More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_3036 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_3036  CBS  100 
 
 
442 aa  889    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0902  protein of unknown function DUF21  71.81 
 
 
436 aa  627  1e-178  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2846  protein of unknown function DUF21  63.78 
 
 
443 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2439  protein of unknown function DUF21  64.86 
 
 
443 aa  572  1.0000000000000001e-162  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0098  hypothetical protein  64.73 
 
 
460 aa  557  1e-157  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2313  hypothetical protein  63.72 
 
 
438 aa  553  1e-156  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0266  protein of unknown function DUF21  65.96 
 
 
444 aa  548  1e-155  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1577  protein of unknown function DUF21  65.96 
 
 
447 aa  551  1e-155  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.569313  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1932  CBS  62.81 
 
 
456 aa  547  1e-154  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0017665  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2077  CBS domain-containing protein  62.65 
 
 
441 aa  543  1e-153  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3640  hypothetical protein  61.99 
 
 
441 aa  540  9.999999999999999e-153  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2774  protein of unknown function DUF21  59.23 
 
 
440 aa  534  1e-150  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.730131  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3770  hypothetical protein  60.05 
 
 
441 aa  533  1e-150  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3447  hypothetical protein  58.77 
 
 
440 aa  528  1e-149  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4935  hypothetical protein  60 
 
 
443 aa  530  1e-149  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4765  hypothetical protein  61.5 
 
 
437 aa  525  1e-148  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.942078 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4026  CBS:protein of unknown function DUF21:transporter-associated region  62.21 
 
 
437 aa  524  1e-147  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2385  hypothetical protein  58.92 
 
 
433 aa  499  1e-140  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4228  hypothetical protein  62.21 
 
 
445 aa  494  9.999999999999999e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.351193  normal  0.199337 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2815  CBS domain-containing protein  55.86 
 
 
439 aa  489  1e-137  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2853  CBS domain-containing protein  57.83 
 
 
439 aa  488  1e-136  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0953  membrane protein  53.76 
 
 
426 aa  465  9.999999999999999e-131  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3199  hypothetical protein  48.97 
 
 
448 aa  425  1e-117  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.184722 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3026  hypothetical protein  49.89 
 
 
442 aa  414  1e-114  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.25014  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1519  hypothetical protein  49.88 
 
 
428 aa  409  1e-113  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3855  protein of unknown function DUF21  52.21 
 
 
437 aa  405  1.0000000000000001e-112  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.469597  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2157  hypothetical protein  50.11 
 
 
437 aa  401  9.999999999999999e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.285648  normal  0.808245 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004057  hemolysin  47.53 
 
 
434 aa  391  1e-107  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3597  protein of unknown function DUF21  44.34 
 
 
447 aa  360  3e-98  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000988374 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4403  hypothetical protein  45.52 
 
 
436 aa  353  2e-96  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0196704  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2480  hemolysin  42.99 
 
 
436 aa  348  1e-94  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4050  hypothetical protein  43.12 
 
 
440 aa  348  1e-94  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0807851  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1250  CBS domain-containing protein  42.37 
 
 
432 aa  345  8.999999999999999e-94  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.144301  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2432  protein of unknown function DUF21  43.03 
 
 
443 aa  344  1e-93  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3678  protein of unknown function DUF21  43.03 
 
 
443 aa  344  1e-93  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.35091 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1314  hypothetical protein  45.88 
 
 
439 aa  345  1e-93  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0274508  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2233  protein of unknown function DUF21  41.91 
 
 
437 aa  343  4e-93  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2766  hypothetical protein  45.26 
 
 
442 aa  343  4e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1441  protein of unknown function DUF21  43.84 
 
 
439 aa  333  3e-90  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.114074  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0926  protein of unknown function DUF21  42.01 
 
 
441 aa  332  8e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0608  hemolysin  41 
 
 
439 aa  322  6e-87  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0562  hypothetical protein  41 
 
 
439 aa  322  9.000000000000001e-87  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.371677  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0264  hypothetical protein  42.37 
 
 
432 aa  315  9e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.265353 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2321  hypothetical protein  40.51 
 
 
446 aa  314  1.9999999999999998e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.638143  normal  0.0384275 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0021  protein of unknown function DUF21  42.32 
 
 
435 aa  313  4.999999999999999e-84  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.099852 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2925  hypothetical protein  42.41 
 
 
465 aa  313  4.999999999999999e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.221134  normal  0.412302 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35020  hemolysin-like protein  40.73 
 
 
432 aa  311  1e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.518958  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0756  hypothetical protein  39.58 
 
 
436 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0635919  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00183  hemolysin  42.33 
 
 
435 aa  308  1.0000000000000001e-82  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.702411  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0831  protein of unknown function DUF21  42.42 
 
 
452 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0300168 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2122  hypothetical protein  40.33 
 
 
436 aa  304  2.0000000000000002e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.705935  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3197  hypothetical protein  41.69 
 
 
479 aa  299  6e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.241932  normal  0.866715 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2753  hypothetical protein  38.19 
 
 
431 aa  299  8e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.429535  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1413  hypothetical protein  38.31 
 
 
430 aa  298  1e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0999393  normal  0.104956 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4139  hypothetical protein  41.06 
 
 
452 aa  297  2e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0969684 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0343  hypothetical protein  37.38 
 
 
437 aa  296  5e-79  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.384323  normal  0.630353 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3152  protein of unknown function DUF21  38.57 
 
 
431 aa  293  3e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0470  hypothetical protein  39.11 
 
 
432 aa  293  5e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000200568  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2711  hypothetical protein  37.88 
 
 
431 aa  292  7e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.155736 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0942  protein of unknown function DUF21  38.21 
 
 
424 aa  291  1e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.429612  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0238  protein of unknown function DUF21  38.1 
 
 
417 aa  290  3e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1085  hypothetical protein  40.8 
 
 
464 aa  290  3e-77  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.792914 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3102  hypothetical protein  39.63 
 
 
466 aa  288  1e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0806544  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0828  protein of unknown function DUF21  37.74 
 
 
424 aa  288  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0769  hypothetical protein  38.52 
 
 
447 aa  286  5.999999999999999e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.574193 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1919  hemolysin  39.24 
 
 
430 aa  285  1.0000000000000001e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1467  protein of unknown function DUF21  39.76 
 
 
429 aa  284  3.0000000000000004e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.211541  normal  0.989219 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1287  protein of unknown function DUF21  37.59 
 
 
428 aa  281  2e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3174  hypothetical protein  37.19 
 
 
458 aa  280  3e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0419  hypothetical protein  36.67 
 
 
407 aa  279  6e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1852  protein of unknown function DUF21  38.44 
 
 
433 aa  279  8e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5725  hypothetical protein  42.27 
 
 
434 aa  279  9e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.239106  hitchhiker  0.00714589 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7487  hypothetical protein  37.24 
 
 
436 aa  278  2e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.160114 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0710  protein of unknown function DUF21  38.53 
 
 
432 aa  277  3e-73  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.149607  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2753  hypothetical protein  37.2 
 
 
433 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.151662  normal  0.98691 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0231  CBS  34.67 
 
 
454 aa  273  3e-72  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0205285  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0723  hypothetical protein  38.98 
 
 
425 aa  273  3e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2008  protein of unknown function DUF21  34.04 
 
 
447 aa  273  4.0000000000000004e-72  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000403932  normal  0.229254 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2145  hypothetical protein  38.26 
 
 
430 aa  272  1e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0819  protein of unknown function DUF21  34.94 
 
 
441 aa  271  1e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0698  hypothetical protein  36.05 
 
 
438 aa  268  1e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.46014  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2235  protein of unknown function DUF21  33.02 
 
 
439 aa  268  1e-70  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3672  hypothetical protein  36.24 
 
 
425 aa  268  2e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00780947 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4087  protein of unknown function DUF21  35.4 
 
 
453 aa  266  4e-70  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1013  hemolysin  40.71 
 
 
424 aa  265  8.999999999999999e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.471918  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2673  hypothetical protein  40.71 
 
 
424 aa  265  8.999999999999999e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.460279  normal  0.557621 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3668  hypothetical protein  35.08 
 
 
452 aa  265  1e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3215  CBS:protein of unknown function DUF21:transporter-associated region  35.8 
 
 
431 aa  264  2e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.141334 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4282  hypothetical protein  38.55 
 
 
434 aa  264  3e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.789831  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3348  hypothetical protein  38.15 
 
 
429 aa  263  6e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0165594  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0820  protein of unknown function DUF21  32.39 
 
 
444 aa  262  1e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3627  CBS/transporter associated domain-containing protein  32.05 
 
 
443 aa  260  4e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3772  hypothetical protein  32.05 
 
 
443 aa  260  4e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3960  CBS/transporter associated domain-containing protein  31.44 
 
 
443 aa  259  6e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.216105  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2591  CBS:protein of unknown function DUF21:transporter-associated region  34.71 
 
 
443 aa  259  8e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5479  hypothetical protein  33.26 
 
 
482 aa  258  1e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4210  protein of unknown function DUF21  34.04 
 
 
427 aa  256  6e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3577  protein of unknown function DUF21  30.95 
 
 
441 aa  256  8e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0786  protein of unknown function DUF21  31.91 
 
 
438 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.35446  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0743  hypothetical protein  35.39 
 
 
439 aa  253  6e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.946695  normal  0.0273705 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>