  protein of unknown function DUF21  33.66 
 
 		 432 aa  249  5e-65  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.149607  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3026  hypothetical protein  36.83 
 
 		 442 aa  247  3e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.25014  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0231  CBS  32.56 
 
 		 454 aa  246  6.999999999999999e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0205285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0419  hypothetical protein  33.42 
 
 		 407 aa  245  9.999999999999999e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0953  membrane protein  33.57 
 
 		 426 aa  244  1.9999999999999999e-63  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3199  hypothetical protein  36.26 
 
 		 448 aa  241  2e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.184722 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4087  protein of unknown function DUF21  33.26 
 
 		 453 aa  238  2e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4410  protein of unknown function DUF21  34.85 
 
 		 444 aa  237  4e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.938013  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1467  protein of unknown function DUF21  34.77 
 
 		 429 aa  235  1.0000000000000001e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.211541  normal  0.989219 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1153  hypothetical protein  35.05 
 
 		 447 aa  233  5e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000974304  normal  0.0417904 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1519  hypothetical protein  34.98 
 
 		 428 aa  233  5e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2234  hypothetical protein  35.27 
 
 		 443 aa  232  9e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.840085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2477  protein of unknown function DUF21  34.92 
 
 		 439 aa  228  2e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0798586 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3215  CBS:protein of unknown function DUF21:transporter-associated region  31.54 
 
 		 431 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.141334 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4426  hypothetical protein  32.86 
 
 		 440 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.598992 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4594  hypothetical protein  33.56 
 
 		 442 aa  217  2.9999999999999998e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.29723  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0389  hypothetical protein  33.89 
 
 		 438 aa  216  5.9999999999999996e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2723  protein of unknown function DUF21  32.46 
 
 		 443 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1143  hypothetical protein  32.93 
 
 		 432 aa  213  5.999999999999999e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000186322  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0295  hypothetical protein  32.63 
 
 		 443 aa  212  9e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.73268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0247  protein of unknown function DUF21  32.48 
 
 		 446 aa  211  2e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>