More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_3447 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_3640  hypothetical protein  78.89 
 
 		 441 aa  690    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4228  hypothetical protein  80.09 
 
 		 445 aa  651    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.351193  normal  0.199337 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3770  hypothetical protein  86.37 
 
 		 441 aa  754    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2774  protein of unknown function DUF21  99.32 
 
 		 440 aa  876    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.730131  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3447  hypothetical protein  100 
 
 		 440 aa  882    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4935  hypothetical protein  80.05 
 
 		 443 aa  694    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4765  hypothetical protein  68.21 
 
 		 437 aa  555  1e-157  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.942078 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4026  CBS:protein of unknown function DUF21:transporter-associated region  66.51 
 
 		 437 aa  550  1e-155  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2846  protein of unknown function DUF21  60.69 
 
 		 443 aa  542  1e-153  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2439  protein of unknown function DUF21  60.56 
 
 		 443 aa  539  9.999999999999999e-153  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3036  CBS  58.77 
 
 		 442 aa  528  1e-149  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0098  hypothetical protein  60.42 
 
 		 460 aa  530  1e-149  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0266  protein of unknown function DUF21  63.4 
 
 		 444 aa  524  1e-147  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2077  CBS domain-containing protein  60.66 
 
 		 441 aa  522  1e-147  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1932  CBS  61.21 
 
 		 456 aa  524  1e-147  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0017665  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2385  hypothetical protein  58.47 
 
 		 433 aa  524  1e-147  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1577  protein of unknown function DUF21  62.24 
 
 		 447 aa  520  1e-146  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.569313  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2313  hypothetical protein  59.23 
 
 		 438 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0902  protein of unknown function DUF21  56.59 
 
 		 436 aa  506  9.999999999999999e-143  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2853  CBS domain-containing protein  54.44 
 
 		 439 aa  487  1e-136  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2815  CBS domain-containing protein  52.42 
 
 		 439 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2157  hypothetical protein  53.37 
 
 		 437 aa  431  1e-119  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.285648  normal  0.808245 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3026  hypothetical protein  51.28 
 
 		 442 aa  424  1e-117  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.25014  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0953  membrane protein  48.95 
 
 		 426 aa  422  1e-117  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1519  hypothetical protein  50 
 
 		 428 aa  416  9.999999999999999e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3199  hypothetical protein  46.92 
 
 		 448 aa  402  1e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.184722 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3855  protein of unknown function DUF21  47.71 
 
 		 437 aa  380  1e-104  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.469597  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004057  hemolysin  42.42 
 
 		 434 aa  362  1e-98  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1250  CBS domain-containing protein  43.27 
 
 		 432 aa  361  2e-98  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.144301  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4403  hypothetical protein  45.18 
 
 		 436 aa  353  2.9999999999999997e-96  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0196704  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1314  hypothetical protein  46.01 
 
 		 439 aa  352  1e-95  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0274508  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2766  hypothetical protein  43.52 
 
 		 442 aa  347  3e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4050  hypothetical protein  42.45 
 
 		 440 aa  346  4e-94  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0807851  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2233  protein of unknown function DUF21  44.14 
 
 		 437 aa  343  4e-93  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2480  hemolysin  40.58 
 
 		 436 aa  342  9e-93  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1441  protein of unknown function DUF21  41.76 
 
 		 439 aa  337  1.9999999999999998e-91  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.114074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3597  protein of unknown function DUF21  41.96 
 
 		 447 aa  337  2.9999999999999997e-91  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000988374 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2432  protein of unknown function DUF21  41.78 
 
 		 443 aa  328  1.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3678  protein of unknown function DUF21  41.78 
 
 		 443 aa  328  1.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.35091 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0831  protein of unknown function DUF21  42.53 
 
 		 452 aa  324  2e-87  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0300168 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0756  hypothetical protein  41.91 
 
 		 436 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0635919  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0608  hemolysin  40.14 
 
 		 439 aa  322  9.999999999999999e-87  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0562  hypothetical protein  40.14 
 
 		 439 aa  321  1.9999999999999998e-86  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.371677  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35020  hemolysin-like protein  43.75 
 
 		 432 aa  318  7.999999999999999e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.518958  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0926  protein of unknown function DUF21  41.22 
 
 		 441 aa  311  1e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2122  hypothetical protein  42.86 
 
 		 436 aa  309  5.9999999999999995e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.705935  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00183  hemolysin  40.14 
 
 		 435 aa  308  1.0000000000000001e-82  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.702411  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2321  hypothetical protein  41.11 
 
 		 446 aa  308  2.0000000000000002e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.638143  normal  0.0384275 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3152  protein of unknown function DUF21  39.63 
 
 		 431 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0238  protein of unknown function DUF21  38.26 
 
 		 417 aa  301  1e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0723  hypothetical protein  42.72 
 
 		 425 aa  299  6e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0021  protein of unknown function DUF21  40.1 
 
 		 435 aa  298  1e-79  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.099852 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0343  hypothetical protein  37.2 
 
 		 437 aa  298  1e-79  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.384323  normal  0.630353 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1085  hypothetical protein  40.23 
 
 		 464 aa  298  1e-79  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.792914 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1919  hemolysin  41.92 
 
 		 430 aa  298  2e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2711  hypothetical protein  38.99 
 
 		 431 aa  294  3e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.155736 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2925  hypothetical protein  38.61 
 
 		 465 aa  293  5e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.221134  normal  0.412302 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3197  hypothetical protein  40.43 
 
 		 479 aa  293  5e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.241932  normal  0.866715 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2753  hypothetical protein  39.22 
 
 		 431 aa  292  8e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.429535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7487  hypothetical protein  39.34 
 
 		 436 aa  292  9e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.160114 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1413  hypothetical protein  37.44 
 
 		 430 aa  286  5e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0999393  normal  0.104956 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0828  protein of unknown function DUF21  39.58 
 
 		 424 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0819  protein of unknown function DUF21  36.24 
 
 		 441 aa  283  3.0000000000000004e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0769  hypothetical protein  39.39 
 
 		 447 aa  283  4.0000000000000003e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.574193 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1467  protein of unknown function DUF21  38.95 
 
 		 429 aa  283  6.000000000000001e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.211541  normal  0.989219 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3215  CBS:protein of unknown function DUF21:transporter-associated region  37.21 
 
 		 431 aa  281  1e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.141334 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2753  hypothetical protein  39.48 
 
 		 433 aa  281  1e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.151662  normal  0.98691 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1852  protein of unknown function DUF21  38.44 
 
 		 433 aa  281  1e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5725  hypothetical protein  43.71 
 
 		 434 aa  280  3e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.239106  hitchhiker  0.00714589 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0942  protein of unknown function DUF21  39.11 
 
 		 424 aa  280  5e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.429612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2008  protein of unknown function DUF21  33.8 
 
 		 447 aa  279  8e-74  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000403932  normal  0.229254 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4139  hypothetical protein  39.52 
 
 		 452 aa  279  9e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0969684 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0264  hypothetical protein  37.77 
 
 		 432 aa  278  1e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.265353 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3348  hypothetical protein  39.01 
 
 		 429 aa  278  2e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0165594  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0419  hypothetical protein  37.38 
 
 		 407 aa  276  4e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3174  hypothetical protein  37.05 
 
 		 458 aa  276  5e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1287  protein of unknown function DUF21  37.65 
 
 		 428 aa  275  1.0000000000000001e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3102  hypothetical protein  37.91 
 
 		 466 aa  274  2.0000000000000002e-72  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0806544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2235  protein of unknown function DUF21  33.33 
 
 		 439 aa  273  5.000000000000001e-72  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0231  CBS  33.64 
 
 		 454 aa  269  7e-71  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0205285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3672  hypothetical protein  37.85 
 
 		 425 aa  269  8e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00780947 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0710  protein of unknown function DUF21  35.04 
 
 		 432 aa  266  5.999999999999999e-70  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.149607  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0470  hypothetical protein  36.49 
 
 		 432 aa  265  1e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000200568  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4282  hypothetical protein  39.95 
 
 		 434 aa  259  7e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.789831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2145  hypothetical protein  36.78 
 
 		 430 aa  256  4e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1153  hypothetical protein  36.5 
 
 		 447 aa  255  1.0000000000000001e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000974304  normal  0.0417904 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5623  protein of unknown function DUF21  42.29 
 
 		 403 aa  252  1e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1013  hemolysin  42.13 
 
 		 424 aa  251  2e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.471918  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4675  putative transporter  30.61 
 
 		 447 aa  251  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.050719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2673  hypothetical protein  42.13 
 
 		 424 aa  249  6e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.460279  normal  0.557621 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4686  putative transporter  30.37 
 
 		 447 aa  249  7e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.116284  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4826  putative transporter  30.37 
 
 		 447 aa  249  7e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.229608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4805  putative transporter  30.37 
 
 		 447 aa  249  7e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.140825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4771  putative transporter  30.37 
 
 		 447 aa  249  7e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3960  CBS/transporter associated domain-containing protein  30.14 
 
 		 443 aa  247  3e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.216105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0457  hypothetical protein  30.05 
 
 		 447 aa  247  3e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0445264  normal  0.119105 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3627  CBS/transporter associated domain-containing protein  30.14 
 
 		 443 aa  247  3e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3772  hypothetical protein  30.14 
 
 		 443 aa  247  3e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5479  hypothetical protein  31.89 
 
 		 482 aa  246  4.9999999999999997e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3668  hypothetical protein  34.2 
 
 		 452 aa  246  4.9999999999999997e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>