More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0021 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_0021  protein of unknown function DUF21  100 
 
 
435 aa  862    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.099852 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4050  hypothetical protein  49.53 
 
 
440 aa  418  1e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0807851  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1314  hypothetical protein  55.01 
 
 
439 aa  419  1e-116  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0274508  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2480  hemolysin  47.13 
 
 
436 aa  413  1e-114  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2766  hypothetical protein  51.34 
 
 
442 aa  409  1e-113  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4403  hypothetical protein  51.54 
 
 
436 aa  400  9.999999999999999e-111  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0196704  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2432  protein of unknown function DUF21  49.4 
 
 
443 aa  385  1e-106  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3597  protein of unknown function DUF21  47.36 
 
 
447 aa  387  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000988374 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2233  protein of unknown function DUF21  50.59 
 
 
437 aa  387  1e-106  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3678  protein of unknown function DUF21  49.4 
 
 
443 aa  385  1e-106  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.35091 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0819  protein of unknown function DUF21  43.46 
 
 
441 aa  365  1e-100  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1250  CBS domain-containing protein  45.35 
 
 
432 aa  362  6e-99  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.144301  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0756  hypothetical protein  45.75 
 
 
436 aa  361  1e-98  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0635919  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2235  protein of unknown function DUF21  42.3 
 
 
439 aa  358  9.999999999999999e-98  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1085  hypothetical protein  44.52 
 
 
464 aa  353  2e-96  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.792914 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2008  protein of unknown function DUF21  43.19 
 
 
447 aa  352  7e-96  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000403932  normal  0.229254 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0266  protein of unknown function DUF21  44.71 
 
 
444 aa  346  4e-94  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0231  CBS  43.26 
 
 
454 aa  343  2.9999999999999997e-93  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0205285  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2846  protein of unknown function DUF21  42.06 
 
 
443 aa  342  7e-93  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3640  hypothetical protein  42.56 
 
 
441 aa  339  5e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4935  hypothetical protein  41.44 
 
 
443 aa  336  5e-91  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0831  protein of unknown function DUF21  45.56 
 
 
452 aa  335  1e-90  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0300168 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1932  CBS  40.93 
 
 
456 aa  333  5e-90  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0017665  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0470  hypothetical protein  40.61 
 
 
432 aa  331  2e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000200568  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3036  CBS  42.4 
 
 
442 aa  330  3e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2439  protein of unknown function DUF21  41.93 
 
 
443 aa  330  4e-89  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0238  protein of unknown function DUF21  41.59 
 
 
417 aa  329  5.0000000000000004e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0343  hypothetical protein  39.04 
 
 
437 aa  327  3e-88  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.384323  normal  0.630353 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2853  CBS domain-containing protein  40.37 
 
 
439 aa  327  3e-88  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4026  CBS:protein of unknown function DUF21:transporter-associated region  42.51 
 
 
437 aa  327  4.0000000000000003e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3770  hypothetical protein  41.59 
 
 
441 aa  326  4.0000000000000003e-88  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7487  hypothetical protein  44.71 
 
 
436 aa  326  5e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.160114 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0926  protein of unknown function DUF21  44.13 
 
 
441 aa  325  7e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0098  hypothetical protein  41.63 
 
 
460 aa  325  8.000000000000001e-88  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2077  CBS domain-containing protein  42.21 
 
 
441 aa  324  2e-87  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2774  protein of unknown function DUF21  40.93 
 
 
440 aa  322  8e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.730131  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1577  protein of unknown function DUF21  42.96 
 
 
447 aa  322  9.999999999999999e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.569313  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2313  hypothetical protein  42.21 
 
 
438 aa  320  3.9999999999999996e-86  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4765  hypothetical protein  41.63 
 
 
437 aa  320  3.9999999999999996e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.942078 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4228  hypothetical protein  42.46 
 
 
445 aa  319  7.999999999999999e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.351193  normal  0.199337 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1441  protein of unknown function DUF21  41.53 
 
 
439 aa  318  1e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.114074  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3447  hypothetical protein  40.47 
 
 
440 aa  317  2e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35020  hemolysin-like protein  41.55 
 
 
432 aa  317  4e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.518958  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3026  hypothetical protein  39.95 
 
 
442 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.25014  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3152  protein of unknown function DUF21  41.3 
 
 
431 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1852  protein of unknown function DUF21  41.35 
 
 
433 aa  313  3.9999999999999997e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0562  hypothetical protein  40.23 
 
 
439 aa  312  7.999999999999999e-84  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.371677  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2385  hypothetical protein  39.44 
 
 
433 aa  312  9e-84  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0608  hemolysin  40.23 
 
 
439 aa  311  1e-83  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2711  hypothetical protein  39.77 
 
 
431 aa  309  8e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.155736 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0902  protein of unknown function DUF21  38.89 
 
 
436 aa  308  1.0000000000000001e-82  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2753  hypothetical protein  40.65 
 
 
431 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.429535  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2753  hypothetical protein  42.72 
 
 
433 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.151662  normal  0.98691 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2925  hypothetical protein  43.24 
 
 
465 aa  305  1.0000000000000001e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.221134  normal  0.412302 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1413  hypothetical protein  38.9 
 
 
430 aa  303  3.0000000000000004e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0999393  normal  0.104956 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0264  hypothetical protein  41.02 
 
 
432 aa  303  4.0000000000000003e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.265353 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3199  hypothetical protein  40.18 
 
 
448 aa  303  4.0000000000000003e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.184722 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3174  hypothetical protein  40.94 
 
 
458 aa  301  1e-80  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1287  protein of unknown function DUF21  39.67 
 
 
428 aa  301  1e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00183  hemolysin  41.44 
 
 
435 aa  300  3e-80  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.702411  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0828  protein of unknown function DUF21  39.95 
 
 
424 aa  299  8e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2321  hypothetical protein  39.21 
 
 
446 aa  298  1e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.638143  normal  0.0384275 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3197  hypothetical protein  42.41 
 
 
479 aa  296  3e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.241932  normal  0.866715 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2122  hypothetical protein  39.95 
 
 
436 aa  296  6e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.705935  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0942  protein of unknown function DUF21  39.72 
 
 
424 aa  293  3e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.429612  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2815  CBS domain-containing protein  36.51 
 
 
439 aa  292  7e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2145  hypothetical protein  39.72 
 
 
430 aa  291  2e-77  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1919  hemolysin  39.76 
 
 
430 aa  291  2e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2157  hypothetical protein  40.57 
 
 
437 aa  290  3e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.285648  normal  0.808245 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3672  hypothetical protein  39.39 
 
 
425 aa  289  8e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00780947 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0769  hypothetical protein  37.8 
 
 
447 aa  283  3.0000000000000004e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.574193 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4282  hypothetical protein  43.66 
 
 
434 aa  284  3.0000000000000004e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.789831  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0419  hypothetical protein  37.23 
 
 
407 aa  283  4.0000000000000003e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4139  hypothetical protein  39.13 
 
 
452 aa  282  8.000000000000001e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0969684 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1467  protein of unknown function DUF21  38.28 
 
 
429 aa  282  1e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.211541  normal  0.989219 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3102  hypothetical protein  39.95 
 
 
466 aa  279  7e-74  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0806544  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0710  protein of unknown function DUF21  36.74 
 
 
432 aa  276  4e-73  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.149607  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0723  hypothetical protein  42.2 
 
 
425 aa  276  5e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5725  hypothetical protein  43.03 
 
 
434 aa  276  6e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.239106  hitchhiker  0.00714589 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1519  hypothetical protein  37.79 
 
 
428 aa  275  1.0000000000000001e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0953  membrane protein  36.53 
 
 
426 aa  274  3e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3348  hypothetical protein  36.81 
 
 
429 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0165594  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4087  protein of unknown function DUF21  36.12 
 
 
453 aa  267  2.9999999999999995e-70  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004057  hemolysin  36.21 
 
 
434 aa  260  3e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3215  CBS:protein of unknown function DUF21:transporter-associated region  35.09 
 
 
431 aa  255  1.0000000000000001e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.141334 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1013  hemolysin  40.38 
 
 
424 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.471918  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2673  hypothetical protein  40.38 
 
 
424 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.460279  normal  0.557621 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3855  protein of unknown function DUF21  36.47 
 
 
437 aa  252  9.000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.469597  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2234  hypothetical protein  35.5 
 
 
443 aa  245  9e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.840085  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4210  protein of unknown function DUF21  33.02 
 
 
427 aa  236  6e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2388  protein of unknown function DUF21  34.59 
 
 
442 aa  236  7e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.945135 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1143  hypothetical protein  32.48 
 
 
432 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000186322  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3282  protein of unknown function DUF21  33.17 
 
 
433 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2723  protein of unknown function DUF21  34.49 
 
 
443 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3668  hypothetical protein  32.63 
 
 
452 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5479  hypothetical protein  32 
 
 
482 aa  234  3e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0295  hypothetical protein  35.06 
 
 
443 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.73268  normal 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4594  hypothetical protein  34.19 
 
 
442 aa  233  4.0000000000000004e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.29723  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1075  hypothetical protein  32.71 
 
 
443 aa  233  6e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.179676  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0967  protein of unknown function DUF21  33.02 
 
 
439 aa  233  7.000000000000001e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.854838 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>