More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1287 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_1287  protein of unknown function DUF21  100 
 
 
428 aa  843    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2145  hypothetical protein  52.54 
 
 
430 aa  424  1e-117  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3174  hypothetical protein  43.97 
 
 
458 aa  333  4e-90  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2321  hypothetical protein  41.81 
 
 
446 aa  324  2e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.638143  normal  0.0384275 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1919  hemolysin  41.65 
 
 
430 aa  315  9.999999999999999e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4050  hypothetical protein  39.38 
 
 
440 aa  313  3.9999999999999997e-84  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0807851  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2766  hypothetical protein  40.34 
 
 
442 aa  313  4.999999999999999e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3597  protein of unknown function DUF21  38.11 
 
 
447 aa  307  2.0000000000000002e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000988374 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2753  hypothetical protein  39.44 
 
 
431 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.429535  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0264  hypothetical protein  41.67 
 
 
432 aa  306  6e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.265353 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2711  hypothetical protein  39.67 
 
 
431 aa  306  7e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.155736 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2853  CBS domain-containing protein  38.5 
 
 
439 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1085  hypothetical protein  40.85 
 
 
464 aa  303  3.0000000000000004e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.792914 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0828  protein of unknown function DUF21  39.67 
 
 
424 aa  301  2e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3102  hypothetical protein  41.47 
 
 
466 aa  301  2e-80  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0806544  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3152  protein of unknown function DUF21  38.48 
 
 
431 aa  298  9e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0756  hypothetical protein  39.91 
 
 
436 aa  297  3e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0635919  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7487  hypothetical protein  39.53 
 
 
436 aa  296  4e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.160114 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2385  hypothetical protein  38.77 
 
 
433 aa  296  5e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2122  hypothetical protein  41.09 
 
 
436 aa  295  8e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.705935  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2233  protein of unknown function DUF21  39.56 
 
 
437 aa  295  9e-79  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0942  protein of unknown function DUF21  39.2 
 
 
424 aa  295  1e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.429612  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0926  protein of unknown function DUF21  39.81 
 
 
441 aa  292  1e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4403  hypothetical protein  38.42 
 
 
436 aa  291  2e-77  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0196704  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1413  hypothetical protein  38.12 
 
 
430 aa  290  4e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0999393  normal  0.104956 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0562  hypothetical protein  37 
 
 
439 aa  289  5.0000000000000004e-77  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.371677  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0608  hemolysin  37 
 
 
439 aa  289  5.0000000000000004e-77  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3672  hypothetical protein  38.35 
 
 
425 aa  289  6e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00780947 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2480  hemolysin  36.71 
 
 
436 aa  287  2.9999999999999996e-76  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3348  hypothetical protein  39.52 
 
 
429 aa  286  5e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0165594  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2753  hypothetical protein  39.33 
 
 
433 aa  286  5e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.151662  normal  0.98691 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0021  protein of unknown function DUF21  39.38 
 
 
435 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.099852 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1932  CBS  38.68 
 
 
456 aa  283  3.0000000000000004e-75  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0017665  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3770  hypothetical protein  39.29 
 
 
441 aa  283  4.0000000000000003e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1250  CBS domain-containing protein  38.72 
 
 
432 aa  282  8.000000000000001e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.144301  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00183  hemolysin  39.34 
 
 
435 aa  281  1e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.702411  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3036  CBS  37.59 
 
 
442 aa  281  2e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2815  CBS domain-containing protein  35.25 
 
 
439 aa  280  4e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0723  hypothetical protein  40.89 
 
 
425 aa  280  4e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0902  protein of unknown function DUF21  37.26 
 
 
436 aa  280  4e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3640  hypothetical protein  37.88 
 
 
441 aa  279  8e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2774  protein of unknown function DUF21  37.88 
 
 
440 aa  278  1e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.730131  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1013  hemolysin  41.04 
 
 
424 aa  278  2e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.471918  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35020  hemolysin-like protein  38.26 
 
 
432 aa  278  2e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.518958  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2008  protein of unknown function DUF21  34.11 
 
 
447 aa  277  3e-73  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000403932  normal  0.229254 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2846  protein of unknown function DUF21  37.03 
 
 
443 aa  277  3e-73  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2439  protein of unknown function DUF21  38.01 
 
 
443 aa  276  4e-73  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2673  hypothetical protein  41.08 
 
 
424 aa  276  5e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.460279  normal  0.557621 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3447  hypothetical protein  37.65 
 
 
440 aa  275  1.0000000000000001e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4139  hypothetical protein  39.08 
 
 
452 aa  273  3e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0969684 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1441  protein of unknown function DUF21  35 
 
 
439 aa  273  3e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.114074  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5725  hypothetical protein  40.96 
 
 
434 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.239106  hitchhiker  0.00714589 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2313  hypothetical protein  38.16 
 
 
438 aa  273  5.000000000000001e-72  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1577  protein of unknown function DUF21  37.59 
 
 
447 aa  273  5.000000000000001e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.569313  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4228  hypothetical protein  37.88 
 
 
445 aa  272  9e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.351193  normal  0.199337 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0098  hypothetical protein  37.68 
 
 
460 aa  272  1e-71  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4282  hypothetical protein  41.12 
 
 
434 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.789831  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2432  protein of unknown function DUF21  36.74 
 
 
443 aa  270  5e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3678  protein of unknown function DUF21  36.74 
 
 
443 aa  270  5e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.35091 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3026  hypothetical protein  36.85 
 
 
442 aa  269  8e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.25014  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2723  protein of unknown function DUF21  36.17 
 
 
443 aa  268  1e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4765  hypothetical protein  38.59 
 
 
437 aa  268  2e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.942078 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0831  protein of unknown function DUF21  38.53 
 
 
452 aa  267  2.9999999999999995e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0300168 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0710  protein of unknown function DUF21  34.81 
 
 
432 aa  266  4e-70  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.149607  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0819  protein of unknown function DUF21  33.49 
 
 
441 aa  266  7e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0295  hypothetical protein  37.12 
 
 
443 aa  266  7e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.73268  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4026  CBS:protein of unknown function DUF21:transporter-associated region  38.52 
 
 
437 aa  265  8.999999999999999e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0266  protein of unknown function DUF21  36.49 
 
 
444 aa  264  2e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4935  hypothetical protein  35.85 
 
 
443 aa  264  3e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1314  hypothetical protein  38.33 
 
 
439 aa  263  6e-69  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0274508  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2388  protein of unknown function DUF21  35.46 
 
 
442 aa  262  8.999999999999999e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.945135 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0238  protein of unknown function DUF21  34.07 
 
 
417 aa  261  2e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2235  protein of unknown function DUF21  31.76 
 
 
439 aa  261  2e-68  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2077  CBS domain-containing protein  36.47 
 
 
441 aa  260  3e-68  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0953  membrane protein  35.85 
 
 
426 aa  260  4e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0231  CBS  33.95 
 
 
454 aa  259  6e-68  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0205285  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2925  hypothetical protein  36.34 
 
 
465 aa  256  4e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.221134  normal  0.412302 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3199  hypothetical protein  35.16 
 
 
448 aa  254  2.0000000000000002e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.184722 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7616  protein of unknown function DUF21  37.98 
 
 
418 aa  250  3e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3911  protein of unknown function DUF21  37.74 
 
 
418 aa  249  5e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2157  hypothetical protein  37.11 
 
 
437 aa  248  1e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.285648  normal  0.808245 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004057  hemolysin  33.25 
 
 
434 aa  248  1e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2234  hypothetical protein  34.1 
 
 
443 aa  247  3e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.840085  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3855  protein of unknown function DUF21  36.47 
 
 
437 aa  243  6e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.469597  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2477  protein of unknown function DUF21  33.73 
 
 
439 aa  241  1e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0798586 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5623  protein of unknown function DUF21  40.16 
 
 
403 aa  242  1e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4675  putative transporter  27.93 
 
 
447 aa  241  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.050719  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4771  putative transporter  27.93 
 
 
447 aa  241  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4826  putative transporter  27.93 
 
 
447 aa  240  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.229608  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4805  putative transporter  27.93 
 
 
447 aa  240  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.140825  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4686  putative transporter  27.93 
 
 
447 aa  240  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.116284  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0769  hypothetical protein  34.61 
 
 
447 aa  239  5.999999999999999e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.574193 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4594  hypothetical protein  35.05 
 
 
442 aa  239  6.999999999999999e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.29723  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3774  protein of unknown function DUF21  27.29 
 
 
447 aa  238  1e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.767387  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4787  putative transporter  27.29 
 
 
447 aa  238  1e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4696  putative transporter  27.29 
 
 
447 aa  238  1e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3197  hypothetical protein  36.5 
 
 
479 aa  238  1e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.241932  normal  0.866715 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4864  putative transporter  27.29 
 
 
447 aa  238  1e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.830156  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3789  hypothetical protein  27.29 
 
 
447 aa  238  1e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4471  putative transporter  27.29 
 
 
447 aa  238  1e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>