More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0269 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007204  Psyc_0269  hypothetical protein  100 
 
 
424 aa  864    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1848  hypothetical protein  77.43 
 
 
424 aa  685    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000139773 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0295  hypothetical protein  98.58 
 
 
424 aa  853    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.731774 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1483  hypothetical protein  59.3 
 
 
429 aa  507  9.999999999999999e-143  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.234798  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3577  protein of unknown function DUF21  52.45 
 
 
441 aa  473  1e-132  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3772  hypothetical protein  52.57 
 
 
443 aa  465  9.999999999999999e-131  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3627  CBS/transporter associated domain-containing protein  52.57 
 
 
443 aa  465  9.999999999999999e-131  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04089  predicted inner membrane protein  51.87 
 
 
447 aa  461  1e-129  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3774  protein of unknown function DUF21  51.87 
 
 
447 aa  461  1e-129  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.767387  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4471  putative transporter  51.87 
 
 
447 aa  461  1e-129  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0786  protein of unknown function DUF21  54.22 
 
 
438 aa  462  1e-129  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.35446  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0820  protein of unknown function DUF21  52.45 
 
 
444 aa  462  1e-129  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0457  hypothetical protein  52.8 
 
 
447 aa  464  1e-129  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0445264  normal  0.119105 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3960  CBS/transporter associated domain-containing protein  52.57 
 
 
443 aa  464  1e-129  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.216105  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5735  putative transporter  51.87 
 
 
447 aa  461  1e-129  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4787  putative transporter  51.87 
 
 
447 aa  461  1e-129  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04052  hypothetical protein  51.87 
 
 
447 aa  461  1e-129  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3789  hypothetical protein  51.87 
 
 
447 aa  461  1e-129  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4675  putative transporter  51.98 
 
 
447 aa  464  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.050719  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4864  putative transporter  51.87 
 
 
447 aa  461  1e-129  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.830156  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4696  putative transporter  51.87 
 
 
447 aa  461  1e-129  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4686  putative transporter  51.75 
 
 
447 aa  460  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.116284  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4826  putative transporter  51.75 
 
 
447 aa  460  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.229608  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3418  hypothetical protein  52.77 
 
 
442 aa  461  9.999999999999999e-129  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4805  putative transporter  51.75 
 
 
447 aa  460  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.140825  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4771  putative transporter  51.75 
 
 
447 aa  461  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0396  hypothetical protein  50.82 
 
 
445 aa  454  1.0000000000000001e-126  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0782784  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3417  hypothetical protein  50 
 
 
435 aa  436  1e-121  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0359  hypothetical protein  50.58 
 
 
438 aa  436  1e-121  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3667  hypothetical protein  50.58 
 
 
438 aa  436  1e-121  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4351  CBS domain-containing protein  49.88 
 
 
438 aa  434  1e-120  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4034  hypothetical protein  49.88 
 
 
438 aa  431  1e-120  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3937  protein of unknown function DUF21  49.88 
 
 
438 aa  431  1e-120  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4131  hypothetical protein  49.88 
 
 
438 aa  431  1e-120  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4012  hypothetical protein  49.65 
 
 
438 aa  432  1e-120  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3617  hypothetical protein  49.65 
 
 
438 aa  433  1e-120  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.960503  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0398  hypothetical protein  51.75 
 
 
437 aa  430  1e-119  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.596861  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0353  hypothetical protein  50.12 
 
 
438 aa  430  1e-119  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3488  protein of unknown function DUF21  51.09 
 
 
432 aa  427  1e-118  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0284  hypothetical protein  50.35 
 
 
441 aa  425  1e-118  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0334132 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0419  hypothetical protein  51.09 
 
 
435 aa  428  1e-118  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.794488  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0907  hypothetical protein  47.56 
 
 
440 aa  423  1e-117  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3284  hemolysin, putative  49.18 
 
 
436 aa  422  1e-117  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3668  hypothetical protein  44.88 
 
 
452 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5479  hypothetical protein  46.6 
 
 
482 aa  410  1e-113  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1075  hypothetical protein  47.78 
 
 
443 aa  411  1e-113  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.179676  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4210  protein of unknown function DUF21  47.31 
 
 
427 aa  409  1e-113  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0777  protein of unknown function DUF21  43.59 
 
 
438 aa  406  1.0000000000000001e-112  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.825818  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0743  hypothetical protein  44.99 
 
 
439 aa  403  1e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.946695  normal  0.0273705 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0848  hypothetical protein  43.36 
 
 
438 aa  403  1e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.684402 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3315  hypothetical protein  44.52 
 
 
427 aa  379  1e-104  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.284865  normal  0.945237 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2968  CorC/HlyC family transporters  44.79 
 
 
427 aa  360  2e-98  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.307812  normal  0.518349 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2476  protein of unknown function DUF21  41.46 
 
 
438 aa  348  1e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.577812 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2082  protein of unknown function DUF21  41.46 
 
 
438 aa  348  1e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.690525  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2277  hypothetical protein  41.49 
 
 
441 aa  347  2e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0698  hypothetical protein  41.2 
 
 
438 aa  343  4e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.46014  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2591  CBS:protein of unknown function DUF21:transporter-associated region  40.14 
 
 
443 aa  337  2.9999999999999997e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3159  protein of unknown function DUF21  39.41 
 
 
445 aa  329  6e-89  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.248716  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2815  CBS domain-containing protein  34.97 
 
 
439 aa  287  2e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2853  CBS domain-containing protein  33.02 
 
 
439 aa  270  4e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2385  hypothetical protein  31.6 
 
 
433 aa  269  5.9999999999999995e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0902  protein of unknown function DUF21  29.12 
 
 
436 aa  256  7e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3036  CBS  30.07 
 
 
442 aa  253  3e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2313  hypothetical protein  31.07 
 
 
438 aa  251  3e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2439  protein of unknown function DUF21  30.94 
 
 
443 aa  249  8e-65  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0098  hypothetical protein  30.53 
 
 
460 aa  248  2e-64  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4026  CBS:protein of unknown function DUF21:transporter-associated region  31.08 
 
 
437 aa  247  3e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2846  protein of unknown function DUF21  29.74 
 
 
443 aa  245  8e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1932  CBS  31.07 
 
 
456 aa  245  9.999999999999999e-64  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0017665  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4765  hypothetical protein  32.05 
 
 
437 aa  245  9.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.942078 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1250  CBS domain-containing protein  32.63 
 
 
432 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.144301  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3678  protein of unknown function DUF21  31.26 
 
 
443 aa  241  2e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.35091 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2432  protein of unknown function DUF21  31.26 
 
 
443 aa  241  2e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3640  hypothetical protein  29.31 
 
 
441 aa  239  5e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3447  hypothetical protein  29.58 
 
 
440 aa  239  5e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3597  protein of unknown function DUF21  28.71 
 
 
447 aa  239  6.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000988374 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3770  hypothetical protein  30.05 
 
 
441 aa  239  8e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2077  CBS domain-containing protein  29.15 
 
 
441 aa  237  4e-61  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2774  protein of unknown function DUF21  29.81 
 
 
440 aa  236  5.0000000000000005e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.730131  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0266  protein of unknown function DUF21  30.5 
 
 
444 aa  236  6e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1577  protein of unknown function DUF21  30.28 
 
 
447 aa  232  8.000000000000001e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.569313  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1413  hypothetical protein  32.2 
 
 
430 aa  232  1e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0999393  normal  0.104956 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4935  hypothetical protein  28.1 
 
 
443 aa  231  2e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35020  hemolysin-like protein  30.48 
 
 
432 aa  229  8e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.518958  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2480  hemolysin  31.02 
 
 
436 aa  228  2e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0953  membrane protein  28.54 
 
 
426 aa  227  3e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4228  hypothetical protein  29.88 
 
 
445 aa  227  4e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.351193  normal  0.199337 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1287  protein of unknown function DUF21  27.96 
 
 
428 aa  226  7e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4050  hypothetical protein  29.08 
 
 
440 aa  226  8e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0807851  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2233  protein of unknown function DUF21  30.48 
 
 
437 aa  225  1e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3026  hypothetical protein  28.97 
 
 
442 aa  223  4e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.25014  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2145  hypothetical protein  26.42 
 
 
430 aa  222  9.999999999999999e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2766  hypothetical protein  29.33 
 
 
442 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4403  hypothetical protein  30.05 
 
 
436 aa  221  1.9999999999999999e-56  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0196704  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2321  hypothetical protein  27.9 
 
 
446 aa  218  1e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.638143  normal  0.0384275 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1085  hypothetical protein  29.1 
 
 
464 aa  218  2e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.792914 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3199  hypothetical protein  29.82 
 
 
448 aa  217  2.9999999999999998e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.184722 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0756  hypothetical protein  28.3 
 
 
436 aa  217  4e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0635919  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1467  protein of unknown function DUF21  29.67 
 
 
429 aa  216  9e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.211541  normal  0.989219 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0926  protein of unknown function DUF21  29.44 
 
 
441 aa  216  9e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.731568 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>