More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_4351 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_3937  protein of unknown function DUF21  92.45 
 
 		 438 aa  836    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4351  CBS domain-containing protein  100 
 
 		 438 aa  902    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4012  hypothetical protein  92.68 
 
 		 438 aa  838    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0907  hypothetical protein  75.29 
 
 		 440 aa  680    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1075  hypothetical protein  76.28 
 
 		 443 aa  687    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.179676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3417  hypothetical protein  80.51 
 
 		 435 aa  732    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3617  hypothetical protein  91.32 
 
 		 438 aa  833    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.960503  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4131  hypothetical protein  92.45 
 
 		 438 aa  836    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0284  hypothetical protein  84.31 
 
 		 441 aa  755    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0334132 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0359  hypothetical protein  96.8 
 
 		 438 aa  875    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3667  hypothetical protein  96.8 
 
 		 438 aa  875    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0419  hypothetical protein  81.54 
 
 		 435 aa  714    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.794488  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4034  hypothetical protein  92.45 
 
 		 438 aa  836    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0398  hypothetical protein  72.31 
 
 		 437 aa  664    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.596861  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0353  hypothetical protein  93.84 
 
 		 438 aa  853    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3284  hemolysin, putative  75.23 
 
 		 436 aa  680    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3627  CBS/transporter associated domain-containing protein  60.71 
 
 		 443 aa  542  1e-153  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3772  hypothetical protein  60.71 
 
 		 443 aa  542  1e-153  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3960  CBS/transporter associated domain-containing protein  60.47 
 
 		 443 aa  540  9.999999999999999e-153  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.216105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0396  hypothetical protein  58.29 
 
 		 445 aa  538  9.999999999999999e-153  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0782784  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04089  predicted inner membrane protein  57.83 
 
 		 447 aa  537  1e-151  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3774  protein of unknown function DUF21  57.83 
 
 		 447 aa  537  1e-151  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.767387  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04052  hypothetical protein  57.83 
 
 		 447 aa  537  1e-151  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4696  putative transporter  57.83 
 
 		 447 aa  537  1e-151  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4805  putative transporter  58.29 
 
 		 447 aa  536  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.140825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5735  putative transporter  57.83 
 
 		 447 aa  537  1e-151  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4787  putative transporter  57.83 
 
 		 447 aa  537  1e-151  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0820  protein of unknown function DUF21  59.62 
 
 		 444 aa  536  1e-151  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4864  putative transporter  57.83 
 
 		 447 aa  537  1e-151  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.830156  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3789  hypothetical protein  57.83 
 
 		 447 aa  537  1e-151  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4686  putative transporter  58.29 
 
 		 447 aa  536  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.116284  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4471  putative transporter  57.83 
 
 		 447 aa  537  1e-151  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4771  putative transporter  58.29 
 
 		 447 aa  536  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4826  putative transporter  58.29 
 
 		 447 aa  536  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.229608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4675  putative transporter  58.29 
 
 		 447 aa  534  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.050719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0457  hypothetical protein  59.29 
 
 		 447 aa  530  1e-149  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0445264  normal  0.119105 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3577  protein of unknown function DUF21  57.75 
 
 		 441 aa  525  1e-148  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0786  protein of unknown function DUF21  58.53 
 
 		 438 aa  522  1e-147  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.35446  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3418  hypothetical protein  59.22 
 
 		 442 aa  518  1e-146  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0777  protein of unknown function DUF21  52.52 
 
 		 438 aa  492  9.999999999999999e-139  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.825818  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0848  hypothetical protein  52.52 
 
 		 438 aa  491  1e-137  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.684402 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5479  hypothetical protein  51.72 
 
 		 482 aa  487  1e-136  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0743  hypothetical protein  53.4 
 
 		 439 aa  484  1e-136  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.946695  normal  0.0273705 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4210  protein of unknown function DUF21  52.35 
 
 		 427 aa  481  1e-135  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3668  hypothetical protein  52.93 
 
 		 452 aa  480  1e-134  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3488  protein of unknown function DUF21  55.12 
 
 		 432 aa  478  1e-133  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1483  hypothetical protein  52 
 
 		 429 aa  446  1.0000000000000001e-124  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.234798  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3315  hypothetical protein  50 
 
 		 427 aa  432  1e-120  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.284865  normal  0.945237 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0295  hypothetical protein  50.35 
 
 		 424 aa  431  1e-119  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.731774 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1848  hypothetical protein  48.26 
 
 		 424 aa  424  1e-117  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000139773 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0269  hypothetical protein  49.88 
 
 		 424 aa  424  1e-117  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2277  hypothetical protein  47.53 
 
 		 441 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2082  protein of unknown function DUF21  46.47 
 
 		 438 aa  395  1e-109  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.690525  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2476  protein of unknown function DUF21  46.47 
 
 		 438 aa  394  1e-108  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.577812 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2968  CorC/HlyC family transporters  47.99 
 
 		 427 aa  393  1e-108  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.307812  normal  0.518349 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2591  CBS:protein of unknown function DUF21:transporter-associated region  45.65 
 
 		 443 aa  385  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0698  hypothetical protein  45.65 
 
 		 438 aa  385  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.46014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3159  protein of unknown function DUF21  39.59 
 
 		 445 aa  318  1e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.248716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0819  protein of unknown function DUF21  32.35 
 
 		 441 aa  259  4e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2853  CBS domain-containing protein  33.87 
 
 		 439 aa  258  1e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2815  CBS domain-containing protein  32.4 
 
 		 439 aa  258  2e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4050  hypothetical protein  32.26 
 
 		 440 aa  254  3e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0807851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2385  hypothetical protein  31.11 
 
 		 433 aa  251  1e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2233  protein of unknown function DUF21  32.45 
 
 		 437 aa  249  6e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2766  hypothetical protein  32.29 
 
 		 442 aa  247  2e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1413  hypothetical protein  33.25 
 
 		 430 aa  246  4e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0999393  normal  0.104956 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3597  protein of unknown function DUF21  32.3 
 
 		 447 aa  243  7e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000988374 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0902  protein of unknown function DUF21  31.52 
 
 		 436 aa  243  7e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2774  protein of unknown function DUF21  31.12 
 
 		 440 aa  241  2e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.730131  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4403  hypothetical protein  32.02 
 
 		 436 aa  239  5.999999999999999e-62  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0196704  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3447  hypothetical protein  30.89 
 
 		 440 aa  239  6.999999999999999e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35020  hemolysin-like protein  32.78 
 
 		 432 aa  238  2e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.518958  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1250  CBS domain-containing protein  32.01 
 
 		 432 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.144301  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2480  hemolysin  31.32 
 
 		 436 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4935  hypothetical protein  30.89 
 
 		 443 aa  236  7e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2077  CBS domain-containing protein  30.9 
 
 		 441 aa  233  6e-60  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1932  CBS  30.09 
 
 		 456 aa  232  1e-59  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0017665  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3036  CBS  29.77 
 
 		 442 aa  229  5e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0266  protein of unknown function DUF21  30.81 
 
 		 444 aa  228  2e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4765  hypothetical protein  31.16 
 
 		 437 aa  228  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.942078 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3640  hypothetical protein  31.4 
 
 		 441 aa  228  2e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3770  hypothetical protein  31.09 
 
 		 441 aa  228  2e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4026  CBS:protein of unknown function DUF21:transporter-associated region  30.5 
 
 		 437 aa  226  7e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1577  protein of unknown function DUF21  30.75 
 
 		 447 aa  225  9e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.569313  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2846  protein of unknown function DUF21  29.58 
 
 		 443 aa  225  2e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2439  protein of unknown function DUF21  30.55 
 
 		 443 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2432  protein of unknown function DUF21  31.5 
 
 		 443 aa  220  3e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3678  protein of unknown function DUF21  31.5 
 
 		 443 aa  220  3e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.35091 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2313  hypothetical protein  29.55 
 
 		 438 aa  220  3.9999999999999997e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0098  hypothetical protein  30.5 
 
 		 460 aa  219  8.999999999999998e-56  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3026  hypothetical protein  30.89 
 
 		 442 aa  218  2e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.25014  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0343  hypothetical protein  30.19 
 
 		 437 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.384323  normal  0.630353 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2008  protein of unknown function DUF21  28.64 
 
 		 447 aa  216  5e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000403932  normal  0.229254 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0756  hypothetical protein  29.37 
 
 		 436 aa  216  5.9999999999999996e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0635919  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1852  protein of unknown function DUF21  29.54 
 
 		 433 aa  216  7e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1085  hypothetical protein  32.27 
 
 		 464 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.792914 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3215  CBS:protein of unknown function DUF21:transporter-associated region  31.15 
 
 		 431 aa  215  1.9999999999999998e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.141334 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1287  protein of unknown function DUF21  28.54 
 
 		 428 aa  215  1.9999999999999998e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0238  protein of unknown function DUF21  29.98 
 
 		 417 aa  214  2.9999999999999995e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0953  membrane protein  30.18 
 
 		 426 aa  212  1e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>