More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0098 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_2077  CBS domain-containing protein  78.74 
 
 
441 aa  681    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1932  CBS  78.17 
 
 
456 aa  677    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0017665  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2439  protein of unknown function DUF21  78.14 
 
 
443 aa  693    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2846  protein of unknown function DUF21  81.59 
 
 
443 aa  729    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0098  hypothetical protein  100 
 
 
460 aa  933    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0266  protein of unknown function DUF21  66.59 
 
 
444 aa  589  1e-167  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2313  hypothetical protein  66.43 
 
 
438 aa  585  1e-166  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1577  protein of unknown function DUF21  66.29 
 
 
447 aa  587  1e-166  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.569313  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3036  CBS  64.08 
 
 
442 aa  566  1e-160  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3640  hypothetical protein  64.25 
 
 
441 aa  555  1e-157  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2774  protein of unknown function DUF21  60.59 
 
 
440 aa  545  1e-154  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.730131  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3770  hypothetical protein  62.53 
 
 
441 aa  540  9.999999999999999e-153  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3447  hypothetical protein  60.14 
 
 
440 aa  540  9.999999999999999e-153  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4935  hypothetical protein  59.95 
 
 
443 aa  535  1e-151  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0902  protein of unknown function DUF21  60.29 
 
 
436 aa  531  1e-150  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2385  hypothetical protein  59.25 
 
 
433 aa  531  1e-150  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4765  hypothetical protein  60.94 
 
 
437 aa  524  1e-147  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.942078 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4026  CBS:protein of unknown function DUF21:transporter-associated region  60.94 
 
 
437 aa  520  1e-146  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2853  CBS domain-containing protein  56.26 
 
 
439 aa  508  1e-143  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2815  CBS domain-containing protein  55.16 
 
 
439 aa  501  1e-141  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4228  hypothetical protein  61.27 
 
 
445 aa  497  1e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.351193  normal  0.199337 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3199  hypothetical protein  50.45 
 
 
448 aa  438  9.999999999999999e-123  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.184722 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3026  hypothetical protein  52.56 
 
 
442 aa  435  1e-120  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.25014  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1519  hypothetical protein  52.01 
 
 
428 aa  427  1e-118  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3855  protein of unknown function DUF21  53.75 
 
 
437 aa  417  9.999999999999999e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.469597  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0953  membrane protein  49.06 
 
 
426 aa  414  1e-114  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2157  hypothetical protein  49.28 
 
 
437 aa  410  1e-113  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.285648  normal  0.808245 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1250  CBS domain-containing protein  43.52 
 
 
432 aa  370  1e-101  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.144301  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2766  hypothetical protein  45.22 
 
 
442 aa  371  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004057  hemolysin  44.93 
 
 
434 aa  369  1e-101  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4050  hypothetical protein  43.9 
 
 
440 aa  365  1e-99  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0807851  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4403  hypothetical protein  44.84 
 
 
436 aa  363  4e-99  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0196704  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2233  protein of unknown function DUF21  45.48 
 
 
437 aa  362  1e-98  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3597  protein of unknown function DUF21  42.22 
 
 
447 aa  358  8e-98  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000988374 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2480  hemolysin  42.33 
 
 
436 aa  354  2e-96  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3678  protein of unknown function DUF21  43.93 
 
 
443 aa  351  1e-95  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.35091 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2432  protein of unknown function DUF21  43.93 
 
 
443 aa  351  1e-95  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1314  hypothetical protein  42.27 
 
 
439 aa  338  8e-92  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0274508  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1441  protein of unknown function DUF21  43.97 
 
 
439 aa  332  1e-89  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.114074  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0021  protein of unknown function DUF21  41.53 
 
 
435 aa  319  5e-86  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.099852 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00183  hemolysin  43.68 
 
 
435 aa  320  5e-86  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.702411  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0831  protein of unknown function DUF21  42.96 
 
 
452 aa  318  1e-85  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0300168 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35020  hemolysin-like protein  41 
 
 
432 aa  318  2e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.518958  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0756  hypothetical protein  39.04 
 
 
436 aa  312  5.999999999999999e-84  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0635919  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0608  hemolysin  42.49 
 
 
439 aa  312  6.999999999999999e-84  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0562  hypothetical protein  42.49 
 
 
439 aa  312  7.999999999999999e-84  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.371677  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0343  hypothetical protein  37.14 
 
 
437 aa  311  2e-83  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.384323  normal  0.630353 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0926  protein of unknown function DUF21  40.28 
 
 
441 aa  306  7e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0238  protein of unknown function DUF21  37.16 
 
 
417 aa  297  2e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1085  hypothetical protein  39.16 
 
 
464 aa  296  6e-79  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.792914 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1467  protein of unknown function DUF21  38.31 
 
 
429 aa  296  7e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.211541  normal  0.989219 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4139  hypothetical protein  40.82 
 
 
452 aa  296  8e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0969684 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3152  protein of unknown function DUF21  36.83 
 
 
431 aa  294  2e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1413  hypothetical protein  37.17 
 
 
430 aa  294  2e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0999393  normal  0.104956 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2321  hypothetical protein  37.06 
 
 
446 aa  294  2e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.638143  normal  0.0384275 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0819  protein of unknown function DUF21  35.39 
 
 
441 aa  293  5e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0264  hypothetical protein  38.2 
 
 
432 aa  293  6e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.265353 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2925  hypothetical protein  38.74 
 
 
465 aa  291  1e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.221134  normal  0.412302 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7487  hypothetical protein  38.05 
 
 
436 aa  290  5.0000000000000004e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.160114 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2711  hypothetical protein  37 
 
 
431 aa  289  6e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.155736 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0828  protein of unknown function DUF21  36.64 
 
 
424 aa  287  2.9999999999999996e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1919  hemolysin  36.98 
 
 
430 aa  287  2.9999999999999996e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0942  protein of unknown function DUF21  36.88 
 
 
424 aa  286  5.999999999999999e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.429612  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3215  CBS:protein of unknown function DUF21:transporter-associated region  37 
 
 
431 aa  284  2.0000000000000002e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.141334 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0723  hypothetical protein  38.78 
 
 
425 aa  284  2.0000000000000002e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2122  hypothetical protein  39.39 
 
 
436 aa  284  3.0000000000000004e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.705935  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3197  hypothetical protein  38.74 
 
 
479 aa  282  1e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.241932  normal  0.866715 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0769  hypothetical protein  37.41 
 
 
447 aa  281  2e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.574193 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2753  hypothetical protein  36.13 
 
 
431 aa  280  4e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.429535  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2008  protein of unknown function DUF21  35.1 
 
 
447 aa  280  5e-74  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000403932  normal  0.229254 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1287  protein of unknown function DUF21  37.26 
 
 
428 aa  278  2e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0419  hypothetical protein  37.5 
 
 
407 aa  276  4e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2753  hypothetical protein  37.74 
 
 
433 aa  273  5.000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.151662  normal  0.98691 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0231  CBS  34.65 
 
 
454 aa  269  8.999999999999999e-71  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0205285  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0470  hypothetical protein  35.5 
 
 
432 aa  268  1e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000200568  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2235  protein of unknown function DUF21  32.94 
 
 
439 aa  268  1e-70  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4087  protein of unknown function DUF21  34.99 
 
 
453 aa  268  1e-70  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1852  protein of unknown function DUF21  37.32 
 
 
433 aa  268  1e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3102  hypothetical protein  35.35 
 
 
466 aa  268  2e-70  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0806544  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0710  protein of unknown function DUF21  36.71 
 
 
432 aa  266  5.999999999999999e-70  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.149607  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3348  hypothetical protein  35.46 
 
 
429 aa  266  5.999999999999999e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0165594  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2145  hypothetical protein  35.99 
 
 
430 aa  263  4.999999999999999e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0820  protein of unknown function DUF21  32.48 
 
 
444 aa  259  8e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5725  hypothetical protein  38.82 
 
 
434 aa  258  2e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.239106  hitchhiker  0.00714589 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3672  hypothetical protein  34.04 
 
 
425 aa  257  2e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00780947 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3668  hypothetical protein  33.87 
 
 
452 aa  256  8e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3577  protein of unknown function DUF21  31.32 
 
 
441 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3772  hypothetical protein  31.94 
 
 
443 aa  254  2.0000000000000002e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4282  hypothetical protein  36.13 
 
 
434 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.789831  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3960  CBS/transporter associated domain-containing protein  31.94 
 
 
443 aa  254  2.0000000000000002e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.216105  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3174  hypothetical protein  33.79 
 
 
458 aa  254  2.0000000000000002e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3627  CBS/transporter associated domain-containing protein  31.94 
 
 
443 aa  254  2.0000000000000002e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4210  protein of unknown function DUF21  33.18 
 
 
427 aa  253  4.0000000000000004e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2591  CBS:protein of unknown function DUF21:transporter-associated region  32.5 
 
 
443 aa  253  6e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0786  protein of unknown function DUF21  32.21 
 
 
438 aa  253  6e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.35446  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0457  hypothetical protein  32.4 
 
 
447 aa  250  5e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0445264  normal  0.119105 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0743  hypothetical protein  35.13 
 
 
439 aa  249  7e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.946695  normal  0.0273705 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5479  hypothetical protein  33.49 
 
 
482 aa  247  3e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0295  hypothetical protein  34.49 
 
 
443 aa  247  3e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.73268  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0698  hypothetical protein  33.41 
 
 
438 aa  246  4.9999999999999997e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.46014  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>