More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1848 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1848  hypothetical protein  100 
 
 
424 aa  855    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000139773 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0269  hypothetical protein  77.43 
 
 
424 aa  665    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0295  hypothetical protein  76.96 
 
 
424 aa  661    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.731774 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1483  hypothetical protein  58.35 
 
 
429 aa  493  9.999999999999999e-139  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.234798  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4805  putative transporter  52.79 
 
 
447 aa  466  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.140825  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4771  putative transporter  52.79 
 
 
447 aa  466  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4686  putative transporter  52.79 
 
 
447 aa  466  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.116284  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4675  putative transporter  52.79 
 
 
447 aa  465  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.050719  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4826  putative transporter  52.79 
 
 
447 aa  466  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.229608  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3577  protein of unknown function DUF21  52.1 
 
 
441 aa  462  1e-129  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3772  hypothetical protein  52.69 
 
 
443 aa  457  1e-127  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3960  CBS/transporter associated domain-containing protein  52.69 
 
 
443 aa  457  1e-127  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.216105  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3627  CBS/transporter associated domain-containing protein  52.69 
 
 
443 aa  457  1e-127  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04089  predicted inner membrane protein  50.93 
 
 
447 aa  454  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3774  protein of unknown function DUF21  50.93 
 
 
447 aa  454  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.767387  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4787  putative transporter  50.93 
 
 
447 aa  454  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3789  hypothetical protein  50.93 
 
 
447 aa  454  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4696  putative transporter  50.93 
 
 
447 aa  454  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0820  protein of unknown function DUF21  51.29 
 
 
444 aa  453  1.0000000000000001e-126  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3418  hypothetical protein  52.66 
 
 
442 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4864  putative transporter  50.93 
 
 
447 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.830156  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0396  hypothetical protein  51.64 
 
 
445 aa  454  1.0000000000000001e-126  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0782784  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5735  putative transporter  50.93 
 
 
447 aa  454  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4471  putative transporter  50.93 
 
 
447 aa  454  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04052  hypothetical protein  50.93 
 
 
447 aa  454  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0457  hypothetical protein  51.17 
 
 
447 aa  451  1e-125  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0445264  normal  0.119105 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0786  protein of unknown function DUF21  52.3 
 
 
438 aa  446  1.0000000000000001e-124  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.35446  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3937  protein of unknown function DUF21  48.95 
 
 
438 aa  422  1e-117  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4351  CBS domain-containing protein  48.26 
 
 
438 aa  424  1e-117  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0398  hypothetical protein  49.65 
 
 
437 aa  423  1e-117  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.596861  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4012  hypothetical protein  48.95 
 
 
438 aa  424  1e-117  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4131  hypothetical protein  48.95 
 
 
438 aa  422  1e-117  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3617  hypothetical protein  48.6 
 
 
438 aa  422  1e-117  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.960503  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0284  hypothetical protein  49.77 
 
 
441 aa  422  1e-117  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0334132 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4034  hypothetical protein  48.95 
 
 
438 aa  422  1e-117  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3488  protein of unknown function DUF21  49.39 
 
 
432 aa  418  1e-116  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0907  hypothetical protein  46.42 
 
 
440 aa  419  1e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3417  hypothetical protein  47.9 
 
 
435 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0359  hypothetical protein  48.96 
 
 
438 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3667  hypothetical protein  48.96 
 
 
438 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0353  hypothetical protein  48.26 
 
 
438 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0419  hypothetical protein  48.67 
 
 
435 aa  414  1e-114  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.794488  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3284  hemolysin, putative  47.79 
 
 
436 aa  412  1e-114  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1075  hypothetical protein  47.21 
 
 
443 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.179676  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4210  protein of unknown function DUF21  47.31 
 
 
427 aa  405  1.0000000000000001e-112  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3668  hypothetical protein  44.99 
 
 
452 aa  402  1e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0743  hypothetical protein  45.79 
 
 
439 aa  403  1e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.946695  normal  0.0273705 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5479  hypothetical protein  44.91 
 
 
482 aa  400  9.999999999999999e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0777  protein of unknown function DUF21  44.19 
 
 
438 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.825818  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0848  hypothetical protein  44.21 
 
 
438 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.684402 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3315  hypothetical protein  43.66 
 
 
427 aa  380  1e-104  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.284865  normal  0.945237 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2968  CorC/HlyC family transporters  45.07 
 
 
427 aa  371  1e-101  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.307812  normal  0.518349 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0698  hypothetical protein  41.29 
 
 
438 aa  347  2e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.46014  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2476  protein of unknown function DUF21  42.44 
 
 
438 aa  347  3e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.577812 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2082  protein of unknown function DUF21  42.44 
 
 
438 aa  347  3e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.690525  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2277  hypothetical protein  42.03 
 
 
441 aa  344  2e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2591  CBS:protein of unknown function DUF21:transporter-associated region  40.09 
 
 
443 aa  338  8e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3159  protein of unknown function DUF21  40.59 
 
 
445 aa  327  3e-88  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.248716  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2815  CBS domain-containing protein  34.52 
 
 
439 aa  279  8e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2853  CBS domain-containing protein  30.3 
 
 
439 aa  251  2e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2385  hypothetical protein  28.94 
 
 
433 aa  247  3e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0902  protein of unknown function DUF21  29.09 
 
 
436 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3036  CBS  30.5 
 
 
442 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2439  protein of unknown function DUF21  29.45 
 
 
443 aa  232  7.000000000000001e-60  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2313  hypothetical protein  30.24 
 
 
438 aa  228  1e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3447  hypothetical protein  27.9 
 
 
440 aa  226  7e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2774  protein of unknown function DUF21  27.9 
 
 
440 aa  225  1e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.730131  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2432  protein of unknown function DUF21  30.79 
 
 
443 aa  224  2e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3678  protein of unknown function DUF21  30.79 
 
 
443 aa  224  2e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.35091 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4026  CBS:protein of unknown function DUF21:transporter-associated region  29.33 
 
 
437 aa  224  2e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1932  CBS  28.17 
 
 
456 aa  224  2e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0017665  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4765  hypothetical protein  29.59 
 
 
437 aa  224  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.942078 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2846  protein of unknown function DUF21  27.91 
 
 
443 aa  224  2e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3770  hypothetical protein  28.94 
 
 
441 aa  223  4.9999999999999996e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35020  hemolysin-like protein  31.21 
 
 
432 aa  223  7e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.518958  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0098  hypothetical protein  28.85 
 
 
460 aa  222  8e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1413  hypothetical protein  32.29 
 
 
430 aa  222  9e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0999393  normal  0.104956 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1250  CBS domain-containing protein  31.53 
 
 
432 aa  222  9.999999999999999e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.144301  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4050  hypothetical protein  28.77 
 
 
440 aa  218  1e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0807851  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3597  protein of unknown function DUF21  27.27 
 
 
447 aa  218  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000988374 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2077  CBS domain-containing protein  28.24 
 
 
441 aa  217  2.9999999999999998e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3640  hypothetical protein  28.1 
 
 
441 aa  216  7e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0266  protein of unknown function DUF21  29.83 
 
 
444 aa  216  9e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4935  hypothetical protein  26.89 
 
 
443 aa  215  9.999999999999999e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2766  hypothetical protein  29.23 
 
 
442 aa  211  1e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0756  hypothetical protein  29.48 
 
 
436 aa  212  1e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0635919  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1287  protein of unknown function DUF21  27.93 
 
 
428 aa  212  1e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0953  membrane protein  28.94 
 
 
426 aa  212  1e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3026  hypothetical protein  29.49 
 
 
442 aa  211  2e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.25014  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3199  hypothetical protein  29.61 
 
 
448 aa  209  7e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.184722 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4403  hypothetical protein  29.72 
 
 
436 aa  209  8e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0196704  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1577  protein of unknown function DUF21  29.05 
 
 
447 aa  208  1e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.569313  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2321  hypothetical protein  28.13 
 
 
446 aa  208  2e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.638143  normal  0.0384275 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2233  protein of unknown function DUF21  29.9 
 
 
437 aa  206  6e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3855  protein of unknown function DUF21  28.74 
 
 
437 aa  206  6e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.469597  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2145  hypothetical protein  26.17 
 
 
430 aa  206  7e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2480  hemolysin  29.31 
 
 
436 aa  206  8e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2157  hypothetical protein  30.22 
 
 
437 aa  204  2e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.285648  normal  0.808245 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0926  protein of unknown function DUF21  29.04 
 
 
441 aa  203  5e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2723  protein of unknown function DUF21  26.73 
 
 
443 aa  202  9e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>