More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_2313 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_2313  hypothetical protein  100 
 
 		 438 aa  864    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2439  protein of unknown function DUF21  67.53 
 
 		 443 aa  598  1e-170  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2846  protein of unknown function DUF21  64.77 
 
 		 443 aa  587  1e-166  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0098  hypothetical protein  66.43 
 
 		 460 aa  585  1e-166  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1932  CBS  64.43 
 
 		 456 aa  577  1.0000000000000001e-163  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0017665  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3036  CBS  63.57 
 
 		 442 aa  565  1e-160  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2077  CBS domain-containing protein  63.29 
 
 		 441 aa  556  1e-157  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1577  protein of unknown function DUF21  66.12 
 
 		 447 aa  554  1e-156  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.569313  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0266  protein of unknown function DUF21  65.11 
 
 		 444 aa  548  1e-155  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2774  protein of unknown function DUF21  59.72 
 
 		 440 aa  534  1e-150  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.730131  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3640  hypothetical protein  60.88 
 
 		 441 aa  529  1e-149  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3447  hypothetical protein  59.44 
 
 		 440 aa  530  1e-149  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3770  hypothetical protein  59.41 
 
 		 441 aa  525  1e-148  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0902  protein of unknown function DUF21  58.63 
 
 		 436 aa  524  1e-147  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4935  hypothetical protein  60.33 
 
 		 443 aa  523  1e-147  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2853  CBS domain-containing protein  58.06 
 
 		 439 aa  511  1e-143  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2385  hypothetical protein  57.85 
 
 		 433 aa  510  1e-143  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4026  CBS:protein of unknown function DUF21:transporter-associated region  61.5 
 
 		 437 aa  502  1e-141  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4228  hypothetical protein  61.74 
 
 		 445 aa  500  1e-140  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.351193  normal  0.199337 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4765  hypothetical protein  60.38 
 
 		 437 aa  500  1e-140  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.942078 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2815  CBS domain-containing protein  54.91 
 
 		 439 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3026  hypothetical protein  51.63 
 
 		 442 aa  431  1e-119  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.25014  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1519  hypothetical protein  50.93 
 
 		 428 aa  421  1e-117  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0953  membrane protein  48.36 
 
 		 426 aa  419  1e-116  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2157  hypothetical protein  52.17 
 
 		 437 aa  419  1e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.285648  normal  0.808245 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3199  hypothetical protein  49.2 
 
 		 448 aa  420  1e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.184722 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3855  protein of unknown function DUF21  51.93 
 
 		 437 aa  409  1e-113  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.469597  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004057  hemolysin  45.98 
 
 		 434 aa  395  1e-108  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3597  protein of unknown function DUF21  45.28 
 
 		 447 aa  370  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000988374 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1250  CBS domain-containing protein  45.69 
 
 		 432 aa  367  1e-100  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.144301  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2233  protein of unknown function DUF21  45.52 
 
 		 437 aa  362  1e-98  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4403  hypothetical protein  45.69 
 
 		 436 aa  356  3.9999999999999996e-97  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0196704  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2432  protein of unknown function DUF21  45.93 
 
 		 443 aa  355  6.999999999999999e-97  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3678  protein of unknown function DUF21  45.93 
 
 		 443 aa  355  6.999999999999999e-97  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.35091 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2766  hypothetical protein  44 
 
 		 442 aa  355  1e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1314  hypothetical protein  44.68 
 
 		 439 aa  346  4e-94  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0274508  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4050  hypothetical protein  43.36 
 
 		 440 aa  338  9.999999999999999e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0807851  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0926  protein of unknown function DUF21  44.5 
 
 		 441 aa  336  5e-91  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2480  hemolysin  39.81 
 
 		 436 aa  335  7.999999999999999e-91  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1441  protein of unknown function DUF21  43.95 
 
 		 439 aa  327  3e-88  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.114074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0756  hypothetical protein  41.67 
 
 		 436 aa  326  5e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0635919  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35020  hemolysin-like protein  43.03 
 
 		 432 aa  322  6e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.518958  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2711  hypothetical protein  40.09 
 
 		 431 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.155736 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0021  protein of unknown function DUF21  42.11 
 
 		 435 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.099852 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0608  hemolysin  41.4 
 
 		 439 aa  311  1e-83  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0562  hypothetical protein  41.4 
 
 		 439 aa  311  1e-83  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.371677  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0831  protein of unknown function DUF21  43.03 
 
 		 452 aa  308  1.0000000000000001e-82  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0300168 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3197  hypothetical protein  42.28 
 
 		 479 aa  308  2.0000000000000002e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.241932  normal  0.866715 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7487  hypothetical protein  40.47 
 
 		 436 aa  306  5.0000000000000004e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.160114 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0343  hypothetical protein  36.78 
 
 		 437 aa  306  7e-82  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.384323  normal  0.630353 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2925  hypothetical protein  41.26 
 
 		 465 aa  305  7e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.221134  normal  0.412302 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3152  protein of unknown function DUF21  38.79 
 
 		 431 aa  305  9.000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00183  hemolysin  42.56 
 
 		 435 aa  305  1.0000000000000001e-81  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.702411  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3215  CBS:protein of unknown function DUF21:transporter-associated region  39.72 
 
 		 431 aa  304  2.0000000000000002e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.141334 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2122  hypothetical protein  40.88 
 
 		 436 aa  304  2.0000000000000002e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.705935  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2753  hypothetical protein  39.21 
 
 		 431 aa  302  6.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.429535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1085  hypothetical protein  42.11 
 
 		 464 aa  299  7e-80  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.792914 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2321  hypothetical protein  39.21 
 
 		 446 aa  298  2e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.638143  normal  0.0384275 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0828  protein of unknown function DUF21  38.3 
 
 		 424 aa  296  4e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0942  protein of unknown function DUF21  38.3 
 
 		 424 aa  296  4e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.429612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0238  protein of unknown function DUF21  38.48 
 
 		 417 aa  296  6e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0723  hypothetical protein  42.34 
 
 		 425 aa  295  1e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3672  hypothetical protein  38.68 
 
 		 425 aa  290  5.0000000000000004e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00780947 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3348  hypothetical protein  39.72 
 
 		 429 aa  288  1e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0165594  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2753  hypothetical protein  38.85 
 
 		 433 aa  287  2e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.151662  normal  0.98691 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4139  hypothetical protein  39.47 
 
 		 452 aa  287  2.9999999999999996e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0969684 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1919  hemolysin  38.69 
 
 		 430 aa  286  4e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1413  hypothetical protein  36.99 
 
 		 430 aa  285  9e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0999393  normal  0.104956 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3102  hypothetical protein  39.06 
 
 		 466 aa  284  3.0000000000000004e-75  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0806544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0264  hypothetical protein  38.59 
 
 		 432 aa  283  4.0000000000000003e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.265353 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4282  hypothetical protein  41.18 
 
 		 434 aa  281  1e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.789831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0819  protein of unknown function DUF21  34.87 
 
 		 441 aa  280  3e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1013  hemolysin  42.29 
 
 		 424 aa  279  6e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.471918  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0769  hypothetical protein  36.13 
 
 		 447 aa  278  9e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.574193 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3174  hypothetical protein  38.04 
 
 		 458 aa  278  1e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2673  hypothetical protein  42.29 
 
 		 424 aa  277  2e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.460279  normal  0.557621 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1287  protein of unknown function DUF21  38.28 
 
 		 428 aa  277  3e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2235  protein of unknown function DUF21  34.27 
 
 		 439 aa  276  4e-73  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1852  protein of unknown function DUF21  38.05 
 
 		 433 aa  275  9e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1467  protein of unknown function DUF21  37.62 
 
 		 429 aa  274  2.0000000000000002e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.211541  normal  0.989219 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0419  hypothetical protein  36.73 
 
 		 407 aa  273  3e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2008  protein of unknown function DUF21  33.03 
 
 		 447 aa  269  8.999999999999999e-71  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000403932  normal  0.229254 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0470  hypothetical protein  37.47 
 
 		 432 aa  268  2e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000200568  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2145  hypothetical protein  36.78 
 
 		 430 aa  267  2.9999999999999995e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0710  protein of unknown function DUF21  35.12 
 
 		 432 aa  265  1e-69  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.149607  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0231  CBS  34.11 
 
 		 454 aa  261  2e-68  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0205285  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4087  protein of unknown function DUF21  35.65 
 
 		 453 aa  261  2e-68  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5725  hypothetical protein  40.87 
 
 		 434 aa  259  7e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.239106  hitchhiker  0.00714589 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3577  protein of unknown function DUF21  31.12 
 
 		 441 aa  254  3e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4675  putative transporter  31.26 
 
 		 447 aa  249  5e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.050719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0295  hypothetical protein  31.52 
 
 		 424 aa  249  5e-65  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.731774 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0457  hypothetical protein  30.95 
 
 		 447 aa  249  9e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0445264  normal  0.119105 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3315  hypothetical protein  33.57 
 
 		 427 aa  247  3e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.284865  normal  0.945237 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4471  putative transporter  30.8 
 
 		 447 aa  246  4e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4787  putative transporter  30.8 
 
 		 447 aa  246  4e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4864  putative transporter  30.8 
 
 		 447 aa  246  4e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.830156  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3774  protein of unknown function DUF21  30.8 
 
 		 447 aa  246  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.767387  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0269  hypothetical protein  31.04 
 
 		 424 aa  246  4.9999999999999997e-64  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3627  CBS/transporter associated domain-containing protein  30.56 
 
 		 443 aa  246  4.9999999999999997e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3789  hypothetical protein  30.8 
 
 		 447 aa  246  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>