More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4410 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_4410  protein of unknown function DUF21  100 
 
 
444 aa  872    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.938013  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0389  hypothetical protein  56.22 
 
 
438 aa  441  9.999999999999999e-123  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0915  protein of unknown function DUF21  53.32 
 
 
460 aa  424  1e-117  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0280711  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1262  hypothetical protein  53.67 
 
 
533 aa  418  9.999999999999999e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0947  hypothetical protein  54.38 
 
 
432 aa  415  9.999999999999999e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0669  hypothetical protein  56.46 
 
 
439 aa  416  9.999999999999999e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0810091 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3237  protein of unknown function DUF21  54.78 
 
 
448 aa  408  1e-113  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.422703  normal  0.0333054 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7969  protein of unknown function DUF21  55.64 
 
 
555 aa  406  1.0000000000000001e-112  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1858  protein of unknown function DUF21  53.36 
 
 
434 aa  402  1e-111  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2040  hypothetical protein  53.88 
 
 
418 aa  404  1e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.923068  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0148  protein of unknown function DUF21  52.82 
 
 
421 aa  400  9.999999999999999e-111  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.518809 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02510  CBS domain-containing protein  49.52 
 
 
470 aa  380  1e-104  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0014  CBS domain protein  45.12 
 
 
431 aa  369  1e-101  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000513416 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1409  hemolysin-like protein  45.52 
 
 
447 aa  370  1e-101  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1099  hypothetical protein  42.3 
 
 
425 aa  307  3e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1116  hypothetical protein  42.3 
 
 
425 aa  307  3e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1127  hypothetical protein  42.05 
 
 
425 aa  305  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.531176 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1263  CBS  43.58 
 
 
425 aa  303  5.000000000000001e-81  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0234  protein of unknown function DUF21  43.84 
 
 
425 aa  296  6e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2633  protein of unknown function DUF21  43.62 
 
 
425 aa  295  1e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1487  protein of unknown function DUF21  44.74 
 
 
421 aa  295  1e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.121973  normal  0.308123 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5899  hypothetical protein  42.07 
 
 
430 aa  291  2e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.476132 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0026  protein of unknown function DUF21  43.29 
 
 
438 aa  288  1e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4979  protein of unknown function DUF21  43.5 
 
 
440 aa  286  5e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0247  protein of unknown function DUF21  37.25 
 
 
446 aa  285  8e-76  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3512  protein of unknown function DUF21  38.01 
 
 
431 aa  281  2e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.257501  normal  0.374436 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0926  protein of unknown function DUF21  37.56 
 
 
441 aa  275  2.0000000000000002e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0064  protein of unknown function DUF21  35.65 
 
 
447 aa  272  9e-72  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2004  hypothetical protein  37.29 
 
 
431 aa  270  2.9999999999999997e-71  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2815  CBS domain-containing protein  32.87 
 
 
439 aa  269  5.9999999999999995e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1422  hypothetical protein  40.99 
 
 
423 aa  266  4e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1678  hypothetical protein  34.02 
 
 
444 aa  264  3e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.306047  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01240  CBS domain-containing protein  36.52 
 
 
443 aa  261  2e-68  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2134  CBS domain-containing protein  32.27 
 
 
451 aa  259  1e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2072  magnesium and cobalt efflux protein  32.27 
 
 
451 aa  259  1e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0473612  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0252  protein of unknown function DUF21  31.41 
 
 
434 aa  258  1e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000514588  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2288  CBS domain-containing protein  32.27 
 
 
451 aa  259  1e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.779019  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2313  CBS domain protein  32.17 
 
 
443 aa  256  6e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0262  protein of unknown function DUF21  45.35 
 
 
421 aa  256  7e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.558818 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2397  CBS domain protein  31.93 
 
 
443 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2068  magnesium and cobalt efflux protein  31.81 
 
 
451 aa  254  3e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4979  hypothetical protein  39.56 
 
 
423 aa  253  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.581997  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2925  hypothetical protein  36.83 
 
 
465 aa  253  6e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.221134  normal  0.412302 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2270  CBS domain protein  32.24 
 
 
443 aa  252  8.000000000000001e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3152  protein of unknown function DUF21  36.36 
 
 
431 aa  250  4e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3277  protein of unknown function DUF21  35.83 
 
 
437 aa  249  5e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000233033  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0796  CBS domain-containing protein  52.31 
 
 
340 aa  249  5e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3055  CBS domain protein  31.78 
 
 
443 aa  249  5e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0470  hypothetical protein  35.33 
 
 
432 aa  249  7e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000200568  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2321  hypothetical protein  34.33 
 
 
446 aa  249  9e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.638143  normal  0.0384275 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2107  hypothetical protein  31.94 
 
 
451 aa  248  1e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3348  hypothetical protein  34.41 
 
 
429 aa  247  2e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0165594  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2711  hypothetical protein  35.81 
 
 
431 aa  246  4.9999999999999997e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.155736 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4282  hypothetical protein  38.32 
 
 
434 aa  245  9e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.789831  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4403  hypothetical protein  34.3 
 
 
436 aa  245  9.999999999999999e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0196704  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2766  hypothetical protein  34.37 
 
 
442 aa  245  9.999999999999999e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3197  hypothetical protein  37.53 
 
 
479 aa  244  1.9999999999999999e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.241932  normal  0.866715 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0756  hypothetical protein  36.03 
 
 
436 aa  244  3e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0635919  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0521  protein of unknown function DUF21  31.74 
 
 
448 aa  243  5e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3597  protein of unknown function DUF21  34.65 
 
 
447 aa  243  6e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000988374 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0740  CBS domain-containing protein  55.47 
 
 
309 aa  243  6e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0817501  hitchhiker  0.00625137 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1413  hypothetical protein  33.25 
 
 
430 aa  243  7e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0999393  normal  0.104956 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3672  hypothetical protein  34.95 
 
 
425 aa  241  2e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00780947 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0828  protein of unknown function DUF21  34.11 
 
 
424 aa  241  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3174  hypothetical protein  34.54 
 
 
458 aa  241  2.9999999999999997e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1919  hemolysin  33.95 
 
 
430 aa  240  2.9999999999999997e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2050  CBS domain protein  31.07 
 
 
435 aa  239  5e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.202921  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3095  hypothetical protein  30.79 
 
 
440 aa  239  5.999999999999999e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0877278  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1153  hypothetical protein  35.61 
 
 
447 aa  238  1e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000974304  normal  0.0417904 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7487  hypothetical protein  36.02 
 
 
436 aa  238  1e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.160114 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1072  hypothetical protein  35.92 
 
 
442 aa  239  1e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.638225  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3259  CBS domain protein  30.84 
 
 
435 aa  238  1e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.698294 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2092  CBS domain protein  30.61 
 
 
435 aa  238  2e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1875  hemolysin-like protein  30.61 
 
 
435 aa  238  2e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0753435  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1866  hemolysin-like protein  30.61 
 
 
435 aa  238  2e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.621127  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2160  CBS domain protein  30.61 
 
 
435 aa  238  2e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00238227  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2753  hypothetical protein  34.85 
 
 
431 aa  237  4e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.429535  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3102  hypothetical protein  35.09 
 
 
466 aa  236  6e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0806544  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1913  CBS domain-containing protein  30.37 
 
 
435 aa  236  7e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.378516  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2059  CBS domain-containing protein  30.37 
 
 
435 aa  236  7e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0361  CBS domain-containing protein  28.25 
 
 
449 aa  236  8e-61  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0819  protein of unknown function DUF21  29.25 
 
 
441 aa  235  1.0000000000000001e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0902  protein of unknown function DUF21  33.65 
 
 
436 aa  235  1.0000000000000001e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3156  hypothetical protein  30.68 
 
 
442 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0703  protein of unknown function DUF21  33.04 
 
 
477 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.401824 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1085  hypothetical protein  35.27 
 
 
464 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.792914 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3391  CBS domain protein  30.68 
 
 
442 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3447  hypothetical protein  33.63 
 
 
440 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2870  hypothetical protein  34.28 
 
 
433 aa  234  2.0000000000000002e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.221651  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0942  protein of unknown function DUF21  33.41 
 
 
424 aa  234  3e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.429612  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3544  protein of unknown function DUF21  33.49 
 
 
446 aa  234  3e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1910  hypothetical protein  31.16 
 
 
435 aa  233  5e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2774  protein of unknown function DUF21  33.41 
 
 
440 aa  233  5e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.730131  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0676  CBS domain-containing protein  31.16 
 
 
432 aa  233  6e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3172  CBS domain-containing protein  30.44 
 
 
442 aa  233  6e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.903732  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5725  hypothetical protein  38.48 
 
 
434 aa  233  7.000000000000001e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.239106  hitchhiker  0.00714589 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3370  CBS domain protein  30.44 
 
 
442 aa  233  7.000000000000001e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3396  CBS domain protein  30.44 
 
 
442 aa  232  8.000000000000001e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4050  hypothetical protein  32.19 
 
 
440 aa  232  8.000000000000001e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0807851  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2313  hypothetical protein  34.69 
 
 
438 aa  232  9e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>