More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0953 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0953  membrane protein  100 
 
 		 426 aa  864    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3036  CBS  53.76 
 
 		 442 aa  465  9.999999999999999e-131  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0902  protein of unknown function DUF21  53.86 
 
 		 436 aa  460  9.999999999999999e-129  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3770  hypothetical protein  51.31 
 
 		 441 aa  432  1e-120  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2846  protein of unknown function DUF21  50.23 
 
 		 443 aa  429  1e-119  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2774  protein of unknown function DUF21  48.95 
 
 		 440 aa  422  1e-117  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.730131  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3447  hypothetical protein  48.95 
 
 		 440 aa  422  1e-117  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4935  hypothetical protein  48.83 
 
 		 443 aa  418  1e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2439  protein of unknown function DUF21  50.12 
 
 		 443 aa  417  9.999999999999999e-116  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1932  CBS  50.47 
 
 		 456 aa  416  9.999999999999999e-116  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0017665  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2313  hypothetical protein  48.55 
 
 		 438 aa  411  1e-113  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1577  protein of unknown function DUF21  50 
 
 		 447 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.569313  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3640  hypothetical protein  48.01 
 
 		 441 aa  408  1.0000000000000001e-112  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0266  protein of unknown function DUF21  50.35 
 
 		 444 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2077  CBS domain-containing protein  46.27 
 
 		 441 aa  399  9.999999999999999e-111  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0098  hypothetical protein  48.55 
 
 		 460 aa  399  9.999999999999999e-111  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4765  hypothetical protein  48.79 
 
 		 437 aa  395  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.942078 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4026  CBS:protein of unknown function DUF21:transporter-associated region  49.76 
 
 		 437 aa  394  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4228  hypothetical protein  51.07 
 
 		 445 aa  389  1e-107  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.351193  normal  0.199337 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2815  CBS domain-containing protein  47.16 
 
 		 439 aa  386  1e-106  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004057  hemolysin  44.71 
 
 		 434 aa  364  1e-99  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2385  hypothetical protein  44.31 
 
 		 433 aa  363  3e-99  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2853  CBS domain-containing protein  42.86 
 
 		 439 aa  351  1e-95  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3026  hypothetical protein  41.53 
 
 		 442 aa  327  3e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.25014  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3199  hypothetical protein  39.41 
 
 		 448 aa  326  4.0000000000000003e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.184722 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2157  hypothetical protein  41.31 
 
 		 437 aa  323  3e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.285648  normal  0.808245 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1250  CBS domain-containing protein  41.3 
 
 		 432 aa  322  9.000000000000001e-87  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.144301  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2480  hemolysin  39.86 
 
 		 436 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1314  hypothetical protein  41.88 
 
 		 439 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0274508  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4050  hypothetical protein  38.5 
 
 		 440 aa  302  8.000000000000001e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0807851  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3855  protein of unknown function DUF21  39.16 
 
 		 437 aa  300  2e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.469597  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2233  protein of unknown function DUF21  39.16 
 
 		 437 aa  297  3e-79  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1519  hypothetical protein  38.37 
 
 		 428 aa  293  4e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35020  hemolysin-like protein  39.34 
 
 		 432 aa  293  5e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.518958  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0926  protein of unknown function DUF21  38.73 
 
 		 441 aa  291  1e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1441  protein of unknown function DUF21  39.19 
 
 		 439 aa  286  4e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.114074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3597  protein of unknown function DUF21  38.9 
 
 		 447 aa  286  5.999999999999999e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000988374 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4403  hypothetical protein  38.86 
 
 		 436 aa  285  9e-76  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0196704  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2432  protein of unknown function DUF21  39.28 
 
 		 443 aa  280  2e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2766  hypothetical protein  39.04 
 
 		 442 aa  281  2e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3678  protein of unknown function DUF21  39.28 
 
 		 443 aa  280  2e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.35091 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0756  hypothetical protein  35.36 
 
 		 436 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0635919  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2321  hypothetical protein  35.76 
 
 		 446 aa  271  2e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.638143  normal  0.0384275 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2925  hypothetical protein  37.83 
 
 		 465 aa  267  2e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.221134  normal  0.412302 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0562  hypothetical protein  35.68 
 
 		 439 aa  265  1e-69  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.371677  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0608  hemolysin  35.68 
 
 		 439 aa  264  3e-69  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0828  protein of unknown function DUF21  36.3 
 
 		 424 aa  263  4e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0942  protein of unknown function DUF21  36.3 
 
 		 424 aa  262  8.999999999999999e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.429612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3197  hypothetical protein  36.45 
 
 		 479 aa  261  2e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.241932  normal  0.866715 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0021  protein of unknown function DUF21  36.3 
 
 		 435 aa  259  4e-68  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.099852 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1287  protein of unknown function DUF21  35.85 
 
 		 428 aa  260  4e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2122  hypothetical protein  35.13 
 
 		 436 aa  258  1e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.705935  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00183  hemolysin  36.66 
 
 		 435 aa  258  2e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.702411  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1085  hypothetical protein  36.67 
 
 		 464 aa  258  2e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.792914 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3152  protein of unknown function DUF21  33.88 
 
 		 431 aa  254  3e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0238  protein of unknown function DUF21  35.58 
 
 		 417 aa  254  3e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2711  hypothetical protein  34.58 
 
 		 431 aa  251  2e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.155736 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0231  CBS  31.76 
 
 		 454 aa  251  3e-65  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0205285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7487  hypothetical protein  34.19 
 
 		 436 aa  250  3e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.160114 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0470  hypothetical protein  33.8 
 
 		 432 aa  250  4e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000200568  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0343  hypothetical protein  32.3 
 
 		 437 aa  248  1e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.384323  normal  0.630353 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2753  hypothetical protein  33.57 
 
 		 431 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.429535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0831  protein of unknown function DUF21  35.13 
 
 		 452 aa  244  3e-63  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0300168 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1413  hypothetical protein  33.09 
 
 		 430 aa  244  3e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0999393  normal  0.104956 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0710  protein of unknown function DUF21  33.73 
 
 		 432 aa  243  5e-63  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.149607  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3174  hypothetical protein  33.26 
 
 		 458 aa  242  9e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4282  hypothetical protein  34.27 
 
 		 434 aa  241  1e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.789831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5725  hypothetical protein  36.71 
 
 		 434 aa  241  2e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.239106  hitchhiker  0.00714589 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3672  hypothetical protein  33.41 
 
 		 425 aa  241  2e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00780947 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0247  protein of unknown function DUF21  32.71 
 
 		 446 aa  240  4e-62  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2673  hypothetical protein  34.43 
 
 		 424 aa  239  6.999999999999999e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.460279  normal  0.557621 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2235  protein of unknown function DUF21  30.3 
 
 		 439 aa  239  6.999999999999999e-62  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0723  hypothetical protein  34.3 
 
 		 425 aa  239  8e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1919  hemolysin  32.39 
 
 		 430 aa  239  9e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1013  hemolysin  34.19 
 
 		 424 aa  238  1e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.471918  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3102  hypothetical protein  34.19 
 
 		 466 aa  238  1e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0806544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2145  hypothetical protein  34.62 
 
 		 430 aa  238  2e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0819  protein of unknown function DUF21  32.48 
 
 		 441 aa  236  5.0000000000000005e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1467  protein of unknown function DUF21  33.49 
 
 		 429 aa  236  5.0000000000000005e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.211541  normal  0.989219 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1852  protein of unknown function DUF21  33.9 
 
 		 433 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3772  hypothetical protein  31.11 
 
 		 443 aa  233  3e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2753  hypothetical protein  32.69 
 
 		 433 aa  234  3e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.151662  normal  0.98691 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3627  CBS/transporter associated domain-containing protein  31.11 
 
 		 443 aa  233  3e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0820  protein of unknown function DUF21  30.9 
 
 		 444 aa  233  5e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3960  CBS/transporter associated domain-containing protein  30.88 
 
 		 443 aa  233  7.000000000000001e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.216105  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4675  putative transporter  31.78 
 
 		 447 aa  232  8.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.050719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0769  hypothetical protein  33.17 
 
 		 447 aa  231  2e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.574193 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3348  hypothetical protein  32.71 
 
 		 429 aa  231  2e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0165594  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4826  putative transporter  31.54 
 
 		 447 aa  229  6e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.229608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4686  putative transporter  31.54 
 
 		 447 aa  229  6e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.116284  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4805  putative transporter  31.54 
 
 		 447 aa  229  6e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.140825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4771  putative transporter  31.54 
 
 		 447 aa  229  7e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0457  hypothetical protein  30.41 
 
 		 447 aa  227  3e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0445264  normal  0.119105 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4864  putative transporter  31.07 
 
 		 447 aa  227  3e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.830156  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4471  putative transporter  31.07 
 
 		 447 aa  227  3e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4787  putative transporter  31.07 
 
 		 447 aa  227  3e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04089  predicted inner membrane protein  31.07 
 
 		 447 aa  226  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3774  protein of unknown function DUF21  31.07 
 
 		 447 aa  226  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.767387  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3789  hypothetical protein  31.07 
 
 		 447 aa  226  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4696  putative transporter  31.07 
 
 		 447 aa  226  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>