More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3668 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_5479  hypothetical protein  72.5 
 
 
482 aa  660    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0777  protein of unknown function DUF21  81.69 
 
 
438 aa  716    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.825818  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3668  hypothetical protein  100 
 
 
452 aa  901    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0743  hypothetical protein  81.73 
 
 
439 aa  707    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.946695  normal  0.0273705 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0848  hypothetical protein  81.24 
 
 
438 aa  711    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.684402 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4210  protein of unknown function DUF21  68.15 
 
 
427 aa  614  9.999999999999999e-175  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4686  putative transporter  54.02 
 
 
447 aa  495  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.116284  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4805  putative transporter  54.02 
 
 
447 aa  495  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.140825  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4675  putative transporter  54.25 
 
 
447 aa  497  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.050719  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4771  putative transporter  54.02 
 
 
447 aa  495  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0457  hypothetical protein  54.2 
 
 
447 aa  496  1e-139  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0445264  normal  0.119105 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4826  putative transporter  54.02 
 
 
447 aa  495  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.229608  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04089  predicted inner membrane protein  53.9 
 
 
447 aa  486  1e-136  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3774  protein of unknown function DUF21  53.9 
 
 
447 aa  486  1e-136  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.767387  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3789  hypothetical protein  53.9 
 
 
447 aa  486  1e-136  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3772  hypothetical protein  54.31 
 
 
443 aa  487  1e-136  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3627  CBS/transporter associated domain-containing protein  54.31 
 
 
443 aa  487  1e-136  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04052  hypothetical protein  53.9 
 
 
447 aa  486  1e-136  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4787  putative transporter  53.9 
 
 
447 aa  486  1e-136  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4471  putative transporter  53.9 
 
 
447 aa  486  1e-136  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4696  putative transporter  53.9 
 
 
447 aa  486  1e-136  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5735  putative transporter  53.9 
 
 
447 aa  486  1e-136  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3960  CBS/transporter associated domain-containing protein  54.31 
 
 
443 aa  487  1e-136  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.216105  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4864  putative transporter  53.9 
 
 
447 aa  486  1e-136  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.830156  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3577  protein of unknown function DUF21  53.29 
 
 
441 aa  481  1e-135  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4351  CBS domain-containing protein  52.93 
 
 
438 aa  480  1e-134  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3418  hypothetical protein  53.86 
 
 
442 aa  475  1e-133  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0396  hypothetical protein  53.43 
 
 
445 aa  478  1e-133  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0782784  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0359  hypothetical protein  52.22 
 
 
438 aa  473  1e-132  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3667  hypothetical protein  52.22 
 
 
438 aa  473  1e-132  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0353  hypothetical protein  52.22 
 
 
438 aa  474  1e-132  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0284  hypothetical protein  50.46 
 
 
441 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0334132 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0820  protein of unknown function DUF21  52 
 
 
444 aa  468  9.999999999999999e-131  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3417  hypothetical protein  50.23 
 
 
435 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0786  protein of unknown function DUF21  53.19 
 
 
438 aa  464  1e-129  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.35446  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4012  hypothetical protein  51.05 
 
 
438 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3488  protein of unknown function DUF21  54.09 
 
 
432 aa  459  9.999999999999999e-129  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3284  hemolysin, putative  51.87 
 
 
436 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3617  hypothetical protein  50.59 
 
 
438 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.960503  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0398  hypothetical protein  50.7 
 
 
437 aa  457  1e-127  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.596861  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4131  hypothetical protein  50.82 
 
 
438 aa  457  1e-127  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3937  protein of unknown function DUF21  50.82 
 
 
438 aa  457  1e-127  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0907  hypothetical protein  50.7 
 
 
440 aa  457  1e-127  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0419  hypothetical protein  50.82 
 
 
435 aa  457  1e-127  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.794488  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4034  hypothetical protein  50.82 
 
 
438 aa  457  1e-127  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1075  hypothetical protein  48.96 
 
 
443 aa  448  1.0000000000000001e-124  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.179676  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2277  hypothetical protein  47.55 
 
 
441 aa  408  1e-113  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2082  protein of unknown function DUF21  48.42 
 
 
438 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.690525  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2476  protein of unknown function DUF21  48.42 
 
 
438 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.577812 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0269  hypothetical protein  44.88 
 
 
424 aa  404  1e-111  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0295  hypothetical protein  44.88 
 
 
424 aa  403  1e-111  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.731774 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1848  hypothetical protein  44.99 
 
 
424 aa  402  1e-111  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000139773 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1483  hypothetical protein  47.06 
 
 
429 aa  400  9.999999999999999e-111  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.234798  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3315  hypothetical protein  44.68 
 
 
427 aa  394  1e-108  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.284865  normal  0.945237 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2591  CBS:protein of unknown function DUF21:transporter-associated region  43.85 
 
 
443 aa  393  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0698  hypothetical protein  43.53 
 
 
438 aa  392  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.46014  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2968  CorC/HlyC family transporters  41.18 
 
 
427 aa  335  9e-91  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.307812  normal  0.518349 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3159  protein of unknown function DUF21  39.13 
 
 
445 aa  316  6e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.248716  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2853  CBS domain-containing protein  40.65 
 
 
439 aa  296  4e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2815  CBS domain-containing protein  34.82 
 
 
439 aa  281  2e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4403  hypothetical protein  35.35 
 
 
436 aa  275  2.0000000000000002e-72  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0196704  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2385  hypothetical protein  36.34 
 
 
433 aa  271  2e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2766  hypothetical protein  34.86 
 
 
442 aa  269  5.9999999999999995e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3036  CBS  34.72 
 
 
442 aa  267  2e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1577  protein of unknown function DUF21  36.07 
 
 
447 aa  262  8e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.569313  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1932  CBS  34.58 
 
 
456 aa  261  2e-68  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0017665  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0902  protein of unknown function DUF21  33.01 
 
 
436 aa  260  3e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2846  protein of unknown function DUF21  33.79 
 
 
443 aa  257  2e-67  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4050  hypothetical protein  32.18 
 
 
440 aa  256  4e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0807851  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1250  CBS domain-containing protein  33.96 
 
 
432 aa  255  9e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.144301  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3640  hypothetical protein  34.79 
 
 
441 aa  251  2e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2077  CBS domain-containing protein  33.73 
 
 
441 aa  251  3e-65  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2774  protein of unknown function DUF21  34.41 
 
 
440 aa  248  1e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.730131  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3597  protein of unknown function DUF21  31.1 
 
 
447 aa  248  2e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000988374 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0098  hypothetical protein  33.87 
 
 
460 aa  248  2e-64  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1085  hypothetical protein  34.93 
 
 
464 aa  248  2e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.792914 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3447  hypothetical protein  34.33 
 
 
440 aa  247  3e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0266  protein of unknown function DUF21  34.18 
 
 
444 aa  246  4e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2439  protein of unknown function DUF21  33.1 
 
 
443 aa  246  6e-64  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0756  hypothetical protein  33.18 
 
 
436 aa  246  6.999999999999999e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0635919  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4935  hypothetical protein  32.8 
 
 
443 aa  244  3e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3770  hypothetical protein  34.36 
 
 
441 aa  243  3.9999999999999997e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3026  hypothetical protein  34.32 
 
 
442 aa  243  5e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.25014  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35020  hemolysin-like protein  34.37 
 
 
432 aa  242  1e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.518958  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2925  hypothetical protein  34.92 
 
 
465 aa  241  2e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.221134  normal  0.412302 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1413  hypothetical protein  33.49 
 
 
430 aa  239  6.999999999999999e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0999393  normal  0.104956 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0819  protein of unknown function DUF21  28.44 
 
 
441 aa  238  2e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2233  protein of unknown function DUF21  32.39 
 
 
437 aa  236  5.0000000000000005e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2480  hemolysin  32.07 
 
 
436 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2313  hypothetical protein  32.63 
 
 
438 aa  232  9e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1852  protein of unknown function DUF21  30.57 
 
 
433 aa  231  2e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3197  hypothetical protein  36.26 
 
 
479 aa  229  9e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.241932  normal  0.866715 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1287  protein of unknown function DUF21  31.15 
 
 
428 aa  228  2e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2145  hypothetical protein  31.88 
 
 
430 aa  228  2e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4765  hypothetical protein  31.96 
 
 
437 aa  228  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.942078 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0021  protein of unknown function DUF21  32.3 
 
 
435 aa  228  2e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.099852 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3199  hypothetical protein  32.8 
 
 
448 aa  228  2e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.184722 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1467  protein of unknown function DUF21  32.08 
 
 
429 aa  226  5.0000000000000005e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.211541  normal  0.989219 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4026  CBS:protein of unknown function DUF21:transporter-associated region  32.7 
 
 
437 aa  224  2e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3174  hypothetical protein  30.63 
 
 
458 aa  225  2e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>