More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4765 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B4026  CBS:protein of unknown function DUF21:transporter-associated region  87.87 
 
 		 437 aa  726    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4765  hypothetical protein  100 
 
 		 437 aa  865    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.942078 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3770  hypothetical protein  68.66 
 
 		 441 aa  602  1.0000000000000001e-171  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2774  protein of unknown function DUF21  67.2 
 
 		 440 aa  596  1e-169  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.730131  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3447  hypothetical protein  68.21 
 
 		 440 aa  594  1e-169  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4935  hypothetical protein  69.53 
 
 		 443 aa  597  1e-169  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3640  hypothetical protein  67.95 
 
 		 441 aa  593  1e-168  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3036  CBS  62.1 
 
 		 442 aa  563  1.0000000000000001e-159  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2846  protein of unknown function DUF21  60.59 
 
 		 443 aa  555  1e-157  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1932  CBS  61.89 
 
 		 456 aa  548  1e-155  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0017665  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0266  protein of unknown function DUF21  63.45 
 
 		 444 aa  550  1e-155  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4228  hypothetical protein  69.01 
 
 		 445 aa  546  1e-154  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.351193  normal  0.199337 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0098  hypothetical protein  60.87 
 
 		 460 aa  543  1e-153  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1577  protein of unknown function DUF21  63.85 
 
 		 447 aa  543  1e-153  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.569313  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2439  protein of unknown function DUF21  61.06 
 
 		 443 aa  538  9.999999999999999e-153  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2385  hypothetical protein  58.97 
 
 		 433 aa  528  1e-148  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2077  CBS domain-containing protein  59.53 
 
 		 441 aa  522  1e-147  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0902  protein of unknown function DUF21  59.08 
 
 		 436 aa  520  1e-146  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2313  hypothetical protein  60.56 
 
 		 438 aa  518  1.0000000000000001e-145  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2853  CBS domain-containing protein  56.51 
 
 		 439 aa  501  1e-140  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2815  CBS domain-containing protein  55.2 
 
 		 439 aa  497  1e-139  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3026  hypothetical protein  51.61 
 
 		 442 aa  438  9.999999999999999e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.25014  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0953  membrane protein  49.3 
 
 		 426 aa  422  1e-117  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3199  hypothetical protein  48.07 
 
 		 448 aa  421  1e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.184722 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1519  hypothetical protein  50.12 
 
 		 428 aa  416  9.999999999999999e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2157  hypothetical protein  50 
 
 		 437 aa  410  1e-113  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.285648  normal  0.808245 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3855  protein of unknown function DUF21  51.69 
 
 		 437 aa  409  1e-113  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.469597  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1250  CBS domain-containing protein  46.4 
 
 		 432 aa  382  1e-105  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.144301  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4050  hypothetical protein  45.16 
 
 		 440 aa  375  1e-102  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0807851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2766  hypothetical protein  45.26 
 
 		 442 aa  362  9e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4403  hypothetical protein  45.22 
 
 		 436 aa  357  2.9999999999999997e-97  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0196704  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3597  protein of unknown function DUF21  43.17 
 
 		 447 aa  356  3.9999999999999996e-97  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000988374 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1314  hypothetical protein  44.34 
 
 		 439 aa  353  4e-96  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0274508  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2233  protein of unknown function DUF21  45.67 
 
 		 437 aa  351  1e-95  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3678  protein of unknown function DUF21  43.84 
 
 		 443 aa  351  2e-95  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.35091 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2432  protein of unknown function DUF21  43.84 
 
 		 443 aa  351  2e-95  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2480  hemolysin  42.12 
 
 		 436 aa  347  3e-94  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004057  hemolysin  43.4 
 
 		 434 aa  347  3e-94  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1441  protein of unknown function DUF21  42.82 
 
 		 439 aa  342  9e-93  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.114074  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35020  hemolysin-like protein  44.26 
 
 		 432 aa  340  2e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.518958  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0926  protein of unknown function DUF21  42.26 
 
 		 441 aa  323  3e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2321  hypothetical protein  40.89 
 
 		 446 aa  323  5e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.638143  normal  0.0384275 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0831  protein of unknown function DUF21  42.92 
 
 		 452 aa  322  6e-87  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0300168 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0021  protein of unknown function DUF21  41.53 
 
 		 435 aa  322  8e-87  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.099852 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0756  hypothetical protein  42.42 
 
 		 436 aa  320  3e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0635919  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2122  hypothetical protein  42.49 
 
 		 436 aa  317  3e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.705935  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0562  hypothetical protein  40.41 
 
 		 439 aa  315  9.999999999999999e-85  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.371677  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0608  hemolysin  40.41 
 
 		 439 aa  315  9.999999999999999e-85  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0343  hypothetical protein  38.13 
 
 		 437 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.384323  normal  0.630353 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2925  hypothetical protein  40.88 
 
 		 465 aa  311  1e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.221134  normal  0.412302 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1085  hypothetical protein  42.24 
 
 		 464 aa  311  1e-83  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.792914 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00183  hemolysin  41.34 
 
 		 435 aa  311  2e-83  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.702411  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0238  protein of unknown function DUF21  38.37 
 
 		 417 aa  310  5e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3152  protein of unknown function DUF21  40 
 
 		 431 aa  306  6e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3102  hypothetical protein  41.71 
 
 		 466 aa  306  6e-82  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0806544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0264  hypothetical protein  40.15 
 
 		 432 aa  304  2.0000000000000002e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.265353 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3174  hypothetical protein  39.5 
 
 		 458 aa  303  4.0000000000000003e-81  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3197  hypothetical protein  41.99 
 
 		 479 aa  303  4.0000000000000003e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.241932  normal  0.866715 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0819  protein of unknown function DUF21  37.79 
 
 		 441 aa  301  2e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1467  protein of unknown function DUF21  39.19 
 
 		 429 aa  297  3e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.211541  normal  0.989219 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0723  hypothetical protein  40.15 
 
 		 425 aa  296  6e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3215  CBS:protein of unknown function DUF21:transporter-associated region  39.16 
 
 		 431 aa  295  1e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.141334 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1413  hypothetical protein  37.44 
 
 		 430 aa  293  3e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0999393  normal  0.104956 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7487  hypothetical protein  39.31 
 
 		 436 aa  293  3e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.160114 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4139  hypothetical protein  40.68 
 
 		 452 aa  293  4e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0969684 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0942  protein of unknown function DUF21  37.83 
 
 		 424 aa  292  7e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.429612  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0710  protein of unknown function DUF21  37.16 
 
 		 432 aa  291  1e-77  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.149607  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0828  protein of unknown function DUF21  37.59 
 
 		 424 aa  291  2e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0769  hypothetical protein  39.11 
 
 		 447 aa  290  4e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.574193 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1852  protein of unknown function DUF21  39.23 
 
 		 433 aa  290  5.0000000000000004e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1287  protein of unknown function DUF21  38.15 
 
 		 428 aa  289  9e-77  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1919  hemolysin  38.8 
 
 		 430 aa  288  2e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2711  hypothetical protein  38.12 
 
 		 431 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.155736 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0419  hypothetical protein  37.28 
 
 		 407 aa  283  6.000000000000001e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2235  protein of unknown function DUF21  32.94 
 
 		 439 aa  282  1e-74  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0231  CBS  35.05 
 
 		 454 aa  282  1e-74  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0205285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2753  hypothetical protein  38.35 
 
 		 431 aa  281  2e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.429535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5725  hypothetical protein  42.08 
 
 		 434 aa  281  2e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.239106  hitchhiker  0.00714589 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2145  hypothetical protein  39.61 
 
 		 430 aa  278  1e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2008  protein of unknown function DUF21  32.63 
 
 		 447 aa  277  3e-73  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000403932  normal  0.229254 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2753  hypothetical protein  38.16 
 
 		 433 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.151662  normal  0.98691 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3348  hypothetical protein  38.48 
 
 		 429 aa  275  2.0000000000000002e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0165594  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4282  hypothetical protein  40.57 
 
 		 434 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.789831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3672  hypothetical protein  36.47 
 
 		 425 aa  270  4e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00780947 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0470  hypothetical protein  35.6 
 
 		 432 aa  268  2e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000200568  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3627  CBS/transporter associated domain-containing protein  31.95 
 
 		 443 aa  264  2e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3772  hypothetical protein  31.95 
 
 		 443 aa  264  2e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3960  CBS/transporter associated domain-containing protein  31.95 
 
 		 443 aa  264  2e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.216105  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0786  protein of unknown function DUF21  32.33 
 
 		 438 aa  260  3e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.35446  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3577  protein of unknown function DUF21  31.32 
 
 		 441 aa  260  4e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0820  protein of unknown function DUF21  32.47 
 
 		 444 aa  259  5.0000000000000005e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4787  putative transporter  30.37 
 
 		 447 aa  259  9e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4471  putative transporter  30.37 
 
 		 447 aa  259  9e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4864  putative transporter  30.37 
 
 		 447 aa  259  9e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.830156  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3774  protein of unknown function DUF21  30.37 
 
 		 447 aa  258  1e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.767387  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3789  hypothetical protein  30.37 
 
 		 447 aa  258  1e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4087  protein of unknown function DUF21  34.66 
 
 		 453 aa  258  1e-67  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04052  hypothetical protein  30.37 
 
 		 447 aa  258  1e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4696  putative transporter  30.37 
 
 		 447 aa  258  1e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5735  putative transporter  30.37 
 
 		 447 aa  258  1e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>