More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_0419 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_4012  hypothetical protein  82.71 
 
 		 438 aa  738    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4351  CBS domain-containing protein  81.54 
 
 		 438 aa  733    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0398  hypothetical protein  71.99 
 
 		 437 aa  639    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.596861  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3617  hypothetical protein  81.78 
 
 		 438 aa  735    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.960503  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3417  hypothetical protein  83.8 
 
 		 435 aa  750    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4131  hypothetical protein  82.24 
 
 		 438 aa  735    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1075  hypothetical protein  72.2 
 
 		 443 aa  640    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.179676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4034  hypothetical protein  82.24 
 
 		 438 aa  735    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3937  protein of unknown function DUF21  82.24 
 
 		 438 aa  735    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0359  hypothetical protein  81.54 
 
 		 438 aa  735    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3667  hypothetical protein  81.54 
 
 		 438 aa  735    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0419  hypothetical protein  100 
 
 		 435 aa  899    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.794488  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0353  hypothetical protein  81.31 
 
 		 438 aa  728    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3284  hemolysin, putative  72.98 
 
 		 436 aa  657    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0284  hypothetical protein  79.08 
 
 		 441 aa  713    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0334132 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0907  hypothetical protein  71.5 
 
 		 440 aa  633  1e-180  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3627  CBS/transporter associated domain-containing protein  60.42 
 
 		 443 aa  546  1e-154  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3772  hypothetical protein  60.42 
 
 		 443 aa  546  1e-154  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3960  CBS/transporter associated domain-containing protein  60.19 
 
 		 443 aa  543  1e-153  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.216105  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0820  protein of unknown function DUF21  60.38 
 
 		 444 aa  539  9.999999999999999e-153  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3577  protein of unknown function DUF21  60.61 
 
 		 441 aa  540  9.999999999999999e-153  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0457  hypothetical protein  59.81 
 
 		 447 aa  534  1e-150  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0445264  normal  0.119105 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0786  protein of unknown function DUF21  60.28 
 
 		 438 aa  531  1e-150  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.35446  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3418  hypothetical protein  60.92 
 
 		 442 aa  531  1e-149  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4805  putative transporter  57.24 
 
 		 447 aa  525  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.140825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4686  putative transporter  57.24 
 
 		 447 aa  525  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.116284  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4675  putative transporter  57.47 
 
 		 447 aa  526  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.050719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4826  putative transporter  57.24 
 
 		 447 aa  525  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.229608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4771  putative transporter  57.24 
 
 		 447 aa  525  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4864  putative transporter  56.78 
 
 		 447 aa  521  1e-147  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.830156  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4471  putative transporter  56.78 
 
 		 447 aa  521  1e-147  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4787  putative transporter  56.78 
 
 		 447 aa  521  1e-147  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04089  predicted inner membrane protein  56.78 
 
 		 447 aa  521  1e-146  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3774  protein of unknown function DUF21  56.78 
 
 		 447 aa  521  1e-146  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.767387  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4696  putative transporter  56.78 
 
 		 447 aa  521  1e-146  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5735  putative transporter  56.78 
 
 		 447 aa  521  1e-146  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0396  hypothetical protein  56.78 
 
 		 445 aa  518  1e-146  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0782784  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04052  hypothetical protein  56.78 
 
 		 447 aa  521  1e-146  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3789  hypothetical protein  56.78 
 
 		 447 aa  521  1e-146  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5479  hypothetical protein  51.26 
 
 		 482 aa  483  1e-135  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3488  protein of unknown function DUF21  54.33 
 
 		 432 aa  474  1e-132  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3668  hypothetical protein  50.82 
 
 		 452 aa  464  9.999999999999999e-131  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0777  protein of unknown function DUF21  50.11 
 
 		 438 aa  463  1e-129  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.825818  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0848  hypothetical protein  49.54 
 
 		 438 aa  462  1e-129  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.684402 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4210  protein of unknown function DUF21  50.23 
 
 		 427 aa  461  9.999999999999999e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0743  hypothetical protein  49.65 
 
 		 439 aa  452  1.0000000000000001e-126  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.946695  normal  0.0273705 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0295  hypothetical protein  51.05 
 
 		 424 aa  428  1e-118  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.731774 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3315  hypothetical protein  48.94 
 
 		 427 aa  423  1e-117  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.284865  normal  0.945237 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0269  hypothetical protein  50.58 
 
 		 424 aa  422  1e-117  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1848  hypothetical protein  48.25 
 
 		 424 aa  422  1e-117  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000139773 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1483  hypothetical protein  51.45 
 
 		 429 aa  424  1e-117  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.234798  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2277  hypothetical protein  46.97 
 
 		 441 aa  390  1e-107  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2591  CBS:protein of unknown function DUF21:transporter-associated region  46.17 
 
 		 443 aa  391  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0698  hypothetical protein  46.86 
 
 		 438 aa  391  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.46014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2968  CorC/HlyC family transporters  46.48 
 
 		 427 aa  388  1e-106  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.307812  normal  0.518349 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2476  protein of unknown function DUF21  45.74 
 
 		 438 aa  384  1e-105  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.577812 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2082  protein of unknown function DUF21  45.74 
 
 		 438 aa  384  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.690525  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3159  protein of unknown function DUF21  37.53 
 
 		 445 aa  319  7e-86  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.248716  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2815  CBS domain-containing protein  34.19 
 
 		 439 aa  262  1e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2853  CBS domain-containing protein  33.64 
 
 		 439 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4050  hypothetical protein  32.8 
 
 		 440 aa  253  7e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0807851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2385  hypothetical protein  31.13 
 
 		 433 aa  247  2e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3036  CBS  32.24 
 
 		 442 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1250  CBS domain-containing protein  32.25 
 
 		 432 aa  244  3e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.144301  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3597  protein of unknown function DUF21  33.01 
 
 		 447 aa  241  2e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000988374 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2766  hypothetical protein  31.63 
 
 		 442 aa  240  2.9999999999999997e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4935  hypothetical protein  33.1 
 
 		 443 aa  238  1e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2233  protein of unknown function DUF21  31.37 
 
 		 437 aa  238  1e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4765  hypothetical protein  32.41 
 
 		 437 aa  238  1e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.942078 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0902  protein of unknown function DUF21  31.5 
 
 		 436 aa  238  1e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4403  hypothetical protein  31.63 
 
 		 436 aa  236  7e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0196704  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2077  CBS domain-containing protein  30.94 
 
 		 441 aa  235  1.0000000000000001e-60  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1932  CBS  30.3 
 
 		 456 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0017665  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3770  hypothetical protein  32.05 
 
 		 441 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2439  protein of unknown function DUF21  31.34 
 
 		 443 aa  233  7.000000000000001e-60  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0756  hypothetical protein  31.32 
 
 		 436 aa  232  9e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0635919  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35020  hemolysin-like protein  30.71 
 
 		 432 aa  232  1e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.518958  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3447  hypothetical protein  31.62 
 
 		 440 aa  231  1e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2846  protein of unknown function DUF21  30.09 
 
 		 443 aa  231  1e-59  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2774  protein of unknown function DUF21  31.62 
 
 		 440 aa  231  2e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.730131  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0343  hypothetical protein  31.82 
 
 		 437 aa  229  7e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.384323  normal  0.630353 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1413  hypothetical protein  30.33 
 
 		 430 aa  228  1e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0999393  normal  0.104956 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0819  protein of unknown function DUF21  29.13 
 
 		 441 aa  227  3e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4026  CBS:protein of unknown function DUF21:transporter-associated region  31.16 
 
 		 437 aa  226  6e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2480  hemolysin  31.37 
 
 		 436 aa  225  1e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1577  protein of unknown function DUF21  31.38 
 
 		 447 aa  225  1e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.569313  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0953  membrane protein  31.11 
 
 		 426 aa  224  2e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0266  protein of unknown function DUF21  30.81 
 
 		 444 aa  223  4e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3199  hypothetical protein  30.93 
 
 		 448 aa  223  4.9999999999999996e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.184722 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3640  hypothetical protein  31.85 
 
 		 441 aa  223  7e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0098  hypothetical protein  28.87 
 
 		 460 aa  221  9.999999999999999e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3026  hypothetical protein  31.31 
 
 		 442 aa  219  5e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.25014  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2157  hypothetical protein  33.41 
 
 		 437 aa  219  7e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.285648  normal  0.808245 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0238  protein of unknown function DUF21  30.36 
 
 		 417 aa  219  8.999999999999998e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1085  hypothetical protein  32.47 
 
 		 464 aa  217  2.9999999999999998e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.792914 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2321  hypothetical protein  26.42 
 
 		 446 aa  215  9.999999999999999e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.638143  normal  0.0384275 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3174  hypothetical protein  29.41 
 
 		 458 aa  214  1.9999999999999998e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2313  hypothetical protein  29.13 
 
 		 438 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1287  protein of unknown function DUF21  27.8 
 
 		 428 aa  211  1e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4228  hypothetical protein  32.47 
 
 		 445 aa  211  2e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.351193  normal  0.199337 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>