More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2968 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2968  CorC/HlyC family transporters  100 
 
 		 427 aa  861    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.307812  normal  0.518349 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3315  hypothetical protein  53.66 
 
 		 427 aa  480  1e-134  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.284865  normal  0.945237 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0457  hypothetical protein  47.76 
 
 		 447 aa  427  1e-118  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0445264  normal  0.119105 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3627  CBS/transporter associated domain-containing protein  48 
 
 		 443 aa  426  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3772  hypothetical protein  48 
 
 		 443 aa  426  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4805  putative transporter  46.71 
 
 		 447 aa  421  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.140825  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0820  protein of unknown function DUF21  47.89 
 
 		 444 aa  423  1e-117  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4826  putative transporter  46.71 
 
 		 447 aa  421  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.229608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3960  CBS/transporter associated domain-containing protein  47.76 
 
 		 443 aa  423  1e-117  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.216105  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4686  putative transporter  46.71 
 
 		 447 aa  421  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.116284  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0398  hypothetical protein  48.7 
 
 		 437 aa  424  1e-117  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.596861  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04089  predicted inner membrane protein  45.9 
 
 		 447 aa  420  1e-116  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3774  protein of unknown function DUF21  45.9 
 
 		 447 aa  420  1e-116  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.767387  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4471  putative transporter  45.9 
 
 		 447 aa  420  1e-116  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3577  protein of unknown function DUF21  47.42 
 
 		 441 aa  419  1e-116  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04052  hypothetical protein  45.9 
 
 		 447 aa  420  1e-116  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4787  putative transporter  45.9 
 
 		 447 aa  420  1e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5735  putative transporter  45.9 
 
 		 447 aa  420  1e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0786  protein of unknown function DUF21  48.54 
 
 		 438 aa  420  1e-116  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.35446  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3789  hypothetical protein  45.9 
 
 		 447 aa  420  1e-116  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4771  putative transporter  46.71 
 
 		 447 aa  421  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4864  putative transporter  45.9 
 
 		 447 aa  420  1e-116  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.830156  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4675  putative transporter  46.48 
 
 		 447 aa  420  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.050719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4696  putative transporter  45.9 
 
 		 447 aa  420  1e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0396  hypothetical protein  46.01 
 
 		 445 aa  416  9.999999999999999e-116  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0782784  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3418  hypothetical protein  48.3 
 
 		 442 aa  416  9.999999999999999e-116  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0284  hypothetical protein  47.64 
 
 		 441 aa  409  1e-113  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0334132 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4351  CBS domain-containing protein  47.99 
 
 		 438 aa  408  1e-113  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4131  hypothetical protein  47.52 
 
 		 438 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3617  hypothetical protein  47.64 
 
 		 438 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.960503  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4012  hypothetical protein  47.75 
 
 		 438 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4034  hypothetical protein  47.52 
 
 		 438 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0359  hypothetical protein  47.64 
 
 		 438 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3667  hypothetical protein  47.64 
 
 		 438 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3937  protein of unknown function DUF21  47.52 
 
 		 438 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0353  hypothetical protein  47.17 
 
 		 438 aa  404  1e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3284  hemolysin, putative  47.28 
 
 		 436 aa  404  1e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3417  hypothetical protein  46.89 
 
 		 435 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0419  hypothetical protein  46.84 
 
 		 435 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.794488  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0907  hypothetical protein  46.3 
 
 		 440 aa  392  1e-108  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1075  hypothetical protein  46.19 
 
 		 443 aa  389  1e-107  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.179676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3488  protein of unknown function DUF21  44.15 
 
 		 432 aa  388  1e-106  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5479  hypothetical protein  45.07 
 
 		 482 aa  383  1e-105  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1848  hypothetical protein  45.07 
 
 		 424 aa  384  1e-105  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000139773 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4210  protein of unknown function DUF21  42.69 
 
 		 427 aa  373  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0777  protein of unknown function DUF21  43.56 
 
 		 438 aa  372  1e-102  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.825818  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0848  hypothetical protein  43.56 
 
 		 438 aa  374  1e-102  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.684402 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0743  hypothetical protein  42.08 
 
 		 439 aa  365  1e-100  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.946695  normal  0.0273705 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0295  hypothetical protein  45.02 
 
 		 424 aa  362  8e-99  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.731774 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0269  hypothetical protein  44.79 
 
 		 424 aa  360  3e-98  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1483  hypothetical protein  43.03 
 
 		 429 aa  358  7e-98  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.234798  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3668  hypothetical protein  41.18 
 
 		 452 aa  351  1e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0698  hypothetical protein  41.11 
 
 		 438 aa  335  7e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.46014  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2277  hypothetical protein  41.65 
 
 		 441 aa  333  2e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2591  CBS:protein of unknown function DUF21:transporter-associated region  41.11 
 
 		 443 aa  331  1e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2082  protein of unknown function DUF21  40.88 
 
 		 438 aa  325  1e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.690525  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2476  protein of unknown function DUF21  40.88 
 
 		 438 aa  325  1e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.577812 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3159  protein of unknown function DUF21  37.88 
 
 		 445 aa  307  2.0000000000000002e-82  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.248716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2853  CBS domain-containing protein  35.12 
 
 		 439 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2815  CBS domain-containing protein  34.59 
 
 		 439 aa  258  2e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2385  hypothetical protein  31.78 
 
 		 433 aa  251  2e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1932  CBS  31.63 
 
 		 456 aa  236  7e-61  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0017665  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2439  protein of unknown function DUF21  33.1 
 
 		 443 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3199  hypothetical protein  32.13 
 
 		 448 aa  233  7.000000000000001e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.184722 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4765  hypothetical protein  32.46 
 
 		 437 aa  231  1e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.942078 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4935  hypothetical protein  30.9 
 
 		 443 aa  231  3e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1250  CBS domain-containing protein  30.5 
 
 		 432 aa  228  1e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.144301  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2774  protein of unknown function DUF21  30.79 
 
 		 440 aa  228  2e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.730131  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2846  protein of unknown function DUF21  30.55 
 
 		 443 aa  228  2e-58  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3447  hypothetical protein  30.55 
 
 		 440 aa  227  3e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2313  hypothetical protein  32.04 
 
 		 438 aa  225  1e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2077  CBS domain-containing protein  31.49 
 
 		 441 aa  224  2e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0098  hypothetical protein  30.6 
 
 		 460 aa  224  2e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3770  hypothetical protein  30.95 
 
 		 441 aa  223  3e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0266  protein of unknown function DUF21  33.01 
 
 		 444 aa  223  4e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3026  hypothetical protein  31.48 
 
 		 442 aa  223  6e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.25014  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3640  hypothetical protein  31.43 
 
 		 441 aa  222  9.999999999999999e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0819  protein of unknown function DUF21  30.91 
 
 		 441 aa  219  6e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1467  protein of unknown function DUF21  31.1 
 
 		 429 aa  218  1e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.211541  normal  0.989219 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4026  CBS:protein of unknown function DUF21:transporter-associated region  31.74 
 
 		 437 aa  217  2.9999999999999998e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0343  hypothetical protein  30.71 
 
 		 437 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.384323  normal  0.630353 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1519  hypothetical protein  32.71 
 
 		 428 aa  216  5e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3036  CBS  30.82 
 
 		 442 aa  216  7e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2766  hypothetical protein  30.27 
 
 		 442 aa  216  9e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1413  hypothetical protein  30.54 
 
 		 430 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0999393  normal  0.104956 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0926  protein of unknown function DUF21  32.11 
 
 		 441 aa  213  5.999999999999999e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3855  protein of unknown function DUF21  31.33 
 
 		 437 aa  213  7e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.469597  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1577  protein of unknown function DUF21  31.46 
 
 		 447 aa  212  9e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.569313  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0902  protein of unknown function DUF21  29.64 
 
 		 436 aa  211  2e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2157  hypothetical protein  31.84 
 
 		 437 aa  211  2e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.285648  normal  0.808245 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4228  hypothetical protein  32.32 
 
 		 445 aa  211  3e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.351193  normal  0.199337 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1852  protein of unknown function DUF21  30.68 
 
 		 433 aa  207  2e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35020  hemolysin-like protein  28.91 
 
 		 432 aa  207  3e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.518958  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2321  hypothetical protein  29.48 
 
 		 446 aa  207  4e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.638143  normal  0.0384275 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2233  protein of unknown function DUF21  29.09 
 
 		 437 aa  207  4e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3597  protein of unknown function DUF21  29.26 
 
 		 447 aa  206  5e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000988374 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3215  CBS:protein of unknown function DUF21:transporter-associated region  30.02 
 
 		 431 aa  206  8e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.141334 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0756  hypothetical protein  29.25 
 
 		 436 aa  204  2e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0635919  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3174  hypothetical protein  29.6 
 
 		 458 aa  205  2e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4050  hypothetical protein  28.7 
 
 		 440 aa  204  3e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0807851  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>