More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_3417 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_4351  CBS domain-containing protein  80.51 
 
 		 438 aa  732    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0284  hypothetical protein  78.52 
 
 		 441 aa  712    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0334132 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4131  hypothetical protein  81.26 
 
 		 438 aa  729    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3937  protein of unknown function DUF21  81.26 
 
 		 438 aa  729    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0398  hypothetical protein  71.53 
 
 		 437 aa  649    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.596861  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3417  hypothetical protein  100 
 
 		 435 aa  896    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4034  hypothetical protein  81.26 
 
 		 438 aa  729    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1075  hypothetical protein  73.38 
 
 		 443 aa  665    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.179676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3617  hypothetical protein  79.91 
 
 		 438 aa  735    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.960503  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0359  hypothetical protein  81.03 
 
 		 438 aa  734    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3667  hypothetical protein  81.03 
 
 		 438 aa  734    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0419  hypothetical protein  83.8 
 
 		 435 aa  732    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.794488  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0907  hypothetical protein  72.41 
 
 		 440 aa  655    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4012  hypothetical protein  81.26 
 
 		 438 aa  729    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0353  hypothetical protein  80.8 
 
 		 438 aa  725    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3284  hemolysin, putative  73.77 
 
 		 436 aa  659    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3772  hypothetical protein  60.24 
 
 		 443 aa  540  9.999999999999999e-153  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3960  CBS/transporter associated domain-containing protein  60 
 
 		 443 aa  538  9.999999999999999e-153  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.216105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3627  CBS/transporter associated domain-containing protein  60.24 
 
 		 443 aa  540  9.999999999999999e-153  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0457  hypothetical protein  60.47 
 
 		 447 aa  537  1e-151  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0445264  normal  0.119105 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0820  protein of unknown function DUF21  59.53 
 
 		 444 aa  528  1e-148  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3577  protein of unknown function DUF21  58.59 
 
 		 441 aa  526  1e-148  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04089  predicted inner membrane protein  57.92 
 
 		 447 aa  522  1e-147  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3774  protein of unknown function DUF21  57.92 
 
 		 447 aa  522  1e-147  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.767387  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5735  putative transporter  57.92 
 
 		 447 aa  522  1e-147  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0786  protein of unknown function DUF21  59.29 
 
 		 438 aa  524  1e-147  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.35446  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0396  hypothetical protein  57.71 
 
 		 445 aa  523  1e-147  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0782784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4787  putative transporter  57.92 
 
 		 447 aa  522  1e-147  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4696  putative transporter  57.92 
 
 		 447 aa  522  1e-147  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4864  putative transporter  57.92 
 
 		 447 aa  522  1e-147  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.830156  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04052  hypothetical protein  57.92 
 
 		 447 aa  522  1e-147  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3789  hypothetical protein  57.92 
 
 		 447 aa  522  1e-147  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4471  putative transporter  57.92 
 
 		 447 aa  522  1e-147  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4826  putative transporter  57.88 
 
 		 447 aa  520  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.229608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4805  putative transporter  57.88 
 
 		 447 aa  520  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.140825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4686  putative transporter  57.88 
 
 		 447 aa  520  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.116284  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4771  putative transporter  57.88 
 
 		 447 aa  519  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3418  hypothetical protein  59.32 
 
 		 442 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4675  putative transporter  57.88 
 
 		 447 aa  518  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.050719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5479  hypothetical protein  50.69 
 
 		 482 aa  484  1e-136  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0848  hypothetical protein  50.23 
 
 		 438 aa  474  1e-133  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.684402 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0777  protein of unknown function DUF21  49.77 
 
 		 438 aa  470  1.0000000000000001e-131  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.825818  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4210  protein of unknown function DUF21  50.94 
 
 		 427 aa  467  9.999999999999999e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3668  hypothetical protein  50.35 
 
 		 452 aa  465  9.999999999999999e-131  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3488  protein of unknown function DUF21  53.64 
 
 		 432 aa  464  1e-129  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0743  hypothetical protein  48.83 
 
 		 439 aa  454  1.0000000000000001e-126  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.946695  normal  0.0273705 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1483  hypothetical protein  51.1 
 
 		 429 aa  427  1e-118  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.234798  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0295  hypothetical protein  50.23 
 
 		 424 aa  424  1e-117  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.731774 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3315  hypothetical protein  48.13 
 
 		 427 aa  423  1e-117  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.284865  normal  0.945237 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0269  hypothetical protein  50 
 
 		 424 aa  421  1e-116  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1848  hypothetical protein  47.9 
 
 		 424 aa  418  9.999999999999999e-116  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000139773 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2277  hypothetical protein  47 
 
 		 441 aa  403  1e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2476  protein of unknown function DUF21  45.17 
 
 		 438 aa  389  1e-107  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.577812 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2082  protein of unknown function DUF21  45.17 
 
 		 438 aa  390  1e-107  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.690525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2591  CBS:protein of unknown function DUF21:transporter-associated region  44.82 
 
 		 443 aa  384  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2968  CorC/HlyC family transporters  46.89 
 
 		 427 aa  384  1e-105  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.307812  normal  0.518349 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0698  hypothetical protein  45.65 
 
 		 438 aa  383  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.46014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3159  protein of unknown function DUF21  37.39 
 
 		 445 aa  313  3.9999999999999997e-84  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.248716  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2815  CBS domain-containing protein  34.11 
 
 		 439 aa  271  2e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2385  hypothetical protein  32.5 
 
 		 433 aa  255  9e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2853  CBS domain-containing protein  33.11 
 
 		 439 aa  250  3e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2766  hypothetical protein  31.65 
 
 		 442 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4050  hypothetical protein  31.89 
 
 		 440 aa  243  5e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0807851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3770  hypothetical protein  32.08 
 
 		 441 aa  241  2e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1250  CBS domain-containing protein  31.94 
 
 		 432 aa  239  1e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.144301  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2233  protein of unknown function DUF21  31.65 
 
 		 437 aa  239  1e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1413  hypothetical protein  31.12 
 
 		 430 aa  238  2e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0999393  normal  0.104956 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4765  hypothetical protein  32.7 
 
 		 437 aa  237  3e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.942078 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3597  protein of unknown function DUF21  32.3 
 
 		 447 aa  236  5.0000000000000005e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000988374 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3447  hypothetical protein  31.15 
 
 		 440 aa  236  7e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2774  protein of unknown function DUF21  31.15 
 
 		 440 aa  236  8e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.730131  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4026  CBS:protein of unknown function DUF21:transporter-associated region  31.07 
 
 		 437 aa  233  5e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1932  CBS  30.84 
 
 		 456 aa  233  5e-60  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0017665  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3640  hypothetical protein  32.25 
 
 		 441 aa  232  1e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4403  hypothetical protein  30.54 
 
 		 436 aa  231  3e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0196704  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3036  CBS  30.18 
 
 		 442 aa  228  1e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4935  hypothetical protein  31.16 
 
 		 443 aa  228  1e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2077  CBS domain-containing protein  29.74 
 
 		 441 aa  228  2e-58  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35020  hemolysin-like protein  30.66 
 
 		 432 aa  226  8e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.518958  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0819  protein of unknown function DUF21  30.3 
 
 		 441 aa  226  9e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1577  protein of unknown function DUF21  31.35 
 
 		 447 aa  225  1e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.569313  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2480  hemolysin  31.13 
 
 		 436 aa  223  4e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0756  hypothetical protein  30.07 
 
 		 436 aa  223  7e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0635919  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2439  protein of unknown function DUF21  29.44 
 
 		 443 aa  223  8e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2846  protein of unknown function DUF21  28.64 
 
 		 443 aa  221  9.999999999999999e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3026  hypothetical protein  31.42 
 
 		 442 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.25014  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0098  hypothetical protein  29.59 
 
 		 460 aa  222  9.999999999999999e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0902  protein of unknown function DUF21  29.67 
 
 		 436 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0266  protein of unknown function DUF21  30.95 
 
 		 444 aa  221  3e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3199  hypothetical protein  30.49 
 
 		 448 aa  217  4e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.184722 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1287  protein of unknown function DUF21  27.76 
 
 		 428 aa  216  5e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3174  hypothetical protein  28.81 
 
 		 458 aa  214  2.9999999999999995e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2313  hypothetical protein  28.4 
 
 		 438 aa  211  2e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0021  protein of unknown function DUF21  30.26 
 
 		 435 aa  211  2e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.099852 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2145  hypothetical protein  28.3 
 
 		 430 aa  211  3e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3678  protein of unknown function DUF21  30.02 
 
 		 443 aa  210  4e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.35091 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2432  protein of unknown function DUF21  30.02 
 
 		 443 aa  210  4e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2388  protein of unknown function DUF21  28.74 
 
 		 442 aa  209  8e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.945135 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0343  hypothetical protein  29.58 
 
 		 437 aa  209  9e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.384323  normal  0.630353 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0264  hypothetical protein  30.19 
 
 		 432 aa  209  1e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.265353 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>