More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_4050 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_4050  hypothetical protein  100 
 
 
440 aa  894    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0807851  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2766  hypothetical protein  54.74 
 
 
442 aa  473  1e-132  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3597  protein of unknown function DUF21  53.32 
 
 
447 aa  459  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000988374 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4403  hypothetical protein  54.21 
 
 
436 aa  457  1e-127  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0196704  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1314  hypothetical protein  53.66 
 
 
439 aa  421  1e-117  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0274508  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3678  protein of unknown function DUF21  49.29 
 
 
443 aa  418  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.35091 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2432  protein of unknown function DUF21  49.29 
 
 
443 aa  418  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2480  hemolysin  46.57 
 
 
436 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2233  protein of unknown function DUF21  47.61 
 
 
437 aa  402  1e-111  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1250  CBS domain-containing protein  48.22 
 
 
432 aa  398  9.999999999999999e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.144301  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0021  protein of unknown function DUF21  49.4 
 
 
435 aa  399  9.999999999999999e-111  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.099852 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0819  protein of unknown function DUF21  43.62 
 
 
441 aa  387  1e-106  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0756  hypothetical protein  44.93 
 
 
436 aa  374  1e-102  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0635919  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35020  hemolysin-like protein  46.75 
 
 
432 aa  372  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.518958  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0238  protein of unknown function DUF21  42.38 
 
 
417 aa  366  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1852  protein of unknown function DUF21  44.29 
 
 
433 aa  364  2e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2439  protein of unknown function DUF21  44.74 
 
 
443 aa  357  1.9999999999999998e-97  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2846  protein of unknown function DUF21  44.11 
 
 
443 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4026  CBS:protein of unknown function DUF21:transporter-associated region  45.37 
 
 
437 aa  356  5e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2815  CBS domain-containing protein  41.94 
 
 
439 aa  355  5.999999999999999e-97  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0831  protein of unknown function DUF21  42.66 
 
 
452 aa  355  1e-96  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0300168 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0902  protein of unknown function DUF21  43.9 
 
 
436 aa  355  1e-96  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4765  hypothetical protein  45.26 
 
 
437 aa  353  4e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.942078 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2385  hypothetical protein  43.03 
 
 
433 aa  353  4e-96  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0098  hypothetical protein  43.72 
 
 
460 aa  352  7e-96  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3770  hypothetical protein  42.99 
 
 
441 aa  352  8.999999999999999e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1932  CBS  41.74 
 
 
456 aa  350  2e-95  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0017665  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3640  hypothetical protein  42.82 
 
 
441 aa  350  3e-95  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1085  hypothetical protein  41.77 
 
 
464 aa  350  4e-95  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.792914 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2853  CBS domain-containing protein  42.22 
 
 
439 aa  348  1e-94  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3036  CBS  43.12 
 
 
442 aa  348  1e-94  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0266  protein of unknown function DUF21  44.57 
 
 
444 aa  347  3e-94  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3447  hypothetical protein  42.45 
 
 
440 aa  346  4e-94  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1577  protein of unknown function DUF21  45.98 
 
 
447 aa  346  5e-94  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.569313  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2774  protein of unknown function DUF21  42.45 
 
 
440 aa  346  5e-94  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.730131  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1441  protein of unknown function DUF21  40.55 
 
 
439 aa  345  1e-93  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.114074  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0926  protein of unknown function DUF21  43.45 
 
 
441 aa  344  1e-93  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2077  CBS domain-containing protein  43.2 
 
 
441 aa  341  1e-92  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1413  hypothetical protein  40.29 
 
 
430 aa  338  9.999999999999999e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0999393  normal  0.104956 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0419  hypothetical protein  39.12 
 
 
407 aa  333  5e-90  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4935  hypothetical protein  42.45 
 
 
443 aa  332  6e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2008  protein of unknown function DUF21  38.12 
 
 
447 aa  332  1e-89  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000403932  normal  0.229254 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2313  hypothetical protein  43.66 
 
 
438 aa  331  2e-89  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0562  hypothetical protein  40.23 
 
 
439 aa  328  1.0000000000000001e-88  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.371677  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0608  hemolysin  40.23 
 
 
439 aa  327  3e-88  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2321  hypothetical protein  41.08 
 
 
446 aa  325  7e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.638143  normal  0.0384275 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7487  hypothetical protein  41.34 
 
 
436 aa  325  9e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.160114 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1467  protein of unknown function DUF21  39.62 
 
 
429 aa  324  2e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.211541  normal  0.989219 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4228  hypothetical protein  43.62 
 
 
445 aa  324  2e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.351193  normal  0.199337 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2925  hypothetical protein  41.3 
 
 
465 aa  323  3e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.221134  normal  0.412302 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0769  hypothetical protein  40.43 
 
 
447 aa  321  9.999999999999999e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.574193 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0231  CBS  37.44 
 
 
454 aa  320  1.9999999999999998e-86  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0205285  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1919  hemolysin  39.68 
 
 
430 aa  320  1.9999999999999998e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3199  hypothetical protein  38.18 
 
 
448 aa  320  1.9999999999999998e-86  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.184722 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5725  hypothetical protein  44.68 
 
 
434 aa  319  6e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.239106  hitchhiker  0.00714589 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3152  protein of unknown function DUF21  38.66 
 
 
431 aa  319  7e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00183  hemolysin  39.31 
 
 
435 aa  318  1e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.702411  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0828  protein of unknown function DUF21  40.24 
 
 
424 aa  318  1e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0942  protein of unknown function DUF21  40.47 
 
 
424 aa  317  4e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.429612  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2235  protein of unknown function DUF21  35.53 
 
 
439 aa  314  1.9999999999999998e-84  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0343  hypothetical protein  39.56 
 
 
437 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.384323  normal  0.630353 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3197  hypothetical protein  41.59 
 
 
479 aa  314  1.9999999999999998e-84  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.241932  normal  0.866715 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3348  hypothetical protein  39.53 
 
 
429 aa  313  2.9999999999999996e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0165594  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1287  protein of unknown function DUF21  39.38 
 
 
428 aa  313  3.9999999999999997e-84  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3026  hypothetical protein  39.2 
 
 
442 aa  312  5.999999999999999e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.25014  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3102  hypothetical protein  40.33 
 
 
466 aa  312  9e-84  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0806544  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4139  hypothetical protein  40.39 
 
 
452 aa  311  1e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0969684 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2711  hypothetical protein  39.19 
 
 
431 aa  311  1e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.155736 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2753  hypothetical protein  40.1 
 
 
433 aa  310  4e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.151662  normal  0.98691 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2753  hypothetical protein  39.67 
 
 
431 aa  309  6.999999999999999e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.429535  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0710  protein of unknown function DUF21  38.44 
 
 
432 aa  307  2.0000000000000002e-82  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.149607  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0264  hypothetical protein  39.08 
 
 
432 aa  306  5.0000000000000004e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.265353 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3174  hypothetical protein  39.95 
 
 
458 aa  306  5.0000000000000004e-82  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0470  hypothetical protein  38.86 
 
 
432 aa  306  5.0000000000000004e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000200568  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0723  hypothetical protein  41.42 
 
 
425 aa  305  1.0000000000000001e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1519  hypothetical protein  38.42 
 
 
428 aa  303  3.0000000000000004e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0953  membrane protein  38.5 
 
 
426 aa  302  8.000000000000001e-81  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004057  hemolysin  37.44 
 
 
434 aa  301  1e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2145  hypothetical protein  40.15 
 
 
430 aa  299  5e-80  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2122  hypothetical protein  40.14 
 
 
436 aa  299  6e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.705935  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2157  hypothetical protein  38.41 
 
 
437 aa  298  1e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.285648  normal  0.808245 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3672  hypothetical protein  37.35 
 
 
425 aa  287  2e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00780947 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4282  hypothetical protein  40.66 
 
 
434 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.789831  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4087  protein of unknown function DUF21  35.21 
 
 
453 aa  282  7.000000000000001e-75  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2673  hypothetical protein  41.71 
 
 
424 aa  282  8.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.460279  normal  0.557621 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1013  hemolysin  41.47 
 
 
424 aa  281  2e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.471918  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3855  protein of unknown function DUF21  38.24 
 
 
437 aa  278  1e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.469597  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4864  putative transporter  32.33 
 
 
447 aa  275  8e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.830156  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4787  putative transporter  32.33 
 
 
447 aa  275  8e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4471  putative transporter  32.33 
 
 
447 aa  275  8e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04089  predicted inner membrane protein  32.33 
 
 
447 aa  275  9e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3774  protein of unknown function DUF21  32.33 
 
 
447 aa  275  9e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.767387  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3789  hypothetical protein  32.33 
 
 
447 aa  275  9e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5735  putative transporter  32.33 
 
 
447 aa  275  9e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4696  putative transporter  32.33 
 
 
447 aa  275  9e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04052  hypothetical protein  32.33 
 
 
447 aa  275  9e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4675  putative transporter  32.49 
 
 
447 aa  275  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.050719  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4805  putative transporter  32.26 
 
 
447 aa  273  6e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.140825  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4826  putative transporter  32.26 
 
 
447 aa  273  6e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.229608  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4771  putative transporter  32.26 
 
 
447 aa  273  6e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>