More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_3159 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_3159  protein of unknown function DUF21  100 
 
 
445 aa  879    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.248716  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04089  predicted inner membrane protein  42.31 
 
 
447 aa  355  8.999999999999999e-97  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3774  protein of unknown function DUF21  42.31 
 
 
447 aa  355  8.999999999999999e-97  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.767387  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4696  putative transporter  42.31 
 
 
447 aa  355  8.999999999999999e-97  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04052  hypothetical protein  42.31 
 
 
447 aa  355  8.999999999999999e-97  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5735  putative transporter  42.31 
 
 
447 aa  355  8.999999999999999e-97  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3789  hypothetical protein  42.31 
 
 
447 aa  355  8.999999999999999e-97  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4471  putative transporter  42.31 
 
 
447 aa  355  1e-96  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4787  putative transporter  42.31 
 
 
447 aa  355  1e-96  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3960  CBS/transporter associated domain-containing protein  42.07 
 
 
443 aa  355  1e-96  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.216105  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3627  CBS/transporter associated domain-containing protein  42.07 
 
 
443 aa  355  1e-96  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3772  hypothetical protein  42.07 
 
 
443 aa  355  1e-96  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4864  putative transporter  42.31 
 
 
447 aa  355  1e-96  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.830156  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4675  putative transporter  42.27 
 
 
447 aa  350  3e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.050719  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4771  putative transporter  41.82 
 
 
447 aa  346  6e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3488  protein of unknown function DUF21  43.36 
 
 
432 aa  346  6e-94  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4826  putative transporter  41.82 
 
 
447 aa  345  7e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.229608  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4805  putative transporter  41.82 
 
 
447 aa  345  7e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.140825  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4686  putative transporter  41.82 
 
 
447 aa  345  7e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.116284  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0396  hypothetical protein  42.3 
 
 
445 aa  344  2e-93  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0782784  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0457  hypothetical protein  41.15 
 
 
447 aa  341  1e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0445264  normal  0.119105 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0820  protein of unknown function DUF21  40.77 
 
 
444 aa  338  1.9999999999999998e-91  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0786  protein of unknown function DUF21  41.08 
 
 
438 aa  335  1e-90  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.35446  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3577  protein of unknown function DUF21  40.23 
 
 
441 aa  335  1e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1848  hypothetical protein  40.59 
 
 
424 aa  327  2.0000000000000001e-88  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000139773 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0777  protein of unknown function DUF21  41.44 
 
 
438 aa  327  3e-88  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.825818  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1483  hypothetical protein  41.4 
 
 
429 aa  326  4.0000000000000003e-88  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.234798  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3418  hypothetical protein  40 
 
 
442 aa  326  6e-88  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0284  hypothetical protein  38.34 
 
 
441 aa  325  9e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0334132 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0848  hypothetical protein  41.31 
 
 
438 aa  325  1e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.684402 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0743  hypothetical protein  40.05 
 
 
439 aa  324  2e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.946695  normal  0.0273705 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4351  CBS domain-containing protein  39.82 
 
 
438 aa  323  4e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0269  hypothetical protein  38.81 
 
 
424 aa  322  6e-87  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0295  hypothetical protein  39.04 
 
 
424 aa  322  6e-87  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.731774 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3668  hypothetical protein  39.59 
 
 
452 aa  321  9.999999999999999e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2476  protein of unknown function DUF21  41.81 
 
 
438 aa  319  6e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.577812 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2082  protein of unknown function DUF21  41.57 
 
 
438 aa  318  1e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.690525  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3417  hypothetical protein  37.39 
 
 
435 aa  318  2e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0359  hypothetical protein  39.59 
 
 
438 aa  317  3e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3667  hypothetical protein  39.59 
 
 
438 aa  317  3e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0398  hypothetical protein  38.22 
 
 
437 aa  316  5e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.596861  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5479  hypothetical protein  39.82 
 
 
482 aa  315  8e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0419  hypothetical protein  38.39 
 
 
435 aa  315  9e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.794488  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3284  hemolysin, putative  38.44 
 
 
436 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0353  hypothetical protein  38.44 
 
 
438 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1075  hypothetical protein  37.53 
 
 
443 aa  310  2e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.179676  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2591  CBS:protein of unknown function DUF21:transporter-associated region  38.95 
 
 
443 aa  310  2.9999999999999997e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3315  hypothetical protein  38.44 
 
 
427 aa  310  4e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.284865  normal  0.945237 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4012  hypothetical protein  37.76 
 
 
438 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4034  hypothetical protein  37.53 
 
 
438 aa  307  3e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4131  hypothetical protein  37.53 
 
 
438 aa  307  3e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3937  protein of unknown function DUF21  37.53 
 
 
438 aa  307  3e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4210  protein of unknown function DUF21  39.32 
 
 
427 aa  307  3e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3617  hypothetical protein  37.53 
 
 
438 aa  306  7e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.960503  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2277  hypothetical protein  41.13 
 
 
441 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0698  hypothetical protein  38.55 
 
 
438 aa  305  1.0000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.46014  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0907  hypothetical protein  37.33 
 
 
440 aa  300  2e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2968  CorC/HlyC family transporters  37.88 
 
 
427 aa  294  2e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.307812  normal  0.518349 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3036  CBS  33.95 
 
 
442 aa  239  5.999999999999999e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4050  hypothetical protein  31.82 
 
 
440 aa  227  4e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0807851  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2815  CBS domain-containing protein  28.73 
 
 
439 aa  224  2e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0238  protein of unknown function DUF21  31.05 
 
 
417 aa  223  4e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3199  hypothetical protein  33.41 
 
 
448 aa  222  9e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.184722 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2233  protein of unknown function DUF21  32.56 
 
 
437 aa  222  9.999999999999999e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2774  protein of unknown function DUF21  31.39 
 
 
440 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.730131  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2766  hypothetical protein  33.49 
 
 
442 aa  220  3e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3447  hypothetical protein  30.98 
 
 
440 aa  220  5e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0902  protein of unknown function DUF21  30.33 
 
 
436 aa  218  1e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1413  hypothetical protein  30.81 
 
 
430 aa  218  1e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0999393  normal  0.104956 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2853  CBS domain-containing protein  33.26 
 
 
439 aa  218  1e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2385  hypothetical protein  31 
 
 
433 aa  214  1.9999999999999998e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1085  hypothetical protein  32.72 
 
 
464 aa  214  2.9999999999999995e-54  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.792914 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2846  protein of unknown function DUF21  29.91 
 
 
443 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2313  hypothetical protein  32.94 
 
 
438 aa  213  4.9999999999999996e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4403  hypothetical protein  31.97 
 
 
436 aa  212  9e-54  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0196704  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3026  hypothetical protein  32.88 
 
 
442 aa  212  1e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.25014  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1250  CBS domain-containing protein  31.49 
 
 
432 aa  208  1e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.144301  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2439  protein of unknown function DUF21  30.02 
 
 
443 aa  209  1e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3770  hypothetical protein  29.52 
 
 
441 aa  206  7e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3678  protein of unknown function DUF21  30.5 
 
 
443 aa  204  2e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.35091 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0756  hypothetical protein  31.44 
 
 
436 aa  204  2e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0635919  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2432  protein of unknown function DUF21  30.5 
 
 
443 aa  204  2e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0098  hypothetical protein  28.71 
 
 
460 aa  204  3e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2157  hypothetical protein  32.32 
 
 
437 aa  203  5e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.285648  normal  0.808245 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4935  hypothetical protein  28.94 
 
 
443 aa  201  1.9999999999999998e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1932  CBS  28.31 
 
 
456 aa  200  3.9999999999999996e-50  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0017665  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2077  CBS domain-containing protein  28.87 
 
 
441 aa  200  5e-50  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3640  hypothetical protein  30.65 
 
 
441 aa  199  7.999999999999999e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1467  protein of unknown function DUF21  30.52 
 
 
429 aa  197  3e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.211541  normal  0.989219 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0819  protein of unknown function DUF21  27.09 
 
 
441 aa  197  4.0000000000000005e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1287  protein of unknown function DUF21  29.73 
 
 
428 aa  196  7e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1519  hypothetical protein  31.62 
 
 
428 aa  196  9e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2480  hemolysin  30.18 
 
 
436 aa  196  1e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0710  protein of unknown function DUF21  27.82 
 
 
432 aa  196  1e-48  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.149607  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4765  hypothetical protein  29.04 
 
 
437 aa  195  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.942078 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4026  CBS:protein of unknown function DUF21:transporter-associated region  28.17 
 
 
437 aa  194  3e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3597  protein of unknown function DUF21  27.66 
 
 
447 aa  194  4e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000988374 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1577  protein of unknown function DUF21  28.38 
 
 
447 aa  192  1e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.569313  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0021  protein of unknown function DUF21  29.51 
 
 
435 aa  191  2e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.099852 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1314  hypothetical protein  30.56 
 
 
439 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0274508  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>