More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_0820 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_04089  predicted inner membrane protein  78.38 
 
 
447 aa  719    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3774  protein of unknown function DUF21  78.38 
 
 
447 aa  719    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.767387  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3772  hypothetical protein  82.24 
 
 
443 aa  729    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4787  putative transporter  78.38 
 
 
447 aa  719    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0786  protein of unknown function DUF21  89.73 
 
 
438 aa  789    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.35446  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0396  hypothetical protein  78.36 
 
 
445 aa  711    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0782784  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0820  protein of unknown function DUF21  100 
 
 
444 aa  899    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4675  putative transporter  78.59 
 
 
447 aa  719    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.050719  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4864  putative transporter  78.38 
 
 
447 aa  719    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.830156  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5735  putative transporter  78.38 
 
 
447 aa  719    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3789  hypothetical protein  78.38 
 
 
447 aa  719    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3960  CBS/transporter associated domain-containing protein  82.01 
 
 
443 aa  727    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.216105  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4805  putative transporter  79.04 
 
 
447 aa  725    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.140825  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4471  putative transporter  78.38 
 
 
447 aa  719    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4686  putative transporter  79.04 
 
 
447 aa  725    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.116284  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4826  putative transporter  79.04 
 
 
447 aa  725    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.229608  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0457  hypothetical protein  80.32 
 
 
447 aa  730    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0445264  normal  0.119105 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3577  protein of unknown function DUF21  85.94 
 
 
441 aa  762    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3627  CBS/transporter associated domain-containing protein  82.24 
 
 
443 aa  729    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4696  putative transporter  78.38 
 
 
447 aa  719    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4771  putative transporter  79.04 
 
 
447 aa  725    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04052  hypothetical protein  78.38 
 
 
447 aa  719    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3418  hypothetical protein  87.68 
 
 
442 aa  743    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4351  CBS domain-containing protein  59.62 
 
 
438 aa  537  1e-151  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4012  hypothetical protein  59.62 
 
 
438 aa  537  1e-151  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3617  hypothetical protein  59.39 
 
 
438 aa  535  1e-151  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.960503  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4034  hypothetical protein  59.62 
 
 
438 aa  536  1e-151  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3937  protein of unknown function DUF21  59.62 
 
 
438 aa  536  1e-151  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0359  hypothetical protein  59.62 
 
 
438 aa  537  1e-151  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3667  hypothetical protein  59.62 
 
 
438 aa  537  1e-151  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0353  hypothetical protein  59.39 
 
 
438 aa  536  1e-151  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4131  hypothetical protein  59.62 
 
 
438 aa  536  1e-151  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3417  hypothetical protein  59.53 
 
 
435 aa  528  1e-149  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0419  hypothetical protein  59.57 
 
 
435 aa  528  1e-149  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.794488  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0284  hypothetical protein  57.95 
 
 
441 aa  525  1e-148  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0334132 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0398  hypothetical protein  60.48 
 
 
437 aa  520  1e-146  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.596861  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3488  protein of unknown function DUF21  60.98 
 
 
432 aa  519  1e-146  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3284  hemolysin, putative  60.1 
 
 
436 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5479  hypothetical protein  53.65 
 
 
482 aa  500  1e-140  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0777  protein of unknown function DUF21  54.72 
 
 
438 aa  494  9.999999999999999e-139  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.825818  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0848  hypothetical protein  54.72 
 
 
438 aa  493  9.999999999999999e-139  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.684402 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4210  protein of unknown function DUF21  53.07 
 
 
427 aa  489  1e-137  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0743  hypothetical protein  54.35 
 
 
439 aa  486  1e-136  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.946695  normal  0.0273705 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1075  hypothetical protein  54.95 
 
 
443 aa  481  1e-134  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.179676  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0907  hypothetical protein  52.68 
 
 
440 aa  475  1e-133  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3668  hypothetical protein  52 
 
 
452 aa  468  1.0000000000000001e-131  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1483  hypothetical protein  54.28 
 
 
429 aa  464  1e-129  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.234798  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1848  hypothetical protein  50.93 
 
 
424 aa  454  1.0000000000000001e-126  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000139773 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0269  hypothetical protein  52.45 
 
 
424 aa  447  1.0000000000000001e-124  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0295  hypothetical protein  52.21 
 
 
424 aa  446  1.0000000000000001e-124  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.731774 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3315  hypothetical protein  49.53 
 
 
427 aa  434  1e-120  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.284865  normal  0.945237 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2277  hypothetical protein  49.88 
 
 
441 aa  411  1e-113  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2968  CorC/HlyC family transporters  47.89 
 
 
427 aa  409  1e-113  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.307812  normal  0.518349 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0698  hypothetical protein  47.79 
 
 
438 aa  405  1.0000000000000001e-112  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.46014  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2476  protein of unknown function DUF21  48.18 
 
 
438 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.577812 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2591  CBS:protein of unknown function DUF21:transporter-associated region  46.53 
 
 
443 aa  399  9.999999999999999e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2082  protein of unknown function DUF21  47.32 
 
 
438 aa  401  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.690525  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3159  protein of unknown function DUF21  41.18 
 
 
445 aa  337  1.9999999999999998e-91  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.248716  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2853  CBS domain-containing protein  36.6 
 
 
439 aa  286  4e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2385  hypothetical protein  33.41 
 
 
433 aa  274  3e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2815  CBS domain-containing protein  32.18 
 
 
439 aa  273  5.000000000000001e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3036  CBS  32.35 
 
 
442 aa  268  1e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2846  protein of unknown function DUF21  31.75 
 
 
443 aa  269  1e-70  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4050  hypothetical protein  32.1 
 
 
440 aa  260  3e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0807851  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2439  protein of unknown function DUF21  32.27 
 
 
443 aa  256  8e-67  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1932  CBS  31.17 
 
 
456 aa  255  1.0000000000000001e-66  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0017665  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3199  hypothetical protein  33.48 
 
 
448 aa  255  1.0000000000000001e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.184722 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0819  protein of unknown function DUF21  31.32 
 
 
441 aa  254  3e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2077  CBS domain-containing protein  32.62 
 
 
441 aa  252  1e-65  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0098  hypothetical protein  31.64 
 
 
460 aa  251  3e-65  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4403  hypothetical protein  32.78 
 
 
436 aa  249  6e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0196704  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2766  hypothetical protein  32.08 
 
 
442 aa  249  6e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3597  protein of unknown function DUF21  32.54 
 
 
447 aa  249  7e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000988374 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35020  hemolysin-like protein  32.95 
 
 
432 aa  248  1e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.518958  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0902  protein of unknown function DUF21  30.84 
 
 
436 aa  248  2e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2313  hypothetical protein  31.35 
 
 
438 aa  246  4.9999999999999997e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1577  protein of unknown function DUF21  32.57 
 
 
447 aa  246  6.999999999999999e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.569313  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0266  protein of unknown function DUF21  32.28 
 
 
444 aa  246  6.999999999999999e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1250  CBS domain-containing protein  31.21 
 
 
432 aa  245  9e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.144301  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3026  hypothetical protein  33.11 
 
 
442 aa  246  9e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.25014  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2774  protein of unknown function DUF21  31.81 
 
 
440 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.730131  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4765  hypothetical protein  32.37 
 
 
437 aa  243  5e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.942078 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3447  hypothetical protein  31.58 
 
 
440 aa  243  6e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2480  hemolysin  31.76 
 
 
436 aa  240  4e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3640  hypothetical protein  32.33 
 
 
441 aa  238  1e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0756  hypothetical protein  33.1 
 
 
436 aa  238  2e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0635919  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1413  hypothetical protein  32.96 
 
 
430 aa  238  2e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0999393  normal  0.104956 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4935  hypothetical protein  30.91 
 
 
443 aa  238  2e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0831  protein of unknown function DUF21  34.91 
 
 
452 aa  235  1.0000000000000001e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0300168 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3770  hypothetical protein  30.97 
 
 
441 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1519  hypothetical protein  32.25 
 
 
428 aa  234  3e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2233  protein of unknown function DUF21  31.64 
 
 
437 aa  233  4.0000000000000004e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0953  membrane protein  30.9 
 
 
426 aa  233  5e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3678  protein of unknown function DUF21  32.61 
 
 
443 aa  231  2e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.35091 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2432  protein of unknown function DUF21  32.61 
 
 
443 aa  231  2e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4026  CBS:protein of unknown function DUF21:transporter-associated region  30.62 
 
 
437 aa  230  3e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0343  hypothetical protein  32 
 
 
437 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.384323  normal  0.630353 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0238  protein of unknown function DUF21  32.38 
 
 
417 aa  226  6e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1467  protein of unknown function DUF21  31.7 
 
 
429 aa  225  1e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.211541  normal  0.989219 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0295  hypothetical protein  30.79 
 
 
443 aa  224  3e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.73268  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>