More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0284 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009456  VC0395_0398  hypothetical protein  75.23 
 
 		 437 aa  676    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.596861  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4351  CBS domain-containing protein  84.31 
 
 		 438 aa  755    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4012  hypothetical protein  83.84 
 
 		 438 aa  740    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3937  protein of unknown function DUF21  83.84 
 
 		 438 aa  738    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0907  hypothetical protein  76.35 
 
 		 440 aa  673    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1075  hypothetical protein  77.21 
 
 		 443 aa  689    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.179676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4034  hypothetical protein  83.84 
 
 		 438 aa  738    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3417  hypothetical protein  78.52 
 
 		 435 aa  712    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0284  hypothetical protein  100 
 
 		 441 aa  900    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0334132 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0359  hypothetical protein  83.61 
 
 		 438 aa  746    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3667  hypothetical protein  83.61 
 
 		 438 aa  746    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0419  hypothetical protein  79.08 
 
 		 435 aa  697    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.794488  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0353  hypothetical protein  84.54 
 
 		 438 aa  750    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3284  hemolysin, putative  76.58 
 
 		 436 aa  686    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4131  hypothetical protein  83.84 
 
 		 438 aa  738    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3617  hypothetical protein  83.61 
 
 		 438 aa  740    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.960503  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3627  CBS/transporter associated domain-containing protein  58.72 
 
 		 443 aa  535  1e-151  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3772  hypothetical protein  58.72 
 
 		 443 aa  535  1e-151  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04089  predicted inner membrane protein  59.07 
 
 		 447 aa  531  1e-150  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3774  protein of unknown function DUF21  59.07 
 
 		 447 aa  531  1e-150  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.767387  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4864  putative transporter  59.07 
 
 		 447 aa  532  1e-150  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.830156  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5735  putative transporter  59.07 
 
 		 447 aa  531  1e-150  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4471  putative transporter  59.07 
 
 		 447 aa  532  1e-150  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4696  putative transporter  59.07 
 
 		 447 aa  531  1e-150  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3960  CBS/transporter associated domain-containing protein  58.49 
 
 		 443 aa  533  1e-150  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.216105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4787  putative transporter  59.07 
 
 		 447 aa  532  1e-150  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04052  hypothetical protein  59.07 
 
 		 447 aa  531  1e-150  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3789  hypothetical protein  59.07 
 
 		 447 aa  531  1e-150  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4686  putative transporter  58.8 
 
 		 447 aa  530  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.116284  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4805  putative transporter  58.8 
 
 		 447 aa  530  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.140825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4771  putative transporter  58.8 
 
 		 447 aa  530  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4675  putative transporter  58.8 
 
 		 447 aa  528  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.050719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4826  putative transporter  58.8 
 
 		 447 aa  530  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.229608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0396  hypothetical protein  58.37 
 
 		 445 aa  526  1e-148  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0782784  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0820  protein of unknown function DUF21  58.82 
 
 		 444 aa  521  1e-147  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3577  protein of unknown function DUF21  56.72 
 
 		 441 aa  519  1e-146  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0457  hypothetical protein  56.91 
 
 		 447 aa  517  1.0000000000000001e-145  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0445264  normal  0.119105 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3418  hypothetical protein  57.78 
 
 		 442 aa  510  1e-143  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0786  protein of unknown function DUF21  57.69 
 
 		 438 aa  508  9.999999999999999e-143  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.35446  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5479  hypothetical protein  51.83 
 
 		 482 aa  483  1e-135  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0777  protein of unknown function DUF21  51.82 
 
 		 438 aa  478  1e-134  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.825818  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0848  hypothetical protein  51.95 
 
 		 438 aa  480  1e-134  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.684402 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3488  protein of unknown function DUF21  55.12 
 
 		 432 aa  475  1e-133  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0743  hypothetical protein  51.99 
 
 		 439 aa  471  1e-132  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.946695  normal  0.0273705 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3668  hypothetical protein  51.05 
 
 		 452 aa  469  1.0000000000000001e-131  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4210  protein of unknown function DUF21  50.94 
 
 		 427 aa  466  9.999999999999999e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1483  hypothetical protein  52.24 
 
 		 429 aa  434  1e-120  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.234798  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3315  hypothetical protein  49.53 
 
 		 427 aa  430  1e-119  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.284865  normal  0.945237 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1848  hypothetical protein  49.77 
 
 		 424 aa  422  1e-117  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000139773 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0269  hypothetical protein  50.35 
 
 		 424 aa  414  1e-114  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0295  hypothetical protein  50.35 
 
 		 424 aa  415  1e-114  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.731774 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2277  hypothetical protein  46.73 
 
 		 441 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0698  hypothetical protein  46.35 
 
 		 438 aa  401  9.999999999999999e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.46014  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2082  protein of unknown function DUF21  45.99 
 
 		 438 aa  394  1e-108  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.690525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2968  CorC/HlyC family transporters  47.64 
 
 		 427 aa  394  1e-108  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.307812  normal  0.518349 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2476  protein of unknown function DUF21  45.99 
 
 		 438 aa  393  1e-108  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.577812 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2591  CBS:protein of unknown function DUF21:transporter-associated region  45.26 
 
 		 443 aa  389  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3159  protein of unknown function DUF21  38.46 
 
 		 445 aa  321  9.999999999999999e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.248716  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2815  CBS domain-containing protein  34.74 
 
 		 439 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4050  hypothetical protein  32.73 
 
 		 440 aa  258  2e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0807851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1413  hypothetical protein  33.98 
 
 		 430 aa  256  5e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0999393  normal  0.104956 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2766  hypothetical protein  33.65 
 
 		 442 aa  255  1.0000000000000001e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2385  hypothetical protein  30.75 
 
 		 433 aa  246  4e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35020  hemolysin-like protein  33.96 
 
 		 432 aa  246  6e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.518958  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2233  protein of unknown function DUF21  32.3 
 
 		 437 aa  245  9e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1250  CBS domain-containing protein  32.71 
 
 		 432 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.144301  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0819  protein of unknown function DUF21  31.05 
 
 		 441 aa  241  1e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2853  CBS domain-containing protein  32.33 
 
 		 439 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4765  hypothetical protein  32.71 
 
 		 437 aa  240  4e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.942078 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4403  hypothetical protein  32.41 
 
 		 436 aa  240  5e-62  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0196704  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2077  CBS domain-containing protein  31.57 
 
 		 441 aa  237  3e-61  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2774  protein of unknown function DUF21  31.22 
 
 		 440 aa  234  3e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.730131  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2480  hemolysin  32.48 
 
 		 436 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3447  hypothetical protein  30.99 
 
 		 440 aa  233  6e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4935  hypothetical protein  31.62 
 
 		 443 aa  232  9e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0756  hypothetical protein  31.6 
 
 		 436 aa  231  1e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0635919  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3640  hypothetical protein  31.71 
 
 		 441 aa  231  2e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2846  protein of unknown function DUF21  28.94 
 
 		 443 aa  230  4e-59  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1287  protein of unknown function DUF21  30.9 
 
 		 428 aa  229  5e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3597  protein of unknown function DUF21  30.81 
 
 		 447 aa  228  1e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000988374 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2439  protein of unknown function DUF21  31.29 
 
 		 443 aa  228  2e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4026  CBS:protein of unknown function DUF21:transporter-associated region  31.29 
 
 		 437 aa  227  4e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1932  CBS  30.3 
 
 		 456 aa  226  5.0000000000000005e-58  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0017665  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0343  hypothetical protein  30.17 
 
 		 437 aa  225  1e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.384323  normal  0.630353 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3036  CBS  30.47 
 
 		 442 aa  223  4e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3026  hypothetical protein  30.18 
 
 		 442 aa  223  4.9999999999999996e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.25014  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0902  protein of unknown function DUF21  28.64 
 
 		 436 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3770  hypothetical protein  31.07 
 
 		 441 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2145  hypothetical protein  29.57 
 
 		 430 aa  219  7.999999999999999e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2321  hypothetical protein  28.21 
 
 		 446 aa  218  1e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.638143  normal  0.0384275 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0098  hypothetical protein  29.47 
 
 		 460 aa  218  2e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0266  protein of unknown function DUF21  30.43 
 
 		 444 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1577  protein of unknown function DUF21  31.47 
 
 		 447 aa  216  4e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.569313  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2313  hypothetical protein  30.02 
 
 		 438 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3174  hypothetical protein  28.74 
 
 		 458 aa  214  1.9999999999999998e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2008  protein of unknown function DUF21  29.25 
 
 		 447 aa  213  3.9999999999999995e-54  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000403932  normal  0.229254 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0238  protein of unknown function DUF21  29.95 
 
 		 417 aa  213  5.999999999999999e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0021  protein of unknown function DUF21  32.14 
 
 		 435 aa  211  2e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.099852 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0264  hypothetical protein  30 
 
 		 432 aa  211  2e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.265353 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1852  protein of unknown function DUF21  29.54 
 
 		 433 aa  211  2e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>