More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5725 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_5725  hypothetical protein  100 
 
 
434 aa  833    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.239106  hitchhiker  0.00714589 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5623  protein of unknown function DUF21  82.48 
 
 
403 aa  523  1e-147  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2122  hypothetical protein  54.27 
 
 
436 aa  444  1e-123  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.705935  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7487  hypothetical protein  52.67 
 
 
436 aa  432  1e-120  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.160114 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2321  hypothetical protein  54.39 
 
 
446 aa  433  1e-120  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.638143  normal  0.0384275 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2711  hypothetical protein  51.99 
 
 
431 aa  426  1e-118  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.155736 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3102  hypothetical protein  54.5 
 
 
466 aa  423  1e-117  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0806544  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3152  protein of unknown function DUF21  51.54 
 
 
431 aa  422  1e-117  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1919  hemolysin  49.07 
 
 
430 aa  417  9.999999999999999e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2753  hypothetical protein  51.05 
 
 
431 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.429535  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3348  hypothetical protein  52.01 
 
 
429 aa  412  1e-114  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0165594  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2753  hypothetical protein  51.2 
 
 
433 aa  414  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.151662  normal  0.98691 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0828  protein of unknown function DUF21  49.53 
 
 
424 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3672  hypothetical protein  50.36 
 
 
425 aa  400  9.999999999999999e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00780947 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0942  protein of unknown function DUF21  49.76 
 
 
424 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.429612  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3174  hypothetical protein  49.77 
 
 
458 aa  396  1e-109  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4139  hypothetical protein  49.29 
 
 
452 aa  394  1e-108  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0969684 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0723  hypothetical protein  52.11 
 
 
425 aa  387  1e-106  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0756  hypothetical protein  49.88 
 
 
436 aa  376  1e-103  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0635919  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4282  hypothetical protein  50.83 
 
 
434 aa  373  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.789831  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1013  hemolysin  52.37 
 
 
424 aa  364  2e-99  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.471918  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2673  hypothetical protein  52.13 
 
 
424 aa  361  1e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.460279  normal  0.557621 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4050  hypothetical protein  44.6 
 
 
440 aa  356  3.9999999999999996e-97  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0807851  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4403  hypothetical protein  44.55 
 
 
436 aa  333  4e-90  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0196704  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2766  hypothetical protein  44.39 
 
 
442 aa  330  3e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3678  protein of unknown function DUF21  42.18 
 
 
443 aa  326  5e-88  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.35091 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2432  protein of unknown function DUF21  42.18 
 
 
443 aa  326  5e-88  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2815  CBS domain-containing protein  39.48 
 
 
439 aa  326  6e-88  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1413  hypothetical protein  41.88 
 
 
430 aa  323  3e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0999393  normal  0.104956 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3597  protein of unknown function DUF21  41.37 
 
 
447 aa  320  1.9999999999999998e-86  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000988374 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2233  protein of unknown function DUF21  44.73 
 
 
437 aa  318  1e-85  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2774  protein of unknown function DUF21  43.47 
 
 
440 aa  318  2e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.730131  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3447  hypothetical protein  43.88 
 
 
440 aa  318  2e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3770  hypothetical protein  43.22 
 
 
441 aa  318  2e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3036  CBS  42.25 
 
 
442 aa  313  2.9999999999999996e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2853  CBS domain-containing protein  42.59 
 
 
439 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0562  hypothetical protein  40.65 
 
 
439 aa  312  5.999999999999999e-84  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.371677  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2385  hypothetical protein  42.59 
 
 
433 aa  311  1e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0608  hemolysin  40.65 
 
 
439 aa  311  1e-83  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0926  protein of unknown function DUF21  46.73 
 
 
441 aa  311  1e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3640  hypothetical protein  43.36 
 
 
441 aa  308  2.0000000000000002e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1287  protein of unknown function DUF21  41.18 
 
 
428 aa  306  6e-82  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1085  hypothetical protein  42.02 
 
 
464 aa  305  8.000000000000001e-82  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.792914 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4935  hypothetical protein  42 
 
 
443 aa  305  1.0000000000000001e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1441  protein of unknown function DUF21  41.33 
 
 
439 aa  302  6.000000000000001e-81  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.114074  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4228  hypothetical protein  45.03 
 
 
445 aa  302  6.000000000000001e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.351193  normal  0.199337 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0021  protein of unknown function DUF21  41.89 
 
 
435 aa  297  2e-79  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.099852 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0264  hypothetical protein  43.77 
 
 
432 aa  296  3e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.265353 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1314  hypothetical protein  43.49 
 
 
439 aa  296  5e-79  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0274508  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0266  protein of unknown function DUF21  40.92 
 
 
444 aa  296  6e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2480  hemolysin  41.12 
 
 
436 aa  295  8e-79  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3199  hypothetical protein  41.18 
 
 
448 aa  295  8e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.184722 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0831  protein of unknown function DUF21  42.6 
 
 
452 aa  295  9e-79  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0300168 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00183  hemolysin  42.12 
 
 
435 aa  294  2e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.702411  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4026  CBS:protein of unknown function DUF21:transporter-associated region  41.88 
 
 
437 aa  293  3e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3026  hypothetical protein  41.51 
 
 
442 aa  293  3e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.25014  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4765  hypothetical protein  42.08 
 
 
437 aa  293  3e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.942078 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0902  protein of unknown function DUF21  38.5 
 
 
436 aa  293  6e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1577  protein of unknown function DUF21  41.34 
 
 
447 aa  292  8e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.569313  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2157  hypothetical protein  41.73 
 
 
437 aa  288  1e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.285648  normal  0.808245 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1250  CBS domain-containing protein  40 
 
 
432 aa  288  2e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.144301  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2439  protein of unknown function DUF21  38.83 
 
 
443 aa  287  2e-76  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2846  protein of unknown function DUF21  38.44 
 
 
443 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2313  hypothetical protein  40.87 
 
 
438 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0098  hypothetical protein  38.82 
 
 
460 aa  284  2.0000000000000002e-75  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2145  hypothetical protein  40.62 
 
 
430 aa  282  8.000000000000001e-75  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0470  hypothetical protein  37.88 
 
 
432 aa  281  1e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000200568  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3197  hypothetical protein  43.3 
 
 
479 aa  281  2e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.241932  normal  0.866715 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0343  hypothetical protein  36.32 
 
 
437 aa  281  2e-74  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.384323  normal  0.630353 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2925  hypothetical protein  40.82 
 
 
465 aa  281  2e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.221134  normal  0.412302 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2077  CBS domain-containing protein  38.74 
 
 
441 aa  280  4e-74  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35020  hemolysin-like protein  40.52 
 
 
432 aa  278  1e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.518958  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0710  protein of unknown function DUF21  34.31 
 
 
432 aa  277  3e-73  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.149607  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1932  CBS  37.95 
 
 
456 aa  275  8e-73  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0017665  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0953  membrane protein  37.09 
 
 
426 aa  274  3e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0819  protein of unknown function DUF21  32.71 
 
 
441 aa  271  1e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1519  hypothetical protein  39.72 
 
 
428 aa  271  2e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0238  protein of unknown function DUF21  36.49 
 
 
417 aa  269  8.999999999999999e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0769  hypothetical protein  39.43 
 
 
447 aa  268  2e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.574193 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0419  hypothetical protein  35.94 
 
 
407 aa  264  2e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1852  protein of unknown function DUF21  36.84 
 
 
433 aa  263  3e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2008  protein of unknown function DUF21  33.03 
 
 
447 aa  263  6.999999999999999e-69  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000403932  normal  0.229254 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4410  protein of unknown function DUF21  37.79 
 
 
444 aa  260  3e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.938013  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0092  hypothetical protein  44.05 
 
 
435 aa  260  3e-68  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2235  protein of unknown function DUF21  32.32 
 
 
439 aa  259  9e-68  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3855  protein of unknown function DUF21  39.15 
 
 
437 aa  257  3e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.469597  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0231  CBS  34.87 
 
 
454 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0205285  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1467  protein of unknown function DUF21  36.6 
 
 
429 aa  251  2e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.211541  normal  0.989219 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3488  protein of unknown function DUF21  34.06 
 
 
432 aa  246  4.9999999999999997e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1153  hypothetical protein  35.92 
 
 
447 aa  242  7.999999999999999e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000974304  normal  0.0417904 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0247  protein of unknown function DUF21  36.51 
 
 
446 aa  241  2e-62  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004057  hemolysin  34.84 
 
 
434 aa  239  6.999999999999999e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3772  hypothetical protein  31 
 
 
443 aa  238  2e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3627  CBS/transporter associated domain-containing protein  31 
 
 
443 aa  238  2e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3960  CBS/transporter associated domain-containing protein  31 
 
 
443 aa  238  2e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.216105  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0698  hypothetical protein  34.04 
 
 
438 aa  235  1.0000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.46014  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0457  hypothetical protein  31.29 
 
 
447 aa  234  3e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0445264  normal  0.119105 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3577  protein of unknown function DUF21  30.57 
 
 
441 aa  233  5e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0295  hypothetical protein  37.44 
 
 
443 aa  231  2e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.73268  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4087  protein of unknown function DUF21  31.64 
 
 
453 aa  231  2e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>