More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4935 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_2774  protein of unknown function DUF21  79.91 
 
 
440 aa  697    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.730131  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3640  hypothetical protein  80.37 
 
 
441 aa  700    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4228  hypothetical protein  80.64 
 
 
445 aa  672    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.351193  normal  0.199337 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3770  hypothetical protein  78.41 
 
 
441 aa  696    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3447  hypothetical protein  80.05 
 
 
440 aa  694    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4935  hypothetical protein  100 
 
 
443 aa  891    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4026  CBS:protein of unknown function DUF21:transporter-associated region  68.35 
 
 
437 aa  559  1e-158  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4765  hypothetical protein  69.53 
 
 
437 aa  558  1e-158  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.942078 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0266  protein of unknown function DUF21  65.18 
 
 
444 aa  544  1e-153  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1577  protein of unknown function DUF21  63.85 
 
 
447 aa  535  1e-151  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.569313  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2439  protein of unknown function DUF21  61.34 
 
 
443 aa  532  1e-150  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2846  protein of unknown function DUF21  60.92 
 
 
443 aa  534  1e-150  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3036  CBS  60 
 
 
442 aa  530  1e-149  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0098  hypothetical protein  59.95 
 
 
460 aa  526  1e-148  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2313  hypothetical protein  60.33 
 
 
438 aa  513  1e-144  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2077  CBS domain-containing protein  58.41 
 
 
441 aa  512  1e-144  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2385  hypothetical protein  58.85 
 
 
433 aa  513  1e-144  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1932  CBS  60.32 
 
 
456 aa  509  1e-143  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0017665  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0902  protein of unknown function DUF21  57.83 
 
 
436 aa  503  1e-141  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2853  CBS domain-containing protein  55.92 
 
 
439 aa  489  1e-137  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2815  CBS domain-containing protein  51.95 
 
 
439 aa  457  1e-127  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0953  membrane protein  48.83 
 
 
426 aa  418  1e-116  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3026  hypothetical protein  51.03 
 
 
442 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.25014  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2157  hypothetical protein  50.96 
 
 
437 aa  408  1.0000000000000001e-112  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.285648  normal  0.808245 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3199  hypothetical protein  47.61 
 
 
448 aa  407  1.0000000000000001e-112  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.184722 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1519  hypothetical protein  49.41 
 
 
428 aa  395  1e-108  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3855  protein of unknown function DUF21  49.28 
 
 
437 aa  390  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.469597  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1250  CBS domain-containing protein  44.65 
 
 
432 aa  357  2.9999999999999997e-97  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.144301  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004057  hemolysin  43.76 
 
 
434 aa  354  2e-96  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2233  protein of unknown function DUF21  42.99 
 
 
437 aa  349  5e-95  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3597  protein of unknown function DUF21  41.57 
 
 
447 aa  349  7e-95  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000988374 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3678  protein of unknown function DUF21  43.65 
 
 
443 aa  347  2e-94  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.35091 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2432  protein of unknown function DUF21  43.65 
 
 
443 aa  347  2e-94  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4403  hypothetical protein  43.63 
 
 
436 aa  348  2e-94  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0196704  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2480  hemolysin  41.07 
 
 
436 aa  347  3e-94  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1314  hypothetical protein  45.18 
 
 
439 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0274508  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2766  hypothetical protein  43 
 
 
442 aa  340  2.9999999999999998e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4050  hypothetical protein  42.45 
 
 
440 aa  332  6e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0807851  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0831  protein of unknown function DUF21  43.75 
 
 
452 aa  328  8e-89  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0300168 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1441  protein of unknown function DUF21  41.65 
 
 
439 aa  322  7e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.114074  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0021  protein of unknown function DUF21  41.33 
 
 
435 aa  322  7e-87  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.099852 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0926  protein of unknown function DUF21  40.37 
 
 
441 aa  319  7e-86  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35020  hemolysin-like protein  42.46 
 
 
432 aa  317  2e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.518958  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0562  hypothetical protein  39.45 
 
 
439 aa  311  1e-83  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.371677  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0608  hemolysin  39.45 
 
 
439 aa  311  1e-83  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0343  hypothetical protein  40.33 
 
 
437 aa  310  4e-83  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.384323  normal  0.630353 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0756  hypothetical protein  40.75 
 
 
436 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0635919  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00183  hemolysin  40.32 
 
 
435 aa  306  6e-82  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.702411  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7487  hypothetical protein  39.72 
 
 
436 aa  302  9e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.160114 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2122  hypothetical protein  41.26 
 
 
436 aa  301  1e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.705935  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2711  hypothetical protein  39.67 
 
 
431 aa  301  2e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.155736 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2321  hypothetical protein  39.12 
 
 
446 aa  300  4e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.638143  normal  0.0384275 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0238  protein of unknown function DUF21  36.36 
 
 
417 aa  300  5e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1085  hypothetical protein  40.76 
 
 
464 aa  298  9e-80  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.792914 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3152  protein of unknown function DUF21  38.34 
 
 
431 aa  298  1e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2753  hypothetical protein  39.44 
 
 
431 aa  297  3e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.429535  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0419  hypothetical protein  38.54 
 
 
407 aa  290  3e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2925  hypothetical protein  37.92 
 
 
465 aa  289  6e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.221134  normal  0.412302 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3174  hypothetical protein  38.5 
 
 
458 aa  288  1e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1919  hemolysin  39.03 
 
 
430 aa  285  1.0000000000000001e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3215  CBS:protein of unknown function DUF21:transporter-associated region  36.36 
 
 
431 aa  283  4.0000000000000003e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.141334 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0819  protein of unknown function DUF21  36.81 
 
 
441 aa  283  4.0000000000000003e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3197  hypothetical protein  38.64 
 
 
479 aa  283  6.000000000000001e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.241932  normal  0.866715 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1413  hypothetical protein  35.87 
 
 
430 aa  281  2e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0999393  normal  0.104956 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1467  protein of unknown function DUF21  37.73 
 
 
429 aa  280  3e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.211541  normal  0.989219 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1852  protein of unknown function DUF21  39.17 
 
 
433 aa  280  3e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0769  hypothetical protein  39.19 
 
 
447 aa  280  4e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.574193 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2235  protein of unknown function DUF21  32.94 
 
 
439 aa  277  2e-73  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0828  protein of unknown function DUF21  37.32 
 
 
424 aa  277  3e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2753  hypothetical protein  39.23 
 
 
433 aa  277  3e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.151662  normal  0.98691 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0942  protein of unknown function DUF21  37.32 
 
 
424 aa  275  8e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.429612  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0723  hypothetical protein  39.51 
 
 
425 aa  274  2.0000000000000002e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3102  hypothetical protein  38 
 
 
466 aa  273  3e-72  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0806544  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3672  hypothetical protein  36.71 
 
 
425 aa  273  3e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00780947 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2008  protein of unknown function DUF21  33.33 
 
 
447 aa  274  3e-72  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000403932  normal  0.229254 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0264  hypothetical protein  37.11 
 
 
432 aa  273  4.0000000000000004e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.265353 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5725  hypothetical protein  42 
 
 
434 aa  272  9e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.239106  hitchhiker  0.00714589 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0710  protein of unknown function DUF21  36.1 
 
 
432 aa  271  2e-71  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.149607  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4139  hypothetical protein  37.2 
 
 
452 aa  270  4e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0969684 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4282  hypothetical protein  40.85 
 
 
434 aa  269  8.999999999999999e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.789831  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0231  CBS  33.64 
 
 
454 aa  268  1e-70  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0205285  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1287  protein of unknown function DUF21  35.85 
 
 
428 aa  264  3e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3348  hypothetical protein  37.5 
 
 
429 aa  263  4.999999999999999e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0165594  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0470  hypothetical protein  35.28 
 
 
432 aa  261  1e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000200568  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1013  hemolysin  39.58 
 
 
424 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.471918  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2145  hypothetical protein  35.66 
 
 
430 aa  252  1e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2673  hypothetical protein  39.58 
 
 
424 aa  251  2e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.460279  normal  0.557621 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4087  protein of unknown function DUF21  33.1 
 
 
453 aa  251  2e-65  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5479  hypothetical protein  33.8 
 
 
482 aa  246  6e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0353  hypothetical protein  31.48 
 
 
438 aa  244  3e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0777  protein of unknown function DUF21  33.41 
 
 
438 aa  243  5e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.825818  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4675  putative transporter  30.23 
 
 
447 aa  243  6e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.050719  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0848  hypothetical protein  33.18 
 
 
438 aa  243  7e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.684402 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0359  hypothetical protein  31.35 
 
 
438 aa  241  2e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3667  hypothetical protein  31.35 
 
 
438 aa  241  2e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3668  hypothetical protein  33.18 
 
 
452 aa  241  2e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0743  hypothetical protein  31.99 
 
 
439 aa  241  2e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.946695  normal  0.0273705 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4686  putative transporter  30 
 
 
447 aa  240  4e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.116284  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4826  putative transporter  30 
 
 
447 aa  240  4e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.229608  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4805  putative transporter  30 
 
 
447 aa  240  4e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.140825  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>