More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1413 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_1413  hypothetical protein  100 
 
 		 430 aa  862    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0999393  normal  0.104956 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4050  hypothetical protein  40.66 
 
 		 440 aa  348  7e-95  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0807851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0756  hypothetical protein  43.6 
 
 		 436 aa  348  1e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0635919  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2480  hemolysin  41.59 
 
 		 436 aa  335  9e-91  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2766  hypothetical protein  41.02 
 
 		 442 aa  335  9e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1085  hypothetical protein  42.76 
 
 		 464 aa  334  2e-90  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.792914 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2233  protein of unknown function DUF21  41.47 
 
 		 437 aa  334  2e-90  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3597  protein of unknown function DUF21  41.65 
 
 		 447 aa  330  3e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000988374 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0828  protein of unknown function DUF21  39.81 
 
 		 424 aa  330  3e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1919  hemolysin  39.2 
 
 		 430 aa  328  2.0000000000000001e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0942  protein of unknown function DUF21  38.86 
 
 		 424 aa  323  5e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.429612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3152  protein of unknown function DUF21  40.9 
 
 		 431 aa  323  5e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2711  hypothetical protein  39.81 
 
 		 431 aa  320  3e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.155736 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3102  hypothetical protein  40.75 
 
 		 466 aa  320  3e-86  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0806544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7487  hypothetical protein  40.57 
 
 		 436 aa  319  5e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.160114 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4403  hypothetical protein  39.72 
 
 		 436 aa  318  1e-85  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0196704  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0926  protein of unknown function DUF21  39.02 
 
 		 441 aa  317  2e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2753  hypothetical protein  41.83 
 
 		 433 aa  317  3e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.151662  normal  0.98691 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2321  hypothetical protein  39.57 
 
 		 446 aa  316  4e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.638143  normal  0.0384275 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0831  protein of unknown function DUF21  41.72 
 
 		 452 aa  316  5e-85  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0300168 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2753  hypothetical protein  39.58 
 
 		 431 aa  313  4.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.429535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3348  hypothetical protein  39.34 
 
 		 429 aa  311  1e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0165594  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0769  hypothetical protein  39.95 
 
 		 447 aa  310  2.9999999999999997e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.574193 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4139  hypothetical protein  39.95 
 
 		 452 aa  308  1.0000000000000001e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0969684 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3174  hypothetical protein  38.73 
 
 		 458 aa  307  3e-82  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2815  CBS domain-containing protein  35.66 
 
 		 439 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2145  hypothetical protein  39.81 
 
 		 430 aa  305  1.0000000000000001e-81  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2432  protein of unknown function DUF21  38.89 
 
 		 443 aa  304  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3678  protein of unknown function DUF21  38.89 
 
 		 443 aa  304  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.35091 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2008  protein of unknown function DUF21  35.53 
 
 		 447 aa  304  2.0000000000000002e-81  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000403932  normal  0.229254 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3640  hypothetical protein  37.73 
 
 		 441 aa  303  5.000000000000001e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3036  CBS  37.79 
 
 		 442 aa  303  6.000000000000001e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0264  hypothetical protein  39.42 
 
 		 432 aa  302  6.000000000000001e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.265353 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2122  hypothetical protein  38.06 
 
 		 436 aa  302  8.000000000000001e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.705935  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0343  hypothetical protein  37.2 
 
 		 437 aa  300  2e-80  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.384323  normal  0.630353 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2925  hypothetical protein  39.47 
 
 		 465 aa  301  2e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.221134  normal  0.412302 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1441  protein of unknown function DUF21  37.29 
 
 		 439 aa  300  3e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.114074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1287  protein of unknown function DUF21  38.12 
 
 		 428 aa  300  3e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2439  protein of unknown function DUF21  37.98 
 
 		 443 aa  300  4e-80  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1314  hypothetical protein  39.06 
 
 		 439 aa  299  5e-80  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0274508  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2385  hypothetical protein  39.21 
 
 		 433 aa  300  5e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0902  protein of unknown function DUF21  37.2 
 
 		 436 aa  300  5e-80  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0238  protein of unknown function DUF21  39.42 
 
 		 417 aa  298  1e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3770  hypothetical protein  36.89 
 
 		 441 aa  298  1e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00183  hemolysin  38.32 
 
 		 435 aa  297  2e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.702411  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0419  hypothetical protein  38.39 
 
 		 407 aa  296  3e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0562  hypothetical protein  37.3 
 
 		 439 aa  296  6e-79  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.371677  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0608  hemolysin  37.3 
 
 		 439 aa  296  7e-79  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2853  CBS domain-containing protein  38.14 
 
 		 439 aa  295  9e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0021  protein of unknown function DUF21  38.81 
 
 		 435 aa  295  1e-78  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.099852 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5725  hypothetical protein  41.26 
 
 		 434 aa  293  3e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.239106  hitchhiker  0.00714589 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0098  hypothetical protein  37.17 
 
 		 460 aa  293  4e-78  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3447  hypothetical protein  37.18 
 
 		 440 aa  292  6e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2774  protein of unknown function DUF21  37.18 
 
 		 440 aa  292  7e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.730131  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3672  hypothetical protein  37.65 
 
 		 425 aa  291  1e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00780947 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2846  protein of unknown function DUF21  34.97 
 
 		 443 aa  289  6e-77  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0470  hypothetical protein  37.65 
 
 		 432 aa  288  2e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000200568  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1932  CBS  35.96 
 
 		 456 aa  287  2.9999999999999996e-76  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0017665  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3197  hypothetical protein  39.23 
 
 		 479 aa  286  4e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.241932  normal  0.866715 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1577  protein of unknown function DUF21  37.06 
 
 		 447 aa  286  5.999999999999999e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.569313  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2235  protein of unknown function DUF21  33.8 
 
 		 439 aa  285  9e-76  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0723  hypothetical protein  37.35 
 
 		 425 aa  285  9e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1250  CBS domain-containing protein  38.41 
 
 		 432 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.144301  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2313  hypothetical protein  36.99 
 
 		 438 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4935  hypothetical protein  35.42 
 
 		 443 aa  285  1.0000000000000001e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0819  protein of unknown function DUF21  34.35 
 
 		 441 aa  284  2.0000000000000002e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4765  hypothetical protein  37.44 
 
 		 437 aa  283  3.0000000000000004e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.942078 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4026  CBS:protein of unknown function DUF21:transporter-associated region  37.44 
 
 		 437 aa  282  7.000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0710  protein of unknown function DUF21  36.67 
 
 		 432 aa  282  8.000000000000001e-75  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.149607  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2077  CBS domain-containing protein  35.58 
 
 		 441 aa  281  2e-74  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3026  hypothetical protein  36.68 
 
 		 442 aa  281  2e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.25014  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4228  hypothetical protein  37.27 
 
 		 445 aa  278  1e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.351193  normal  0.199337 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1852  protein of unknown function DUF21  37.26 
 
 		 433 aa  278  1e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1467  protein of unknown function DUF21  37.95 
 
 		 429 aa  278  1e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.211541  normal  0.989219 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0266  protein of unknown function DUF21  36.47 
 
 		 444 aa  277  2e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0231  CBS  33.41 
 
 		 454 aa  276  5e-73  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0205285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1013  hemolysin  39.91 
 
 		 424 aa  274  3e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.471918  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4282  hypothetical protein  37.2 
 
 		 434 aa  271  2e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.789831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2673  hypothetical protein  39.58 
 
 		 424 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.460279  normal  0.557621 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35020  hemolysin-like protein  36.3 
 
 		 432 aa  265  1e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.518958  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0284  hypothetical protein  34.04 
 
 		 441 aa  262  6.999999999999999e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0334132 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4087  protein of unknown function DUF21  34.29 
 
 		 453 aa  257  3e-67  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5623  protein of unknown function DUF21  40.75 
 
 		 403 aa  257  3e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0907  hypothetical protein  33.81 
 
 		 440 aa  256  4e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2388  protein of unknown function DUF21  34.89 
 
 		 442 aa  256  6e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.945135 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2723  protein of unknown function DUF21  34.66 
 
 		 443 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4426  hypothetical protein  35.12 
 
 		 440 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.598992 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3488  protein of unknown function DUF21  33.82 
 
 		 432 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1075  hypothetical protein  33.1 
 
 		 443 aa  254  3e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.179676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0353  hypothetical protein  33.81 
 
 		 438 aa  251  1e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0953  membrane protein  33.18 
 
 		 426 aa  251  2e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4351  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 		 438 aa  250  4e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4826  putative transporter  31.31 
 
 		 447 aa  249  6e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.229608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4686  putative transporter  31.31 
 
 		 447 aa  249  6e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.116284  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4805  putative transporter  31.31 
 
 		 447 aa  249  6e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.140825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4771  putative transporter  31.31 
 
 		 447 aa  249  6e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4410  protein of unknown function DUF21  32.71 
 
 		 444 aa  249  8e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.938013  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4675  putative transporter  31.31 
 
 		 447 aa  248  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.050719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0359  hypothetical protein  33.1 
 
 		 438 aa  247  4e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3667  hypothetical protein  33.1 
 
 		 438 aa  247  4e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>